
ГЭОТАР-Медиа
Иммуногеномика и генодиагностика человека / Р. М. Хаитов, Л. П. Алексеев, Д. Ю. Трофимов - Москва : ГЭОТАР-Медиа, 2017. - 256 с. - ISBN 978-5-9704-4139-8 |
Аннотация
В национальном руководстве представлены данные об истории развития, современном состоянии и перспективных достижениях в области структуры, функции и иммунобиологической роли генов иммунного ответа (ГИО), и в первую очередь генов главного комплекса тканевой совместимости человека HLA и их протеомных продуктов. Рассмотрены их иммунологические и общебиологические функции. Приведены данные о роли ГИО человека в обеспечении развития основных направлений здравоохранения - репродуктологии, клинической трансплантологии, противоинфекционной защиты, чувствительности и устойчивости к аутоиммунным и онкологическим заболеваниям и воздействию радиации. Отражена роль генетического и межпопуляционного полиморфизма ГИО человека в поддержании гомеостаза организма и обеспечении выживания человека как вида. Содержащийся в книге материал фундаментальных исследований ГИО человека и их практического использования основан на анализе мировой и отечественной литературы и собственных данных. Книга предназначена для научных сотрудников, врачей, аспирантов, ординаторов, студентов медицинских и биологических вузов и специалистов, получающих постдипломное образование.
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ACTB (Actin, Beta) - β-актин
ASHI (American Society for Histocompatibility and Immunogenetics) - Американское общество по тканевой совместимости и иммуногенетике
ASEATTA (Australasian and South East Asian Tissue Typing Association) - Австралазийская и юго-восточноазиатская ассоциация по тканевому типированию
B2M (β2 Microglobulin) - β2-микроглобулин
BKV (BK-Virus) - вирус BK, полиомавирус человека 1
CDC2 (Cell Division Cycle 2) - белок клеточного цикла 2
CML (Cell-Mediated Lympholysis) - клеточно-опосредованный лимфолизис
CMV (CytoMegaloVirus) - цитомегаловирус
Ds (Disease susceptibility gene) - ген предрасположенности к заболеванию
DZ (DiZygotic twins) - дизиготные близнецы
EBV (Epstein-Barr Virus) - вирус Эпштейна-Барр
EF (Etiologic Fraction) - этиологическая фракция
EFI (European Federation for Immunogenetics) - Европейская федерация иммуногенетики
GAPDH (GlycerAldehyde 3-Phosphate DeHydrogenase) - глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа
GUSB (Glucuronidase, Beta) - β-глюкуронидаза
HEPs (Highly Exposed Persistently Seronegative) - лица, контактировавшие с ВИЧ, но не заразившиеся
HGNC (HUGO Gene Nomenclature Committee) - Комитет по номенклатуре человеческих генов при Международной организации по изучению генома человека HUGO (Human Genome Organisation)
HLA (Human Leukocyte Antigens) - человеческие лейкоцитарные антигены, группа антигенов гистосовместимости, главный комплекс тканевой совместимости человека
HPRT1 (Hypoxanthine-guanine PhosphoRibosylTransferase) - гипоксантин-гуанин-фосфорибозилтрансфераза
HSP или HSPs (Heat Shock Proteins) - белки теплового шока
HSP70 (70 kilodalton Heat Shock Proteins) - белки теплового шока с мол. массой 70 кД
HSV (Herpes Simplex Virus) - вирус простого герпеса
kb (kilobase) - килобаза (кб), единица длины нуклеиновых кислот, равная 1000 нуклеотидов в одноцепочечной НК или пар нуклеотидов в двухцепочечной
MLC (Mixed Lymphocyte Culture) - смешанная культура лимфоцитов
MHC (Major Histocompatibility Complex) - главный комплекс гистосовместимости человека
MZ (Monozygotic twins) - монозиготные близнецы
NMDP (National Marrow Donor Program) - Национальная программа донорства костного мозга, США
PDB (Protein Data Bank) - банк данных 3D-структур белков и нуклеиновых кислот
PF (Preventive Fraction) - превентивная фракция
PLT (Primed Lymphocyte typing Test) - тест примированных лимфоцитов
RFLP (Restriction Fragments Length Polymorphism) - полиморфизм длин рестрикционных фрагментов
RR (Relative Risk) - относительный риск (ОР)
SBT (Sequence-Based Typing) - типирование прямым определением последовательности ДНК
SCID (Severe Combined ImmunoDeficiency) - тяжелый комбинированный иммунодефицит
SDF-1 (Stromal Derived Factor-1) - хемокин подсемейства CXC, регулирующий функции В-лимфоцитов и гемопоэтических стволовых клеток
SLE (System Lupus Erythematosis) - системная красная волчанка
SNP (Single Nucleotide Polymorphism) - однонуклеотидные полиморфизмы (ОНП)
SSP (Sequence Specific Primers) - сиквенс-специфические праймеры
ТВР (TATA-Binding Protein) - TATA-связывающий протеин
TCR (T Cell Receptor) - Т-клеточный рецептор
TOP2A (Topoisomerase 2 Alpha) - топоизомераза-2-альфа
WMDA (World Marrow Donor Association) - Всемирная ассоциация доноров костного мозга
ВАДКМ - Всемирная ассоциация доноров костного мозга (соотв. англ. аббревиатуре WMDA - World Marrow Donor Association)
Вирус BK - полиомавирус человека 1 (соотв. англ. аббревиатуре BKV - BK-Virus)
ВОЗ - Всемирная организация здравоохранения
ВЭБ - вирус Эпштейна-Барр
ГИО - гены иммунного ответа
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
ЕКК - естественные клетки-киллеры
ЕС - Европейский союз
ИГ - иммуногенетика
ИЗСД - инсулинзависимый сахарный диабет кб - килобаза, единица длины нуклеиновых кислот, равная 1000 нуклеотидов в одноцепочечной НК или пар нуклеотидов в двухцепочечной (соотв. англ. kb - kilobase)
КМ - костный мозг
КСК - кроветворные стволовые клетки
МПК - мононуклеарные клетки периферической крови (соотв. англ. PBMC - Peripheral Blood Mononuclear Cells)
мРНК - матричная рибонуклеиновая кислота
НК - нуклеиновая кислота
ООН - Организация Объединенных Наций
ООР - относительная опасность развития СПИД
ООС - относительная опасность смерти от СПИД у ВИЧ-инфицированных
ОНП - однонуклеотидные полиморфизмы (соотв. англ. SNP - Single Nucleotide Polymorphism)
ОР - относительный риск (соотв. англ. RR - Relative Risk)
ОТ - обратная транскрипция
ОТ-ПЦР - ПЦР с обратной транскрипцией
ПВН - потребители внутривенных наркотиков
ПК - периферическая кровь
ПО - программное обеспечение п.н. - пары нуклеотидов
ПСГ - прямой сиквенс генов
ПЦР - полимеразная цепная реакция (соотв. англ. PCR - Polymerase Chain Reaction).
ПЦР-РВ - метод ПЦР в реальном времени
РА - ревматоидный артрит
РБТЛ - реакция бластной трансформации лейкоцитов
РБТЛ-сп - спонтанная реакция бласттрансформации лимфоцитов
РБТЛ-ФГА - реакция бласттрансформации лимфоцитов, индуцированная фитогем-агглютинином
РНК - рибонуклеиновая кислота
РС - рассеянный склероз
СД1 - сахарный диабет 1 типа
СЖ - синовиальная жидкость
СКЛ - смешанная культура лимфоцитов
СКВ - системная красная волчанка (болезнь Либмана-Сакса)
сМ - сантиморган или сантиморганида, единица генетического расстояния между локусами хромосомы, соответствует 1% кроссинговера, эквивалентна в среднем 106 п.н.
СМИ - средства массовой информации
СПИД - синдром приобретенного иммунодефицита т.п.н. - тысячи пар нуклеотидов
ТПЛ - тест примированной смешанной культуры лимфоцитов
ФГА - фитогемагглютинин
ФЗ - федеральный закон
ФНО - фактор некроза опухоли (соотв. англ. TNF - Tumor Necrosis Factor)
ХВЗК - хроническое воспалительное заболевание кишечника (болезнь Крона)
ЮНЕСКО - Организация Объединенных Наций по вопросам образования, науки и культуры
18SrRNA (18S ribosomal RiboNucleic Acid) - 18S рибосомальная РНК
Глава 1. Введение в иммуногенетику. Иммуногеномика и генодиагностика иммунозависимых заболеваний
На протяжении многих веков основным бичом человечества были эпидемии инфекционных заболеваний. Отношение к ним ярко демонстрируют их бытовые названия в русском языке, например «мор», т.е. «смерть». Именно эпидемии, а не кровопролитные войны, были основным фактором, определяющим среднюю продолжительность жизни человека 30 годами. Причем это происходило не только в античный период, но и в период Средневековья, и в эпоху Возрождения, и в последующие времена. Примечательно, что основные средства противостояния, в первую очередь санитарно-гигиенического характера, были более эффективны именно в античный и средневековый периоды, когда вследствие относительно низкой плотности населения отдельные его группы и в первую очередь города имели возможность на время эпидемий полностью прерывать сообщение с внешним миром. Увеличение плотности населения, в частности в Европе, а также великие географические открытия, следствием которых стал межконтинентальный «обмен» инфекциями, привел к развитию эпидемий, вызванных «новыми» для тех или иных этносов заболеваниями, к которым, как мы теперь знаем, у населения не было выработано специфического (приобретенного) иммунитета.
Путь к спасению человечества от опустошавших Европу эпидемий открыл в 1796 г. английский врач Эдвард Дженнер, благодаря своей наблюдательности и способности к логическому мышлению. Во время эпидемии оспы Дженнер обратил внимание на то, что ей не была подвержена одна группа населения - доярки, перенесшие так называемую коровью оспу. Это заболевание протекало легко и быстро без случаев летального исхода. Дженнер сопоставил эти факты с данными о том, что немногочисленная часть населения, выжившая после заболевания натуральной (или черной) оспой, больше не заболевала ею в период последующих эпидемий. Эдвард Дженнер пришел к заключению о том, что перенесенная коровья оспа делает человека невосприимчивым (иммунным) к черной оспе, так же как и ранее перенесенная черная оспа.
Это предположение было подтверждено на практике. В 1796 г. Дженнер привил коровью оспу 8-летнему мальчику Джеймсу Фипсу, а через полтора месяца - человеческую оспу, и ребенок не заболел. Этот факт был неоднократно проверен Дженнером, и в 1798 г. он опубликовал свой труд «Исследование причин и действие коровьей оспы», в котором обосновал и доказал высокую эффективность вакцинации против оспы. Уже в 1803 г. в Лондоне были основаны Королевское Дженнеровское общество и Институт оспопрививания (Дженнеровский институт), а Эдвард Дженнер стал его первым руководителем. С 1808 г. оспопрививание было введено в Англии как государственное мероприятие. Метод оспопрививания снискал широкую поддержку и стал применяться практически во всех странах Европы, включая Россию.
Метод Э. Дженнера открыл путь к созданию средств, обеспечивающих противостояние человечества эпидемиям особо опасных инфекций, уносивших жизни людей на протяжении столетий и опустошавших не только города, но и целые страны.
В течение XIX и начала XX вв. были созданы вакцины против основных особо опасных и социально значимых заболеваний, включая холеру, столбняк, туберкулез, полиомиелит и т.д. Ведутся работы по созданию вакцин к новому вызову ХХ-ХХI вв. - СПИДу. Однако само значение открытия Э. Дженнера не ограничивается тем, что именно благодаря ему было создано новое направление клинической медицины - вакцинология.
В свою очередь, именно благодаря появлению и развитию вакцинологии возникла новая для XIX в. наука - иммунология, ставшая впоследствии одной из базовых медико-биологических наук.
Первоначальным посылом для ее появления стало естественное стремление понять: каким образом формируется невосприимчивость, т.е. иммунитет к тому или иному возбудителю.
Этот процесс шел одновременно с созданием новых вакцин, благодаря чему уже в конце XIX в. сформировалось общее представление об иммунном ответе организма на чужеродные агенты, в первую очередь инфекционного происхождения. Первоначальное внимание иммунологов было сосредоточено на изучении роли гуморального иммунного ответа, но в конце XIX в. был открыт клеточный иммунитет, и в течение определенного отрезка времени имела место конфронтация при рассмотрении роли клеточного и гуморального иммунитетов в развитии иммунного ответа.
В 1903 г. признанием роли как клеточного, так и гуморального иммунитета в развитии иммунного ответа стало присвоение Нобелевских премий Паулю Эрлиху за развитие учения о роли гуморального иммунитета и Илье Мечникову за формирование теории клеточного иммунитета.
Это событие ознаменовало новый этап в развитии фундаментальной и клеточной иммунологии и определило ход дальнейших исследований в этой области науки.
Следующим важнейшим этапом в развитии иммунологии стали открытие генов иммунного ответа (ГИО) и формирование нового направлении иммунологии - иммуногенетики. В частности, были разработаны и широко внедрены методы иммунодиагностики, иммунотерапии и мониторинга иммунного статуса социально значимых заболеваний не только инфекционного, но и аутоиммунного генеза.
Биобезопасность любого современного государства в значительной степени определяется уровнем развития фундаментальных и прикладных исследований в области иммунологии (человека). Достаточно ярким примером этого является возможность противостояния национальных систем здравоохранения угрозе пандемии синдрома приобретенного иммунодефицита (СПИД).
Естественно, это целиком и полностью относится и к другим иммуно-зависимым заболеваниям, в том числе неинфекционного происхождения, например, аутоиммунным и онкологическим заболеваниям, представляющим все большую угрозу для человечества.
Для решения этих проблем наиболее важными являются достижения в области иммуногенетики (ИГ) - одного из основных разделов фундаментальной и прикладной иммунологии. Первоначально магистральным направлением исследований в иммуногенетике было решение задач генетического контроля иммунного ответа. В настоящее время представления о назначении иммуногенетики значительно расширились, и стало ясно, что ИГ выполняет гораздо более широкие функции - вплоть до обеспечения выживания человека как вида.
Данная монография посвящена изложению современных представлений об основных областях биомедицины, где ГИО и их белковые продукты играют первостепенную роль в защите организма от неблагоприятных факторов окружающей среды и поддержании гомеостаза человека.
Современные научные достижения в области иммуногенетики, одного из наиболее перспективных направлений биомедицинской науки, в настоящее время позволили реализоваться новому важнейшему клиническому направлению - трансплантации органов и тканей. Благодаря достижениям, в том числе отечественных иммуногенетиков, появились принципиально новые возможности в области вакцинопрофилактики и эпидемиологии инфекционных заболеваний; были решены актуальные проблемы в области репродукции и установления иммуногенетической предрасположенности и устойчивости к целому ряду социально значимых заболеваний [7].
Основной предпосылкой для появления иммуногенетики явилась необходимость решения проблемы клинической трансплантации органов и тканей. Дело в том, что уровень развития медицины уже во второй половине XIX - начале XX вв. технически позволял осуществлять пересадку органов и тканей. Однако за исключением ряда случаев, когда донором являлся близкий родственник и трансплантат приживался, во всех других случаях он отторгался.
В этот же период, в первую очередь благодаря работам Грегора Менделя, были установлены принципы наследования генов (1866 г.), хотя само название «гены» ввел датский ботаник Вильгельм Иогансен (1909 г.). Объектами их исследований были растения. Тем не менее они стали основой для развития генетики в целом, и сформулированные Г. Менделем принципы генетического наследования в дальнейшем легли в основу работ, выполненных на представителях животного мира, в первую очередь на мышах. Проведение генетических исследований на мышах стало возможным благодаря созданию с помощью внутрисемейного скрещивания мышиных линий, внутри которых все животные являлись генетически идентичными. Линейные мыши каждой линии генетически отличаются не только от «диких» мышей, но и от мышей других линий. Один из критериев внутрилинейной генетической идентичности - толерантность к трансплантату (кожному лоскуту) от донора, принадлежащего к этой же линии [9, 10]. Используя этот факт, американский исследователь Джордж Снелл сформулировал основополагающие законы трансплантационного иммунитета и ввел понятие «главный комплекс тканевой совместимости» (МНС - Major Histocompatibility Complex) [28]. В серии работ, выполненных совместно с Питером Горером, была установлена экспрессия на клетках мыши антигенов, ответственных за тканевую совместимость, которые с тех пор обозначаются как Н-2 [11, 29]. В 1940-х годах Дж. Снелл подробно изучил данную систему антигенов.
Однако до использования этих знаний в клинической трансплантологии оставался еще значительный период времени. Дело в том, что методические приемы, использованные для изучения системы Н-2 мышей [24, 25], были неприемлемыми (с этической и правовой точек зрения) для изучения МНС человека. Решению этой проблемы современная иммуногенетика и клиническая трансплантология обязаны французскому иммуногематологу Жану Доссе, который нашел путь к получению реагентов для выявления и идентификации антигенов МНС человека [12, 20]. Основой его подхода послужила следующая гипотеза: поскольку родители каждого ребенка, как правило, не являются идентичными по антигенам МНС, то, согласно сформулированным Дж. Снеллом законам наследования антигенов МНС, ребенок получает строго по половине генотипа каждого родителя, и на поверхности его клеток должны экспрессироваться антигены обоих родителей.
В результате в крови матери должны образоваться антитела против антигенов, входящих в МНС-генотип отца ребенка. Ж. Доссе считал, что если его предположение верно, то эти антитела могут быть использованы в качестве «инструмента» для выявления МНС-антигенов человека, и антитела, полученные таким способом, могут быть использованы в дальнейшем для последующего определения набора МНС-генов конкретного человека [22]. Ж. Доссе использовал следующую модель исследования: он собрал значительное количество образцов сывороток от многорожавших женщин и перекрестно протестировал их с лейкоцитарной взвесью, полученной также от значительного количества мужчин. Ж. Доссе оказался прав: положительная реакция лейкоагглютинации с одним и тем же образцом лейкоцитарной взвеси была зарегистрирована при использовании нескольких образцов сывороток. Таким образом был открыт первый МНС-антиген человека, названный «МАС». Опубликованная Ж. Доссе работа, содержащая описание этого открытия, вызвала живейший интерес исследователей, работающих в области гематологии, иммунологии и хирургии [21]. Однако стало ясно, что для практического использования в клинической медицине требуется продолжение исследований в целях получения спектра антител ко всем или к большинству антигенов МНС человека [19], что позволило бы осуществлять МНС-типирование. Такая работа стала возможной благодаря созданию международного неправительственного сообщества исследователей, которые использовали схему, предложенную Ж. Доссе, и при этом исследователи обменивались образцами клеток и сывороток. На первом совместном совещании был выбран организационный комитет и принято решение координировать исследования путем создания 4-годичных программ, завершающихся так называемыми Международными рабочими совещаниями и конференциями, подводящими итоги совместных исследований с постановкой задач для последующей программы. Следует отметить, что принятый на первом совещании алгоритм проведения исследований используется и в настоящее время. Однако если в работе первых программ принимали участие десятки исследователей, то в настоящее время в рамках 4-годичных программ работают тысячи научных коллективов, объединяющих десятки тысяч исследователей. Исследование системы МНС, начатое в 1960-х годах, с самого начала носило и носит по настоящее время характер «открытого» международного сотрудничества. Наиболее ярким примером этого является тот факт, что Ж. Доссе при вручении Нобелевской премии ему, Дж. Снеллу и Б. Бенасеррафу заявил, что международные исследования в области генетики гистосовместимости являются беспрецедентным примером гуманитарного сотрудничества, исключающего патентование результатов [22].
На первом совещании было решено персонифицировать наименование МНС-человека и обозначить его как система HLA (Human Leukocyte Antigens) [16].
Уже в 1970-х годах участниками международных исследований по HLA рассматривался вопрос о целесообразности изменения названия данной генетической системы с HLA на «систему ГИО». Однако было решено оставить старое историческое название, подразумевая при этом, что в действительности речь идет именно о генах иммунного ответа и их продуктах - HLA-антигенах.
Сегодня международное научное сообщество, изучающее гены иммунного ответа, объединяет исследователей практически из всех государств. В Европе функционирует Европейская федерация по иммуногенетике (EFI - European Federation for Immunogenetics) [35], в США - Американское общество по изучению тканевой совместимости и иммуногенетики (ASHI - American Society for Histocompatibility and Immunogenetics) [34], в Австралии, Океании и Юго-Восточной Азии - Австралазийская и юго-восточноазиатская ассоциация по тканевому типированию (ASEATTA - Australasian and South East Asian Tissue Typing Association) [33].
Использование в 1970-1980-х годах в рамках международных исследований типирования HLA-специфичностей, основанного на выявлении белковых молекул с помощью серологических и клеточно-опосредованных методов, позволило развиться новой клинической дисциплине - трансплантологии органов и внести значительный вклад в целый ряд уже существовавших отраслей медицины. Одновременно с этим именно в данный период удалось сформулировать основные представления о роли белковых молекул HLA в развитии целого ряда физиологических и патологических процессов в организме человека. В основе широкого спектра биологических функций HLA-антигенов лежит в первую очередь их участие в таких процессах, как межклеточное взаимодействие не только клеток иммунной системы, но и всех других ядросодержащих клеток человека; распознавание генетически чужеродных, в том числе собственных перерожденных, агентов и их уничтожение; формирование и поддержание толерантности к клеткам собственного организма [17, 18].
Таким образом, уже в указанный период времени, когда не имелось технической возможности проводить исследования непосредственно генома человека, были достаточно полно изучены протеомика генов иммунного ответа человека и ее роль в физиологических и патологических процессах, протекающих в организме человека [13, 31, 27].
Иммуногенетика человека, по-видимому, является единственной отраслью биомедицины, где протеомика была изучена, и уже нашла широкое применение в догеномный период. Подтверждением этому, в частности, является следующий факт. В строении молекул HLA были обнаружены аминокислотные замены, приводящие к изменению их структуры, что, в свою очередь, ведет к изменению свойств данных молекул. И только через 10 лет в результате реализации программы «Геном человека» стало ясно, что основой этих изменений являются единичные нуклеотидные замены (SNP - Single Nucleotide Polymorphism), ведущие к появлению аллельных вариантов HLA-генов, продукты которых, т.е. HLA-антигены, были известны десятью годами ранее.
Первоначальной целью сообщества иммуногенетиков было решение проблемы селекции тканесовместимых пар донор-реципиент для нужд трансплантации органов и тканей. Однако достаточно скоро стало ясно, что биологическая роль генов HLA и их продуктов - антигенов HLA значительно шире и по сути они выполняют в организме целый ряд физиологических функций, в том числе не связанных напрямую с иммунным ответом. Так, в частности, они обеспечивают физиологическое взаимодействие всех ядросодержащих клеток организма человека, т.е. обеспечивают само его существование. В основе этого взаимодействия лежит идентичность наборов - генотипов HLA-антигенов, экспрессированных на взаимодействующих клетках одного организма [1].
Одновременно с этим HLA-антигены обеспечивают распознавание и уничтожение всех агентов, несущих чужеродную генетическую информацию в виде чужеродных белковых продуктов, несущих чужеродные HLA-антигены, включая собственные перерожденные, в том числе раковые, клетки.
Именно в «догеномный» период изучения HLA (1960-1985 гг.) были выполнены фундаментальные базовые исследования, посвященные биологической роли HLA-антигенов. Так, благодаря работам нобелевских лауреатов Р. Цинкернагеля и П. Доэрти [32], был установлен феномен «двойного распознавания» чужеродных иммуногенных пептидов - основного этапа развития адаптивного иммунного ответа. Суть феномена заключается в том, что чужеродный иммуногенный пептид - инициатор иммунного ответа, распознается Т-клеточным рецептором, «запускающим» каскад иммунного ответа на данный пептид только в том случае, если он «представлен» Т-клеточному рецептору собственной молекулой HLA (рис. 1.1, см. цв. вклейку). На рис. 1.1 представлен этап распознавания пептида молекулами HLA класса II, а также эффекторный этап, обеспечиваемый молекулой HLA класса I. Как следует из этого рисунка, ответ на иммунодоминантный пептид развивается только в том случае, если он представлен собственной молекулой HLA организма. Исключением является ситуация, когда пептид представляется чужеродными молекулами HLA, полностью идентичными собственным. Следует также отметить, что в том случае, если любой чужеродный иммуногенный пептид представляется Т-клеточному рецептору чужеродной для данного организма молекулой HLA, иммунный ответ будет развиваться не против этого пептида, а против чужеродной молекулы HLA как наиболее сильного из известных на сегодняшний день иммуногенов.
В этот же период времени, благодаря циклу работ Памелы Бъеркман [14, 15], основанных на использовании метода кристаллографии, были установлены тонкие механизмы взаимодействия иммунодоминантного пептида и представляющей его молекулы HLA. Эти работы позволили установить принципы осуществления генетического контроля иммунного ответа, которые не подвергнуты пересмотру по настоящее время. Принципиально они состоят в следующем: для развития иммунного ответа на тот или иной иммунодоминантный пептид в антигенсвязывающей области (бороздке) молекулы должны быть специфичные для данного пептида участки связывания (рис. 1.2, см. цв. вклейку). Естественно, что биологически целесообразно наличие наибольшего количества пептид-связывающих участков (сайтов), взаимодействующих с различными иммунодоминантными пептидами. Последнее определяет уровень полиморфизма иммунного ответа. В случае отсутствия в HLA-генотипе сайтов для взаимодействия с иммуно-доминантным пептидом конкретного возбудителя иммунный ответ не развивается. Это относится как к развитию иммунного ответа на болезнетворный инфекционный агент, так и на вакцину, созданную для профилактики данного заболевания. Вероятность такой ситуации снижается за счет того, что развитие иммунного ответа зависит от наличия конкретных сайтов связывания иммунодоминантных пептидов в HLA-генотипе, который, в свою очередь, состоит из двух HLA-гаплотипов. Один из них наследуется от отца, второй - от матери. В том случае, если эти гаплотипы полностью различаются между собой, уровень разнообразия является максимальным, т.е. обеспечивается возможность ответа на значительное количество патогенов или вакцин. В том случае, если наследуемые гаплотипы частично, а тем более полностью совпадают (что вероятно при родственных браках), уменьшается количество распознаваемых патогенов или вакцин за счет того, что идентичные в двух гаплотипах сайты распознают одни и те же чужеродные агенты.
Таким образом, проблема иммуногенетической неотвечаемости на конкретные возбудители инфекций или на вакцинацию является чрезвычайно актуальной для практического здравоохранения. Решение этой важнейшей для клинической медицины проблемы было найдено отечественными исследователями Р.В. Петровым и Р.М. Хаитовым, предложившими принципиально новый поход к преодолению такого рода иммуногенетической неотвечаемости. Разработанный ими метод «Фенотипическая коррекция иммунного ответа» стал основой для появления нового наиболее перспективного направления в вакцинологии [3, 4]. Авторы добились превращения фенотипически низкореагирующих на данный антиген (инфекцию) особей в высокореагирующие, модифицируя молекулу антигена иммуномодуляторами. Основу данного превращения составляет «дополнительное вовлечение» в иммунный ответ новых сайтов генов, участвующих в развитии иммунного ответа на данный антиген. Таким образом, этот подход открыл совершенно новые возможности создания вакцин нового поколения и в настоящее время позволил использовать достижения нанотехнологий в области направленной генетической «реконструкции» иммунного ответа.
Примечательно, что именно этот подход является наиболее перспективным для мирового здравоохранения на пути создания эффективной вакцины против ВИЧ.
В природе существует ситуация, когда иммуногенетическое распознавание, не служа основой для уничтожения в организме чужеродных болезнетворных агентов, является, тем не менее, необходимым физиологическим звеном обеспечения существования любого биологического вида [21]. Причем этот процесс не направлен на уничтожение иммуногена. Речь идет о процессе репродукции. Дело в том, что для развития нормально протекающей беременности и появления здорового потомства с полноценной иммунной системой необходимым условием является иммуногенетическая несовместимость родителей. Именно эта ситуация обеспечивает поддержание иммуногенетического разнообразия человека, поскольку наследование HLA-генов осуществляется по кодоминантному типу, когда ребенок наследует строго по половине от каждого родителя. В случае наличия у родителей общих HLA-антигенов (например, при родственных браках) может происходить снижение уровня полиморфизма (появление так называемых HLA-гомозиготных генотипов), что ведет к повышению вероятности возникновения неотвечаемости на конкретные болезнетворные агенты. Было выяснено, что HLA-совместимость супругов значительно повышает вероятность развития целого ряда нарушений в области репродукции, таких как идиопатическое бесплодие, привычное невынашивание беременности, тяжелые токсикозы беременности и др. Принципиальная возможность профилактики этих осложнений беременности была разработана уже в 1980-е годы. Однако результатом такого рода вмешательства является высокая (практически до 100%) вероятность появления HLA-гомозиготного потомства, среди которого, как указывалось, повышена вероятность отсутствия иммунного ответа на целый ряд инфекционных агентов. Помимо этого среди HLA-гомозигот также повышена частота встречаемости онкологических и аутоиммунных заболеваний, что связано с нарушением иммунного распознавания. В случае онкологических заболеваний речь идет о нарушении распознавания собственных измененных клеток [23]. В случае аутоиммунных заболеваний нарушается распознавание собственных неизмененных клеток за счет наличия в протеоме больных антигенов, общих с антигенами возбудителей ранее перенесенных заболеваний. Таким образом, для родителей с указанными репродуктивными проблемами, в протеоме которых имеются общие HLA-антигены, существует выбор: отказ от общего ребенка или использование иммунотерапии, которая возможно позволит иметь ребенка с заведомо сниженной иммунологической защитой.
В 1970-х годах получило свое развитие еще одно направление иммуногенетики - «HLA и болезни». Было установлено, что с конкретными HLA-антигенами ассоциирована предрасположенность или, напротив, устойчивость к конкретным заболеваниям. Наиболее выраженной оказалась ассоциация с аутоиммунными заболеваниями, в том числе социально значимыми, такими как сахарный диабет 1 типа, системная красная волчанка и анкилозирующий спондилит. Также было установлено, что такого рода ассоциации обнаруживаются и между HLA и определенными формами инфекционных и онкологических заболеваний [6, 7]. Одновременно с этим проведение масштабных международных исследований в области «HLA и болезни» стало основой для развития нового направления, получившего название «HLA и антропология». Его развитие связано со следующим: было установлено, что степень выраженности ассоциаций конкретных HLA-антигенов с заболеваниями весьма варьирует в зависимости от расовой и/или этнической принадлежности обследуемой группы, и что иммуногенетический профиль групп здорового населения, используемых в качестве контрольных, в значительной степени различается.
Эти данные послужили основанием для того, чтобы развернуть широкие международные сравнительные исследования по изучению особенностей HLA-полиморфизма в отдельных этнических группах, проживающих в различных регионах мира. Первые результаты этих обследований были обобщены на XI Международном рабочем совещании и конференции по изучению HLA (г. Иокогама, Япония, 1991 г.). В работе данного форума принимали участие более 3000 ученых, представляющих свыше 2000 научных коллективов. Коллективу исследователей из ФГБУ «ГНЦ Институт иммунологии» ФМБА России, г. Москва (далее Институт иммунологии) была вручена медаль за наибольший вклад в развитие направления «HLA и антропология». Это направление стало приоритетным в программе форума.
Дальнейшее развитие данного направления к сегодняшнему дню позволило наиболее полно установить генетическую взаимосвязь между отдельными популяциями и этническими группами, населяющими различные регионы мира. Использование для этих целей именно HLA-полиморфизма определяется в первую очередь тем, что данная генетическая система является наиболее разнообразной (полиморфной) из числа генетических систем человека, что делает ее наиболее информативной при сопоставительном анализе различных рас и этнических групп населения [18]. Одновременно с этим открываются принципиально новые возможности международного обмена тканесовместимыми трансплантатами органов и тканей (в первую очередь кроветворными стволовыми клетками - КСК). На рис. 1.3 (см. цв. вклейку) представлена дендрограмма, отражающая сходство и различие в распределении генов иммунного ответа в различных этнических группах населения, проживающих в различных регионах мира, включая Россию и ближнее зарубежье (последнее исследование выполнено сотрудниками Института иммунологии). На этой дендрограмме представлены данные исследований по распределению генов HLA-DRB1, несущих основную ответственность за распознавание чужеродных, в том числе болезнетворных, и собственных перерожденных агентов.
Примечательно, что XI Международное рабочее совещание стало первым всемирным научным форумом, на котором были представлены данные, полученные при проведении международных исследований не только с использованием протеомного, но и геномного анализа. В этой части научной программы также принимал активное участие коллектив исследователей Института иммунологии. Проведение анализа системы HLA на геномном уровне стало возможным благодаря тому, что в 1985 г. Керри Мюллисом была открыта полимеразная цепная реакция (ПЦР), позволившая проводить широкомасштабные молекулярно-генетические исследования. Переход с протеомных на молекулярно-генетические методы изучения системы HLA привел к прорыву практически во всех направлениях исследований иммуногенетики человека. Так, количество типируемых HLA-специфичностей возросло к настоящему времени с 138 (белковых антигенов) до 10 533 аллельных вариантов HLA-генов, выявленных методом молекулярно-генетического анализа (по состоянию на январь 2014 г.). Указанные гены представлены на рис. 1.4 (см. цв. вклейку). Они организованы в 3 основных класса. Класс I включает гены A, B, C, E, F и G, обеспечивающие развитие эффекторного звена иммунитета и участвующие в репродуктивной функции. В области генов класса II локализованы гены DR, DQ, DP, продукты которых обеспечивают иммунологическое распознавание чужеродных агентов (основная функция генов иммунного ответа). Помимо них в области генов HLA класса II картированы так называемые «неклассические» гены LMP, TAP, DM, CLIP и др., ответственные за процессинг и презентацию иммунодоминантных пептидов, т.е. за выделение из антигена иммунодоминантного пептида и его «доставку» к соответствующим пептид-связывающим участкам молекулы HLA. В области генов HLA класса III локализованы гены C3, ответственные за функцию комплемента, а также гены TNF, кодирующие белки фактора некроза опухолей, HSP, кодирующие белки теплового шока, и др. Эти гены объединены сходной функцией - обеспечением «неспецифической» защиты организма от чужеродных агентов без стадии распознавания генетически чужеродных агентов [7].
Вполне естественно, что молекулярно-генетическое типирование нашло практическое применение в клинической трансплантологии. Дело в том, что еще до его создания (в 1970-1980-е годы) подбор тканесовместимых пар донор-реципиент, основанный исключительно на HLA-протеомном анализе, мог быть относительно эффективен только при пересадках органов [26, 30], но не кроветворных стволовых клеток. Однако в настоящее время использование молекулярно-генетических методов HLA-типирования не только сделало более эффективными органные трансплантации, но и позволило проводить эффективные пересадки КСК за счет того, что в 80% случаев удается подобрать тканесовместмые КСК, необходимые для пересадки больным онкогематологическими заболеваниями [2].
Подбор тканесовместимых пар для трансплантаций КСК требует значительно более высокого уровня тканевой совместимости по сравнению с органными пересадками. Это определяется в первую очередь тем, что сами трансплантируемые КСК являются, в отличие от органных трансплантатов, иммунокомпетентными клетками, которые в случае HLA-несовместимости сами развивают «иммунную атаку» на клетки организма больного. Под высоким уровнем подбора тканесовместимых КСК следует понимать HLA-генотипирование на уровне установления аллельных вариантов генов HLA. Под аллельными вариантами подразумеваются гены HLA, имеющие незначительное отличие от исходного (дикого) варианта. Эти отличия могут касаться единичных нуклеотидных замен в геноме (SNP), ведущих к незначительным отличиям в аминокислотной последовательности, меняющим протеомную структуру HLA-антигенов. Последнее, в свою очередь, может придавать такой молекуле HLA новые биологические свойства, в том числе сделать эту молекулу тканенесовместимой с молекулой, кодируемой исходным геном. В основе формирования полиморфизма на уровне аллельных вариантов лежит мутационный процесс, но, в отличие от «обычных» мутаций, в ряде случаев SNP-мутации закрепляются и приобретают распространенность в конкретной популяции в виде аллельного варианта того или иного гена. Аллельным вариантом гена (в отличие от обычной мутации) называются варианты того или иного гена, встречаемого с частотой выше 1% в популяции. Как правило, появление новых аллельных вариантов гена связано с их биологической целесообразностью в эволюционном процессе, в том числе с преимуществами выживания носителей этих вариантов гена. Именно этот механизм лежит в основе формирования чрезвычайно высокого уровня полиморфизма генов HLA.
Полиморфизм HLA является основой иммуногенетической защиты человека от чужеродных агентов. По существу, именно он в первую очередь определяет и поддерживает биологическую индивидуальность человека. Поэтому для решения проблемы подбора тканесовместимого донора КСК необходим подбор, приближающийся к полностью совместимым (на уровне аллельных вариантов) парам донор-реципиент. Следует учитывать, что вероятность нахождения такого уровня совместимости среди неродственных пар колеблется от 1 на 1 000000 до 1 на 3 000000 для представителей различных этнических групп.
Кажущаяся неразрешимой проблема поиска доноров КСК для клинической трансплантации в настоящее время решена за счет создания Всемирной ассоциации доноров костного мозга (ВАДКМ, соотв. англ. аббревиатуре WMDA - World Marrow Donor Association). Теперь поиск тканесовместимых доноров и реципиентов стал рутинной процедурой, поскольку ВАДКМ располагает регистром HLA-генотипированных доноров-добровольцев, готовых предоставить безвозмездно трансплантат КСК любому больному, проживающему в любой стране мира, чей регистр входит в регистр ВАДКМ и следует его стандартам. К сожалению, Россия не может принимать полноценного участия в этом процессе, в первую очередь в связи с нерешенностью организационных и правовых аспектов проблемы трансплантации КСК в России. При этом медико-биологическая составляющая (включая молекулярно-генетическое генотипирование на соответствующем уровне) проблемы трансплантации КСК в России решена [8].
Необходимым условием для решения проблемы трансплантации КСК в нашей стране является международное сотрудничество. Это обусловлено чрезвычайно высоким уровнем генетического разнообразия генов HLA, при котором поиск тканесовместимого донора среди неродственных доноров-добровольцев требует наличия регистра, включающего миллионы потенциальных генотипированных доноров. Что касается родственных доноров, то пары родители-дети практически всегда несовместимы. Сибсы (братья-сестры) совместимы лишь в 25% случаев. Эффективный централизованный международный обмен КСК стал возможен лишь при создании ВАДКМ, объединяющей к настоящему времени более 17 млн доноров-добровольцев КСК, готовых безвозмездно предоставить КСК неизвестным им больным из разных частей света. В соответствии с решениями ООН, ЮНЕСКО и ВОЗ, безвозмездность донорства, в том числе КСК, является необходимым условием, нарушение которого в ряде стран законодательно приравнивается к торговле людьми [5].
Как уже указывалось, по уровню своего генетического разнообразия система HLA является наиболее полиморфной среди генетических систем всех биологических видов, населяющих Землю, включая человека. Существует достаточно обоснованное мнение, что именно это обстоятельство обеспечило наибольшую выживаемость человека как вида, и наиболее ярко это демонстрирует многовековая история борьбы человека с инфекциями. Дело в том, что именно иммунная система должна распознавать любые, в том числе новые, болезнетворные агенты и обеспечивать формирование адекватного ответа на них. Это было установлено благодаря протеомным и молекулярно-генетическим исследованиям двух последних десятилетий, когда стало ясно, что иммунная функция HLA-генов и их продуктов отнюдь не ограничивается обеспечением представления иммунодоминантных пептидов Т-клеточным рецепторам и запуском иммунного ответа на эти пептиды. В действительности, именно так называемые «неклассические» молекулы HLA обеспечивают все этапы «выделения» иммунодоминантных пептидов из чужеродных молекул и клеток (включая бактериальные) и их доставку антигенпредставляющим структурам молекул HLA, которые лишь после связывания пептидов с соответствующими сайтами могут экспрессироваться на поверхности клеток и полноценно участвовать в иммунном ответе (рис. 1.5, см. цв. вклейку). Как следует из рисунка, к этим генам, контролирующим функции, называемые процессингом и презентацией иммунодоминантых пептидов, относятся HLA-TAP и -LMP, ответственные за функцию молекул HLA класса I и HLA-CLIP и -DM, ответственные за функцию молекул HLA класса II. Также следует отметить, что нарушение функции этих генов и их продуктов ведет к развитию тяжелых форм иммунологической недостаточности, включая инфекционные, онкологические и аутоиммунные заболевания.
Таким образом, система HLA обеспечивает и контролирует почти все этапы развития иммунного ответа человека. «Недостающим» звеном в этой ее функции является передача сигналов запуска иммунного ответа от этапа его инициации, осуществляемой с помощью молекул HLA класса II к эффекторному этапу, осуществляемому Т-клетками-эффекторами и Т-хелперами. Что касается этого «недостающего» звена, то его иммуно-генетический контроль осуществляет группа генов, контролирующих цитокины, которые по современной номенклатуре относят к «не-HLA-генам иммунного ответа».
Естественно, что отдельно взятый организм не в состоянии обладать столь высоким уровнем генетического разнообразия, который мог бы обеспечить присутствие в антигенраспознающей бороздке сайтов для любого вновь появившегося болезнетворного агента. Однако такая задача решаема на популяционном уровне, где структура распознающих сайтов отличается крайне выраженным разнообразием. Более того, одним из важнейших достижений биомедицинской науки, явившимся результатом реализации программы «Геном человека», стало формирование представлений о роли генетического полиморфизма на уровне одиночных SNP. Наиболее яркий пример SNP - именно система HLA, которая, как указывалось, является наиболее полиморфной системой человека, включающей более 10000 аллельных вариантов генов, «закрепившихся» в геноме в силу той или иной биологической целесообразности. Очень важно, что значительная часть вариантов SNP одного и того же гена выполняет отличные или даже противоположные от основного (дикого) гена функции. По существу, процесс формирования полиморфизма на уровне одиночных нуклеотидных замен в системе HLA служит наиболее ярким проявлением позитивной биологической роли мутационного процесса, в результате которого возникают и закрепляются новые аллельные варианты генов иммунного ответа. Именно это обеспечивает выживание человека как вида в условиях агрессивной окружающей среды, что подтверждают данные о формировании современных HLA-профилей населения различных регионов мира [17]. Так, наиболее часто встречаемым среди коренного населения Европы является гаплотип HLA-A1-B8-DR3. Частота встречаемости этого гаплотипа значительно превышает таковую не только у представителей других рас, но и статистически ожидаемую, поэтому этот гаплотип считается классическим иммуногенетическим маркером европеоидов.
Уже в 1970-х годах выдающийся иммуногенетик Вальтер Бодмер выдвинул гипотезу, согласно которой это превышение связано с тем, что у носителей данного гаплотипа имелось селективное преимущество в выживании в условиях античных и средневековых пандемий. Эта точка зрения была поддержана основателем иммуногенетики - Жаном Доссе. В 1980-х годах сотрудниками Института иммунологии была проведена серия работ, в которой было установлено, что наличие данного гаплотипа и входящих в него антигенов ассоциировано с показателями иммунитета, которые в настоящее время отнесены к основным эффекторам врожденного иммунитета (активность естественных клеток-киллеров, фагоцитоз и др.) [7].
Примечательно, что врожденный иммунитет обеспечивает защиту организма от болезнетворных вирусов, бактерий и злокачественно перерожденных клеток. Встреча коренного населения Америки с европейцами во время освоения континента закончилась для аборигенов трагически, поскольку встречаемость указанных HLA-гаплотипов и, соответственно, уровень врожденного иммунитета у них были и остаются чрезвычайно низкими и не обеспечивали эффективной защиты против привезенных инфекционных агентов.
Следует отметить, что относящееся к европеоидной расе население Земли «расплачивается» по настоящее время за высокий уровень частоты встречаемости гаплотипа HLA-A1-B8-DR3, который ассоциирован с предрасположенностью к заболеваниям аутоиммунного генеза, включая сахарный диабет 1 типа и ряд других эндокринологических патологий, а также системную красную волчанку, анкилозирующий спондилит, миастению Гравис и др.
Примечательно, что в большинстве стран мира с населением, принадлежащим монголоидной расе (ориенты), аутоиммунные патологии составляют малый процент в структуре заболеваемости. Практически единственным исключением является популяция узбеков, занимающая первое место в мире по числу случаев сахарного диабета 1 типа среди представителей ориентов. Только в данной этнической группе ориентов частота встречаемости гаплотипа HLA-A1-B8-DR3 приближается к таковой у европеоидов.
Приведенные примеры основаны на историческом опыте человечества, однако подобные механизмы могут играть роль и в настоящее время. Это относится, в частности, к «чуме» XX и XXI вв. - СПИДу. Дело в том, что вирус СПИДа поражает клетки иммунной системы, несущие рецептор CD4+ (характерный для субпопуляции иммунокомпетентных клеток - Т-хелперов, принимающих непосредственное участие в инициации и контроле иммунного ответа). Рецепторы CD4+ являются основными «воротами», через которые вирус ВИЧ попадает в иммунную систему человека. Однако обязательным участником этого процесса является еще один рецептор - CCR5, не относящийся к системе HLA, но играющий важную роль в формировании иммунного ответа.
Среди возникших в результате мутационного процесса аллельных вариантов гена, кодирующего этот рецептор, имеется вариант, содержащий небольшую делецию CCR5A32. Данный вариант гена, в отличие от основного (дикого гена), обладает важной особенностью, а именно: кодируемый им рецептор не связывается с вирусом ВИЧ и тем самым блокирует его проникновение в клетку, предохраняя организм от развития заболевания. Правда, следует принять во внимание, что этот процесс имеет место только в случае, если делеция CCR5A32 есть на обеих гомологичных хромосомах. В случае гетерозиготной формы гена, т.е. когда делеция представлена только на одной хромосоме, заболевание может развиваться, хотя и протекает в менее агрессивной форме. Сотрудниками Института иммунологии было проведено изучение частоты встречаемости на массиве около 1000 «здоровых» людей, относящихся к 10 этническим группам, принадлежащим двум расам: европеоиды и ориенты, проживающие на территории России и бывших республик СССР (рис. 1.6, см. цв. вклейку). Из данных, представленных на рисунке, следует, что наиболее высокая частота встречаемости гомозигот CCR5A32 выявлена на Северо-Западе европейской части России и снижается по направлению к Киргизии и Туве.
Таким образом, эти данные подтверждают представления о возможной роли агрессивных факторов окружающей среды в формировании межпопуляционных различий в иммуногеноме человека. При этом следует принять во внимание, что к настоящему времени эти представления подтверждаются не только на уровне воздействия инфекционных агентов, но и таких неблагоприятных для человека факторов, как радиация [1].
В заключение отметим, что система генов иммунного ответа сама по себе стоит на страже своего разнообразия, не допуская появления гомозигот по указанным генам иммунного ответа. Этим обеспечивается биологическое преимущество гетерозигот, имеющих, в частности, значительно меньший шанс по сравнению с гомозиготами в развитии практически всех социально значимых заболеваний человека. В настоящее время активно развивается иммуногеномика - направление молекулярной генетики, посвященное изучению механизмов реализации иммунного ответа на генном уровне. Особенностью данного научно-практического направления является то, что представления о строении самой полиморфной генетической системы организма изначально базировались на исследованиях белковых молекул, кодируемых комплексом генов HLA.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ И ИНТЕРНЕТ-ИСТОЧНИКОВ
-
Пальцев М.А., Хаитов Р.М., Алексеев Л.П. Иммуногенетика человека и биобезопасность. - М.: Медицина, 2007. - 143 стр.
-
Пальцев М.А., Хаитов Р.М., Алексеев Л.П. и др. Главный комплекс тканевой совместимости человека (HLA) и клиническая трансплантология // Молекулярная медицина. - 2009. - № 2. - C. 3-13.
-
Петров Р.В., Хаитов Р.М., Атауллаханов Р.И. Иммуногенетика и искусственные антигены. - М.: Медицина, 1983.
-
Петров Р.В., Хаитов Р.М, Норимов А.Ш. и др. Фенотипическая коррекция Ir-генного контроля иммунного ответа при иммунизации конъюгатами (Т,Г)-А-Л с синтетическими полимэлектролитами // Иммунология. - 1985. - № 2. - C. 21-4.
-
Совет Европы // Конвенция «О защите прав человека и человеческого достоинства в связи с применением биологии и медицины» (О правах человека и биомедицине) // Страсбург, ноябрь 1996 г. Dir/Jur (96).
-
Хаитов Р.М., Алексеев Л.П. Физиология генов иммунного ответа // Рос. физиол. журн. им. И.М. Сеченова. - 2003. - Т. 89. № 3. - С. 313-28.
-
Хаитов Р.М. Физиология иммунной системы. - М.: ВИНИТИ РАН, 2005. - 375 с.
-
Хаитов Р.М., Алексеев Л.П., Хаманева Н.Ю. и др. Проблема трансплантации неродственных кроветворных стволовых клеток человека и биобезопасность // Молекулярная медицина. - 2010. - № 5. - С. 3-9.
-
Amos D.B. The agglutination of mouse leukocytes by iso-immune sera // Br. J. Exp. Path. - 1953. - Vol. 3. - P.464-70.
-
Amos D.B., Gorer P.A., Mikulska B.M. et al. An antibody response to skin homographts in mice // Br. J. Exp. Path. - 1954. - Vol. 35. - P. 203-8.
-
Amos D.B., Gorer P.A., Mikulska B.M. An analysis of an antigenic system in the mouse (the H-2 system) // Proc. Royal Society B. - 1955. - Vol. 144. - P. 369-80.
-
Bach F., Hirschhorn K. Lymphocyte interaction: a parennial histocompatibility test in vitro // Science. - 1964. - Vol. 143. - P. 813-4.
-
Bach F., Amos D.B. Phenotyphic expressions of the major histocompatibility locus in man (HLA): Leukocyte antigens and mixed leukocyte culture reactivity // J. Exp. Med. - 1968. - Vol. 128. - P. 623-39.
-
Bjorkman P.J., Saper M.A., Samraoui B. et al. Structure of the human class I histocompatibility antigen, HLA-A2 // Nature. - 1987. - Vol. 329. - P. 506-12.
-
Bjorkman P.J., Saper M.A., Samraoui B. et al. The foreign antigen binding site and T cell recognition regions of class I histocompatibilty antigens // Nature. - 1987. - Vol. 359. - P. 512-8.
-
Bodmer W.F. Evolutionary significance of the HLA system // Nature. - 1972. - Vol. 237. - P. 139-45.
-
Bodmer W., Bodmer J.G. Evolution and function of the HLA system // Brit. Med. Bull. - 1978. - Vol. 3. - P. 309-16.
-
Bodmer W. HLA polymorphism: origin and maintenance. In: HLA 1997, P. Terasaki and D. Gjertson, eds. - 1998. - P. 1-7.
-
Brodsky F.M., Parham P., Barnstable C.J. et al. Monoclonal antibodies for analysis of the HLA system // Immunol. Rev. - 1979. - Vol. 47. - P. 3-61.
-
Dausset J. Iso-leuco-anticorps // Acta Haematologica. - 1959. - Vol. 20. - P. 15666.
-
Dausset J., Contu L. Is the MHC a general self-reconnition system playing a major unifying role in an organism? // Hum. Immunol. - 1980. - Vol.1. - P. 5-17.
-
Dausset J. The major histocompatibility complex in man: past, present, and future concepts // Science. - 1981. - Vol. 213. - P. 1469-74 (Nobel Lecture).
-
Haldane J.B.S. The genetics of cancer // Nature. - 1933. - Vol. 132. - P. 265-7.
-
Gorer P.A., Lyman S., Snell G.D. Studies on the genetic and antigenic basis of tumour transplantation. Linkage between a histocompatibility gene and «fused» in mice // Proceedings of the Royal Society of London - Series B: Biological Sciences. - 1948. - Vol. 135. - P. 499-505.
-
Klein J. The major histocompatibility complex of the mouse // Science. - 1979. - Vol. 203. - P. 516-21.
-
Patel R, Mickey M.R., Terasaki P.I. Serotyping for homotransplantation of kidneys from unrelated donors // New Eng. J. Med. - 1968. - Vol. 279. - P. 501-6.
-
Robinson M.A., Noreen H.J., Amos D.B., Yunis E.J. Target antigens of cell-mediated lympholysis discrimination of HLA subtypes by cytotoxic lymphocytes //J. Immunol. - 1978. - Vol. 121. - P. 1486.
-
Snell G.D. Methods for the study of histocompatibility genes // J. Genet. - 1948. - Vol.49. - P. 87-108.
-
Snell G.D. Histocompatibility genes of the mouse. I. Demonstration of weak histocompatibility differences by immunization and controlled tumor dosage // J. Natl. Cancer Inst. - 1958. - Vol. 20. - P. 787-824.
-
Stickel D.L., Amos D.B., Robinson R.R., Glenn J.F., Zmijewski C.M., Metzgar R.S., Hayes C.P. Renal Transplantation with donor recipient tissue-matching: Preliminary report of first case in North Carolina // N.C. Med. J. - 1965. - Vol. 26. - P. 379-83.
-
Van RoodJ.J, Eernisse J.O., Van Leeuwen A. Leucocyte antibodies in sera from pregnant women // Nature. - 1958. - Vol. 181. - P. 1735-6.
-
Zinkernagel R.M., Doherty P.C. Restriction of in vitro T cell-mediated cytotoxicity in lymphocytic choriomeningitis within a syngeneic or semiallogeneic system // Nature. - 1974. - Vol. 248. - P. 701-2.
-
ASEATTA (Australasian and South East Asian Tissue Typing Association). - http://www.aseatta.org.au
-
ASHI (American Society for Histocompatibility and Immunogenetics). - http://www.ashi-HLA.org
-
EFI (European Federation for Immunogenetics). - http://www.efiweb.eu
Глава 2. Геномика и протеомика генов иммунного ответа
Иммуногенетика - это направление иммунологии, задачей которого является изучение генетического контроля, т.е. регуляции иммунного ответа человека. Естественно, что эта функция - одна из основных функций организма. Как было сказано выше, основной генетической структурой, выполняющей данную функцию, является так называемый главный комплекс генов тканевой совместимости.
По современным представлениям система HLA, обеспечивая регуляцию иммунного ответа, осуществляет такие важнейшие функции, как взаимодействие всех иммунокомпетентных клеток организма, распознавание своих и чужеродных, в том числе измененных собственных, клеток, запуск и реализацию иммунного ответа, обеспечение временной толерантности организма матери к тканенесовместимому плоду в период его вынашивания и, в целом, обеспечивает выживание человека как вида в условиях экзогенной и эндогенной агрессии [18].
Все многообразие указанных функций обеспечивается строением главного комплекса тканевой совместимости и в первую очередь генетическим и популяционным разнообразием или, как принято называть, полиморфизмом данной генетической системы и ее продуктов - HLA-антигенов.
Система HLA - одна из самых сложных, наиболее хорошо изученных и вместе с тем загадочных генетических структур в геноме человека. Так, если еще в 1987 г. расстояние между его условными границами оценивалось в 2000 kb, то в настоящее время оно расширено более чем в 2 раза, причем протяженность отдельных его элементов - генных кластеров - колеблется в широких пределах в зависимости от HLA-гаплотипа [87].
Современная карта генов главного комплекса тканевой совместимости человека была представлена нами ранее (см. рис. 1.4 на цв. вклейке).
По выполняемой функции гены HLA делятся на три группы: охарактеризованные гены, псевдогены и гены с неустановленной функцией. На основании исследования главных комплексов гистосовместимости различных видов высших организмов был сделан вывод о том, что этот генный комплекс расширялся за счет дупликации, что, в свою очередь, давало определенные преимущества организмам с более полиморфной системой HLA в процессе эволюции. Однако вопрос о том, какие причины привели к подавлению экспрессии ранее функционировавших генов HLA, остается открытым [58, 17].
Представления о строении системы HLA развивались и развиваются в течение всего периода ее изучения, однако, как указывалось выше, за последние годы произошел качественный скачок в развитии данной проблемы. Ранее, со времени открытия Ж. Доссе, основным объектом исследования могли служить только белки - HLA-антигены, выявляемые с помощью антител или в клеточно-опосредованных реакциях, поэтому представления о комплексе генов HLA могли формироваться в основном на анализе косвенных данных. Эти данные основывались на изучении HLA-антигенов в популяциях и при семейном анализе. Теперь, благодаря развитию молекулярной генетики и молекулярной иммунологии, появилась возможность выявления и изучения самих генов HLA.
Особенный прогресс в этом направлении произошел после открытия и внедрения в исследования в области изучения системы HLA метода полимеразной цепной реакции (ПЦР) и прямого сиквенса генов (ПСГ) системы HLA, позволяющих анализировать необходимые для исследований участки ДНК, что, в свою очередь, открыло широкие возможности для быстрого и точного анализа молекулярного полиморфизма HLA, включая выявление новых генов, в том числе на уровне аллельных вариантов [66]. Примечательно, что если со времени открытия системы HLA до середины 1980-х годов было открыто менее 150 HLA-специфичностей, то за последующий период количество известных HLA-специфичностей превысило 10000 (рис. 2.1, см. цв. вклейку).
Это увеличение произошло как за счет открытия новых генов HLA, так и вследствие установления многочисленных аллельных вариантов уже известных генов. Следует отметить, что в самое последнее время было также установлено, что многие HLA-молекулы, которые ранее рассматривались как «конечное» функциональное звено системы HLA, например HLA-DR4, в действительности подразделяются на целый ряд субспецифичностей в зависимости от того, каким аллельным вариантом гена DRB1*04 они кодируются. Несмотря на минимальный уровень различий этих молекул (3-4 аминокислотных замены), они выполняют совершенно различные, а иногда - противоположные функции. Так, в частности, среди аллельных вариантов гена DRB1*04 имеются как положительно ассоциированные с предрасположенностью к развитию инсулинзависимого сахарного диабета - сахарного диабета 1 типа (СД1), т.е. генетические маркеры предрасположенности к диабету, так и отрицательно ассоциированные, т.е. обеспечивающие «устойчивость» к развитию данного заболевания. При этом следует отметить, что при наличии в HLA-генотипе двух аллельных вариантов различной направленности доминирующим оказывается протективный вариант [1, 2].
2.1. Геномика главного комплекса тканевой совместимости человека
Одним из достижений человечества в XX в. стала расшифровка генома человека. Однако эту работу никак нельзя считать законченной. Более того, основная часть практических результатов будет, по-видимому, получена в течение не одного десятка лет. Это связано с тем, что сама по себе расшифровка отдельных участков генома далеко не всегда дает возможность применить эти знания на практике. Необходимы установление и изучение функции белковых продуктов тех или иных генов, поскольку именно они принимают непосредственное участие в осуществлении различных функций организма. Этот этап изучения геномики человека называется «протеомикой», и, в целом, эта наука находится на начальной стадии исследований. Разумеется, достижения и прорывы в различных областях протеомики неоднозначны. Однако есть много оснований для того, чтобы считать, что наибольшие знания не только геномики, но и протеомики имеются сегодня в области исследований главного комплекса тканевой совместимости человека - системы HLA. Последнее объясняется тем, что, как было сказано выше, уже с конца 1950-х годов интенсивно исследовались именно белковые продукты системы HLA и на основании их анализа судили об HLA-генах. Таким образом, как было отмечено ранее, к началу периода изучения именно геномики HLA протеомика данной генетической системы была изучена достаточно полно. При этом следует напомнить, что и начало исследований геномики HLA (1980-е годы) значительно опередило начало интенсивных исследований в области геномики человека в целом. Результатом этого стал факт наиболее полного и широкого понимания не только структур, но и функции (т.е. протеомики) системы HLA.
Тем не менее при изложении современного состояния знаний в области геномики и протеомики системы HLA мы сочли целесообразным представление данных не в порядке их получения, т.е. начиная с протеомики, а с геномики. Это связано с тем, что именно такая последовательность является, на наш взгляд, более логичной для освещения современных знаний о функции системы HLA.
Традиционно гены HLA и их продукты разделяют на 3 класса - I, II, III. Причем в клеточном взаимодействии и регуляции иммунного ответа участвуют в основном HLA-антигены I и II классов - продукты соответствующих генов (класс I и II).
Гены HLA класса I, которые иногда также по традиции называют генами, кодирующими трансплантационные антигены, первоначально были подразделены на 3 локуса, называемые А, В и С. Однако сегодня кроме генов этих локусов в класс I системы HLA включаются еще 18 генов класса I HLA, 11 из которых являются псевдогенами, а 7 - ассоциированы с продуктами транскрипции [87, 68].
Расположение генов А, В и С на хромосоме следующее: крайний к центромере локус HLA-B на 0,2 сМ (1 cM соответствует 1х106 п.н. ДНК); в сторону теломеры расположен локус HLA-C и на 0,8 сM в сторону теломеры расположен HLA-A [58].
«Соседом» кластера генов класса I HLA является ген, относящийся к классу III - C2, расстояние до которого от HLA-B составляет 0,65х106 п.н. Всего же размер кластера генов HLA класса I составляет 1,4х106 п.н.
Организация генов HLA класса I имеет высокую степень гомологии. В них содержится 8 экзонов (рис. 2.2, см. цв. вклейку). Первый экзон кодирует сигнальную последовательность; второй, третий и четвертый - домены α1, α2 и α3 соответственно, молекулы HLA. Пятый экзон кодирует трансмембранный участок цепи, цитоплазматический участок кодирует экзоны 6 и 7. 3'-Нетранслируемый участок кодирует экзон 8 (3’UTR).
Межэкзонные различия между генами локусов А, В и С состоят в том, что HLA-A и -B гены содержат втрое больше нуклеотидов (1080) в 5-м экзоне по сравнению с генами локуса HLA-C.
В дополнение к «классическим» локусам HLA-A, -B и -C к первому классу относятся также гены HLA-E, -F, -G (рис. 1.4, см. цв. вклейку). Гены Е локализованы между HLA-B и -C, а картируемые ими антигены экспрессируются на покоящихся (зрелых) периферических Т-лимфоцитах и клетках карциномы человека [58].
Гены HLA-F и -G картированы в сторону от теломеры на расстояние 80 сМ [58] (рис. 1.4, см. цв. вклейку).
Благодаря использованию метода ДНК-генотипирования с применением сиквенс-специфических олигонуклеотидов в 1994 г. при секвенировании HLA-E установлено 5 аллельных вариантов, хотя соответствующие белки еще не выявлены [16].
Антигены, кодируемые генами HLA-F, также еще не установлены.
Экспрессия антигенов, кодируемых локусом HLA-G, впервые была установлена на клетках хориокарциномной клеточной линии, а также на мембране клеток при хроническом цитотрофобластозе [35]. Их физиологическая функция связана в первую очередь с репродукцией (подробнее см. гл. 5).
Методом PCR-RFLP был установлен аллельный полиморфизм HLA-G в экзонах 2 и 3 [71]. Всего к настоящему времени установлено 14 аллельных вариантов HLA-G. Следует отметить, что вопрос о степени полиморфизма у описанных выше «неклассических» генов остается открытым, как остается открытым и вопрос о биологической функции их самих и их продуктов.
Несколько новых генов с необычной периодической структурой идентифицированы на расстоянии 250 kb от HLA-A гена в центромерном направлении. Анализ нуклеотидных последовательностей этих генов показал, что они относятся к псевдогенам. В этом же субрегионе HLA-комплекса идентифицирован экспрессирующий ген, обозначенный как CD12 и расположенный на расстоянии 50 kb от гена HLA-A. Кодируемый им белок по своей структуре отличается от классических антигенов I класса [33].
Также к HLA-антигенам класса I относятся гены локуса MIC (MIC-A и MIC-B). Аббревиатура MIC расшифровывается как MHC class I Chain-related genes. Эти гены локализуются на 6-й хромосоме в непосредственной близости от HLA-B [52]. Молекула MIC-A состоит из 383 аминокислотных полипептидов и имеет массу 43 кД. Антигены MIC обладают способностью связывать пептиды и другие короткие лиганды. В настоящее время не ясно, являются ли MIC-антигены более древними либо, напротив, происходящими от классических антигенов класса I [11]. При нуклеотидном сиквенсе установлено 17 аллельных вариантов генов МICA и MICB, в геноме MICA обнаружено 5 различных аллельных вариантов, полиморфных по микро-сателлитным участкам [68]. Установлена взаимосвязь между микросателлитным полиморфизмом MICA и болезнью Бехчета. Данная ассоциация оказалась более выраженной, чем известные ранее ассоциации болезни Бехчета с классическими HLA-антигенами.
В последнее время обнаружено, что антигены MICA участвуют в активации взаимодействия TCR с молекулой МНС и принимают участие в развитии Т-клеточно-опосредованной цитотоксичности и активности НК-клеток; тем самым, в частности, играя роль в обеспечении противоракового иммунитета [12]. Таким образом, по-видимому, антигены MIC по своей физиологической значимости приближаются к таковой, установленной для классических антигенов HLA.
Молекулярно-генетический анализ позволяет разделить регион HLA класса II на отдельные локусы (рис. 1.4, см. цв. вклейку). Внутри локуса HLA-DR кодируются относительно неполиморфный ген α-цепи - DRA (2 аллельных варианта) и несколько генов β-цепи - DRB1-DRB9. Из данных генов β-цепи экспрессируются DRB1, DRB3, DRB4 и DRB5. Интересно, что количество DRB-генов на данной хромосоме зависит от DR-специфичности гаплотипа. Внутри HLA-DQ и -DP-региона кодируются два гена α- и два гена β-цепи. Однако экспрессированы только DQA1, DQB1 и DPA1, DPB1.
Каждая HLA-молекула несет только одну антигенсвязывающую бороздку, которая, тем не менее, должна обеспечить представление всего разнообразия пептидов. Это обеспечивается за счет экстремально высокого уровня HLA-аллельного полиморфизма. Помимо этого двум из генов HLA класса II - HLA-DQ и HLA-DP присуща еще одна особенность: продукты этих генов имеют различные функционально активные молекулы, в зависимости от cis- и trans-положения при ассоциации α- и β-цепей.
Для идентификации аллельных вариантов генов HLA Номенклатурный комитет ВОЗ ввел новую официальную номенклатуру, отличную от ранее существовавшей для идентификации HLA-антигенов [16]. Естественно, что количество аллельных вариантов HLA значительно превосходит количество ранее известных соответствующих HLA-антигенов. Более того, в отношении ряда HLA-локусов имеются уже не количественные, а качественные отличия, поскольку серологическими или клеточно-опосредованными методами продукты ряда генов не выявляются.
Для сопоставления возможностей выявления HLA-специфичностей на уровне антигенов с таковыми на молекулярно-генетическом уровне приведена табл. 2.1.
Таблица 2.1. Два уровня определения HLA-полиморфизма, общее число специфичностей
Генетический локус |
Методы установления и количество HLA-специфичностей |
||
Иммунологические методы (1956-1985) |
Молекулярно-генетические методы (1985-2012) |
||
КЛАСС I |
HLA-A |
28 |
2013 |
HLA-B |
61 |
2605 |
|
HLA-C |
10 |
1551 |
|
HLA-E |
- |
11 |
|
HLA-F |
- |
22 |
|
КЛАСС II |
HLA-G |
- |
50 |
HLA-DRA |
- |
7 |
|
HLA-DRB1 |
24 |
1159 |
|
HLA-DRB2-9 |
- |
101 |
|
HLA-DQA1 |
9 |
47 |
|
HLA-DQB1 |
176 |
||
HLA-DPA1 |
6 |
34 |
|
HLA-DPB1 |
155 |
||
DOA |
- |
12 |
|
DOB |
- |
13 |
|
DMA |
- |
7 |
|
DMB |
- |
13 |
|
TAP1,2 |
- |
24 |
|
MICA,-B |
- |
119 |
|
Общее количество специфичностей |
138 |
8119 |
Действительно, из табл. 2.1 следует, что молекулярно-генетическое HLA-генотипирование не только позволяет идентифицировать почти на порядок большее количество HLA-cпецифичностей, чем серологические и клеточно-опосредованные методы, но и идентифицировать новые гены как в классе I, так и в классе II. Помимо этого в классе II в локусах HLA-DQ и -DP идентифицируются аллельные варианты, определяемые полиморфизмом отдельных цепей, например DQA1 и DQB1.
На наш взгляд, было бы целесообразным для понимания реализации роли системы HLA более подробно осветить вопрос о роли полиморфизма отдельных генов HLA в осуществлении иммунных функций.
Так, гены DR-локуса включают один низкополиморфный регион, кодирующий альфа-цепь. До настоящего времени полиморфизм HLA-DRA установлен относительно наличия серина или валина в положении 217 [36]. Таким образом, имеются два аллельных варианта гена DRA.
Напротив, в высокополиморфном HLA-В-регионе полиморфизм проявляется как на уровне экспрессирующих генов, так и псевдогенов. Наиболее полиморфным из генов HLA-DRB является HLA-DRB1, насчитывающий к настоящему времени более 300 аллельных вариантов.
DQ-локус содержит по 2 пары генов А и В (рис. 1.4, см. цв. вклейку), однако хотя DQA-2 и B2 гены транскрибированы, их белковые продукты еще не установлены, и поэтому в настоящее время принято считать, что единственным экспрессирующим геном DQ является А1 и В1, при этом, в отличие от DR-локуса, полиморфизм DQ-локуса связан с генами HLA-DQ-A и -В. DQ-полиморфизм в значительной степени связан с DRB-полиморфизмом, причем эта связь значительно более выражена для DQA по сравнению с DQB.
Третьим из хорошо изученных локусов HLA класса II является DP-регион, в котором экспрессирующим являются также два гена DPA1 и DPB1, в то время как гены DPA2 и DPB2 являются псевдогенами [85].
Исследования последовательности DPA-генов позволило установить к 1989 г. наличие 8 аллелей, в DPB1 -регионе было установлено 38 аллелей. Эти аллели идентифицируются методом SSO, и для части из них установлено соответствие с определенными HLA-DP-антигенами [15], выявленными в тесте примированной смешанной культуры лимфоцитов (PLT).
Следует отметить, что для антигенов локуса HLA-DP установлен значительно более низкий уровень полиморфизма (на уровне аминокислотных последовательностей) по сравнению с генами локусов HLA-DR и -DQ.
Помимо хорошо изученных генов HLA класса II, в регионе HLA-D установлены новые гены HLA (рис. 1.4, см. цв. вклейку), среди них в первую очередь стоит остановиться на генах HLA-DOB; HLA-DNA и особенно HLA-DM (DMA и DMB), LMP и ШР.
Три последних локуса обеспечивают такую важнейшую функцию, как процессинг и экспрессию HLA-антигенов на поверхности клеток [24, 27].
HLA-DOB выявлены в ДНК-библиотеке, полученной из В-лимфобластоидных линий, и при этом была установлена 70% нуклеотидная гомология с генами DRB, DQB и DPB. Гены HLA-DOB картированы между DQ и DP, их экспрессия установлена на уровне мРНК в В-клеточных линиях и в Т-клеточных линиях, стимулированных γ-интерфероном [87].
Гены HLA-DNA были получены из геномной ДНК, гибридизированной с HLA-DRA, и они открываются на уровне РНК, выделенной из В-клеточных линий [87]. Гены локализированы в непосредственной близости от HLA-DQB в сторону центромеры (рис. 1.4, см. цв. вклейку). Гены HLA класса III занимают на хромосоме пространственное положение между генами HLA класса I и II и выполняют целый ряд важнейших биологических функций. До последнего времени этот регион был изучен по сравнению с генами класса I и II сравнительно мало.
Помимо генов HLA, принадлежащих классу I и II, на рис. 1.4 (см. цв. вклейку) представлена также локализация генов класса III, которым также принадлежит значительная физиологическая роль.
Так, одним из генов HLA класса III, привлекающих наибольшее внимание исследователей, работающих как в области изучения структуры системы HLA, так и по проблеме «HLA и болезни», является ген CYP21. Продукт этого гена - HLA-антиген HLA-B42, но основная его функция - контроль активности энзима цитохрома Р450.
Дефицит этого энзима приводит к развитию синдрома конгениальной адренальной гиперплазии, частота которой составляет в популяции европеоидов 1/10000.
«Нормально» функцию энзимов кодирует ген CYP21; в то время как CYP21A является псевдогеном.
Дефицит 21-гидроксилазы (21-ОН) в 25% обусловлен делецией не только CYP21B, но и гена C4B в результате генной конверсии [46].
Гены С4 (С4А и С4Б) кодируют 4-й компонент комплемента. Этот сывороточный белок в 200 кД синтезируется как молекула-прекурсор, которая при созревании образует белок, состоящий из 3 цепей - альфа, бета и гамма (с мол. массой 75, 95 и 30 кД) соответственно.
Компоненты С4А и С4В различаются как по физическим свойствам, так и по биологической эффективности. Так, С4А в 100 раз эффективнее, чем С4В, связывает аминовые группы.
Анализ сиквенса С4А и С4В позволил установить различия в последовательности 6 аминокислотных остатков в α-цепи. Исследование полиморфизма С4 в различных популяциях представляет значительный интерес для изучения проблемы «HLA и болезни».
Так, в популяциях европеоидов наличие «нулевого аллеля С4А» в большинстве случаев ассоциировано с делецией сегмента региона HLA класса III, включающего гены С4А и CYP21A. Помимо этого наличие «нулевого аллеля» в гаплотипе ассоциировано с предрасположенностью к системной красной волчанке (СКВ) и другим аутоиммунным патологиям. Следует отметить, что только полное отсутствие С4 (результат гомозиготности в обоих локусах) также имеет выраженную ассоциацию с СКВ. Что касается ассоциации СКВ и HLA-гаплотипом в целом, то наиболее сильная связь с предрасположенностью к СКВ установлена для гаплотипа HLA-A1-B8-DR3-C4.
Непосредственно к С4А примыкает ген G11 в сторону теломеры [83] (рис. 2.2, см. цв. вклейку).
Ген G11 экспрессирован в моноцитах, макрофагах, Т- и В-лимфоцитах и клетках печени. Ген G11 кодирует белок с мол. массой 28 кД, но его функция неизвестна.
Ген В (Bf) функционирует в значительной степени совместно с геном С2, принимая участие в «запуске» каскада комплемента, включая активацию С3- и С5-компонента комплементов, кодирующихся генами, находящимися вне HLA-системы. Дефицит В-фактора описан только в гетерозиготе [89]. В гомозиготе дефицит В-фактора не описан и, по-видимому, является летальным.
Как С2-, так и Bf-гены полиморфны. Среди аллелей гена С2 наиболее часто встречается вариант С2С. При этом наиболее частотными в Bf-генах являются аллели F и S.
Дефицит С2 - наиболее частая форма недостаточности системы комплемента у человека (частота отсутствия С2 в гомозиготе 1:10000). У 40% больных СКВ обнаружен дефицит С2 [82]. Отсутствие С2 связано не с делецией участка ДНК, а с нарушением транскрипции мРНК [81].
На расстоянии 92 т.п.н. (тысяч пар нуклеотидов) от С2 в сторону от центромеры, в пределах локуса MHC класса III, находится кластер генов теплового шока 70 (HSP70 - 70 kilodalton Heat Shock Proteins), включающий 3 гена - HSP70-1 (HSPA1A в соответствии с номенклатурой HGNC), HSP70-2 (HSPA1B) и HSP70-HOM (HSPA1L). Первые два гена имеют сходную последовательность и кодируют практически идентичные белковые продукты [67]. Третий ген теплового шока, из расположенных на 6-й хромосоме, локализован на 4 т.п.н. дальше в сторону теломеры и также характеризуется высокой степенью гомологии с другими генами кластера. Белки, кодируемые данными генами, включают 641 аминокислотный остаток. Усиление экспрессии генов кластера HSP70 происходит в ответ на повышение температуры до 42°С.
Продукты HSPO-локуса играют определенную роль в интрацеллюлярном транспорте пептидов и вызывают развертывание белка перед преципитацией антигена [67].
Установлен также полиморфизм гена HSPO70-1 на уровне промоторного региона и HSP70-HOM на уровне кодирующего участка [67].
Крайним в сторону теломеры среди генов HLA класса III является локус TNF, отстоящий на 600 кД от локуса HLA-B [88]. В локус входят 2 гена А, кодирующие белок из 156 аминокислот, и TNF-B, кодирующий белок, включающий 171 аминокислоту.
Сиквенс генов TNF свидетельствует о 35% гомологии TNFa и ΤΝΡβ. Оба белка секретируются активированными макрофагами и Т-лимфоцитами и оказывают плейотропное действие на различные клеточные типы, включая различные субпопуляции лимфоцитов, нейтрофилы и эпителий сосудов [54].
Указанные механизмы действия белков TNF, а также их влияние на воспалительный процесс, опосредованный ими цитолитический и цитотоксический эффект против раковых клеток обеспечивают важнейшую биологическую функцию TNF [73].
Помимо этого белки TNF участвуют в регуляции экспрессии антигенов HLA класса I на эндотелии сосудов [61], что свидетельствует об участии TNF в развитии аутоиммунных патологий и при развитии отторжения трансплантации.
Представления о функции TNF в последние годы значительно расширились за счет появления работ, посвященных биологической роли отдельных полиморфизмов генов TNF. Так, в частности, было установлено [3], что наличие аллеля (-308)А в промоторе гена TNF связано с увеличенной продукцией белка TNFa клетками иммунной системы. Поэтому носители генотипа АА могут характеризоваться неадекватно увеличенной продукцией этого цитокина и, как следствие, более сильными воспалительными реакциями. Для этого же аллеля установлена ассоциация с повышенным риском развития аномалий центральной нервной системы. Установлено также, что женщины с бактериальным вагинозом - носители генотипа АА гена TNF (rs1800629) - имели высокий риск преждевременных родов [48, 63]. Найдены ассоциации аллеля (-308)F гена TNF с развитием эндотелиальной дисфункции у женщин при гестозе [5], а также с системным проявлением гестационной гипертензии во время беременности [26].
Недавно установленный ген G1, кодирующий полипептид, состоящий из 93 аминокислот, имеющий 35% идентичность с внутриклеточным Са2+ -связывающим белком кальмодулином и, по-видимому, выполняющий аналогичную кальмодулину функцию. Ген G картирован в центромере TNF (рис. 1.4, см. цв. вклейку). Гены HLA класса III, относящиеся к группе G, распределены в регионе HLA класса III дискретно. И часть их (ВАТ-гены) в настоящее время рассматриваются как отдельный локус.
Ген G13 кодирует белок 77 кД [56], принимающий участие в транскрипции HLA. Ген картирован на ближайшем к DRA конце региона HLA класса III (рис. 1.4, см. цв. вклейку).
В регионе генов HLA класса III большое количество новых генов, причем экспрессирующих, выявлено при изучении структурной организации комплекса МНС человека в рамках программы международных рабочих совещаний по изучению HLA. К ним следует отнести гены ВАТ1-9 (В-ассоциированные транскриптеры). Авторы, открывшие эти гены, ссылаясь на литературные данные и свои собственные результаты, не исключают возможности идентификации в этом регионе более чем 19 генов. К настоящему времени установлены белковые продукты двух генов, входящих в локус ВАT, - ВАТ2 и ВАТ3, это богатые пролином белки с мол. массой 228 и 110 кД соответственно [56].
Изучение биологической роли белков этих генов предполагает выполнение таких этапов, как отбор полноразмерных генов из библиотеки кДНК, секвенирование генов и их трансфекция, затем получение микробиальных продуцентов, синтезирующих полноразмерные белки, что, безусловно, требует достаточно много времени. В ближайшее время можно ожидать опубликования материалов, определяющих биологическую значимость этих генов и кодируемых ими белковых продуктов, в том числе и в патогенезе заболеваний.
Безусловно, обнаружение новых генов как в составе МНС, так и во фланкирующих его фрагментах ДНК имеет большую значимость. До сих пор не исключается возможность развития заболеваний человека, обусловленных нарушениями в структуре генов, локализованных рядом с генами главного комплекса тканевой совместимости I и II классов, или функциональной активностью кодируемых ими белковых продуктов. Кандидатами на эту роль могут быть в первую очередь гены серии ВАТ. Вполне возможно, что их белковые продукты участвуют во внутриклеточном процессинге антигенов, их транспорте и других событиях, в которых также участвуют МНС-молекулы I, II и III классов. Но в то же время это нисколько не противоречит данным, убедительно свидетельствующим о том, что аминокислотные замены в полиморфных эпитопах молекул тканевой совместимости II класса играют ключевую роль в нарушении физиологического иммунного гомеостаза и в запуске таких аутоиммунных заболеваний, как инсулин-зависимый сахарный диабет, псориаз и целиакия.
2.2. Протеомика главного комплекса тканевой совместимости человека
Для того чтобы лучше представить соотношение белковых молекул системы HLA и кодирующих их генов, нам представлялось целесообразным привести схему, предложенную R. Wassmuth, удачно сочетающую взаимоотношения указанных параметров [94]. Как следует из этой схемы (рис. 2.3, см. цв. вклейку), молекулы HLA класса I состоят из полиморфной α-цепи с мол. массой приблизительно 45 кД, а неполиморфная - β2-микроглобулин с мол. массой 11,5 кД, кодируемый геном, локализованным на 15-й хромосоме. Гликозилированная α-цепь состоит из трех экстрацеллюлярных доменов (α1 , α2 и α3 ), трансмембранного домена и интрацеллюлярного якоря (рис. 2.3, а, см. цв. вклейку). Экзонинтронная структура генов класса I в общем отражает деление на функциональные домены (рис. 2.3, б, см. цв. вклейку). Как правило, гены HLA класса I состоят из 8 экзонов, общей протяженностью 3500 п.н. Основной полиморфизм локализован в доменах α1 и α2, кодируемых экзонами 2 и 3. Пространственная структура HLA-антигенов класса I была определена на примере антигена HLA-A2 исследователями из группы П. Бъеркман [13, 14], использовавшими для анализа растворимый антиген HLA-А2, полученный отщеплением с помощью папаина надмембранного участка молекулы. Проведенный рентгеноструктурный анализ позволил построить пространственную модель HLA-A2 с точностью до 2,6 ангстрема. Антиген HLA-A2 состоит из 2 наборов структурно гомологичных доменов: один набор образуется за счет α3- и β2-m-доменов, расположенных по соседству с мембраной; другой набор формируется α1- и α2-доменами, расположенными в отдалении от поверхности клетки.
Как видно из общего вида молекулы, представленного на рис. 2.3 (см. цв. вклейку), α3- и β2-m-домены имеют структуру β-складчатого листа и, таким образом, напоминают константный участок иммуноглобулина. Молекула образуется за счет двух антипараллельных β-складок, соединенных внутренним дисульфидным мостиком. Одна складка состоит из 4, а вторая - из 3 β-последовательностей. Общая укладка α1- и α2-доменов не имеет ничего общего с константными и вариабельными участками иммуноглобулинов, хотя α2-домен и содержит дисульфидную связь, напоминающую связь подобного рода в иммуноглобулиновых доменах. Между доменом β2-m и доменами α1 и α2 наблюдают более плотный контакт, чем между α1- и α2- и наиболее близким к поверхности клетки α3-доменом, а β2-микроглобулин как бы поддерживает пространственно ориентированные α1- и α2-домены. Кроме того, β2-m-домен является стержневым для укладки α3-домена. Наибольший интерес представляет, безусловно, организация α1- и α2-доменов, так как именно эта часть молекулы ответственна за рестриктированное распознавание антигенов Т-клеточными рецепторами [41, 64]. Несмотря на то что гомология между такими доменами менее выражена, они имеют общую структурную организацию и происхождение, так как они появились вследствие дупликации генов.
Каждый из доменов состоит из антипараллельных β-тяжей, сформированных 4 фрагментами молекулы, дающими в итоге N-концевую часть. Далее у каждого из доменов имеется С-концевой α-спиральный район. При объединении доменов формируется «платформа» из β-тяжей двух доменов. α-Спирали располагаются по бокам этой сформированной «платформы» под углом 40° к ее оси, т.е. α1- и α2-домены образуют желоб или «корзину», дно которой образовано β-структурой, а боковые части - α-спиралями. Размер данного региона приблизительно составляет 25х10х11А. Он может связывать иммунодоминантные пептиды длиной 8-11 аминокислот.
Спиральные участки α1- и α2-доменов состоят из двух α-спиралей. Первая спираль α1-домена более короткая (1,5 оборота, аминокислотных остатков 50-55), за ней следует более длинная вторая α-спираль (7,5-8 оборотов, аминокислотных остатков 57-85); угол между ними 110°. Спиральный район а2-домена также начинается с короткой α-спиральной последовательности (около 3 оборотов, аминокислотных остатков 138148), затем следует длинная спираль (аминокислотных остатков 150-175); угол между ними 130°. Глубокий «желоб» между α-спиралями а1- и а2-доменов является антигенсвязывающим участком. На дне его имеются углубления - «карманы», принимающие непосредственное участие в связывании пептидов, обеспечивая надежность связи между пептидом и участвующим во взаимодействии с ним участком молекулы HLA. Размер всей молекулы составляет 70 А в длину, а ее экстрацеллюлярная часть - от 50 до 40 А в поперечнике [87].
Вслед за кристаллографическим анализом молекулы HLA-A2-антигена «в целом» был выполнен анализ молекул HLA-антигенов класса I, кодируемых уже аллельными вариантами HLA-A*68:01, HLA-A*02:01 и HLA-B*27:05 [41, 64].
Хотя сравнительный анализ пространственной структуры этих антигенов выявил их принципиальную близость, оказалось, что аминокислотные остатки α1- и α2-доменов варьируют между изученными аллельными вариантами молекул HLA класса I. Так, при сравнении трех молекул HLA-A*02:01, HLA-A*68:01 и HLA-B*27:05 было установлено, что различие между ними касается 11 аминокислот, находящихся в антигенсвязывающей бороздке. Эти различия при кристаллографическом анализе, в свою очередь, меняют очертания карманов антигенсвязывающего сайта [41, 64], что, естественно, отражается на характере связи.
Как указывалось, размер желоба таков, что в нем может разместиться пептид, состоящий из 9-11 аминокислотных остатков. При этом концы желоба у антигенов гистосовместимости класса 1 закрыты в результате взаимодействия боковых цепей аминокислотных остатков, α-спиральных участков и крайних β-тяжей.
Исследование структуры пептидов, способных взаимодействовать с продуктами определенных аллельных вариантов антигенов тканевой совместимости, позволило установить, что они имеют общие структурные черты, а именно наличие 2-3 консервативных участков последовательностей аминокислотных остатков. Боковые цепи этих аминокислот располагаются в карманах дна корзины, обеспечивая достаточно прочное связывание пептида. Как правило, пара карманов находится на участках, где располагаются N- и С-концевые фрагменты пептида, в то время как его центральная часть располагается свободно, что позволяет размещаться в бороздке пептидам разного размера и различной структуры. Профиль и характер (ионный, гидрофильный, гидрофобный) карманов варьируют от аллеля к аллелю, что также обеспечивает разнообразие взаимодействий в зависимости от аллельных специфичностей антигенов тканевой совместимости [87].
По данным рентгеноструктурного анализа [22], пространственная структура пептидсвязывающего участка антигена HLA класса II (HLA-DR1) имеет те же основные черты, что и у антигенов I класса HLA (рис. 2.3, а и б, см. цв. вклейку). Молекулы HLA класса II (рис. 2.3, а, см. цв. вклейку) состоят из тяжелой α- и легкой β-цепи с приблизительной молекулярной массой 33-35 кД и 29 кД соответственно. Обе цепи имеют два экстрацеллюлярных домена (α1, α2 и β1, β2), трансмембранный регион и интрацеллюлярный якорь (рис. 2.3, б, см. цв. вклейку). N-концевые α1- и β1-домены вместе образуют антигенсвязывающую бороздку молекул класса II. Трехмерная структура молекул HLA класса II имеет выраженное сходство со структурой молекул класса I [13, 90]. Это относится, в частности, и к антигенсвязывающей бороздке, которая также состоит из восьмиполосного β-складчатого листочка и двух α-спиралей.
В отличие от HLA-молекул класса I, антигенсвязывающая бороздка HLA-молекул класса II «открыта» с двух сторон, поэтому она может связывать более длинные фрагменты белков (15-30 аминокислот). При этом они могут выступать за пределы антигенсвязывающей бороздки. Ген α-цепи класса II состоит из 5 экзонов. Ген β-цепи несет добавочный экзон, кодирующий последовательности цитоплазматического домена. Наибольшим полиморфизмом отличаются N-концевые α1- и β1-домены, кодируемые экзоном 2. При этом связывающие сайты αβ-димеров имеют противоположную направленность. Пептид располагается в желобе в вытянутом положении [87].
Модель комплекса, образуемого пептидами с антигенами HLA, основана на представлении о том, что вариабельные аминокислотные остатки антигена, расположенные внутри желоба, ответственны за связывание с пептидами, а аминокислотные остатки, локализованные на находящихся внутри желоба участках α-спиралей или на их наружной поверхности, взаимодействуют с Т-клеточным рецептором. Именно это и является субстратом двойного распознавания, при котором Т-клеточный рецептор распознает чужеродный иммунодоминантный пептид только в контексте молекулы HLA.
Структурные исследования комплексов пептид-молекула HLA свидетельствуют о том, что один и тот же аллельный вариант антигена HLA может связывать целый ряд пептидов, обладающих общими структурными чертами (якорными аминокислотными остатками, обеспечивающими надежную связь с HLA-молекулой). Благодаря этому антигены, кодируемые различными аллелями HLA класса I и II, могут связывать тысячи различных пептидов [49]. При этом еще раз следует напомнить, что антигены HLA, серологически выявляемые как один антиген, но включающие в свой состав различные аллельные варианты, имеют различающийся профиль связи с этими пептидами. Понимание этого принципиально важно, поскольку, хотя речь идет о белковых молекулах HLA, осуществляющих презентацию тех или иных пептидов, прогнозировать то, как они будут представлены или будут ли они представлены вообще, можно уже на основании HLA-генотипирования, т.е. геномного анализа [72]. Таким образом, следует понимать, что различия, выявляемые на аллельном уровне, реализуются в возможности связывания конкретных пептидов внутри пептид-связывающей бороздки [80].
Следует также отметить, что имеется достаточно выраженный межаллельный полиморфизм в отношении связывания и презентации не только чужеродных, но и собственных пептидов, происходящих из HLA-молекул.
Последняя функция, роль которой, по-видимому, состоит в распознавании «свое-чужое», может также реализоваться и в патологическом процессе в случае нарушения количественного уровня представляемых аутопептидов, что бывает, например, при развитии аутоиммунных заболеваний [49, 60, 37]. Говоря о разнообразии в связывании и представлении пептидов, которое обеспечивает аллельный полиморфизм системы HLA, следует также отметить, что не все из молекул HLA, различающихся по кодирующему их аллельному варианту, имеют равные возможности в количестве связываемых ими тех или иных пептидов. Так, например, одна лишь специфичность - молекула HLA-A-2, кодируемая аллельным вариантом HLA-A*02:01, имеет 258 уже охарактеризованных лигандов, в то время как для большинства (двух третей) из числа молекул HLA-A различных специфичностей (учитывая все их аллельные варианты) эта цифра не превышает 10 [84]. При этом часть этих молекул может связывать только один конкретный пептид.
Такого рода различия не могут не сказаться на определенных преимуществах или, напротив, «изъянах» как в плане обеспечения развития специфического противовирусного иммунитета, так и в отношении выявления злокачественно трансформированных клеток и, соответственно, предотвращения развития онкологических заболеваний [43]. Таким образом, наличие в HLA-генотипе человека определенных аллельных вариантов тех или иных молекул HLA значительным образом влияет на реализацию иммунного ответа против факторов, существенно определяющих выживание данного индивида. В частности, не случаен поэтому тот факт, что HLA-A*02:01 является одним из высокочастотных аллельных вариантов, во всяком случае в большинстве европеоидных популяций. Этот факт - еще одно подтверждение важнейшей роли системы HLA в обеспечении выживаемости человека как биологического вида.
В большинстве случаев отдельно взятая молекула антигена тканевой совместимости способна связывать ограниченный круг пептидов. Поэтому для того чтобы отдельные чужеродные белки не могли избежать иммунологического распознавания, необходимо присутствие на клеточной мембране целого набора антигенов тканевой совместимости, включающих в гетерозиготном состоянии по 2 антигена каждого из локусов системы HLA. Отсюда же ясно, что HLA-гомозиготность организма по HLA-антигенам того или иного локуса является чрезвычайно невыгодным для него с физиологической точки зрения.
Помимо того что в генотипе конкретных лиц могут отсутствовать HLA-специфичности, способные связывать и представлять конкретные пептиды, в ряде случаев Т-клеточный рецептор не способен распознать пептид, представляемый конкретными антигенами класса II [78]. Результатом является ассоциированная с конкретным HLA-аллелем «неотвечаемость» организма на какой-то конкретный агент.
Следует также отметить, что подобная ситуация известна для антигенов HLA класса I, когда среди HLA аллелей класса I (локусы А и В), представляющих пептиды вируса инфлюэнцы, были выявлены аллельные варианты, при которых не происходило Т-клеточного распознавания в HLA-рестриктированном ответе [34].
В настоящее время анализ HLA-генотипов на уровне установления аллельного полиморфизма в сопоставлении с данными об иммуногенных эпитопах конкретных возбудителей заболеваний позволяет объяснять факты резистентности отдельных индивидов к тем или иным инфекциям [47, 23] и предсказывать, каким образом та или иная вакцина, и в первую очередь построенная на пептидной основе, будет «работать» среди представителей конкретной этнической группы в зависимости от HLA-профиля последней [9, 75, 86].
Естественно, что обязательным компонентом для реализации указанного достижения молекулярной генетики является необходимость знания HLA-профиля этнических групп, населяющих ту или иную страну или регион. Это особенно важно для такой многонациональной страны, как Россия, в которой HLA-профиль населяющих ее этнических групп весьма различен [4].
Что же касается вопроса о возможности оценки способности развивать иммунный ответ на конкретный иммунодоминантный пептид, в том числе определяющий защиту того или иного организма от патогенов, включая особо опасные инфекции, то такая возможность в последние годы появилась также благодаря дальнейшему развитию исследований, проводимых в области изучения молекулярных основ участия антигенов HLA в развитии иммунного ответа.
Был разработан принципиально новый метод, основанный на использовании мультимерных комплексов молекул HLA с представляемыми ими пептидами. Этот метод, используемый сегодня в тетрамерных и пентамерных вариантах, позволяет на молекулярном уровне оценивать как саму способность, так и эффективность Т-клеточного иммунного ответа человека с тем или иным генотипом на конкретный иммунодоминантный пептид. Более того, появилась принципиально новая возможность прогнозировать эффективность (по проценту населения, способного эффективно отвечать на иммунизацию) вновь создаваемых вакцин в определенной популяции людей в зависимости от HLA-генетического профиля. Одновременно с этим появляется возможность осуществлять на основании проведения мультимерного анализа образцов крови HLA-генотипированных лиц ретроспективную оценку состояния иммунологической защиты у лиц, иммунизированных в предыдущее время.
Естественно, что все сказанное выше относится только к группам населения, для которых заранее установлен характерный для них HLA-генетический профиль. Несмотря на то что подобные исследования на территории России ведутся уже более 20 лет, в том числе в рамках международной программы «HLA и антропология», в силу чрезвычайно выраженного этнического разнообразия населения страны, до настоящего времени на ее территории имеется еще целый ряд необследованных регионов.
Таким образом, следует еще раз подчеркнуть, что выполнению всего многообразия функций системы HLA способствует ее крайне выраженный полиморфизм, который определяется как наличием различных классов антигенов HLA, так и достаточно сложной их организацией. Этому же способствует кодоминантный тип наследования HLA-антигенов, при котором каждый человек получает по половине своего HLA-генотипа от каждого из родителей, т.е. из каждого локуса, кодирующего два антигена, один генотип наследует от отца и один от матери.
2.3. Генетический полиморфизм HLA и осуществление процессинга и презентации пептидов
Как показано на рис. 1.5 (см. цв. вклейку), одной из важнейших функций системы HLA, реализуемой на ранних этапах развития иммунного ответа и лежащей в основе его регуляции, являются процессинг и презентация иммунодоминантных пептидов - продуктов внутриклеточного протеолиза чужеродных антигенов, против которых и будет индуцирован, а затем и разовьется иммунный ответ [21, 49, 45]. Этой функции антигенов системы HLA способствует само строение ее молекул, которое, несмотря на выраженное различие в структуре молекулы HLA-антигенов класса I и II, позволяет образовать на внешнем ее конце так называемую пептид-связывающую бороздку, в которой и удерживается представляемый для распознавания пептид.
Принципиальная схема представления пептидов антигенами HLA класса I и класса II приведена ранее. Общим для антигенов класса I и II является следующее. Антигенпредставляющая клетка осуществляет свое специфическое взаимодействие, представляя пептид в контексте собственной HLA-молекулы, идентичной таковой на клетке, воспринимающей информацию. Именно за установление этого феномена, названного феноменом двойного распознавания, Р.М. Цинкернагель и П.С. Доэрти получили Нобелевскую премию. Действительно, установление этого феномена стало ключевым моментом в понимании основ регуляции иммунного ответа. В то же время видны и существенные различия между взаимодействием, обеспечиваемым в процессе иммунного ответа антигенами HLA класса I и II. Во-первых, антигены HLA класса II обеспечивают взаимодействие антигенпрезентирующей клетки с Т-хелпером, а антигены HLA класса I - c Т-эффектором-киллером. Во-вторых, помогают им в этом различные молекулы-корецепторы: CD4 для Т-хелперов и CD8 для Т-киллеров. Естественно, что различным будет и эффект этого взаимодействия. Так, распознавание пептидов в контексте молекулы HLA класса II ведет к формированию популяции клеток Тh1 и Тh2, одни из которых индуцируют развитие гуморального иммунного ответа, а другие являются необходимым компонентом в индукции Т-киллеров. Что же касается антигенов гистосовместимости класса I, то Т-киллер, индуцированный против иммунодоминантного пептида, экпрессированного на поверхности клеток-мишеней в контексте HLA-антигенов класса I, идентичного таковым, экспрессированным на Т-киллере, уничтожит их. Следует еще раз подчеркнуть, что оба эти важнейших звена «нормального», т.е. физиологического, иммунного ответа строго ограничены набором HLA-антигенов, кодируемых конкретным аллельным вариантом, характерным для конкретного человека. В том случае, если пептид был бы представлен для распознавания клеткой, отличающейся по HLA-антигенам от распознающих клеток, то иммунный ответ развивался бы против этих представляющих клеток, т.е. в этом случае речь будет уже идти о развитии трансплантационного иммунитета.
Как указывалось выше, большое значение для формирования современных представлений о физиологической роли HLA-антигенов имело установление роли новых HLA-генов: DM, LMP и TAP. Это, в свою очередь, позволило конкретизировать представление о реализации функции HLA-антигенов. Их функция хорошо видна на рис. 1.5 (см. цв. вклейку).
Так, из числа антигенов, кодируемых системой HLA, первыми в систему процессинга антигенов, имеющих эндогенное происхождение (вирусы, собственные измененные и даже неизмененные антигены), включаются продукты локуса LMP (гены LMP2 и LMP7), активируемые γ-интерфероном и затем инкорпорируемые в протеосомы [20, 92]. Ген LMP2 также известен, как RING12, а LMP7 - как RING10. Аббревиатура LMP расшифровывается как Large Multifunctional Protease, а аббревиатура RING - как Really Interesting New Genes. Ген LMP2 находится в неравновесном сцеплении с геном ТАР1. Впервые данные гены были описаны и картированы в регионе 6-й хромосомы, находящемся между генами ТАР [44, 55]. Четыре входящих в систему HLA гена - LMP2 LMP7 и RING4, RING11- составляют кластер генов, ответственный за индукцию интерферонов [33, 34, 39], и именно с этим связан механизм действия генов LMP2 и LMP7 в плане активации протеосом. Возможным механизмом действия продуктов генов LMP2 и LMP/является замена ими, под влиянием индукции γ-интерферона, двух протеосомных субъединиц Y и X [8, 38].
Молекулы МНС класса I синтезируются в цитозоле клетки, где до появления соответствующего пептида находятся в связи с так называемым тирозин-калретикулиновым комплексом. После связывания с пептидом происходят высвобождение молекул HLA и транспорт на поверхность клеток также кодируемых МНС «пептидных насосов» ТАР (от транспортеров, ассоциированных с антигенным процессингом) [19, 91]. Данные гены известны так же как RING4 и -12 и PSF1 и 2 соответственно (PSF - Peptide Supply Factor). Последнее название отражает функцию данных молекул, которая в целом состоит в том, что они регулируют размер и специфичность пептидов, приводя их в «соответствие» со связывающими сайтами молекул МНС класса I [49]. Эти гены аналогичны Haml и Ham2, открытым ранее у мышей.
В 1993 г. было установлено, что гетеродимеры ТАР-1 и ТАР-2 участвуют в окончательной сборке молекул антигенов класса I и презентации ими эндогенных пептидов [70]. Молекулы, кодируемые геном ТАР2, находятся в неравновесном сцеплении с антигенами HLA-DR, и между генами ТАР1 и ТАР2 имеется высокая частота рекомбинаций [28, 53]. Установлено, что некоторые мутации в районе генов HLA-TAP ведут к потере презентирующей функции антигенов тканевой совместимости класса I [6]. Вполне возможно, что с нарушением антигенпрезентирующей функции ТАР-антигенов может быть связан высокий уровень ассоциации между аллелями гена ТАР1 и предрасположенностью к развитию такого аутоиммунного заболевания, как инсулинзависимый сахарный диабет [50]. В то же время имеется исследование о том, что один из аллелей ТАР1-локуса, а именно R659Q, для которого характерен дефект транскрипции РНК, выявляется на клетках мелкоклеточного рака легких [25, 7]. Наконец, имеются данные [31, 32] о том, что при синдроме Луи-Бар, характеризуемом наличием «голых Т-лимфоцитов», нарушение экспрессии антигенов HLA класса I связано именно с гомозиготным состоянием аллелей гена ТАР2.
Несмотря на то что данная работа посвящена изложению представлений о физиологической функции системы HLA, мы сочли целесообразным обсудить как вышеизложенные, так и некоторые последующие данные в связи с тем, что они иллюстрируют то, к чему приводят нарушения или полная утрата функции молекул HLA.
В отличие от молекулы класса I, обе цепи молекулы МНС класса II синтезируются в эндоплазматическом ретикулуме, откуда после их временного соединения с третьей инвариантной цепью они транспортируются в эндоцитарный компартмент, где они или встречаются и затем связываются с пептидом, имеющим экзогенное происхождение, или же (если этого не произошло) деградируют в лизосомах. После связи с пептидом, заменяющим инвариантную цепь, молекулы МНС класса II переходят на клеточную мембрану [20, 44]. Вытеснение пептидом инвариантной цепи молекул HLA класса II обеспечивают белки, также кодируемые системой HLA и названные HLA-DM. Эти белки катализируют замену «временного» пептида инвариантной цепи на специфический пептид [20, 59].
В систему DM входят 2 гена - DMA и DMB. Анализ последовательности аллелей, входящих в DMA- и DMB-гены, привел к заключению [76, 55, 74, 91], что они являются более древними, чем классические молекулы генов HLA класса II. T.R. Mosmann и соавт. [69] на основании мутационного анализа картировали DMA- и DMB-гены между локусами DP и DQ (рис. 1.4, см. цв. вклейку).
Роль антигенов HLA-DM является решающей в презентации экзогенных пептидов молекулами класса II [69]. Механизм их действия состоит в удалении временно связывающей пептид молекулы CLIP (см. рис. 1.5, см. цв. вклейку) и освобождении связывающего сайта молекулы HLA класса II для его замещения пептидом, происходящим из экзогенного агента. Дефект функции HLA-DM ведет к нарушению замены молекулы CLIP на пептид и отмене антигенпрезентирующей функции молекул класса II [95].
В целом следует отметить, что, хотя данные о новых системах HLA-LMP, -TАР и -DM являются еще далеко не окончательными, уже сейчас ясно, что они выполняют в иммунном ответе важнейшую роль, обеспечивая физиологическую презентацию процессированных пептидов для дальнейшего развития иммунного ответа.
По-видимому, с нарушениями их функций связаны некоторые формы иммунодефицитных состояний человека, в основе которых лежит потеря возможности экспрессии HLA на иммунокомпетентных клетках [62].
Потеря способности к экспрессии молекул HLA на мембранах клеток является также одним из основных патогенетических звеньев развития онкологических заболеваний. Во всяком случае, в пользу этого свидетельствуют данные, приведенные в табл. 2.2.
Таблица 2.2. Полная или частичная потеря экспрессии антигенов HLA на онкологически перерожденных клетках различного типа
Тип опухоли | Количество случаев опухолей с потерей экспрессии,% | Авторы |
---|---|---|
Цервикальная карцинома |
90 |
1. Keating P.J., Cromme F.V., Duggan-Keen M. et al. // Br. J. Cancer. - 1985. - Vol.72. - P.405. 2. Koopman L.A., Corver W.E., van der Silk A.R. et al. // J. Exp. Med. - 2000. - Vol. 191. - P. 961 |
Опухоли молочной железы |
88 |
Cabrera T., Fernandez M.A., Sierra A. et al. // Hum. Immunol. - 2000. - Vol. 61. - P. 499 |
Колоректальная локализация рака |
73 |
Cabrera T., Collado A. Fernandez M.A. et al. // Tissue Antigens. - 1996. - Vol. 50. - P. 127 |
Меланома |
51 |
Ferrone S., Marincola F.M. // Immunol. Today. - 1995. - Vol. 6. - P. 487 |
Рак гортани |
66 |
Cabrera T., Salinero J., Fernandez M.A. et al. // Hum. Immunol. - 2000. - Vol. 61. - P. 499 |
Как указывалось выше, в целом связь между молекулами HLA и пептидами имеет много общего для антигенов HLA класса I и II. Однако и здесь имеются серьезные отличия. Так, пептид удерживается в связывающей складке молекулы HLA класса I, за счет связи его N- и C-окончаний с определенным мотивом «аллель-специфического» участка МНС, а также за счет связи боковых цепей пептида с боковыми карманами молекулы МНС. Длины пептидов, связывающихся с молекулой HLA класса I, - 8-10 аминокислот [19].
Пептиды, связывающиеся с молекулой HLA класса II, более гетерогенны - 9-25 аминокислот. Связывающая бороздка молекул HLA класса II, в отличие от класса I, «открыта» для связывания с двух сторон, что создает возможность большего полиморфизма в связях HLA-пептид. Более того, в молекуле класса II зоны связывания могут выходить даже за связывающую складку. Все это дает возможность «аккомодации» более широкого спектра пептидов к молекулам HLA класса II по сравнению с классом I [20].
Переход исследований HLA на молекулярно-генетический уровень позволил по-новому взглянуть на физиологическую функцию системы HLA. Так, молекулы МНС приобретают стабильную форму и соответствующую трехмерную конфигурацию только после того, как в связывающий сайт ее складки встраивается пептид. Только после этого молекула МНС способна мигрировать на поверхность клетки, где она готова выполнить свои функции. Удаление пептида из пептид-связывающей структуры МНС, экспрессированной на клеточной мембране, нарушает ее трехмерную конфигурацию, лишая ее возможности функционировать, и ведет к ее гибели [52, 79]. Комплекс МНС-пептид является чрезвычайно стабильным, очищается и кристаллизируется в единой структуре. Этот комплекс остается на поверхности клетки в течение нескольких недель, что позволяет многим «проходящим» Т-клеткам сканировать представляемый собственной молекулой МНС-пептид. Наконец, каждый пептид связывается (и удерживается в складке) с инвариантным участком, характерным для каждого из аллелей молекулы МНС и имеющим определенный мотив аминокислотных остатков, участвующий в таком связывании. Таким образом, в связь с конкретным пептидом вовлекаются конкретные же участки антигенов - аллельные варианты молекул МНС, что, по сути, и является основой генетического контроля иммунного ответа. Это положение хорошо иллюстрируют данные о том, что пептид вируса герпеса связывается с гаплотипом HLA-DQA1*05:01-DQB1*20:01, но не HLA-DQA1*02:01-DQB1*201. Различие между ними в цепи DQA1 составляет 15 аминокислотных остатков [58].
Установление этого факта и имеющаяся в настоящее время возможность анализировать аминокислотные последовательности всех аллельных вариантов антигенов HLA, включая участки, определяющие их специфичность, а также структуру пептидов, определяющих специфичность различных чужеродных агентов, включая болезнетворные, позволяют заранее предсказать соответствие тех или иных иммунодоминантных пептидов тем или иным участкам молекулы МНС. Таким образом, можно заранее предсказать генетическую отвечаемость или неотвечаемость на тот или иной агент.
В свою очередь, это дает возможность не только заранее решить вопрос о том, ответит ли данный индивидуум на вакцинацию против того или иного болезнетворного агента, а также - насколько этот ответ будет физиологичен. Это, в свою очередь, позволит прогнозировать возможность развития ряда заболеваний аутоиммунного генеза (например, ревматоидный артрит и инсулинзависимый сахарный диабет), в генезе которых, возможно, лежит идентичность иммунодоминантных пептидов, имеющихся в структуре конкретных инфекционных агентов и конкретных эпитопов молекул HLA, кодируемых теми или иными аллельными вариантами генов HLA [42, 10].
Хотя описанный выше механизм распознавания пептидов в контексте антигенов тканевой совместимости является в целом универсальным, из него, по видимому, есть отдельные исключения, и в первую очередь это может относиться к распознаванию чужеродных (аллогенных) антигенов тканевой совместимости. Такая ситуация бывает, по крайней мере, в двух случаях: во-первых, при пересадке органов и тканей; а во-вторых, при беременности.
Как указывалось, одной из основных функций молекул HLA класса II является презентация иммунодоминантных пептидов для их распознавания Т-клеточным рецептором (TCR - T Cell Receptor).
Именно благодаря этому распознаванию TCR контролируют весь спектр различных комплексов HLA-пептид, которые постоянно презентируются на клеточной поверхности [40]. Имеется два различных семейства генов, кодируемых либо αβ-, либо γδ-Т-клеточными рецепторами. αβ-Т-клеточные рецепторы экспрессируются на 95% всех Т-клеток и проявляют большую вариабильность по сравнению с γδ-Т-клеточными рецепторами. Поэтому далее вопрос о взаимодействии Т-клеточных рецепторов будет сфокусирован на αβ-рецепторах. Вариабельность в αβ-Т-клеточных рецепторах определяется случайной генной реорганизацией, комбинаторикой, удалениями (делециями) или добавлениями N-региона, возникающими в различных сегментах генов Т-клеточных рецепторов, которые реорганизуются во время развития в тимусе [30]. Гены β-цепи TCR составляют кластер множественных V-регионов, разнообразных сегментов (D) и примыкающих областей (J), которые беспорядочно создают различные VDJ-комбинации. Гены α-цепи TCR также составляют кластер множественных V-регионов и примыкающих областей (J), которые создают различные VJ-комбинации. Предположительный потенциальный репертуар уникальных Т-клеточных рецепторов (1015) намного превосходит реальное количество человеческих Т-клеток (1011-1012) [30].
TCR сами по себе являются чрезвычайно неустойчивой полиморфной структурой со сложным молекулярным механизмом генерации гигантского репертуара αβ-TCR. Разумеется, это позволяет адаптивной Т-клеточной системе предоставлять значительное число возможных рецепторов для распознавания сравнительно большого ряда чужеродных антигенов (в том числе возбудителей широкого спектра инфекционных заболеваний, как в нативной форме, так и в составе вакцин). Однако, несмотря на видимый прогресс в понимании структурно-функциональных отношений между молекулами и Т-клеточными рецепторами, существует достаточно спорных вопросов в Т-клеточном распознавании комплексов HLA-пептид, которые еще не решены. Неясно, как организованы корецепторы CD4 и CD8 при совместном распознавании комплексов МНС-пептид, и недостаточно изучены механизмы, с помощью которых сигналы передаются внутрь Т-клетки. В самом деле более высокая организация трехмерной структуры антигенспецифического Т-клеточного рецептора в комплексе с инвариантными сигнальными компонентами CD3 пока не установлена, несмотря на все усилия. Видимо, решение данных и многих других проблем способно осветить не только работу иммунной системы, но и более общие принципы, управляющие комплексами клеточных взаимодействий. Когда появятся молекулярные решения так часто встречаемых проблем распознавания, можно будет разработать стратегии вмешательства в предсказуемые отрицательные последствия такого распознавания, например аутоиммунитет или иммунная дисфункция, или же напротив - разработать стратегии вмешательства в целях преодоления «неотвечаемости» на конкретный иммунодоминантный эпитоп, что особенно важно при разработке эффективных вакцин.
В целом, можно сказать, что уникальное строение генома и протеома HLA обеспечивает выполнение важнейших регуляторных механизмов в организме человека. Из числа наиболее важных следует отметить следующие.
-
Распознавание собственных, чужеродных и собственных измененных клеток, запуск и реализация иммунного ответа против них.
-
Обеспечение процессинга и презентации иммунодоминантных пептидов - индукторов и мишеней иммунного ответа.
-
Поддержание генетического разнообразия человека как вида на всех этапах репродуктивного процесса, в том числе на пренатальном, интранатальном и постнатальном уровнях.
-
Участие в регуляции определенных этапов врожденного иммунного ответа.
-
Нарушение указанных биологических функций лежит в основе целого ряда заболеваний человека, включая онкопатологию, аутоиммунные патологии, атопии и инфекционные заболевания.
Способность распознавать антиген является важнейшим свойством лимфоцитов и обеспечивается присутствием на их поверхности специализированных антигенраспознающих рецепторов (исключение составляют ЕКК, не имеющие такого рецептора) [51].
Именно молекулы HLA ответственны за осуществление отрицательной селекции клонов, которая состоит в «выбраковке» клонов, специфичных комплексам аутологичных пептидов с аутологичными молекулами HLA (т.е. потенциально аутоагрессивных клонов), которые подвергаются «программированной гибели» или апоптозу [93].
Выжившие в результате селекции клоны Т-лимофоцитов несут рецепторы, способные распознавать чужеродные пептиды в комплексе с аутологичными молекулами HLA [57]. Специфичность этих клонов определяет «вторичный антигенраспознающий репертуар» лимфоцитов, т.е. специфику реакций зрелых лимфоцитов на антигены [29].
Таким образом, система HLA закладывает и осуществляет контроль и регуляцию иммунного ответа человека, с одной стороны, препятствуя аутоагрессии, а с другой - осуществляя надзор за появлением в организме чужеродных клеток (включая собственные перерожденные).
Наиболее хорошо изученным аспектом регуляторной роли HLA в иммунном ответе является его адаптивный компонент, что объясняется тем, что само развитие проблемы биологической роли HLA началось с клинической трансплантологии, где, естественно, превалирует адаптивный иммунитет, а также тем, что всю вторую половину XX в. внимание исследователей было сосредоточено на адаптивном иммунитете. Тем не менее уже в 1980-х годах, в рамках исследования регуляторной роли HLA, большое внимание уделялось направлению «HLA и качество иммунного ответа». С современных позиций это направление следует рассматривать как «HLA и врожденный иммунитет», поскольку основными объектами изучения иммунного ответа были классические факторы врожденного иммунитета, как то: фагоцитоз, активность ЕКК-ответа на поликлональные митогены и уровень иммуноглобулинов в сыворотке крови.
К настоящему времени удалось не только установить выраженную взаимосвязь между конкретными HLA-генотипами и активностью указанных показателей врожденного иммунитета, но и получить данные о том, что этот вид HLA-ассоциированной регуляции врожденного иммунитета имеет выраженное различие на межэтническом уровне.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
-
Алексеев Л.П., Дедов И.И., Болдырева М.Н. и др. HLA-гены - маркеры инсулин-зависимого сахарного диабета, этнические аспекты // Иммунология. - 2003. - Т. 24. - № 5. - C. 308-11.
-
Болдырева М.Н., Хаитов Р.М., Дедов И.И. и др. Новый взгляд на механизм HLA-ассоциированной предрасположенности к сахарному диабету 1 типа. Теоретические и прикладные аспекты // Иммунология. - 2005. - Т. 26. - № 6. - С. 324-9.
-
Выдловская А.В., Симбирцев А.С. Функциональный полиморфизм гена и патология // Цитокины и воспаление. - 2005. - № 3. - С. 4-10.
-
Петров Р.В., Хаитов P.M., Атауллаханов Р.И. и др. Супрессия антителогенеза костномозговыми В-лимфоцитами в культуре клеток селезенки мышей разных генотипов // ДАН СССР. - 1977. - Т. 233, № 4. - С. 745-8.
-
Радьков О.В., Калинкин М.Н., Заварин В.В. Влияние полиморфизма генов цитокинов на формирование дисфункции эндотелия при гестозе // Цитокины и воспаление. - 2010. - № 3. - С. 15-18.
-
Хаитов P.M. В-клеточная регуляция иммунной системы // Иммунология. - 1987. - № 3. - С.10-13.
-
Хаитов P.M. Физиология иммунной системы // Рос. физиол. журн. им. И.М. Сеченова. - 2000. - Т. 86, № 3. - С. 252-67.
-
Akiyama K., Yokota K., Kagawa S. et al. cDNA cloning and interferon gamma down-regulation of proteasomal subunits X and Y// Science. - 1994. - Vol. 265. - P. 1231-4.
-
Altman J.D., Moss P.A., Goulder P.J. et al. Phenotypic analysis of antigen-specific Τ lymphocytes // Science. - 1996. - Vol. 274. - P. 94-96.
-
Auger I., Lepecuchel L., Mugnier B., Roudier J. HLA-DRB1 motifs and heat shock proteins // 14th European Histocompatibility Conference, 4-7 April 2000, Montpellier, France. - 2000. - P. 35.
-
Bahram S., Bresnahan M., Geraghty D.E. et al. A second lineage of mammalian major histocompatibility complex class I genes // Proc. Natl. Acad. Sci. - 1994. - Vol. 91. - P. 6259-63.
-
Bauer S., Groh V., Wu J. et al. Activation of NK cells ad Τ cells by NKG2D, a receptor for stress-inducible MICA // Science. - 1999. - Vol. 285. - P. 727-9.
-
Bjorkman P.J., Saper M.A., Samraoui B. et al. Structure of the human class I histocompatibility antigen, HLA-A2 // Nature. - 1987. - Vol. 329. - P. 506-12.
-
Bjorkman P.J., Saper M.A., Samraoui B. et al. The foreign antigen binding site and Τ cell recognition regions of class I histocompatibilty antigens // Nature. - 1987. - Vol. 359. - P. 512-8.
-
Bodmer J., Bodmer W.F., Heyes J. et al. Indication of HLA-DP polymorphism with DPα and DPβ probes and monoclonal antibodies: correlation with primed lymphocyte typing // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1987. - Vol. 84. - P. 4596-600.
-
Bodmer J.G., Marsh S.G., Albert E.D. et al. Nomenclature for factors of the HLA system // Tissue Antigens. - 1996. - Vol. 49. - P. 297-321.
-
Bodmer W. HLA: What’s in a name? A commentary on HLA nomenclature development over years // Tissue Antigens. - 1997. - Vol. 46. - P. 293-6.
-
Bodmer W. HLA Polymorphism: origin and maintenance // In: HLA 1997, P. Terasaki and D. Gjertson, eds. - 1998. - P. 1-7.
-
Bresnahan P.A., Barber L.D., Brodsky F.M. Localization of class I histocompatibility molecule assembly by subfraction of the early secretory pathway // Hum. Immunol. - 1997. - Vol. 53. - № 2. - Р. 129-139.
-
Brodsky F.M., Lem L., Bresnahan P.A. Antigen Processing and Presentation // Tissue Antigens. - 1996. - Vol. 47, № 6. - Р. 464-71.
-
Brodsky F.M., Lem L., Solache A., Bennett E.M. Human pathogen subversion of antigen presentation // Immunol. Rev. - 1999. - Vol. 168. - P. 199-215.
-
Brown J.H., Jaredtzky T., Gorga J.C. et al. Three dimensional structure of the human class II histocompatibility antigen HLA-DR1 // Nature. - 1993. - Vol. 364. - P. 33-9.
-
Carrington M., Nelson G.W., Martin M.P. et al. HLA HIV-1: heterozygote advantage B℘ 5-Cw*04 disadvantage // Science. - 1999. - Vol. 283. - P. 1748-52.
-
Cerundelo V., Alexander J., Anderson K. et al. Presentation of viral antigen controlled by a gene in the major histocompatibility complex // Nature. - 1990. - Vol. 345. - P. 449-52.
-
Chen H.L., Gabrilovich D., Tampe R. et al. A functionally defective allele of TAP1 results in loss of MHC class I antigen presentation in a human lung cancer // Nature Genet. - 1996. - Vol. 13. - P. 210-3.
-
Chen Y.-P., Pfab T., Slowinski T. et al. Impact of genetic variation of tumor necrosis factor-α on gestational hypertension // Chin. Med. J. - 2006. - Vol. 119. - P. 71924.
-
Cohen C.R., Gichui J., Rukaria R. et al. Immunogenetic correlates for CHLAmydia trachomatis-associated tubal infertility // Obstet. Gynecol. - 2003. - Vol. 101. - № 3. - P. 438-44.
-
Cullen M., Erlich H., Klitz W. et al. Molecular mapping of a recombination hotspot located in the second intron of the human TAP2 locus // Am. J. Hum. Genet. - 1995. - Vol. 56. - Р. 1350-8.
-
Cumano P., Kee B.L., Ramsden D.E. et al. Development of B-lymphocytes from lymphoid committed and uncommitted progenitore // Immunol. Rev. - 1994. - Vol. 137. - P. 5-33.
-
Davis M.M., Bjorkman P.J. T-cell antigen receptor genes and T-cell recognition. // Nature. - 1988. - Vol. - 334, № 6181. - Р. 395-7.
-
de la Salle H., Hanau D., Fricker D. et al. Homozygous human TAP peptide transporter mutation in HLA class I deficiency // Science. - 1994. - Vol. 265. - P. 237-41.
-
de la Salle H., Donato L., Zimmer J. et al. HLA class I deficiencies // In: Ochs H.D.; Smith C.I.E., Puck J.M. (eds): Primary Immunodefficiency Diseases: A Molecular and genetic Approach. New York: Oxford University Press. - 1999. - P. 181-8.
-
Deng G.Y., Muir A., Maclaren N.K. She J-X: Association of LMP2 and LMP7 genes within the major histocompatibility complex with insulin-dependent diabetes mellitus: population and family studies // Am. J. Hum. Genet. - 1995. - Vol. 56. - P. 528-53.
-
Driscoll J., Brown M.G., Finley D. et al. MHC-linked LMP gene products specially alter peptidase activities of the proteasome // Nature. - 1993. - Vol. 365. - P. 262-4.
-
Ellis S.A., Palmer M.S., McMichael A.J. Human trophoblast and the choriocarcinoma cell line be Wo express a truncated HLA class I molecule // J. Immunol. - 1990. - Vol. 144. - P. 731-5.
-
Erlich H., Stetler D., Sheng-Dong R. et al. Analysis by molecular cloning of human class II genes // Fed. Proc. - 1984. - Vol. 43. - P. 3025-30.
-
Falk K., Rotzschke O., Takiguchi M. et al. Peptide motifs of HLA-A1-A11-A31, and -A33 molecules // Immunogenetics. - 1994. - Vol. 40. - P. 238-41.
-
Fehling H.J., Swat W., Laplace C. et al. MHC class I expression in mice lacking the proteasome subunit LMP-7 // Science. - 1994. - Vol. 265. - P. 1234-7.
-
Gaczynska M., Rock K.L., Goldberg A.L. Gamma-interferon and expression of MHC genes regulate peptide hydrolysis by proteasomes // Nature. - 1993. - Vol. 365. - P. 264-7.
-
Garcia К.С., Teyton L., Wilson I.A. Structural basis of T cell recognition // Ann. Rev Immunol. - 1999. - Vol. 17. - P. 369-71.
-
Garrett T.P.J., Saper M.A., Bjorkman P.J. et al. Specificity pockets for side chains of peptide antigens in HLA-Aw68 // Nature. - 1989. - Vol. 342. - P. 692-5.
-
Gergely P. New immunological aspects of reumatoid arthritis // Allergology & Clinical Immunology International. March/April. - 2000. - Vol. 12. - № 2. - Р. 77-81.
-
Germain R.N. The ins and outs of antigen processing and presentation // Nature. - 1986. - Vol. 322. - P. 687-9.
-
Glynne R., Powis S.H., Beck S. et al. A proteasome-related gene between the two ABC transporter loci in the class II region of the human MHC // Nature. - 1991. - Vol. 353. - P. 357-60.
-
Guargliardi L.E., Koppebnan B., Blum J.S. et al. Co-localization of molecules involved in antigen processing in an early endocytic compartment // Nature. - 1990. - Vol. 343. - P. 133-9.
-
Higashi Y., Tanae A., Inoue H.H. et al. Evidence for frequent gene conversion in the steroid 21-hydroxylase P-450 gene (C21) gene: implications for steroid 21 hydroxylase deficiency // Am. J. Hum. Genet. - 1988. - Vol. 42. - P. 17-25.
-
Hill A.V.S., Allsopp C.E., Kwiatkowski D. et al. Common West African HLA antigens are associated with protection from severe malaria // Nature. - 1991. - Vol. 352. - P. 595-600.
-
Himes K.P., Simhan H.N. Genetic susceptibility to infection-mediated preterm birth // Infect. Dis. Clin. N. Am. - 2008. - Vol. 22. - P. 741-53.
-
Huczko E.L., Bodnar W.M., Benjamin D. et al. Characteristics of endogenous peptides eluted from the class I MHC molecule HLA-B7 determined by mass spectrometry and computer modeling // J. Immunol. - 1993. - Vol. 151. - P. 2572-87.
-
Jackson D.G., Capra J.D. TAP1 alleles in insulin-dependent diabetes mellitus: a newly defined centromeric boundary of disease susceptibility // Proc. Natl. Acad. Sci. - 1993. - Vol. 90. - P. 11079-83.
-
Janeway C.A. The T cell receptor as a multicomponent signalling machine: CD4/ CD8 coreceptors and CD45 in T cell activation // Ann. Rev. Immunol. - 1992. - Vol. 10. - P. 645-74.
-
Janeway C.A. Functions of the MHC: Presentation of antigens to T cells. Plenary report at ASHI 23rd Annual Meeting, October 14-19, 1997, Atlanta, Georgia. - 1997. - P. 27-42.
-
Jeffreys A.J., Ritchie A., Neumann R. High resolution analysis of haplotype diversity and meiotic crossover in the human TAP2 recombination hotspot // Hum. Molec. Genet. -2000. - Vol. 9. - P. 725-33.
-
Kehrl J.H., Alvarez-Mon M., Delsing G.A. et al. Lymphotoxin is an important T cell-derived growth Factor for human B cells // Science. - 1987. - Vol. 238. - P. 1144-6.
-
Kelly A., Powis S.H. Glynne R. et al. Second proteasome-related gene in the human MHC class II region // Nature. - 1991. - Vol. 353. - P. 667-8.
-
Khanna A., Campbell R.D. Characterization of a novel gene G13 in the class III region of the human MHC. In HLA 1991 (eds K. Tsuji, M. Aizawa and T. Sasazuki), Oxford University Press, Oxford. - 1992. - P. 198-202.
-
Kisielow P., Von Boehmer H. Development and selection of T cells: facts and puzzles // Adv. Immunol. - 1995. - Vol. 58. - P. 87-209.
-
Koller B.H., Geraghty D.E., de Mars R. et al. Chromosomal organization of the human major histocompatibility complex class I gene family // J. Exp. Med. - 1989. - Vol. 169. - P. 469-80.
-
Kropshofer H., Hammerling G.J., Vogt A.B. The impact of non-classical MHC proteins HLA-DMA and HLA-DO on loading of MHC class II molecules // Immunol. Rev. - 1999 Dec. - Vol. 172. - P. 267-78.
-
Kubo R.T., Sette A., Grey H.M. et al. Definition of specific peptide motifs for four major HLA-A alleles // J. Immunol. - 1994. - Vol. 152. - P. 3913-24.
-
Lapierre L.A., Fiers W., Pober J.S. Three distinct classes of regulatory cytokins control endothelial cell MHC antigen expression. Interactions with immune gamma interferon differenciate the effects of human necrosis factor and lymphotoxin from those of leukcocyte alpha and fibroblast beta interferons // J. Exp. Med. - 1988. - Vol. 167. - P. 794-804.
-
Mach B., Steimle V., Martinez-Soria E. et al. Regulation of MHC class II genes: lessons from a disease // Ann. Rev. Immunol. - 1996. - Vol. 14. - P. 302-10.
-
Macones G.A., Parry S., Elcousy M. et al. A polymorphism in the promoter region of TNF and bacterial vaginosis: preliminary evidence of gene-environment interaction in the etiology of spontaneous preterm birth // Am. J. Obstet. Gynecol. - 2004. - Vol. 190. - P. 1504-8.
-
Madden D.R., Gorga J.C., Strominger J.L. et al. The structure of HLA-B27 reveals nonamer self-peptides bound in an extended confirmation // Nature. - 1991. - Vol. 353. - P. 321-5.
-
Marsh S.G.E., Albert E.D., Bodmer W.F. et al. Nomenclature for factors of the HLA system, 2010 // Tissue Antigens. - 2010. - Vol. 75. - P. 291-455.
-
Middleton D., Williams F. A History of DNA Typing for HLA. In HLA 1997. P. Terasaki and D. Gjertson, eds. - 1997. - P. 1-7.
-
Milner C.M., Campbell R.D. Polymorphic analysis of the three MHC-linked HSP70 genes. In HLA 1991 (eds K. Tsuji, M. Aizawa and T. Sasazuki), Oxford University Press, Oxford. Moller G. - 1992. - P. 157-61.
-
Mizuki N., Ota M., Kimura M. et al. Triplet repeat polymorphism in the transmembrane region of the MICA gene: strong association of six GCT repetitions with Behcet disease // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1997. - Vol. 94. - P. 1298-303.
-
Mosmann T.R., Sad S. The expanding universe of T cell subsets: Thl, Th2 and more // Immunol. Today. - 1996. - Vol. 17. - P. 138-46.
-
Neefjes J.J., Momburg F., Hammerling G.J. Selective and TAP-dependent translocation of peptides by the MHC-encoded transporter // Science. - 1993. - Vol. 261. - P. 769-71.
-
Orr H.T. HLA class I gene family: characterization of genes encoding non-HLA-A, B, C proteins. In: Immunobiology of HLA, Vol. II (ed. B. Dupont) Springer-Verlag, New York. - 1989. - P. 33-9.
-
Parham P., Lomen C.E., Lawlor D.A. et al. The nature of polymorphism in HLA-A, -B, -C molecules // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1988. - Vol. 85. - P. 4005-9.
-
Permuller D.H., Dinarello C.A., Punsal P.I. et al. Cachetin/tumor necrosis factor regulates hepatic acute-phase gene expression // J. Clin. Invest. - 1986. - Vol. 78. - P. 1349-54.
-
Powis S.H., Mockridge I., Kelly A. et al. Polymorphism in a second ABC transporter gene located within the class II region of the human major histocompatibility complex // Proc. Natl. Acad. Sci. - 1992. - Vol. 89. - P. 1463-7.
-
Prillman K.R., Jackson K.W., Lindsey M. et al. HLA-B15 peptide ligands are preferentially anchored at their C termini // J. Immunol. - 1999. - Vol. 162. - P. 7277-84.
-
Radley E., Alderton R.P., Kelly A. et al. Genomic organization of HLA-DMA and HLA-DMB: comparison of the gene organization of all 6 class II families in the human histocompatibility complex // J. Biol. Chem. - 1994. - Vol. 269. - P. 18834-8.
-
Robinson J., Mistry K., McWilliam H. et al. The IMGT/HLA database // Nucleic Acids Research. - 2011. - Vol. 39, Suppl 1. - Р. D1171-6.
-
Roche P., Cresswell P. High affinity binding of an influenza haemagglutinin derived peptide to purified HLA-DR // J. Immunol. - 1990. - Vol. 144. - P. 1849-56.
-
Roelen D., van Bree F., van Beelen E. et al. Regulatory functions of human CD4+ T-cells recognising HLA peptides presented by self-HLA-DR. Human Immunology, 14th European Histocompatibility Conference. - 2000. - Vol. 61. - P. 1.
-
Rotzschke O., Falk K., Stevanovic S. et al. Peptide motifs of closely related HLA class I molecules encompass substantial differences // Eur. J. Immunol. - 1992. - Vol. 22. - P. 2453-6.
-
Ruddy S. Component deficiencies. 3. The second component // Prog. Allergy. - 1986. - Vol. 39. - P. 50-266.
-
Rynes R.I. Inherited complement deficiency states and SLE // Clin. Rheum. Dis. -1982. - Vol. 8. - P. 29-47.
-
Sargent C.A., Dunham I., Trowsdale J. et al. Human major histocompatibility complex contains genes for the major heat shock protein HSP70 // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1989. - Vol. 86. - P. 1968-72.
-
Sathiamurthy M., Hickman H.D., Cavett J.W. et al. Population of the HLA Ligand database // Tissue Antigens. - 2003. - Vol. 61. - P. 12-9.
-
Servenious B., Gustafsson K., Widmark E. et al. Molecular map of the human HLA-SB (HLA-DP) region and sequence of an SB-alpha (DP-alpha) pseudogene // EMBO J. - 1984. - Vol. 3. - P. 3209-14.
-
Sidney J., del Guercio M.F., Southwood S. et al. Several HLA alleles share overlapping peptide specificities // J. Immunol. - 1995. - Vol. 154. - P. 247-9.
-
So R. Structure and Assembly of Class I and Class II Molecules // HLA and Disease. Academic Press. - 1994. - P. 35-45.
-
Spies T., Morton C.C., Nedospasov S.A. et al. Genes for the tumor necrosis factors alpha and beta linked to the human major histocompatibility complex // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1986. - Vol. 83. - P. 8699-702.
-
Tokunaga K., Omoto K., Yukiyama Y. et al. Further study or a Bf silent allele // Hum. Genet. - 1984. - Vol. 67. - P. 449-51.
-
J. Genetics and polymorphism: class II antigens // Br. Med. Bull. - 1987. - Vol. 43. - P. 15-36.
-
Trowsdale J., Hanson I., Mockridge I. et al. Sequences encoded in the class II region of the MHC related to the 'ABC' superfamily of transporters // Nature. - 1990. - Vol. 348. - P. 741-4.
-
Van Kaer L., Ashton-Rickardt P.G., Eichelberger M. et al. Altered peptidase and viral-specific T cell response in LMP2 mutant mice // Immunity. - 1994. - Vol. 1. - P. 533-41.
-
Von Boehmer H. The developmental biology of T lymphocytes //Ann. Rev. Immunol. -1993. - Vol. 6. - P. 309-26.
-
Wassmuth R. Molecular analysis of HLA-polymorphism and relevance for transplantation // Biotest Bulletin. - 1997. - Vol. 5. - P. 539-51.
-
Weber D.A., Evavold B.D., Jensen P.E. Enhanced dissociation of HLA-DR-bound peptides in the presence of HLA-DM // Science. - 1996. - Vol. 274. - P. 618-20.
Глава 3. Эпидемиологические аспекты противоинфекционной защиты и полиморфизм генов иммунного ответа
3.1. HLA-полиморфизм на генетическом и популяционном уровнях
Важнейшую биологическую роль, так же как и генетический полиморфизм HLA, выполняет популяционный полиморфизм этой генетической системы. Более того, именно он сыграл и продолжает играть первостепенную роль в сохранении человечества как вида в неблагоприятных условиях окружающей среды, оказывающих все более выраженное воздействие на человека в процессе развития цивилизации.
Суть популяционного или, как его иногда называют, межэтнического полиморфизма HLA состоит в том, что частота встречаемости тех или иных специфичностей HLA на расовом или этническом уровне имеет выраженные различия. Так, отдельные специфичности HLA, присутствие которых в большинстве этнических групп европеоидов превышает 10% и более, во многих этнических группах монголоидного происхождения не превышают процента или даже составляют его доли. Другим фактором, имевшим порой решающее значение для судеб отдельных этнических групп или даже целых народов, является уровень популяционного HLA-полиморфизма, показателем которого является количество HLA-специфичностей, встречаемых в той или иной популяции. Так, если в большинстве популяционных групп, населяющих Западную и Центральную Европу, с той или иной частотой встречаются практически все установленные на сегодняшний день HLA-специфичности, то на территории Южной Америки, Азии и Северо-Востока Европы по настоящее время проживают отдельные этнические группы, HLA-полиморфизм которых ограничивается 5-10% от числа известных HLA-специфичностей. Естественно, что в этих популяциях резко повышена частота HLA-гомозигот. Последнее, в свою очередь, снижает возможности противоинфекционной защиты у представителей данных популяций. Наиболее ярким проявлением последствий негативного влияния низкого уровня HLA-полиморфизма на судьбу отдельных этнических групп населения стало, безусловно, их практическое исчезновение во времена завоевания Южной Америки. В настоящее время, в эпоху развитой медицины, расширение контактов представителей подобных этнических групп при промышленном освоении новых труднодоступных ранее территорий (в том числе в России) несет для них определенную инфекционную опасность. Для предотвращения такой опасности необходимо не только тщательное медицинское обследование подобных групп населения, но и исследование их HLA-генетического профиля в целях установления вероятности такого рода опасности.
Таким образом, экстремальный аллельный полиморфизм системы HLA служит мощным механизмом вариабильности и естественного отбора человека как вида и позволяет ему противостоять постоянно эволюционирующему множеству патогенов.
На территории России, которая является многонациональным государством, проживает множество этнических групп, относящихся либо к европеоидной, либо к монголоидной расе, что определяет высокую полиморфность генофонда российских популяций и этносов. Свидетельством выраженного полиморфизма на уровне межэтнических различий являются данные о частоте встречаемости 3 выбранных нами специфичностей HLA-DRB1 (типированных на уровне низкого разрешения) в 10 этнических группах, относящихся по расовой принадлежности или к европеоидам, или к ориентам (рис. 3.1, см. цв. вклейку). Выбор в качестве примера для исследования именно гена HLA-DRB1 определен тем, что он сам и кодируемые им антигены играют особую роль, как было сказано выше, в осуществлении физиологической регуляции иммунного ответа. Естественно, нужно понимать, что представленная на данном рисунке информация является лишь малой частью информации об этническом полиморфизме HLA. Однако представление полной информации невозможно из-за ее объема. Так, если на представленном рисунке содержатся данные о 3 HLA-специфичностях, можно легко представить, какое место заняла бы информация о 2000 HLA-специфичностей.
На рис. 3.1 (см. цв. вклейку) представлены данные о распределении спе-цифичностей HLA-DRB1*01; -DRB1*04 и -DRB1*09 в следующих этнических группах: 2 группы русских (одна - жители Москвы, вторая - поморы, коренные жители побережья Белого моря, Архангельской области); мари (республика Мари-Эл), татары (республика Татарстан). Перечисленные выше группы относятся к европеоидной расе. Удмурты (жители Среднего Урала); ненцы (Ямало-Ненецкий автономный округ); тувинцы (республика Тыва); буряты (республика Бурятия); калмыки (Калмыкия) - эти перечисленные группы относятся к монголоидной расе. Что касается саамов (Карелия), то их расовая принадлежность является объектом дискуссий среди антропологов. Как следует из представленных данных, 3 этнические группы европеоидов (2 русских и татары) имеют сходное по своему характеру распределение исследованных специфичностей: наиболее высокий уровень HLA-DRB1*04, несколько ниже -DRB1*01 и наиболее низкий уровень -DRB1*09. В количественном отношении частоты всех указанных специфичностей наиболее высоки у поморов, вслед за ними идут москвичи, а затем татары. В целом же и характер этого распределения, и абсолютные частотные значения укладываются в характерные для всех других популяций Центра и Севера Европы. У мари же имеются выраженные отличия, а именно: чрезвычайно высока частота специфичности DRB1*01, и, напротив, частота HLA-DRB1*04 является наиболее низкой по сравнению с другими европеоидными группами. Более выражены различия по изученным специфичностям внутри групп ориентов: частота HLA-DRB1*01 - наиболее высокая среди удмуртов и наиболее низкая среди тувинцев и бурят; частота HLA-DRB1*04 высока у всех изученных групп, за исключением удмуртов, у которых она является самой низкой среди всех изученных групп в целом. Что же касается HLA-DRB1*09, то частота данной специфичности практически одинакова, за исключением ненцев, у которых она более чем в 3 раза выше по сравнению с остальными группами. Наиболее вероятным объяснением этому является тот факт, что в отличие от других этнических групп ориентов, связанных между собой азиатским происхождением, группа ненцев связана с американскими ориентами (индейцами). Для последних также характерна высокая частота специфичности HLA-DRB1*09.
Что же касается саамов, как расовая принадлежность, так и происхождение которых спорно, то и по распределению HLA им присуща определенная особенность. Она характеризуется тем, что частота специфичности HLA-DRB1*04 у них чрезвычайно высока и не имеет аналога по сравнению с другими исследованными популяционными группами мира. Распределение же других специфичностей является промежуточным между ориентами и европеоидами и при этом обнаруживает большее сходство с последними. Возможно, саамы, которых чаще всего относят к реликтовым группам Северо-Западной Европы, могли оказать влияние на формирование HLA-профиля европеоидных популяций.
Приведенные данные достаточно красноречиво свидетельствуют о наличии межрасового и межэтнического различия по HLA-специфичностям, которое весьма четко проявляется среди этнических групп, населяющих в течение многих столетий Россию. Примечательно, что имеется принципиальное сходство HLA-профиля у групп ориентов (тувинцы, буряты), проживающих в течение исторических эпох в окружении других групп ориентов, и ориентов (калмыки), проживающих в окружении европеоидных групп.
Следует отметить следующее. Сами по себе различия между HLA-профилем представленных популяций русских (европеоидов) и 5 популяций ориентов закономерны. Однако результаты широкомасштабного исследования, выполненного сотрудниками Института иммунологии [7], выявили достаточно существенные различия в HLA-профиле, имеющиеся у представителей групп русского населения, проживающих в различных регионах европейской части России. В данной работе были исследованы 7 групп русских, случайным образом отобранных здоровых лиц, из которых 5 групп - жители сельских районов (в третьем поколении живущие в одной местности) и 2 группы - горожане. Сельские жители были из Архангельской (n=82), Костромской (n=126), Вологодской (n=121) и Смоленской областей (n=156), а также из районов Удмуртии (n=159). Горожане были из Москвы (n=300) и Астрахани (n=82).
На основании вычисленных частот гена DRB1 и гаплотипов DRB1-DQA1-DQB1 были посчитаны генетические расстояния и построены соответствующие матрицы генетических расстояний. Был проведен кластерный анализ, графически представленный на рис. 3.2 и 3.3 (см. цв. вклейку) в виде дендрограмм и многомерного шкалирования, представленного в виде двухмерных графиков на рис. 3.4 и 3.5 (см. цв. вклейку).
Дендрограммы, построенные на основе кластерного анализа, демонстрируют, что при использовании для анализа частот гена DRB1 и частот гаплотипов DRB1-DQA1-DQB1 все исследованные группы делятся на два кластера, один из которых состоит из русских г. Москвы, г. Астрахани и Смоленской области и второй, который включает все остальные исследованные группы. Структура кластеризации московско-смоленско-астраханской группы, построенная на основе частот гена DRB1, не отличалась от таковой, построенной на основании частот гаплотипов DRB1-DQA1-DQB1. Другая картина наблюдается для кластера, в который входят все остальные исследованные группы. Если при расчетах генетических расстояний на основе частот гена DRB1 из общей группы выделяются русские из Удмуртии, то при расчетах генетических расстояний на основе частот гаплотипов из общей группы выделяются жители Архангельской области. Следует также отметить, что величина шкалы генетических расстояний при использовании HLA-гаплотипов больше, чем при использовании частот конкретного гена. Это связано, скорее всего, с тем, что число возможных (и выявленных) вариантов трехлокусных гаплотипов значительно больше, чем число вариантов одного гена. Так, в данном исследовании были определены 40 вариантов гаплотипов DRB1-DQA1-DQB1 по сравнению со всеми возможными 13 вариантами одного гена DRB1 (типированного на уровне низкого разрешения). Поэтому, вероятно, использование гаплотипов, в которые входят несколько генов, позволяет выявлять более «тонкие» различия между популяционными группами.
Те же закономерности наблюдаются и на графиках многомерного шкалирования. Использование частот гаплотипов для расчета генетических расстояний дает более четкую картину кластеризации исследованных групп, хотя основные, «грубые» закономерности вполне отражают и графики, построенные на основе частот одного гена DRB1.
Наиболее полные данные по европейским русским были добыты в ходе «Русской антропологической экспедиции». Она была организована Институтом этнографии АН СССР и продолжалась 5 лет, с 1955 по 1959 г. В ходе этой экспедиции антропологи обследовали более 100 групп русских [10]. Антропологи используют для исследований такие методы, как оценка антропоскопических признаков, описывающих рост бороды, горизонтальный профиль лица, форму носа, губ и т.д., дерматоглифику, географию фамилий и т.д. В последние годы набирает силу такое направление исследований различных популяций, как геногеография, которая использует для анализа различные генетически наследуемые факторы, в частности систему AB0, некоторые биохимические маркеры. В настоящее время в банке данных «ГЕНОФОНД» Института общей генетики РАН содержатся сведения о частотах 100 аллелей 36 генных локусов из 170 опубликованных с 1885 по 1995 г. литературных источников, характеризующих генофонд населения Восточной Европы [23]. Трудно проводить сравнение результатов типирования генов HLA в качестве генетической основы с антропологическими данными, полученными в таких масштабных, многолетних исследованиях. Это связано прежде всего с огромной разницей в количестве обследованных групп из разных регионов России по сравнению с данными, полученными специалистами Института иммунологии. Однако следует все же отметить, что основные закономерности по географическому взаиморасположению исследованных групп можно проследить даже на таком небольшом их количестве.
Представители городского населения, особенно Москвы, вряд ли могут иметь значение для популяционных исследований, так как представляют собой сильно смешанную группу населения из разных регионов страны. Группа москвичей была использована для анализа в качестве смешанной группы русских, однако русские жители Москвы оказались в одном кластере с жителями Смоленской области и г. Астрахани, что, вероятно, свидетельствует о том, что исследованная группа москвичей в большей мере генетически связана с южными и западными областями России, чем с северными. Интересно также, что жители такого крупного города, как С.-Петербург [16], в большей мере оказались похожими на жителей северных областей России, так как на графике многомерного шкалирования (рис. 3.5, см. цв. вклейку) из всех исследованных групп ближе всего к ним оказались жители Костромской и Вологодской областей. Жители Архангельской области существенно удалены от основной группы популяций, что, вероятно, отражает их значительно более северное проживание и генетическую близость к таким североевропейским популяциям, как норвежцы и финны [72]. Группа русских из Удмуртии также удалена от основной группы популяций, что отражает ее более восточное географическое расположение и влияние на ее генофонд популяционных групп, принадлежащих к уральской расе, в непосредственном соседстве с которыми проживает эта группа русских.
Следует отметить, что представленная выше часть исследований, проведенных сотрудниками Института иммунологии, была проиллюстрирована HLA-генотипированием на уровне низкого разрешения. Для того чтобы показать возможности HLA-генотипирования на уровне высокого разрешения, т.е. на уровне выявления аллельных вариантов генов HLA, нами были приведены данные о межэтническом HLA-разнообразии специфичности HLA-DRB1*04. Выбор именно этой специфичности не случаен, поскольку при проведении данного исследования впервые были установлены выраженные различия в HLA-полиморфизме на уровне отдельных аллельных вариантов одного гена, не только на межэтническом, но и на внутриэтническом уровне [37, 38].
В табл. 3.1 представлены данные по исследованию частот аллельных вариантов гена HLA-DRB1*04 в 7 популяционных группах России. Выбор для анализа аллельных вариантов именно данного гена связан с тем, что с отдельными его аллелями - HLA-DRB1*04:01, HLA-DRB1*04:04 и HLA-DRB1*04:05 - ассоциирована предрасположенность к такому аутоиммунному заболеванию, как инсулинзависимый сахарный диабет (ИЗСД, СД1). В то же время с другим - HLA-DRB1*04:03 - ассоциирована устойчивость к развитию заболеваний.
Таблица 3.1. Частота встречаемости аллельных вариантов гена HLA-DRB1*04 в различных популяционных группах России
№ | Русские-москвичи | Русские-поморы | Саамы | Татары | Мари | Тувинцы | Ненцы |
---|---|---|---|---|---|---|---|
04 |
11,64 |
35,37 |
33,52 |
17,78 |
16,34 |
28,74 |
17,39 |
04:01* |
3,80 |
16,21 |
9,14 |
5,61 |
12,65 |
12,13 |
0,73 |
04:02 |
1,66 |
0 |
0,76 |
0,93 |
0 |
0 |
0 |
04:03** |
0,95 |
1,47 |
8,38 |
1,87 |
1,05 |
5,75 |
7,16 |
04:04* |
3,09 |
17,69 |
5,33 |
7,9 |
0,53 |
1,28 |
10,14 |
04:05* |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
5,75 |
0 |
04:07 |
1,66 |
0 |
0 |
0 |
0,53 |
0 |
0 |
04:08 |
1,19 |
0 |
16,00 |
1,87 |
1,58 |
2,93 |
0 |
04:10 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
1,28 |
0 |
* Ассоциация с предрасположенностью к ИЗСД (СД1).
** Ассоциация с устойчивостью к ИЗСД (СД1).
Из представленных в табл. 3.1 данных видно, что во всех популяциях, за исключением ненцев, высока частота аллеля HLA-DRB1*04:01, но в трех из популяций: саамы, тувинцы, ненцы, в отличие от других популяций, высока и частота аллеля-протектора (8,38, 5,35 и 7,16 соответственно). И именно в этих популяциях практически отсутствует заболеваемость ИЗСД. Аналогичная ситуация имеет место и в отношении двух других аллелей *04:04 и *04:05, частота первого из них является достаточно высокой у саамов и ненцев (5,33 и 10,14 соответственно), а частота аллеля *0405 повышена у тувинцев (5,75). Таким образом, протективный эффект является превалирующим по отношению к предрасполагающему.
Эта же таблица служит наглядным доказательством внутриэтнических различий по распределению аллелей HLA. Так, внутри русской популяции между москвичами и жителями Архангельской области имеются выраженные различия по аллелям HLA-DRB1*04:01 и *04:04. Причем оба аллеля имеют выраженную ассоциацию с предрасположенностью к ИЗСД, его частота достаточно высока в обеих указанных группах.
Таким образом, ясно, что полиморфизм системы HLA, характерный для каждой конкретной группы населения, оказывает существенное или даже определяющее влияние на биологическую стабильность данной этнической группы. В данной главе обсуждался вопрос о том, каким образом этот эффект реализовался (и продолжает реализовываться в настоящее время) в способности к противостоянию инфекционным заболеваниям различной этиологии на уровне тех или иных популяций. При этом особое внимание было обращено на роль HLA-полиморфизма и гетерозиготности в этом процессе, являющимся по сути одним из важнейших компонентов биобезопасности на уровне той или иной этнической группы, нации и страны в целом.
Система HLA обладает еще одним уникальным свойством. Это обеспечение на физиологическом уровне высокого полиморфизма и гетерозиготности популяций и человечества как вида. Эта функция реализуется в активном участии системы HLA в репродуктивном процессе.
3.2. Роль HLA-полиморфизма в обеспечении резистентности к инфекционным заболеваниям
Как указывалось выше, главный комплекс тканевой совместимости человека (HLA) играет чрезвычайно важную роль в регуляции иммунного ответа, а также обеспечивает целый ряд других важнейших физиологических функций организма (гены иммунного ответа являются составной частью HLA), обеспечивая поддержание постоянства генетического состава организма [36].
Благодаря своему чрезвычайно выраженному полиморфизму, HLA обеспечивает успешное выживание человека в условиях непрерывного воздействия факторов внешней среды, прежде всего инфекционного и паразитарного окружения. При этом следует напомнить, что HLA-полиморфизм носит выраженный межрасовый и межэтнический характер [36].
В то же время установлено, что скорость мутационного процесса, являющегося основой для возникновения новых вариантов генов, для генов MHC и генов других локусов существенно не различается [86, 106]. Каким же образом происходит поддержание такого высокого уровня полиморфизма именно в системе генов главного комплекса тканевой совместимости и зачем это необходимо организму? Анализ накопленных к настоящему времени данных в различных областях биологии и медицины, где так или иначе исследовались функция и биологическая роль HLA, позволили сегодня хотя бы частично ответить на этот вопрос.
В процессе эволюции иммунная система позвоночных, и в частности человека, развивалась и совершенствовалась под действием инфекционного окружения. Поэтому открытие Р.М. Цинкернагелем и П. Доэрти иммунного распознавания вирусных антигенов Т-лимфоцитами «в контексте» белков главного комплекса тканевой совместимости хозяина, за которое они были удостоены Нобелевской премии [133], позволило предположить, что генетические различия индивидуумов в локусе, кодирующем MHC-белки, могут влиять на интенсивность и эффективность ответа хозяина на инфекцию [88], определяя тем самым результат этого взаимодействия.
Изучение ассоциаций между HLA и факторами врожденного иммунитета (с учетом возможности межэтнических различий) тем более перспективно, поскольку уже сейчас накоплено достаточно данных о наличии ассоциаций между конкретными аллельными вариантами HLA и предрасположенностью или устойчивостью к тем или иным инфекционным заболеваниям человека.
Так, установлено, что специфичность HLA-DRB1*01 ассоциирована с устойчивостью к HIV-1, а HLA-DRB1*04 и сцепленные с ней варианты генов DQA1 и DQB1, а также DRB1*01 и *03 [98, 104] ассоциированы со спонтанным очищением организма от HCV. По результатам анализа эпидемии малярии в Кении и Габоне показано, что с наличием в HLA-генотипе DRB1*01 связана защита против развития тяжелых форм этого заболевания [82, 83].
Специфичности генов DR3 и DR4 связаны с сильным иммунным ответом, а специфичность гена DR2 со слабым ответом против энтеровирусных антигенов (вирусы Коксаки) [117].
Специфичность гена DRB1*13 ассоциирована с чувствительностью к HIV-1 [97], DR2 и DR11(5) - к гепатиту В [111, 126], DR2 - к лепре [29, 32], DRB1*07 является генетическим маркером предрасположенности к развитию легочного туберкулеза [32], а частота аллеля DRB1*15(2) значительно увеличена среди больных вирусом папилломы (HPV16) [93].
Для наглядности состояние вопроса об исследовании ассоциаций HLA с чувствительностью или устойчивостью к различным инфекционным заболеваниям представлено в табл. 3.2.
Таблица 3.2. HLA-DRB1 -маркеры чувствительности и устойчивости к различным инфекционным заболеваниям
Заболевание | Чувствительность | Самостоятельное очищение от патогена | Ссылка |
---|---|---|---|
Гепатит В |
DRB1*11(5) |
- |
Thio C.L. et al., 1999 [125] |
DR2, DR11(5) |
- |
Park M.H. et al., 2003 [111] |
|
Гепатит С |
- |
DRB1*11(5) |
Minton E.J. et al., 1998 [101] |
- |
DRB1*04 |
Cramp M.E. et al., 1998 [60] |
|
DRB1*07 |
DRB1*11(5) |
Thursz M. et al., 1999 [127] |
|
- |
DRB1*01 |
Barrett S. et al., 2001 [46] |
|
DRB1*15(2) |
- |
Wawrzynowicz-Syczewska M. et al., 2000 [129] |
|
DRB1*07 |
DRB1*01 |
Fanning L.J. et al., 2000 [75] |
|
- |
DRB1*01, *03 |
Mc Kiernan S.M. et al., 2004 [98] |
|
HIV-инфекция |
- |
DRB1*01 |
McDonald K.S. et al., 2000 [78] |
DRB1*04 |
- |
Roe D.L. et al., 2000 [115] |
|
- |
DR5 |
Lockett S.F. et al., 2001 [89] |
|
DRB1*13 |
DRB1*01 |
Motta P. et al., 2002 [104] |
|
Лепра |
DR2 |
- |
Сароянц Л.В. и соавт., 1992, 1995 [32, 34]. Dessoukey M.W. et al., 1996 [65] Van Eden W. et al., 1980 [128] |
Туберкулез |
DRB1*16(2) |
DRB1*13(6) |
Dubaniewicz A. et al., 2000 [70] |
DR6 |
- |
Takahashi M. et al., 2000 [124] |
|
DRB1*07, *15(2) |
- |
Naik E. et al., 2003 [105] |
|
DRB1*07 |
- |
Amirzargar A.A. et al., 2004 [45] |
|
Хламидиоз |
DRB1*15(2) |
- |
Cohen C.R. et al., 2003 [59] |
Гистоплазмоз |
DR15(2) |
- |
Dabil H. et al., 2003 [61] |
Папилломатоз |
DRB1*16(2) |
- |
Cervantes J. et al., 2003 [54] |
DRB1*15(2) |
- |
Matsumoto K. et al., 2003 [93] |
|
Вирус Коксаки |
DR2 |
DR3, DR4 |
Sadeharju K. et al., 2003 [117] |
Подобные данные имеются в литературе и в отношении ассоциаций вариантов гена DRB1 с эффективным или неэффективным ответом на вакцинацию [52].
Помимо того, что эффективность противоинфекционной защиты связана с конкретными HLA/MHC-специфичностями, находящимися в генотипе, эффективность иммунного ответа зависит также и от того, в каком состоянии, гетерозиготном или гомозиготном, эта HLA-специфичность присутствует.
Дело в том, что поскольку каждая специфичность, входящая в HLA- (или в МНС- в целом) генотип, обеспечивает возможность реагировать на определенный набор пептидов, гетерозиготность по MHC может обеспечивать эффективный иммунный ответ на более разнообразный спектр антигенов по сравнению с MHC-гомозиготами по соответствующему аллелю, где указанный спектр заведомо в 2 раза ниже [67].
Экспериментальные исследования на инбредных мышах обеспечили более четкие доказательства, что MHC-гетерозиготность усиливает иммунную резистентность к инфекциям [112].
Разумеется, эффект большего разнообразия в иммунном ответе на тот или иной патоген, обусловленный HLA-гетерозиготностью по сравнению с гомозиготностью по соответствующему аллелю, более трудно проверить у человека как вида, поскольку он имеет значительно более широкий спектр вариантов генов MHC по сравнению с инбредными линиями животных. Поэтому в работах, посвященных подобному анализу у человека, чаще используется метод сравнения по специфичностям генов HLA в различных популяционных группах при тех или иных инфекциях [94].
Результатом этих работ стали данные об ассоциациях между HLA-гетерозиготностью и резистентностью к ряду инфекционных заболеваний [84], а также установление факта более длительного выживания больных СПИДом - HLA-гетерозигот по сравнению с гомозиготами [53].
Можно констатировать, что на сегодняшний день общепринята точка зрения о преимуществе HLA-гетерозигот в процессе борьбы за выживание организма в инфекционном окружении. В частности, существует точка зрения, что МНС-гетерозиготность, усиливая резистентность к инфекционным заболеваниям, обеспечивает исключение или, по крайней мере, снижение вероятности инбридинга [94, 112].
Однако такого рода отбор, осуществляемый под влиянием инфекционных агентов, не является единственным в природе. Другой вариант направленного поддержания полиморфизма генов MHC обеспечивается системой репродукции и, в частности, не случайным выбором партнера для воспроизведения потомства.
В настоящее время хорошо известно, что гены MHC, и в том числе HLA, играют главную роль в развитии адаптивного иммунного ответа на инфекционные патогены. Как обсуждалось выше, эти гены кодируют
MHC-молекулы I и II классов, которые представляют пептиды чужеродных антигенов Т-клеткам, инициируя тем самым иммунное распознавание антигенов [74] и обеспечивая межклеточные взаимодействия в процессе иммунного ответа.
Естественно, что человек как биологический вид на протяжении всей своей истории, вплоть до того времени, когда были разработаны и внедрены подходы к борьбе с инфекционными болезнями (вакцинация, антибиотики, сульфаниламиды и т.д.), мог противостоять инфекциям только за счет активности своего иммунитета. При этом уровень этой активности у конкретных индивидуумов в значительной степени зависел от его иммуногенетического статуса, т.е. от генотипа HLA. Отражением этого является сам иммуногенетический профиль не только отдельных групп, но и целых рас.
Еще в начале 1970-х годов, когда были накоплены первые данные об особенностях иммуногенетического профиля представителей различных рас и популяционных групп по HLA-антигенам класса I, выдающиеся иммуногенетики Жан Доссе и Вальтер Бодмер обратили внимание на то, что уровень частоты ряда HLA-антигенов и гаплотипов никоим образом не соответствует теоретически прогнозированному. Так, в частности, была установлена необычно высокая частота антигенов HLA-A1, -В8 и -DR3 (а также этого гаплотипа) среди представителей обследованных к этому времени европейских популяций. С этого времени указанные антигены принято называть HLA-генетическими маркерами европеоидов. Вальтер Бодмер выдвинул гипотезу, объясняющую этот факт. Он предположил, что во времена пандемий чумы, оспы и холеры шанс выжить был выше у предков современных жителей большинства европейских стран, имевших в своем генотипе именно эти HLA-антигены.
Позже это было подтверждено на примере вспышек брюшного типа в Суринаме, когда среди выживших европеоидов значительный процент составили лица с гаплотипом HLA-A1, -В8, -DR3.
Таким образом, система HLA явилась фактором, обусловливающим естественный отбор и формирование «нового» генетического профиля европеоидной расы в целом. Последующие исследования подтвердили это предположение. В частности, уже в 1980-е годы было установлено, что HLA-генетический профиль некоторых этнических групп европеоидов, чьи предки не сталкивались с пандемиями, не несет столь высокой частоты указанных HLA-антигенов и гаплотипов по сравнению с абсолютным большинством других европеоидных популяций. Так, в частности, к таким этническим группам относятся популяции высокогорной Грузии - менгрелы и сваны, которые до настоящего времени не только проживают в труднодоступных районах, но и сохранили свои древние дома-крепости, которые во времена эпидемий полностью прекращали общение с внешним миром [1, 2, 19, 22].
Примечательно, что HLA-генетический профиль представителей других этнических групп грузин практически не отличается от генетического профиля, характерного для большинства других европеоидов. Вслед за этим появились и новые доказательства, свидетельствующие о правомочности гипотезы, высказанной Ж. Доссе и В. Бодмером. Так, была установлена взаимосвязь между наличием в гаплотипе европеоидов антигенов HLA-A1 и -В8, а также -DR3 и особенностями иммунного статуса, позволяющими более эффективно реализовать противоинфекционную защиту вне зависимости от природы возбудителя [36].
При сравнительном изучении HLA-полиморфизма представителей коренного населения Европейского Севера России и особенностями иммунного статуса была установлена адаптивная значимость связей параметров иммунного статуса с HLA-генетическими маркерами [7, 13, 14, 72].
Учитывая тот факт, что с одними и теми же гаплотипами HLA связана устойчивость к самым различным инфекционным агентам, логично было предположить, что подобного рода ассоциации с HLA могут быть связаны не только с самой генетически обусловленной отвечаемостью к конкретному инфекционному агенту, но и с теми звеньями иммунного ответа, которые принимают участие в его реализации, т.е. в его конечном эффекте; этот тезис получил первоначальное название «качество иммунного ответа». Направление было включено в качестве раздела в программу XII Международного рабочего совещания и конференции по изучению HLA [63]. Следует отметить, что в данном направлении исследований отечественные иммунологи имеют несомненный приоритет [42], хотя само это направление ранее входило в состав исследований ассоциации между HLA и иммунным статусом человека [41, 43].
К настоящему времени достаточно хорошо известно, что между отдельными HLA-специфичностями и HLA-гаплотипами существуют положительные и отрицательные ассоциации с теми или иными показателями иммунного статуса, а именно количественная и функциональная активность CD4+, CD8+ клеток, фагоцитирующая функция нейтрофилов и ЕКК. Эти показатели в настоящее время относят к основным факторам врожденного иммунитета. Следует, однако, отметить, что абсолютное число работ в этом направлении выполнялось при изучении представителей различных этнических групп, относящихся к европеоидной расе [43, 44, 91, 95, 96, 102].
В работах, выполненных отечественными исследователями, было показано, что ассоциированные с HLA показатели иммунного статуса могут отличаться в различных этнических группах и расах [5]. Примером может служить исследование ассоциаций между отдельными параметрами иммунного статуса и HLA-специфичностями в двух этнических группах: русские (европеоиды) и буряты (монголоиды) [5, 21]. Данные приведены в табл. 3.3.
Таблица 3.3. HLA-антигены, связанные со сходными параметрами иммунного статуса в бурятской и русской популяциях
Параметры | Буряты | Русские |
---|---|---|
IgM |
HLA-A1↑, B15↓, B40↓ |
HLA-B5↑ |
IgG |
HLA-A2↓, B7↓ |
- |
Фагоцитоз |
HLA-B12↓, B40↑ |
HLA-B27↓ |
РБТЛ-сп |
HLA-B16↓ , B40↓ |
HLA-B7, DR2↓ |
РБТЛ-ФГА |
HLA-A10↓, DR2↓ |
HLA-B8↑, DQ2↑ |
Интерлейкин-2 |
HLA-B16↓, DR7↑ |
HLA-B7↑, DR4↓, DQ3↓ |
Условные обозначения:
↓ - сниженный уровень исследованного параметра, маркируемый данным антителом;
↑ - повышенный уровень исследованного параметра, маркируемый данным антителом;
прочерк - отсутствие связи параметра с антигенами системы HLA;
РБТЛ-сп - спонтанная реакция бласттрансформации лимфоцитов;
РБТЛ-ФГА - реакция бласттрансформации лимфоцитов, индуцированная фитогемагглютинином (ФГА).
Анализ полученных результатов свидетельствует о целесообразности дальнейшего межэтнического подхода к изучению ассоциированного с HLA качества иммунного ответа.
Несмотря на то что исследование этой функции системы HLA стало развиваться относительно недавно, данное направление является весьма перспективным как в фундаментальном аспекте - установление молекулярных механизмов указанных ассоциаций, так и в практическом, поскольку имеет значение для прогноза возможных неблагоприятных воздействий (включая техногенные) окружающей среды на представителей различных этнических групп.
Помимо данных, представленных в табл. 3.3, установлены ассоциации между HLA-специфичностями и таким важнейшим элементом врожденного иммунитета, как естественные клетки-киллеры - ЕКК [11, 12]. Данной популяции клеток, как известно, принадлежит весьма существенная роль в обеспечении противоинфекционной, в первую очередь противовирусной, защиты организма. Они также несут ответственность и за обеспечение элиминации из организма мутирующих, в том числе раковых, клеток, которые распознаются ЕКК по отсутствию или даже снижению на их поверхности МНС-антигенов [71, 103].
При этом следует отметить, что роль в запуске активности ЕКК играет не только уровень экспрессии HLA-молекул, но и их специфичность. Существуют данные о том, что в организме имеет место своего рода «приспособление» популяции ЕКК к генотипу HLA. Это приспособление происходит в процессе дифференцировки ЕКК, когда из их популяции элиминируются клетки, рецепторы которых не связываются с HLA-антигенами, входящими в генотип организма [71, 103]. Таким образом, исключается возможность повреждения собственных «нормальных» клеток, несущих генотип хозяина, и активность ЕКК реализуется по отношению к клеткам с потерянной или ослабленной способностью экспрессии HLA-антигенов.
Таким образом, можно заключить, что сам факт наличия ассоциаций между конкретными HLA-специфичностями, гаплотипами и генотипами, с одной стороны, и определенными показателями иммунного статуса человека, с другой стороны, является непреложной истиной.
Многие иммунологические параметры, в отношении которых установлены эти ассоциации, относятся как к показателям адаптивного, так и естественного или врожденного иммунитета человека, изучению которого современная иммуногенетика уделяет пристальное внимание.
Врожденный иммунитет осуществляет первую и самую быструю реакцию на вторгающиеся микроорганизмы, такие как бактерии, вирусы и грибы. Эффекторные клетки, реализующие естественный ответ, разнообразны, но имеют общую способность распознавать чужеродные агенты, осуществляющие агрессию, и тем самым инициировать эффективную защиту [77].
К факторам естественного иммунитета относятся фагоцитоз, ЕКК и ответ Т- и В-лимфоцитов на поликлональные митогены.
Что же касается возможных механизмов ассоциаций HLA и факторов врожденного иммунитета, то следует принять во внимание следующие соображения. Во-первых, существуют данные об определенной взаимосвязи между функцией семейства молекул CD1, относящихся к факторам естественного иммунитета, и антигенпрезентирующей функцией [73]. Во-вторых, известно, что такой фактор врожденного иммунитета, как γ-интерферон, принимает активное участие в процессинге пептидов и их презентации молекулами HLA [36]. И наконец, в-третьих, гены такого важнейшего фактора врожденного иммунитета, как TNF, относятся к генам системы HLA класса III [92].
Имеются данные о неслучайной сегрегации HLA-гаплотипов от родителей с высоким или низким уровнем ЕКК к их детям, т.е. о сцепленном с HLA-генетическим контролем уровня ЕКК [12].
Эти представления подтверждают, в частности, данные, полученные при изучении взаимосвязи маркеров предрасположенности и устойчивости к «классическому» инфекционному заболеванию - лепре [3, 29].
Лепра является одним из инфекционных заболеваний, известных человечеству еще с библейских времен и носивших характер эпидемий в средние века. Несмотря на значительные успехи, достигнутые в XX в. при внедрении комбинированной антибактериальной терапии, проблема лепры остается до настоящего времени весьма актуальной в 55 странах мира. Ежегодно в мире регистрируется от 300000 до 500000 новых случаев заболевания лепрой [78].
Лепра - одна из первых инфекционных болезней, при которой была установлена роль наследственного фактора в развитии заболевания. Так, еще до открытия А. Hansen в 1874 г. возбудителя лепры, D.C. Danielssen, W. Boeck [62] относили проказу к наследственным заболеваниям. Позднее исследования, выявившие конкордантность по типу заболевания у однояйцовых близнецов [55], роль эритроцитарных изоантигенов, проявившуюся в преимущественном поражении лепрой лиц с 0- и А-групповыми факторами крови, а также изучение типов пальцевых узоров у больных лепрой [6], подтвердили эту точку зрения.
Представление о генетической предрасположенности к лепре нашли свое подтверждение и развитие при проведении исследований, посвященных ассоциации HLA с этим заболеванием. При этом были установлены ассоциации предрасположенности к развитию лепры с продуктами этих генов - антигенами HLA I класса, а именно: В7, В8, В40, А11, А18 и др. [32, 57], а затем и с антигенами HLA II класса: DR3, DR2, DQ1 [32, 80, 110, 118, 119]. С внедрением молекулярно-генетических методов генотипирования ассоциации с лепрой генов HLA и их аллельных вариантов были выявлены в различных этнических группах и популяциях [26, 27, 30, 51, 113].
Благодаря санитарно-эпидемиологическим и лечебным мероприятиям, проведенным на территории СССР, распространенность лепры в значительной степени сократилась. В настоящее время на территории СНГ очаги лепры сохранились только в некоторых регионах, включая низовья реки Волги (Астраханская область), территорию Средней Азии (Республика Каракалпакстан) и Казахстана [15, 20].
Следует отметить, что лепра, которая еще 10-15 лет назад рассматривалась как «практически побежденное» заболевание (во всяком случае в абсолютном большинстве государств мира), в последние годы становится все более значимым для мирового здравоохранения. Это связано с несколькими причинами: в первую очередь с возрастанием политической, социальной и экономической нестабильности в ряде государств Африки и Азии, в том числе сопредельных с РФ. Помимо этого за последние годы резко возрос уровень межнациональных и межэтнических контактов за счет миграции значительных групп населения и с территории сопредельных государств. Нельзя забывать и о все возрастающем объеме туристических поездок, особенно в «экзотические» страны. Несмотря на то что лепра на территории России имеет ограниченный ареал встречаемости, нельзя исключить тот факт, что она может стать серьезной проблемой для отечественного здравоохранения.
Дело в том, что, учитывая географическое положение России и бывших стран СНГ, можно ожидать появления на их территориях носителей лепры, принадлежащих к различным этническим группам, которые несут в своем генотипе с разной частотой HLA-гаплотипы, в том числе ассоциированные с чувствительностью к данному заболеванию.
Необходимо также отметить, что лепра, в отличие от большинства других инфекционных болезней, имеет чрезвычайно продолжительный инкубационный период, и пик развития клинически манифестированной лепры может проявиться через несколько лет после инфицирования.
Сотрудниками Института иммунологии (г. Москва) и ФГБУ «НИИ по изучению лепры» Минздрава РФ (г. Астрахань) проведено уникальное исследование, целью которого было решение вопроса о том, имеются ли выраженные различия в наличии генетических маркеров предрасположенности к лепре (включая ее различные формы) у представителей этнических групп, компактно проживающих в Каспийском регионе [25, 39].
В ходе работы обследовано 255 больных лепрой в стадии клинического регресса, бактериоскопически негативных, находящихся на стационарном и амбулаторном лечении в ФГБУ «НИИЛ» (г. Астрахань) и Каракалпакском республиканском лепрозории (п. Крантау, г. Нукус) [24]. Среди больных лепрой: 149 русских, 66 казахов и 40 каракалпаков. Среди обследованных: 139 мужчин и 116 женщин.
В качестве контроля использовались образцы крови, полученные от 254 здоровых доноров-добровольцев, не связанных кровным родством, различной этнической принадлежности: русские (n=108), казахи (n=70) - жители Астрахани и Астраханской области и каракалпаки (n=76) из Каракалпакстана.
Из обследованных больных лепрой 163 человека входили в группу многобактериальных (МВ - MultiBacillary) больных (LLp, LLs BL, BB по классификации Ridley-Jopling [114]): русские (100), казахи (29), каракалпаки (34), и 92 в группу малобактериальных (PB - PauciBacillary) больных (TT, BT): русские (49), казахи (37), каракалпаки (6).
В исследовании был использован метод анализа трехлокусных HLA-гаплотипов, позволяющий выявить глубокие закономерности ассоциаций генов HLA с предрасположенностью к лепре. Было проведено изучение распределения гаплотипов HLA-DRB1-DQA1-DQB1 по всем изучаемым этническим популяциям. При этом у больных лепрой казахов установлено достоверное увеличение частоты встречаемости гаплотипов DRB1*17-DQA1*05:01-DQB1*02:01 (RR=2,90; p<0,05) и DRB1*01-DQA1*01:01-DQB1*05:01 (RR=2,30; p<0,01). У больных лепрой русской и каракалпакской популяционных групп обнаружено достоверное увеличение частоты встречаемости гаплотипа DRB1*16-DQA1*01:02-DQB1*05:02/04 (в группе русских больных RR=3,8; p<0,001, у каракалпаков RR=9,9; p<0,05). У больных лепрой каракалпаков также определялось достоверное увеличение частоты встречаемости гаплотипа DRB1*15-DQA1*01:02-DQB1*06:02/08 (RR=2,30; р<0,05).
Отрицательная ассоциация (устойчивость) установлена у больных лепрой русской популяционной группы с гаплотипами DRB1*11-DQA1*0501-DQB1*0301 (RR=0,62; р<0,05) и DRB1*07-DQA1*0201-DQB1*0201 (RR=0,50; р<0,01), у казахов - с гаплотипом DRB1*13-DQA1*01:03-DQB1*06:02/08 (RR=0,14; р<0,01), у каракалпаков - с гаплотипом DRB1*09-DQA1*03:01-DQB1*03:03 (RR=0,29; р<0,05). Таким образом, сравнительный анализ обобщенных данных по всем обследованным этническим популяциям свидетельствует, что для русских и каракалпаков характерно увеличение частоты встречаемости одних и тех же аллелей и гаплотипа, а именно HLA-DRB1*16-DQA1*01:02-dQb1*05:02/04, с которым ассоциирован и самый высокий относительный риск. Гаплотип DRB1*16-DQA1*01:02-DQB1*05:02/04 имеет низкую частоту встречаемости как в обследованных, так и в большинстве других популяционных групп здорового населения [7, 9], что подчеркивает значение увеличения его частоты у больных лепрой. Наличие такого гаплотипа может играть решающую роль в возникновении заболевания.
Р.Р. де Вриз [66] высказал предположение, что если существуют гены предрасположенности к лепре, сцепленные с HLA, то можно ожидать, что гаплотипы, чаще встречаемые у больных лепрой, будут редко выявляться у здоровых лиц. Низкая частота встречаемости данного гаплотипа у здоровых лиц, возможно, результат влияния процесса, имевшего место еще в средние века, когда лепра носила характер эпидемий. В этом отношении имеет смысл провести параллель между предположением, сделанным В. Бодмером, о формировании HLA-профиля европеоидной популяции под влиянием эпидемий, уносивших значительную часть населения в античную эпоху, эпохи Средневековья и Возрождения и результатами данного исследования. Хотя в средние века лепра не была так распространена, как чума, оспа, холера, лепрозории существовали не только в каждом городе, но и в сельской местности около каждой кафедральной церкви [35].
В отличие от чумы, оспы и холеры, лепра имеет длительный инкубационный период и хроническое течение, т.е. больные доживали до детородного возраста. Однако их изолировали от общества в лепрозориях, и им в большинстве случаев запрещалось иметь детей. Можно предположить, что лица с гаплотипом DRB1*16-DQA1*01:02-DQB1*05:02/04 имели более высокую вероятность заболевания лепрой и вследствие этого пониженную возможность оставления потомства. Такое предположение может быть одним из объяснений того обстоятельства, что лепра практически исчезла из Европы в конце XIX столетия. Таким образом, это привело к тому, что лепра, пусть не столь явно, как чума или оспа, оказала влияние на HLA-профиль европеоидной популяции. Система HLA, являясь объектом естественного отбора, сформировала новый иммуногенетический профиль европеоидной расы, устойчивый не только к чуме, оспе и холере, но и к лепре, что проявилось в значительном уменьшении количества лиц, восприимчивых к ней.
Исходя из выдвинутых предположений об эволюционных процессах формирования генофонда популяций, следует признать вероятность того, что в настоящее время круг лиц, «восприимчивых» к лепре, невелик. В то же время лепра, являясь инфекционным заболеванием, продолжает распространяться в мире. У подавляющего большинства лиц, контактирующих с возбудителем лепры, развивается соответствующий эффективный клеточный иммунный ответ без клинических признаков болезни. В то же время полиморфизм генов иммунного ответа человека, определяющий уровень активности тех или иных факторов иммунитета, может оказаться решающим фактором для устойчивости или восприимчивости к лепре.
Чем определяется сдерживание болезни или ее развитие по лепроматозному (многобактериальному) или туберкулоидному (малобактериальному) типу, остается пока до конца неясным. Одно из объяснений данного феномена состоит в том, что развитие клинической симптоматики при лепре тесно связано со степенью напряженности клеточного компонента иммунитета, включая врожденный иммунитет [3, 31, 79], что во многом определяется иммуногенетическими факторами.
В целях установления HLA-ассоциаций с различными вариантами клинического течения лепрозного процесса проведены анализ и сравнение данных о распределении аллелей и гаплотипов HLA II класса у больных с много- и малобактериальными формами лепры.
В результате проведенного исследования установлена положительная ассоциация многобактериальной лепры у больных русской популяционной группы с гаплотипом HLA-DRB1*15-DQA1*01:02-DQB1*06:02/08 (RR=1,5; р<0,05), а отрицательная - с HLA-DRB1*07-DQA1*02:01-DQB1*02:01 (RR=0,56; р <0,01).
В то же время повышение частоты встречаемости гаплотипов DRB1*01-DQA1*01:01-DQB1*05:01 (RR=2,01; р <0,05) и DRB1*04-DQA1*03:01-DQB1*03:02 (RR=3,14; р <0,01) характерно для больных с малобактериальной формой лепры. С низкой частотой в этой группе больных встречался гаплотип DRB1*11-DQA1*05:01-DQB1*03:01 (RR=0,50; р <0,05). Для больных многобактериальной лепрой казахов, жителей Астраханской области, также характерно повышение частоты встречаемости гаплотипа DRB1*15-DQA1*01:02-DQB1*06:02/08 (RR=2,24; р <0,05). Развитие малобактериальной формы заболевания ассоциируется с гаплотипом DRB1*01-DQA1*01:01-DQB1*05:01 (RR=2,90; р <0,05). Кроме того, у больных лепрой каракалпаков достоверно повышена частота встречаемости гаплотипа DRB1*15-DQA1*01:02-DQB1*06:02/08, а так как около 90% обследованных больных каракалпакской популяционной группы составляют больные многобактериальной лепрой, можно заключить, что повышение частоты данного гаплотипа характерно в первую очередь для многобактериальной лепры. Таким образом, в результате проведенных иммуногенетических исследований выявлены HLA-маркеры предрасположенности к развитию различных клинических форм лепры. Эти маркеры характерны для каждой конкретной этнической популяции, хотя существуют и маркеры, определяющие клиническое течение лепры независимо от этнической принадлежности больного. В этом смысле гаплотип DRB1*01-DQA1*0101-DQB1*0501 ассоциирован с малобактериальной формой, а гаплотип DRB1*15-DQA1*01:02-DQB1*06:02/08 - с развитием более тяжелой многобактериальной формы болезни.
При разделении больных по формам заболевания на многобактериальных и малобактериальных, в соответствии с рекомендациями ВОЗ при проведении химиотерапии, H. Soebono и колл. [121], изучая индонезийско-японскую этническую группу, обнаружили ассоциацию DRB1-02 специфичности с развитием многобактериальной формы лепры, отрицательная ассоциация была найдена для специфичности DRB1-12 с обеими формами. R. Rani и соавт. в Северной Индии [113], объединив больных по формам заболевания, нашли достоверное увеличение частоты встречаемости DRB1*15:01, DRB5*01:01 аллелей и снижение DQB1*02:01 аллели у больных многобактериальной лепрой по сравнению с малобактериальной.
Следует отметить, что ассоциация между HLA и формами лепры установлена не во всех исследованиях. Так, у больных лепрой японцев хотя и отмечались достоверное увеличение частоты встречаемости HLA-DRB1*15:01, DQA1*01:02, DQB1*06:02/08 и снижение частоты DQA1*03 и DQB1*04:01 аллелей, однако при анализе больных по формам заболевания достоверных различий не выявлено [85].
Несмотря на все многообразие и противоречивость данных по выявлению иммуногенетических маркеров чувствительности к различным клиническим формам лепры, в большинстве популяций превалируют ассоциации со специфичностью HLA-DRB1*02 и ее аллельными вариантами [99, 113, 121]. При этом следует учитывать, что в подавляющем большинстве работ акцент делался на поиске ассоциаций между отдельными аллелями локусов DR и DQ и восприимчивостью к различным формам лепры. Однако более выраженные (и, вероятно, точные) различия можно найти при использовании трехлокусных гаплотипов HLA-DRB1-DQA1-DQB1, так как число возможных (и выявленных) вариантов трехлокусных гаплотипов значительно больше, чем число вариантов одного гена. Так, специфичность DRB1*15 и гаплотип DRB1*15-dQA1*01:02-DQB1*06:02/08 встречаются практически во всех популяционных группах с умеренной или достаточно высокой частотой. Кроме того, эта специфичность и гаплотип ассоциированы не только с лепрой, но и с другими инфекционными заболеваниями [28, 70, 111]. Учитывая тот факт, что с одними и теми же гаплотипами HLA ассоциирована чувствительность к различным инфекционным агентам, логично предположить, что подобного рода ассоциации могут быть связаны не только с самой генетически обусловленной отвечаемостью на конкретный инфекционный агент [36], но и с теми звеньями (как адаптивного, так и врожденного иммунного ответа), которые принимают участие в его реализации.
При этом наиболее выраженные ассоциации установлены для врожденного иммунитета [4, 42]. При исследовании взаимосвязи генов HLA класса II с иммунологическими показателями у больных лепрой были обнаружены ассоциации маркерных HLA-гаплотипов с различными параметрами как врожденного, так и адаптивного иммунитета. Выявлено, что у больных лепрой с HLA-маркерами предрасположенности, а именно гаплотипами DRB1*16-DQA1*01:02-DQB1*05:02/04 и DRB1*15-DQA1*01:02-DQB1*06:02/08, выявляется низкий уровень фагоцитоза, пролиферативной активности лимфоцитов и активности ЕКК [24, 33, 40].
Установленная в данном исследовании повышенная восприимчивость к лепре у лиц, имеющих в генотипе гаплотипы HLA-DRB1*16-DQA1*01:02-DQB1*05:02/04 и HLA-DRB1*15-DQA1*01:02-DQB1*06:02/08, позволяет пролить свет на неясные ранее вопросы о механизмах заражения, развития клинических форм болезни и путей эволюции заболеваемости. Базирующаяся на этих фактах концепция о решающей роли иммуногенетических факторов в патогенезе лепры позволяет выдвинуть предположение, что в наиболее древних очагах этой болезни в течение многих столетий в популяциях шла естественная селекция в сторону выживаемости лиц, резистентных к этому заболеванию. Очевидно, что преимущественное поражение инфекцией и более тяжелое течение лепры наблюдались у лиц с гаплотипом HLA-DRB1*16-DQA1*01:02-DQB1*05:02/04, сцепленным с низким уровнем активности естественных клеток-киллеров [24, 33]. Кроме того, с позиций этой теории и с учетом роли всех остальных патогенетических факторов многобактериальная лепра чаще развивается у лиц с гаплотипом HLA-DRB1*15-DQA1*01:02-DQB1*06:02/08, которому сопутствует повышение антителогенеза на фоне недостаточности функции фагоцитов и снижения пролиферативной активности Т-лимфоцитов [3, 24, 33]. Дальнейшее расширение знаний в области иммуногенетических основ патогенеза лепры будет способствовать более глубокому пониманию патогенеза и других инфекционных болезней.
Получены данные о наличии двух типов HLA-генетических маркеров: общих для обследованных групп и специфических для конкретной этнической группы. При этом последний вариант HLA-маркеров в ряде случаев был характерен для представителей этнических групп, проживающих в сопредельных государствах [24, 25].
Естественно, что само по себе установление этого факта свидетельствует о возрастании риска инфицирования лепрой среди представителей популяций российских граждан, имеющих общие генетические маркеры предрасположенности к лепре с жителями сопредельных государств, в том числе эндемических по лепре.
Помимо возможности непосредственного использования результатов проведенного исследования этих данных в целях обеспечения биобезопасности России, их необходимо учитывать при составлении долговременного эпидемиологического прогноза инфицирования лепрой в конкретных регионах России.
Как было сказано выше (табл. 3.2), наличие HLA-генетических маркеров предрасположенности к целому ряду социально значимых заболеваний в ряде случаев имеет выраженные межэтнические различия. Ранее эпидемиологическая ситуация не рассматривалась с точки зрения общности и различий HLA-генетических маркеров того или иного инфекционного заболевания (в том числе особо опасного или социально значимого) в сопредельных государствах. Между тем направление исследований подобного рода является весьма перспективным, а возможно, и необходимым для эпидемиологического прогноза развития инфекционных болезней, а также послужить основой для формирования нового направления в эпидемиологии.
При этом следует принять во внимание следующее. Использование эпидемиологического подхода может оказаться эффективным не только при сравнении распределения HLA-генетических маркеров предрасположенности к заболеванию за счет инфицирования населения больными мигрантами из сопредельных государств, но и внутри одного многонационального и этнически неоднородного государства, каким является РФ. На территории России проживает максимальное количество этнических групп, HLA-иммуногенетический профиль которых к настоящему времени изучен далеко не полностью, хотя эти исследования проводит целый ряд учреждений России. Более того, в течение определенного времени советские исследователи занимали лидирующую позицию в этой области. Свидетельством этого является тот факт, что еще в 1991 г. на XI Международном рабочем совещании и конференции по изучению HLA (Йокогама, Япония) почетной медали за наибольший вклад в развитие направления «HLA и антропология» (межпопуляционный полиморфизм HLA) были удостоены отечественные исследователи из Института иммунологии.
Следует отметить, что эпидемиологический подход может также оказаться целесообразным не только в отношении хорошо изученных инфекционных заболеваний, но и в отношении «новых» инфекций, в том числе носящих характер эпидемий и пандемий, таких как птичий и свиной грипп.
Таким образом, при изучении HLA-ассоциированной генетической предрасположенности к лепре в популяциях больных, относящихся к различным этническим группам, выявлены как общие, так и индивидуальные HLA-специфичности и гаплотипы, ассоциированные с предрасположенностью и характером клинического течения болезни. Установлены ассоциации гаплотипа DRB1*16-DQA1*01:02-DQB1*05:02/04 с лепрой (вне зависимости от ее формы) в русской и каракалпакской популяционных группах. В казахской популяционной группе риск развития лепры ассоциирован с гаплотипами DRB1*17-DQA1*05:01-DQB1*02:01 и DRB1*01-DQA1*01:01-DQB1*05:01 . Риск развития малобактериальной формы лепры ассоциирован с гаплотипом DRB1*01-DQA1*01:01-DQB1*05:01, а гаплотип DRB1*15-DQA1*01:02-DQB1*06:02/08 - с развитием более тяжелой многобактериальной формы болезни независимо от этнической принадлежности больного. Одним из механизмов реализации HLA-ассоциированной генетической предрасположенности к лепре является ассоциация между маркерными гаплотипами и показателями врожденного иммунитета [24, 25, 39].
Вопрос о роли генов иммунного ответа (ГИО) в восприимчивости или устойчивости к инфекционным заболеваниям является краеугольным камнем в механизмах противостояния инфекциям различной этиологии на уровне тех или иных популяций. На формирование иммуногенетического полиморфизма популяций значительное влияние оказали различные эпидемии, имевшие место на протяжении всей истории человечества, что не могло не сказаться на формировании популяционных генотипов [50].
Полученные при исследовании лепры данные могут в определенной степени послужить еще одной моделью для изучения других, в том числе особо опасных и социально значимых, инфекционных заболеваний с учетом межэтнических особенностей распределения и различий в них иммуногенетических маркеров предрасположенности и устойчивости к той или иной инфекции. Кроме того, такого рода исследования могут быть использованы для прогнозирования эпидемиологической ситуации в различных регионах России в целях обеспечения биобезопасности государства.
3.3. Генетический полиморфизм человека и устойчивость к ВИЧ/СПИД. Популяционный аспект
Говоря о роли иммуногенетики в биобезопасности государства необходимо упомянуть одну из наиболее очевидных угроз настоящего времени - ВИЧ/СПИД. Несмотря на значительные успехи в диагностике ВИЧ-инфекции, нерешенными остаются такие задачи здравоохранения, как профилактика (разработка эффективных вакцин) и лечение заболевания [17].
До последнего времени недостаточно изученной оставалась и проблема генетической предрасположенности и устойчивости к ВИЧ-инфекции.
Перспективным путем решения этой задачи представляется изучение генетического полиморфизма рецепторов, используемых ВИЧ для проникновения в клетку. Среди них особое место принадлежит так называемым корецепторам ВИЧ, установлением роли которых в заболевании посвящены многочисленные исследования [21].
Известно, что помимо рецептора CD4, необходимого для проникновения ВИЧ в клетку, активность и специфичность вирусиндуцированной фузии определяется наличием корецепторов, относящихся к семейству 7TМ-рецепторов хемокинов (G-белок-связывающие рецепторы) [58].
Первым из открытых хемокиновых корецепторов для ВИЧ был фузин (fusin) - рецептор класса CXC [76]. Экспериментально доказано, что фузин служит корецептором только для Т-тропных, но не для М-тропных, штаммов ВИЧ. Лигандом фузина является SDF-1 (Stromal Derived Factor-1) - CXC-хемокин, регулирующий функции В-лимфоцитов и гемопоэтических клеток-предшественников [107]. Согласно принятой номенклатуре, корецептор фузин был переименован в корецептор CXCR4 [49]. Исследование молекулярной структуры гена SDF-1 показало, что мутация, приводящая к гиперэкспрессии хемокина, является важным фактором, влияющим на особенности течения ВИЧ-инфекции. Наличие замены A→G в позиции 801 в 3'-нетранслируемом регионе гена при гомозиготности по аллелю SDF1-3A достоверно ассоциировано с отсрочкой развития клинически манифестированного СПИДа. По-видимому, SDF1, связываясь с рецептором CXCR4, препятствует проникновению Т-тропных штаммов вируса, характерных для поздних стадий развития инфекции [68, 130]. Таким образом, данный полиморфизм может рассматриваться в качестве одного из основных факторов, препятствующих быстрой прогрессии СПИД.
Аллель SDF1-3A распространен достаточно широко. Наибольшая его частота наблюдается в странах Океании, где достигает 72%. Среди коренного населения Черной Африки данный аллель практически не встречается. Частота встречаемости аллеля SDF1-3A в прочих исследованных на настоящий момент группах весьма вариабильна и колеблется от 3 до 43% [123].
Основным корецептором для М-тропных изолятов ВИЧ является CCR5 [69]. Этот рецептор экспрессируется на дендритных клетках периферической крови [81], на поверхности CD34-гемопоэтических клеток-предшественников [116] и активированных клетках памяти фенотипа CD26high, CD45RAlow, CD45R0 [56]. Рецептор CCR5 экспрессируется также на тимоцитах фенотипов CD4 и CD8 и на клетках Лангерганса [132]. Сообщалось и о наличии рецептора CCR5 на мембране нейронов, астроцитов, клеток капиллярного эндотелия, эпителиальных клеток и фибробластов, но функциональная роль рецептора CCR5 для этих клеток пока не выяснена.
Сейчас известно, что β-хемокиновый рецептор CCR5, в отличие от рецептора CXCR4, является единственным корецептором для ВИЧ, исчезновение которого с поверхности клеток (блок или делеция) никак не влияет на иммунные процессы организма. В экспериментах на мышах было показано, что делеция рецептора CXCR4 приводит к смерти животного [134]. Таким образом, инфицирование или другое повреждение CXCR4-позитивных клеток может оказаться более ощутимым воздействием на иммунную систему по сравнению с инфицированием клеток фенотипа CCR5.
Эпидемиологические исследования показали, что путь заражения не оказывает существенного влияния на степень прогрессии заболевания [90]. Конечно, это не относится к случаям, когда заражение происходит при попадании непосредственно в кровь большого количества вирусов фенотипа Х4. Такие ситуации наблюдаются при инфицировании лиц, употребляющих наркотики внутривенно (ПВН - потребители внутривенных наркотиков) и у больных гемофилией. В этих случаях происходит чрезвычайно быстрая прогрессия ВИЧ-инфекции в СПИД [131].
Как указывалось ранее, наличие или отсутствие полноразмерного и нормально функционирующего хемокинового рецептора CCR5 не влияет на осуществление важных процессов жизнедеятельности организма человека [109]. Таким образом, ингибиторы функциональной активности рецептора CCR5 могут быть использованы для подавления ВИЧ-инфекции in vivo без существенных побочных эффектов для организма человека.
Исследование нуклеотидной последовательности гена CCR5 привело к открытию дефектного аллеля CCR5D32, играющего значительную роль в патогенезе ВИЧ-инфекции [64]. Обнаружено, что гомозиготный по этой мутации генотип распространен среди некоторых групп так называемых HEPs (лиц, контактировавших с ВИЧ, но не заразившихся) и не был обнаружен среди нескольких тысяч исследованных ВИЧ-инфицированных пациентов. Мононуклеары периферической крови (МПК, соотв. англ. PBMC - Peripheral Blood Mononuclear Cell) от HEPs с гомозиготной мутацией были восприимчивы к инфицированию штаммами вируса фенотипа Х4 и абсолютно устойчивы к инфицированию вирусами фенотипа R5 [48]. В дальнейшем было показано, что люди с генотипом D32/D32 практически резистентны по отношению к вирусам фенотипа R5 и обладают частичной устойчивостью к инфицированию вирусами фенотипа R5X4 [87]. Гетерозиготность по мутации CCR5D32 ассоциирована с медленной прогрессией заболевания. Все это может служить подтверждением того, что рецептор CCR5 ответствен за вирусную трансмиссию и репликацию ВИЧ-1 на ранних стадиях инфекции [100].
Наиболее часто эта мутация встречается у европеоидов, реже на Ближнем Востоке и в Индии и крайне редко среди коренного населения Азии, Африки, Дальнего Востока и среди американских индейцев. В Северной Европе частота мутаций по этому гену составляют 16% (Финляндия, Мордовия), в Южной Европе (на Сардинии) - 4%, т.е. имеется градиент с севера на юг [123].
При дальнейшем исследовании эпидемиологических когорт были обнаружены индивидуумы, гетерозиготные по мутации CCR5D32, но при этом демонстрирующие абсолютную устойчивость к R5-вирусам in vitro. Впоследствии было показано, что причиной этому явлению служит второй аллель, обозначенный как CCR5-m303. Этот вариант гена содержит одно-нуклеотидную замену Т-А в концевой позиции открытой рамки считывания гена CCR5, связанную с синтезом нефункционального рецептора [108]. Эта мутация наследовалась как несцепленный признак у 3 гетерозиготных по этому гену индивидуумов из 209 здоровых доноров, участвовавших в исследовании [47].
Мутация в гене другого хемокинового рецептора - CCR2, по данным некоторых источников, также обладает защитным эффектом в отношении ВИЧ/СПИД. Она приводит к замене валина на изолейцин в первом трансмембранном домене (полиморфизм CCR2-64I) и так же, как и в случае с гетерозиготами по аллелю CCR5D32, сопровождается продлением периода между сероконверсией и развитием симптомов СПИД [120].
Данный рецептор также выполняет функцию корецептора проникновения ВИЧ-1. Защитный эффект варианта CCR2-64I проявляется как у гомозигот, так и у гетерозигот. Принцип, на котором основан эффект данной мутации, до сих пор недостаточно понятен, в частности из-за того, что мутация расположена в трансмембранном домене и не может влиять на эффективность проникновения ВИЧ в клетку. Предполагается, что протективный эффект CCR2-64I носит опосредованный характер, т.е. в данном случае наблюдаемый признак не связан напрямую с изменениями свойств рецептора CCR2. Скорее всего, вариант CCR2-64I сцеплен с другим неизвестным в настоящее время генетическим фактором, ассоциированным с формированием устойчивого фенотипа. Таким образом, по существу данный мутантный вариант гена CCR2 может рассматриваться как генетический маркер определенной формы течения заболевания.
Аллель CCR2-64I является наиболее распространенным среди популяций, проживающих на территории континентальной Азии и Африки, где его частота превышает 35%. В странах Европы его частота несколько ниже, наиболее редко он встречается в странах Океании [123].
Для рассмотренных аллелей, действие которых в целом условно может быть обозначено как «протективное», характерен кумулятивный эффект, проявляющийся в повышенной устойчивости и/или торпидном течении заболевания, что, в свою очередь, позволяет использовать эти данные на уровне индивидуального прогноза и выборе адекватных методов терапии [130]. Помимо этого, данные о распространенности указанных полиморфизмов в той или иной расовой или популяционной группе могут быть использованы при разработке стратегии борьбы со СПИДом в рамках обеспечения биобезопасности на национальном и международном уровнях.
В рамках нескольких крупных исследований эпидемиологических когорт, состоящих из представителей различных рас [64, 123, 130], было оценено влияние рассматриваемых «протективных» аллельных вариантов на динамику развития симптомов СПИД и смертность в группах серопозитивных пациентов. На основании полученных данных были рассчитаны коэффициенты относительного риска, характеризующие относительный риск развития заболевания по тому или иному сценарию в зависимости от генотипа [130].
Современная Россия является одним из наиболее многонациональных государств мира, где проживают представители двух рас - европеоиды и ориенты, включающие большое количество этнических и субэтнических групп. Проведенные в течение последних 20 лет исследования в области межпопуляционного полиморфизма генов HLA - наиболее полиморфной генетической системы человека - свидетельствуют о том, что имеет место выраженный полиморфизм в распределении аллельных вариантов генов, контролирующих иммунный ответ человека не только на межрасовом и межпопуляционном, но и на внутрипопуляционном уровнях [21]. Имелись все основания предположить существование отличий и в отношении распределения аллельных вариантов CCR2-64I, SDF1-3’A и CCR5D32.
В связи с этим сотрудниками Института иммунологии была выполнена работа по выяснению особенностей распределения протективных аллелей на территории бывшего СССР [18].
В ходе исследования был проведен анализ образцов ДНК, полученных от 960 здоровых (не имеющих известной истории ВИЧ/СПИД), взрослых представителей 10 этнических групп, не связанных кровным родством: коренного населения Архангельской области (поморы), коренного населения Вологодской области, гагаузов, украинцев, татар, удмуртов, чеченцев, казахов, киргизов и тувинцев (по 96 человек для каждой группы). Для каждого из образцов определяли аллельный статус по трем полиморфным локусам, ассоциированным с формированием устойчивости к ВИЧ/СПИД.
Аллель CCR5D32 наиболее представлен в выборке поморов (рис. 3.6, см. цв. вклейку). Здесь высока доля гомозиготных генотипов, связанных с пониженным риском инфицирования ВИЧ, а также гетерозиготных генотипов, ассоциированных с положительной динамикой течения заболевания.
В изученных восточно-европейских популяциях частота аллеля CCR5D32 совпадает со средними значениями, характерными для центральной Европы. Аллель одинаково представлен в выборках украинцев, русских из Вологодской области и гагаузов.
Наименьшая частота «защитного» аллеля CCR5D32 была отмечена в популяциях тувинцев, казахов, киргизов и чеченцев (центрально-азиатская и северо-кавказская группы). Казахи и киргизы принадлежат южносибирской этнической группе, сформированной с участием европеоидной и монголоидной рас, а тувинцы являются представителями монголоидной расы. В этих случаях представленные данные соотносятся с результатами проводимых ранее исследований, демонстрирующих низкую распространенность варианта CCR5D32 в популяциях азиатского региона [123]. В выборках чеченцев, татар и удмуртов отмечены пониженные частоты аллеля CCR5D32 по сравнению с восточно-европейскими, что укладывается в общую картину распределения аллеля в популяциях Евроазиатского региона.
Таким образом, распределение аллеля CCR5D32 в изученных регионах, так же как и в изученных ранее популяциях Европы и Азии, характеризуется отрицательным градиентом в направлении с севера на юго-восток (рис. 1.6, см. цв. вклейку).
Гетерогенность в распределении протективного аллеля CCR5D32 на территории изученных регионов связана в первую очередь с участием европеоидного и монголоидного компонентов в этногенезе народов, проживающих на территории России. Полученные нами результаты подтверждают и дополняют существующие данные молекулярно-генетического анализа пространственной структуры генофонда восточно-европейских и центрально-азиатских народов.
В отношении аллеля CCR2-64I наиболее значимые отличия были обнаружены для казахов и киргизов (центрально-азиатская группа) относительно других рассмотренных групп (рис. 3.7, см. цв. вклейку). В популяции чеченцев частота аллеля ниже, чем в центрально-азиатской группе, однако выше относительно других рассмотренных выборок.
В пределах восточно-европейской и волго-уральской этнографических групп обнаружены достоверные отличия для гагаузов относительно других популяций. Эти данные коррелируют с данными о миграционных потоках со стороны южных (Греция, Болгария) регионов Европы, где частота аллеля CCR2-64I демонстрирует повышенные значения. Значимых отличий в других этнических группах Восточно-европейского региона не обнаружено.
Отдельного упоминания стоит рассмотренная выборка из популяции тувинцев. Здесь частота аллеля CCR2-64I зафиксирована на самом низком уровне. Причиной этому могла послужить как географическая изолированность республики, так и этническая близость к монголам (старое название региона - Бурято-Монголия). Полученные нами данные позволяют предположить, что формирование генофонда тувинской популяции находилось под влиянием миграционных потоков, проникавших на территорию Восточной Сибири из южных областей азиатского региона, где частота полиморфизма CCR2-64I ниже относительно Центральной Азии.
Аллель SDF1-3’A для всех исследованных популяций распространен равномерно (рис. 3.8, см. цв. вклейку). Обнаруженные отличия не достоверны и не позволяют выявить тенденций в его распространении. Единственное значимое отличие отмечено нами для популяции гагаузов, где частота аллеля несколько выше, чем у представителей других изученных популяций. К сожалению, в доступной литературе отсутствуют сведения о представленности варианта SDF1-3A на территории Европы и Ближневосточного региона, и мы не можем делать предположений о путях его распространения.
Однако если сопоставить данные по частоте аллелей CCR2-64I и SDF1-3A с основными путями миграции в Азиатском регионе, видно, что изменение частот аллелей совпадает с существующими представлениями о направлении миграционных потоков на территории Азиатского региона. По одной из существующих на сегодняшний день гипотез, предки проживающих в этом регионе людей попали на территорию Центральной Азии примерно 50000-70000 лет назад с юга, вероятно, из Юго-Восточной Азии (где частота аллеля SDF1-3A высокая), и в дальнейшем распространились на север Азии. Вместе с тем следующие 7000 лет миграции на территории Китая были направлены с севера на юг - из области с высокой частотой CCR2-64I. Противоположная направленность в распределении частот протективных аллелей CCR2-64I и SDF1-3’A на территории Азиатского региона отчасти подтверждает эту гипотезу [122].
На основе частот трехлокусных генотипов в изученных популяциях и значений коэффициентов относительных рисков нами были рассчитаны значения относительной опасности развития СПИДа (ООР) и относительной опасности смерти от СПИДа (ООС) у ВИЧ-инфицированных. Данные представлены на рис. 3.9 и 3.10 (см. цв. вклейку).
В рассмотренных нами выборках значения ООР и ООС попадают в интервал 0,79-0,94 и 0,76-0,93 соответственно. В целом они соответствуют данным, полученным для других европейских и азиатских популяций. Широкое распространение аллеля CCR2-64I в центрально-азиатской группе, а также высокая частота аллеля CCR5D32 в выборке русских из Архангельской области определили пониженные значения ООР и ООС в этих группах. Напротив, в выборке тувинцев и популяциях волго-уральской группы относительная опасность демонстрирует повышенные значения, что связано с низкой частотой протективных аллелей CCR5D32 и CCR2-64I. У восточно-европейских народов и выборки чеченцев выявлен средний уровень ООР и ООС. Можно предположить, что в первом случае оказывает влияние распространенность варианта CCR5D32, а во втором - CCR2-64I.
Как было многократно показано, частота встречаемости алеллей, ассоциированных с устойчивостью к ВИЧ/СПИД, в значительной степени варьирует в различных расах и популяциях, влияя тем самым на особенности эпидемического процесса в различных регионах мира. Гетерогенность в распределении «защитных» вариантов генов на территории России и сопредельных государств также может оказывать влияние на динамику развития эпидемии в различных популяционных группах. В связи с этим представляется важным дальнейшее изучение существующих и поиск новых генетических факторов устойчивости к ВИЧ/СПИД, а также расширение географии исследования. Целесообразность проведения таких исследований помимо фундаментального значения имеет и выраженный прикладной аспект, поскольку, как указывалось выше, их результаты открывают новые возможности в профилактике, повышении эффективности лечения и эпидемиологии СПИД, что в конечном итоге в значительной степени определяет биобезопасность государства.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
-
Алексеев Л.П., Ведерников А., Яздовский В. и др. Антигены HLA у имеретинской популяции // В кн.: Актуальные вопросы геронтологии и гериатрии. Матер. 2-й республиканской конференции, Тбилиси, 1982.
-
Алексеев Л.П., Махатадзе Н., Яздовский В.В. и др. Популяционные исследования частот HLA-генов и гаплотипов у лиц грузинской национальности // Иммунология. - 1986. - № 6. - С. 15-7.
-
Алексеев Л.П., Сароянц Л.В., Ющенко А.А. Иммунологические показатели при различном течении лепроматозной лепры // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиотехнологии. - 1990. - № 9. - С. 70-2.
-
Алексеев Л.П., Хаитова Н.М., Яздовский В.В. и др. HLA и сниженные показатели иммунного статуса у европеоидов и ориентов // В кн.: Иммунодефициты и аллергия, тез. докл. Всесоюзного симп. с междунар. участием. - М., 1986. - С. 7.
-
Алексеев Л.П., Яздовский В.В., Хаитов Р.М. Межэтнические различия в генетическом контроле иммунного статуса человека // Рос. физиол. журн. им. И.М. Сеченова. - 2000. - Т. 86. - С. 280-4.
-
Баранов Ю.Н., Подоплелов И.И. Распределение групп крови и пальцевых узоров в семьях больных лепрой // Актуальные вопросы лепрологии. - Астрахань, 1984. - С. 94-8.
-
Болдырева М.Н., Гуськова И.А., Богатова О.В. и др. HLA-генетическое разнообразие населения России и СНГ. II. Народы европейской части // Иммунология. - 2006. - Т. 27, № 4. - С. 98-102.
-
Болдырева М.Н., Гуськова И.А., Богатова О.В. и др. HLA-генетическое разнообразие населения России и СНГ. III. Народы Евразии // Иммунология. - 2006. - Т. 27, № 6. - C. 324-9.
-
Голованова О.В., Шевченко А.В., Прокофьев В.Ф. и др. Молекулярный полиморфизм HLA-генов DRB1 и DPB1 в популяции европеоидного происхождения, проживающей в Западно-Сибирском регионе // Иммунология. - 2002. -№ 1. - С. 29-31.
-
Дерябин В.Е. Современные восточнославянские народы // В кн.: Восточные славяне: антропология и этническая история. - М.: Научный мир, 2002. - С. 10934.
-
Дмитриева Н.Г., Хаитова Н.М., Алексеев Л.П. и др. HLA и некоторые показатели иммунореактивности у здоровых лиц узбекской популяции //Иммунология. - 1988. - № 2. - С. 63-7.
-
Дмитриева Н.Г., Хаитова Н.М., Болдырева М.Н. и др. Семейное иммунологическое обследование // Бюллетень экспериментальной биологии и мед. - 1987. - № 7. - С. 125.
-
Евсеева И.В., Алексеев Л.П. Генетическая детерминированность особенностей иммунного статуса на Севере // Аллергия, астма и клиническая иммунология. - 2001. - № 9. - С. 6-94.
-
Евсеева И.В., Уэлс С., Тонкс С. и др. Генетический полиморфизм генов иммунного ответа I класса в коренных популяциях Европейского Севера России // Иммунология. - 2001. - № 5. - С. 27-30.
-
Ещанов Т.Б., Абдиров Ч.А., Ющенко А.А. и др. Организационные и научные основы ликвидации лепры в Каракалпакской эндемической зоне. - Каракалпакстан: Нукус, 2003. - 168 с.
-
Капустин С.И. Особенности аллельного полиморфизма генов HLA II класса в здоровой популяции Санкт-Петербурга и у больных тяжелой апластической анемией //Автореф. дис. …канд. биол. наук. - СПб., 1998. - 21 с.
-
Карамов Э.В., Сидорович И.Г., Хаитов Р.М. Новая вакцинология: вакцины против ВИЧ/СПИД // М.: МИА, 2008. - 368 с.
-
Кофиади И.А. Генетическая устойчивость к заражению ВИЧ и развитию СПИД в популяциях России и сопредельных государств: автореф. дис. .канд. биол. наук. - М., 2008. - 23 с.
-
Махатадзе Н.И., Меунаргия В.В., Микадзе Н.Г. и др. Распределение HLA-антигенов среди имеретинцев и аджарцев // Сообщения АН ГССР. - 1985. - Т. 117, № 1. - С. 121-124.
-
Мырзахметов Е.И., Молотов Д.Л. Современные аспекты диагностики лепры в Казахстане // Междунар. науч.-практ. конф. «Современное состояние и перспективы борьбы с лепрой. Вопросы медико-социальной реабилитации больных». - Кызылорда, 2009. - С. 20-23.
-
Пальцев М.А., Хаитов Р.М., Алексеев Л.П. Иммуногенетика человека и биобезопасность // М.: Медицина, 2007. - 144 с.
-
Полянская И.С., Яздовский В.В. Гуния М.Г. и др. HLA-DR-антигены в грузинской популяции // Известия АН ГССР (серия биологическая) - 1989. - Т. 15. - № 5. - С. 340-4.
-
Рычков Ю.Г., Балановская Е.В., Нурбаев С.Д. и др. Историческая геногеография Восточной Европы //В кн.: Восточные славяне: антропология и этническая история. - М.: Научный мир. - 2002. - С. 109-34.
-
Сароянц Л.В. Иммуногенетика лепры. Межпопуляционный аспект: автореф. дис. …д-ра мед. наук. - М., 2011. - 49 с.
-
Сароянц Л.В., Алексеев Л.П. HLA и лепра - межпопуляционные аспекты // Физиология и патология иммунной системы. Иммунофармогеномика. - 2012. - Т. 16, № 1.- С. 3-9.
-
Сароянц Л.В., Болдырева М.Н., Гуськова И.А. и др. Иммуногенетические маркеры предрасположенности к лепре у русских жителей Астраханского региона // Иммунология. - 2005. - № 5. - С. 263-7.
-
Сароянц Л.В., Болдырева М.Н., Гуськова И.А. и др. Иммуногенетический профиль больных туберкулезом и лепрой в казахской популяции // Иммунология. - 2006. - Т. 27, № 5. - С. 285-8.
-
Сароянц Л.В., Болдырева М.Н., Гуськова И.А. и др. Исследование ассоциаций аллелей HLA II класса с микобактериозами в русской популяции // Иммунология. - 2007. - № 1. - С. 13-6.
-
Сароянц Л.В., Болдырева М.Н., Гуськова И.А. и др. Иммуногенетические маркеры предрасположенности к лепре // Рос. журн. кож. вен. болезней. - 2008. - № 1.- С. 47-9.
-
Сароянц Л.В., Гуськова И.А., Дуйко В.В. и др. Иммунологический профиль больных каракалпакской национальности, страдающих лепрой // Рос. журн. кож. вен. болезней. - 2009. - № 1. - С. 16-9.
-
Cароянц Л.В., Дмитриева Н.Г., Ющенко А.А. и др. Активность естественных клеток-киллеров при лепроматозной лепре // Иммунология. - 1994. - № 5. - С. 54-7.
-
Сароянц Л.В., Полянская И.С., Алексеев Л.П. и др. HLA-антигены при лепроматозной лепре // Вестн. дерматол. венерол. - 1992. - № 4. - С. 18-9.
-
Сароянц Л.В., Ульянова Л.И., Алексеев Л.П. и др. Ассоциированные с HLA особенности иммунного статуса у больных лепрой // Иммунология. - 2008. - № 6. - С. 365-70.
-
Cароянц Л.В., Ющенко А.А., Алексеев Л.П. Иммуногенетические аспекты восприимчивости к лепре // Пробл. туберкулеза. - 1995. - № 2. - С.57.
-
Торсуев Н.А., Остапенко Е.Ф., Романовская Н.А. и др. К вопросу об источниках заражения лепрой // Сборник науч. работ по лепрологии и дерматологии. - Ростов-на-Дону, 1954. - № 6. - С. 61-114.
-
Хаитов Р.М. Физиология иммунной системы. ВИНИТИ РАН. - 2005. - 375 с.
-
Хаитов Р.М., Алексеев Л.П. Геномика HLA: новые возможности молекулярной генетики человека в диагностике и терапии // Молекулярная медицина. - 2003. - № 1. - С. 17-31.
-
Хаитов Р.М., Алексеев Л.П. Физиология генов иммунного ответа // Рос. физиол. журн. им. И.М. Сеченова. - 2003. - Т. 89. - № 3. - С. 313-28.
-
Хаитов Р.М., Алексеев Л.П., Болдырева М.Н. и др. Эпидемиологические аспекты противоинфекционной защиты и полиморфизм генов иммунного ответа человека // Физиология и патология иммунной системы. Иммунофармогеномика. - 2012. - Т. 16, № 7. - С. 3-23.
-
Хаитов Р.М., Алексеев Л.П., Болдырева М.Н. и др. Полиморфизм генов иммунного ответа и его роль в противоинфекционной защите // Иммунология. - 2013. - № 3 (34). - С. 132-44.
-
Яздовский В.В., Алексеев Л.П., Земсков В.М. и др. Связь параметров иммунного статуса с HLA-фенотипом у здоровых лиц русской национальности // Иммунология. - 1998. - Т. 3. - С. 20-4.
-
Яздовский В.В., Дмитриева Н.Г., Алексеев Л.П. Динамика пролиферативного ответа лимфоцитов на митогенные лектины и анти-CD3-антитела в культурах цельной крови и выделенных клеток у здоровых людей // Иммунология. - 1994. - Т. 5. - С. 21-4.
-
Яздовский В.В., Дмитриева Н.Г., Батурин П.С. и др. Генетический контроль активности естественных клеток-киллеров у человека // Современные методы иммунотерапии. - Ташкент, 1984. - С. 65-266.
-
Amer A., Singh G., Darke C., Dolby A.E. Impaired lymphocyte responsiveness to phytohaemagglutinin associated with the possession of HLA-B8/Dr3 // Tissue Antigens. - 1986. - Vol. 28. - Р. 193-8.
-
Amirzargar A.A., Yalda A., Hajabolbaghi M. et al. The association of HLA-DRB, DQA1, DQB1 alleles and haplotype frequency in Iranian patients with pulmonary tuberculosis // Int. J. Tuberc. Lung Dis. - 2004. - № 8. - P. 1017-21.
-
Barrett S., Goh J., CougHLAn B. et al. The natural course of hepatitis C virus infection after 22 years in a unique homogenous cohort: spontaneous viral clearance and chronic HCV infection // Gut. - 2001. - Vol. 49, № 3. - P. 423-30.
-
Berger E.A., Murphy P.M., Farber J.M. Chemokine receptors as HIV-1 coreceptors: roles in viral entry, tropism, and disease // Annu. Rev. Immunol. - 1999. - Vol. 17. - P. 657-700.
-
Bjorndal A. Biological determinants of HIV infection: studies of viral evolution during disease progression in children and adults // Thesis. Stockholm: Karolinska institutet. 2000.
-
Bleul C.C., Farzan M., Choe H. et al. The lymphocyte chemoattractant SDF-1 is a ligand for LESTR/fusin and blocks HIV-1 entry // Nature. - 1996. - Vol. 382, № 6594. - P. 829-33.
-
Bodmer W.F., Bodmer J.G. Evolution and function of the HLA system // Brit. Med. Bull. - 1978. - Vol. 34. - P. 309-16.
-
Borras S.G., Cotorrueto C., Racca L. et al. Association of leprosy with HLA-DRB1 in an Argentinean population // Ann. Clin. Biochem. - 2008. - Vol. 45. - P. 96-8.
-
Caillat-Zucman S., Gimenez J.J., Wambergue F. et al. Distinct HLA class II alleles determine antibody response to vaccination with hepatitis B surface antigen // Kidney Int. - 1998. - Vol. 53, № 6. - P. 1626-30.
-
Carrington M., Nelson G.W., Martin M.P. et al. HLA HIV-1: heterozygote advantage B℘ 5-Cw*04 disadvantage // Science. - 1999. - Vol. 283. - P. 1748-52.
-
Cervantes J., Lema C., Valentina Hurtado L. et al. HLA-DRB1*1602 allele is positively associated with HPV cervical infection in Bolivian Andean women // Hum. Immunol. - 2003. - Vol. 64, № 9. - P. 890-5.
-
Chakravarti M.R., Vogel F. A twin study on leprosy // Topics in Human Genetics / Ed. P.E. Becker. Stuttgart: Georg Thieme, 1973. - P. 1-123.
-
Chan S.Y., Speck R.F., Power C. et al. V3 recombinants indicate a central role for CCR5 as a coreceptor in tissue infection by human immunodeficiency virus type 1 // J. Virol. - 1999. - Vol. 73, № 3. - P. 2350-8.
-
Chiewslip P., Athkambhira S., Chirachariyave T. et al. The HLA-antigens and leprosy in Thailand // Tiss. Antigens. - 1979. - Vol. 13. - P. 186-8.
-
Cocchi F., DeVico A.L., Garzino-Demo A. et al. Identification of RANTES, MIP-la, MIP-lb as the major HIV-suppressive factors producedby CD8+ Т cells // Science. - 1995. - Vol. 270, - P. 1811-5.
-
Cohen C.R., Gichui J., Rukaria R. et al. Immunogenetic correlates for CHLAmydia trachomatis-associated tubal infertility // Obstet. Gynecol. - 2003. - Vol. 101, №3. - P. 438-44.
-
Cramp M.E., Carucci P., Underhill J. et al. Association between HLA class II genotype and spontaneous clearance of hepatitis C viremia // J. Hepatol. - 1998. - Vol. 29, № 2. - P. 207-13.
-
Dabil H., Kaplan H.J., Duffy B.F. et al. Association of the HLA-DR15/HLA-DQ6 haplo-type with development of choroidal neovascular lesions in presumed ocular histoplasmosis syndrome // Hum. Immunol. - 2003. - Vol. 64, № 10. - P. 960-4.
-
Danielssen D.C., Boeck W. Traite de la Spedalskhed on Elephantiasis des Grecs. - Paris, 1848.
-
Dausset J. Twelfth International Histocompativbility Workshop HLA-Saint-Malo. 12th International Histocompativbility Workshop Study / Charron D., Ed. Paris, EDK. - 1997. - P. 23-4.
-
Dean M., Carrington M., Winkler C. et al. Genetic restriction of HIV-1 infection and progression to AIDS by a deletion allele of the CKR5 structural gene. Hemophilia growth and development study, multicenter AIDS cohort study, multicenter hemophilia cohort study, San Francisco city cohort, alive study // Science. - 1996. - Vol. 273, № 5283. - P. 1856-62.
-
Dessoukey M.W., el-Shiemy S., Sallam T. HLA and leprosy: segregation and linkage study // Int. J. Dermatol. - 1996. - Vol. 35, № 4. - P. 257-64.
-
de Vries R.R.P., Ottenhoff T.H.M., van Schooten W.C.A. Human leukocyte antigens (HLA) and mycobacterial disease // Springers Seminars Immunopathol. - 1988. - Vol.10. - P. 305-18.
-
Dogerty P.C., Zinkernagel R.M. A biological role for the major histocompatibility antigens // Lancet. - 1975. - Vol. 1, № 7922. - P. 1406-9.
-
DomsR.W., PeiperS.C. Unwelcomed guests with master keys: how HIV uses chemokine receptors for cellular entry // Virology. - 1997. - Vol. 235, № 2. - P. 179-90.
-
Dragic Т., Litwin V., Allaway G.P. et al. HIV-1 entry into CD4+ cells is mediated by the chemokine receptor CC-CRK-5 // Nature. - 1996. - Vol. 381. - P. 667-73.
-
Dubaniewicz A., Lewko B., Moszkowska G. et al. Molecular subtypes of the HLA-DR antigens in pulmonary tuberculosis // Int. J. infect. Dis. - 2000. - Vol. 4. - P. 12933.
-
Dupont B., Kettering S. Natural killer cell receptors with ligand specificity for HLA class I molecules.14th European histocompatibility Conference, 4-7 April 2000, Montpellier, France. - 2000. - Р. 33.
-
Evseeva I., Spurkland A., Thorsby E. et al. HLA profile of three ethnic groups living in the North-Western region of Russia // Tissue Antigens. - 2002, Jan. - Vol. 59, № 1. - Р. 38-43.
-
Ezekowitz B., HoffmannJ.A. CD1-Restricted T-cells. D. Branch Moody. Edited by Alan R. Innate immunity. Humana press, Totowa NJ. - 2003. - P. 387-402.
-
Falk K., Rotzschke O., Stevanovic S. et al. Allele-specific motifs revealed by sequencing of self-peptides eluted from MHC molecules // Nature. - 1991. - Vol. 351, № 6324. - P. 290-6.
-
Fanning L.J., Levis J., Kenny-Walsh E. et al. Viral clearance in hepatitis C (1b) infection: relationship with human leukocyte antigen class II in homogenous population // Hepatology. - 2000. - Vol. 31, № 6. - P. 1334-7.
-
Feng Y., Broder С.С., Kennedy P.E. et al. HIV-1 entry cofactor: functional cDNA cloning of a seven-transmembrane, G protein-coupled receptor // Science. - 1996. - Vol. 272. - P. 872-7.
-
Fukuishi N., Metcalfe D., Kulka M. Sounding the alarm in infection. Mast Cells CounterAttack // J. World Allergy Organization. - March-April 2004. - Vol. 16, № 2. - P. 70-4.
-
Global leprosy situation, 2010 // Wkly Epidemiol. Rec. - 2010. - Vol. 85, № 35. - P. 337-48.
-
Godal T. Immunological aspects of leprosy. - Present status // Prog. Allergy. - 1978. - Vol. 25. - P. 211-42.
-
Gorodezky C., Flores J., Arevalo N. et al. Tuberculoid leprosy in Mexicans is associated with HLA-DR3 // Lepr. Rev. - 1987. - Vol. 58. - P. 401-6.
-
Granelli-Piperno A., Zhong L. et al. Dendritic cells, infected with vesicular stomatitis virus-pseudotyped HIV-1, present viral antigens to CD4+ and CD8+ T cells from HIV-1-infected individuals // J. Immunol. - 2000. - Vol. 165, № 11. - P. 6620-6.
-
Hill A.V. Genetic susceptibility to malaria and other infectious diseases: from the MHC to the whole genome // Parasitology. - 1996. - Vol. 112 (Suppl). - S75-S84.
-
Hill A.V.S., Allsopp C.E., Kwiatkowski D. et al. Common West African HLA antigens are associated with protection from severe malaria // Nature. - 1991. - Vol. 352. - P. 595-600.
-
Jeffery K.J., Siddique A.A., Bunce M. et al. The influence of HLA class I alleles and heterozygosity on the outcome of human T cell lymphotropic virus type I infection // J. Immunol. - 2000. - Vol. 165, № 12. - P. 7278-84.
-
Joko S., Numaga J., Kawashira H. et al. Human leukocyte antigens in forms of leprosy among Japanese patients // Inter. J. Lepr. - 2000. - Vol. 68. - P. 49-56.
-
Klein J., Figueroa F. Evolution of the major histocompatibility complex // Crit. Rev. Immunol. - 1986. - Vol. 6. - P. 295-386.
-
Kresge K.J. Italian AIDS vaccine advances into Phase II trials // IAVI report. - 2005. - Vol. 9, № 3. - P. 24.
-
Lipsitch M., Bergstrom C.T., Antia R. Effect of human leukocyte antigen heterozygosity on infectious disease autcome: The need for allele-specific measures // BMC Medical Genetics. - 2003. - № 4. - P. 2.
-
Lockett S.F., Robertson J.R., Brettle R.P. et al. Mismatched human leukocyte antigen alleles protect against heterosexual HIV transmission // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. - 2001. - Vol. 27, № 3. - P. 277-80.
-
Lyles C.M., Graham N.M., Astemborski J. et al. Cell-associated infectious HIV-1 viral load as a predictor of clinical progression and survival among HIV-1 infected injection drug users and homosexual men // Eur. J. Epidemiol. - 1999. - Vol. 15, № 2. - P. 99-108.
-
Makhatadze N., Sanchez-Llamozas P., Frajo M.T. et al. Strong association between major histocompatibility complex class I antigens and immune aberrations among healthy Venezuelans // Hum. Immunol. - 1995. - Vol. 42. - P. 189-94.
-
Marsh S., Bodmer J., Albert E. et al. Nomenclature for factors of the HLA system, 2000 // Hum. Immunol. - April 2001. - Vol. 62, № 4. - P. 419-68.
-
Matsumoto K., Yasugi T., Nakagawa S. et al. Human papillomavirus type 16 E6 variants and HLA class II alleles among Japanese women with cervical cancer // Int. J. Cancer. - 2003. - Vol. 106, № 6. - P. 919-22.
-
McClelland E.E., Penn D.J., Potts W.K. Major Histocompatibility Complex heterozy-gote superiority during coinfection // Infection and Immunity. - 2003. - Vol. 71, № 4. - P. 2079-86.
-
McCombs C.C., Michalski J.P. Lymphocyte abnormality associated with HLA-B8 in healthy youth and adults // J. Exp. Med. - 1982. - Vol. 156. - P. 936-41.
-
McCombs C.C., Michalski J.P., De-Shazo R. et al. Immune abnormalities associated with HLA-B8: lymphocyte subsets and functional correlation // Clin. Immunol. Immunopathol. - 1986. - Vol. 39. - P. 112-20.
-
McDonald K.S., Fowke K.R., Kimani J. et al. Influence of HLA supertypes on susceptibility and resistance to human immunodeficiency virus type 1 infection // J. Infect. Dis. - 2000. - Vol. 181, № 5. - P. 1581-9.
-
Mc Kiernan S.M., Hagan R., Curry M. et al. Distinct MHC class I and II alleles are associated with hepatitis C viral clearance? Originating from a single source // Hepatology. - 2004. - Vol. 40, № 1. - P. 108-14.
-
Mehra N.K., Rajalingam R., Mitra D.K. et al. Variants of HLA-DR2/DR51 group hap-lotypes and susceptibility to tuberculoid leprosy and pulmonary tuberculosis in Asian Indians // Inter. J. Lepr. - 1995. - Vol. 63. - P. 241-48.
-
Meyer L., Carre N. Cofactors in the course of HIV infection // Presse Med. - 1996. - Vol. 25, № 8. - P. 379-80, 382-4.
-
Minton E.J., Smillie D., Neal K.R. et al. Association between MHC class II alleles and clearance of circulating hepatitis C virus. Members of the Trent Hepatitis C Virus Study Group // J. Infect. Dis. - 1998. - Vol. 178, № 1. - P. 1309-10.
-
Modica M.A., Cammarata G., Caruso C. HLA-B8, DR3 phenotype and lymphocyte responses to phytohaemagglutinin // J. Immunogenet. - 1990. - Vol. 17. - P. 101-7.
-
Moretta A., Bottino C., Biassoni R. The natural cytotoxicity receptors that trigger human NK cell-mediated functions14th European histocompatibility Conference, 4-7 April 2000, Montpellier, France. - 2000. - P. 34.
-
Motta P., Marinic K., Sorrentino A. et al. Association of HLA-DQ and HLA-DR alleles with susceptibility or resistance to HIV-1 infection among the population of Chaco Province, Argentina // Medicina (B Aires). - 2002. - Vol. 62, № 3. - P. 245-8.
-
Naik E., LeBlanc S., Tang J. et al. The complexity of HLA class II (DRB1, DQB1, DM) associations with disseminated Mycobacterium avium complex infection among HIV-1-seropositive whites // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. - 2003. - Vol. 33, № 2. - P. 140-5.
-
Nei M., Hughes A.L. Polymorphism and evolution of the major histocompatibility complex loci in mammals /In: R.Selander, A. Clark, T. Whittam, eds. Evolution at the molecular level // Sinauer Associates, Sunderland, Mass. - 1991. - P. 227-47.
-
Oberlin E., Amara A., Bachelerie F. et al. The CXC chemokine SDF-1 is the ligand for LESTR/fusin and prevents infection by T-cell-line-adapted HIV-1 // Nature. - 1996. - Vol. 382, № 6594. - P. 833-5.
-
O’Brien W.A., Koyanagi Y., Namazie A. et al. HIV-1 tropism for mononuclear phagocytes can be determined by regions of gp120 outside the CD4-binding domain // Nature. - 1990. - Vol. 348, № 6296. - P. 69-73.
-
O’Brien S.J., MooreJ.P. The effect of genetic variation in chemokines and their receptors on HIV transmission and progression to AIDS // Immunol. Rev. - 2000. - Vol. 177. - P. 99-111.
-
Ottenhoff T.H.M., de Vries R.R.P. HLA class II immune response and suppression genes in leprosy // Int. J. Lepr. - 1987. - Vol. 55. - P. 521-34.
-
Park M.H., Song E.Y., Ahn C. et al. Two subtypes of hepatitits B virus-associated glomerulonephritis are associated with different HLA-DR2 alleles in Koreans // Tiss. Antigens. - 2003. - Vol. 62. - P. 505-11.
-
Penn D.J., Damjanovich K., Potts W.K. MHC Heterozygosity confers a selective advantage against multiple-strain infections // Proc. Natl. Acad. Sci. - 2002. - Vol. 99, № 17. - Р. 11260-4.
-
Rani R., Fernandez-Vina M.A., Zaheer S.A. et al. Study of HLA class II alleles by PCR oligotyping in leprosy patients from North India // Tiss. Antigens. - 1993. - Vol. 42. - P. 133-7.
-
Ridley D.S., Jopling W.H. Classification of leprosy accoding to immunity. A five-group system // Int. J. Lepr. - 1966. - Vol. 34. - P. 255-73.
-
Roe D.L., Lewis R.E., Cruse J.M. Association of HLA-DQ and -DR alleles with protection from or infection with HIV-1 // Exp. Mol. Pathol. - 2000. - Vol. 68, № 1. - P. 21-8.
-
Ruiz M.E., Cicala C., Arthos J. et al. Peripheral blood-derived CD34+ progenitor cells: CXC chemokine receptor 4 and CC chemokine receptor 5 expression and infection by HIV // J. Immunol. - 1998. - Vol. 161, № 8. - P. 4169-76.
-
Sadeharju K., Knip M., Hiltunen M. et al. The HLA-DR phenotype modulates the humoral response to enterovirus antigens // Diabetologia. - 2003. - Vol. 46, № 8. - P. 1100-5.
-
Schauf V., Ryan S., Scollard D. et al. Leprosy associated with HLA-DR2 and DQw1 in the population of northern Thailand // Tiss. Antigens. - 1985. - Vol.26. - P. 2437.
-
Shaw M.A., Donaldson I.J., Collins A. et al. Association and linkage of leprosy phe-notypes with HLA class II and tumour necrosis factor genes // Genes Immun. - 2001. - Vol. 2. - P. 196-204.
-
Smith M.W., Dean M., Carrington M. et al. Contrasting genetic influence of CCR2 and CCR5 variants on HIV-1 infection and disease progression. Hemophilia Growth and Development Study (HGDS), Multicenter AIDS Cohort Study (MACS), Multicenter Hemophilia Cohort Study (MHCS), San Francisco City Cohort (SFCC), ALIVE Study // Science. - 1997. - Vol. 277. - P. 959-65.
-
Soebono H., Giphart M.I., Schreuder G.M. et al. Association between HLA-DRB1 alleles and leprosy in an Indonesian population // Int. J. Lepr. - 1997. - Vol. 65. - P. 190-6.
-
Su B., Jin L., Hu F. et al. Distribution of two HIV-1-resistant polymorphisms (SDF1-3’A and CCR2-64I) in East Asian and world populations and its implication in AIDS epidemiology // Am. J. Hum. Genet. - 1999. - Vol. 65, № 4. - P. 1047-53.
-
Su B., Sun G., Lu D. et al. Distribution of three HIV-1 resistance-conferring polymorphisms (SDF1-3’A, CCR2-641, and CCR5-delta32) in global populations // Eur. J. Hum. Genet. - 2000. - Vol. 8, № 12. - P. 975-9.
-
Takahashi M., Ishizaka A., Nakamura H. et al. Specific HLA in pulmonary MAC infection in a Japanese population // Am. J. Respir. Crit. Care Med. - 2000. - Vol. 162, № 1. - P. 316-8.
-
Thio C.L., Carrington M., Marti D., O’Brien S.J. et al. Class II HLA alleles and hepatitis B virus persistence in African Americans // J. Infect. Dis. - 1999. - Vol. 179, № 4. - P. 1004-6.
-
Thursz M.R., Thomas H.C., Greenwood B.M. et al. Heterozygote advantage for HLA class-II type in hepatitis B virus infection // Nat. Genet. - 1997. - Vol. 17, № 1. - P. 11-2.
-
Thursz M., Yallop R., Goldin R. et al. Influence of MHC class II genotype on outcome of infection with hepatitis C virus. The HENCORE group. Hepatitis C European Network for Cooperative Research // Lancet. - 1999. - Vol. 354, № 9196. - P. 2094-5.
-
Van Eden W., de Vries R.R., Mehra N.K. et al. HLA segregation of tuberculoid leprosy: confirmation of the DR2 marker // J. Infect. Dis. - 1980. - Vol. 141, № 6. - P. 693-701.
-
Wawrzynowicz-Syczewska M., Underhill J.A., Clare M.A. et al. HLA class II genotypes associated with chronic hepatitis C virus infection and response to alfa-interferon treatment in Poland // Liver. - 2000. - Vol. 20, № 3. - P. 234-9.
-
Winkler C., Modi W., Smith M.W. et al. Genetic restriction of AIDS pathogenesis by an SDF-1 chemokine gene variant. Alive Study, Hemophilia Growth and Development Study (HGDS), Multicenter AIDS Cohort Study (MACS), Multicenter Hemophilia Cohort Study (MHCS), San Francisco City Cohort (SFCC) // Science. - 1998. - Vol. 279. - P. 389-93.
-
Yu X.F., Wang Z., Vlahov D. et al. Infection with dual-tropic human immunodeficiency virus type 1 variants associated with rapid total T cell decline and disease progression in injection drug users // J. Infect. Dis. - 1998. - Vol. 178, № 2. - P. 388-96.
-
Zaitseva M., Blauvelt A., Lee S. et al. Expression and function of CCR5 and CXCR4 on human Langerhans cells and macrophages: implications for HIV primary infection // Nat. Med. - 1997. - Vol. 3, № 12. - P. 1369-75.
-
Zinkernagel R.M., Doherty P.C. Immunological surveillance against altered self components by sensitized T lymphocytes in lymphocytic choriomeningitis // Nature. - 1974. - Vol. 251, № 5475. - P. 547-8.
-
Zou Y.R., Kottmann A.H., Kuroda M. et al. Function of the chemokine receptor CXCR4 in haematopoiesis and in cerebellar development // Nature. - 1998. - Vol. 393, № 6685. - P. 595-9.
Глава 4. Трансплантация органов и тканей человека, полиморфизм HLA и биобезопасность
Как указывалось ранее, появление и формирование такого направления, как «Иммуногенетика человека», связано с развитием клинической трансплантологии. Напоминанием этого является само название комплекса классических генов, выполняющих основную роль в контроле иммунного ответа человека, - «гены тканевой совместимости», т.е. гены, ответственные за приживление и отторжение трансплантата. Данная функция этих генов является частной. В действительности их функции гораздо более разнообразны и значимы. Они осуществляют контроль физиологических функций организма и участвуют в инициации и патогенезе целого ряда заболеваний. Таким образом, название «гены тканевой совместимости» отражает историю их открытия, напрямую связанную с решением проблемы тканевой совместимости. Вопрос о переименовании комплекса генов тканевой совместимости в комплекс генов иммунного ответа стоял на повестке дня иммунологических конгрессов в конце 1970-х - начале 1980-х годов. Однако при обсуждении этого вопроса было решено оставить уже укоренившуюся терминологию - главный комплекс гистосовместимости (МНС - Major Histocompatibility Complex), а для человека - еще более старое название HLA (Human Leukocyte Antigens). Coхранение этой терминологии - дань уважения исследователям, стоявшим у истоков развития иммуногенетики человека (Ж. Доссе, В. и Дж. Бодмер, Р. Цепеллини, Б. Эмос, Р. Пейн), а также справедливое предположение о том, что в будущем, возможно, будут выявлены и охарактеризованы гены и генетические системы, наряду с HLA играющие существенную роль в регуляции иммунного ответа. Это предположение подтвердилось в последние годы, когда вновь открытые гены, принимающие участие в контроле иммунного ответа и входящие в главный комплекс тканевой совместимости, получили официальное название «не-HLA-гены иммунного ответа», хотя возможно, что в будущем это название будет пересмотрено.
Что же касается самой клинической трансплантации, то история ее развития служит, по-видимому, наиболее очевидным и ярким примером того, как решение фундаментальных проблем иммунологии открыло путь к появлению и развитию клинической трансплантологии как новому клиническому направлению, над созданием которого практическая медицина безуспешно работала в течение многих веков.
Дело в том, что история развития клинической трансплантологии введет свое начало еще от античных времен, когда зародилась сама идея «замены» органов и тканей человека с помощью их пересадки. Вполне естественно, что первоначальной «трансплантологической» идеей была замена конечностей (руки, ноги), утерянных в сражениях. О попытках такого рода пересадок можно судить по древним рисункам, а также по египетским, греческим, римским и индийским литературным источникам. Есть основание считать, что первая попытка трансплантации была предпринята именно в Индии.
Теперь мы знаем, что в то время все такого рода попытки были обречены на неудачу хотя бы потому, что врачи, даже такие великие, как Гиппократ и Авиценна, не имели представления о системе кровообращения органов, без восстановления которой невозможно и восстановление функций пересаженного чужеродного или даже приживление собственного «потерянного» или отчужденного органа.
Понимание того, каким образом осуществляется кровоснабжение, пришло к врачам через сотни лет, когда английский хирург Уильям Гарвей открыл систему кровообращения человека. Следствием этого гениального открытия стало появление хирургии как науки, позволяющей спасать жизнь и здоровье людей, в том числе перенесших различного рода травмы в результате боевых действий. Вновь были предприняты попытки пересадить воинам, утратившим свои конечности, чужеродные руки или ноги либо же их собственные, но и эти попытки оказались безуспешными. Важным моментом, зафиксированным в истории развития трансплантации органов, стал 1778 г., когда Джон Хантер, проводивший эксперименты по пересадке органов животным, впервые ввел понятие «трансплантат».
Следует отметить, что великий русский хирург Н.И. Пирогов, которому принадлежит разработка техники хирургических операций, применяющихся до настоящего времени, т.е. более 150 лет, первым осуществил успешные восстановительные операции носа и ушей на основе пересадок собственных хрящей и кожи [22, 23].
Вслед за Н.И. Пироговым вклад в решение хирургических проблем пересадки органов и тканей внес выдающийся французский хирург Алексис Каррель, удостоенный за эти работы в 1912 г. Нобелевской премии. Благодаря его работам удавалось успешно вернуть на место собственную руку, ногу или их часть. Но в то же время они никогда не приживались, если речь шла о пересадках от другого человека; более того, в этих случаях пациент, как правило, погибал.
Принципиальную возможность подбора совместимого донора, но не органов, а одной из важнейших для жизнедеятельности человека тканей - крови, блестяще доказал лауреат Нобелевской премии 1930 г. австрийский врач и химик Карл Ландштейнер, открывший наличие у людей различных групп крови. Он доказал также, что кровь от донора для нуждающегося в переливании крови больного (реципиента) может быть перелита только при условии их совместимости по эритроцитарным антигенам, определяющим ту или иную группу крови. Благодаря этому великому открытию были спасены миллионы человеческих жизней. Переливание крови стало широкодоступной процедурой, благодаря ограниченному количеству групп крови - их всего четыре и дополнительные две, так называемые резус-фактор положительная и резус-фактор отрицательная, открытые позже. Сегодня не только гематологические центры, но и все больницы должны иметь запасы крови всех этих групп, чтобы при необходимости обеспечить ею любого пациента.
Однако и это открытие не смогло решить проблему трансплантации органов, поскольку совместимость по группам крови не обеспечивала приживление пересаженных чужеродных органов. Так, неудачей закончилась предпринятая в 1933 г. попытка пересадить почку от совместимого по группе крови погибшего человека. В этом случае сочли, что неудача, возможно, связана с тем, что в качестве трансплантата был использован орган, изъятый у трупа. Однако точно так же окончилась в 1952 г. попытка французских хирургов пересадить почку и от живого, генетически неродственного донора.
В то же время принципиальная возможность иммуногенетического подбора донора для трансплантации была установлена еще раньше. Так, в 1930-1940-х годах были созданы имбредные линии мышей, что позволило Дж. Снеллу, используя межлинейные комбинации при пересадках кожных трансплантатов, не только конкретизировать роль иммунной реакции в отторжении трансплантата, но и открыть систему генов иммунного ответа мышей - H2, ответственную за отторжение трансплантата; в это время и появилось само понятие «иммуногенетика».
Что касается клинической трансплантации, то первой удачной пересадкой органа человека стала пересадка почки реципиенту от однояйцового близнеца, выполненная Бостонским хирургом Джоном Мюрреем [61]. Именно это событие принято считать началом эпохи клинической трансплантации органов, поскольку до этого момента речь могла идти только об экспериментальной трансплантологии.
Таким образом, опыт, в основном негативный, хирургов, пытавшихся осуществлять пересадки органов и тканей, позволил сделать следующие заключения:
-
Трансплантаты, как органные, так и тканевые чужеродного происхождения, неизменно отторгаются, что, как правило, приводит к гибели больного.
-
Совершенствование хирургической техники пересадки не решает данную проблему.
-
Успешно пересаженной может быть ткань или орган, «изъятый» у самого пациента или же у его гомозиготного близнеца.
Однако само понятие «клиническая трансплантология», которое можно сформулировать как отрасль клинической медицины, в которой лечение больных осуществляется с помощью замены их жизненно важного органа или тканей, утративших свои функции, на аналогичные «функционирующие» чужеродные орган или ткань, обрело свое содержание несколько позже. Это произошло в начале 1960-х годов, когда была найдена возможность проведения клинических трансплантаций не только от одного генетически идентичного близнеца к другому, что определяло эксклюзивный характер данного вида лечения, но и от неродственных тканесовместимых доноров.
Собственно, сам факт того, что успешную пересадку органа Джону Мюррею удалось осуществить, используя иммуногенетически идентичный трансплантат, убедил хирургов в том, что для успешной трансплантации нужна тканевая совместимость донора и реципиента на принципиально ином уровне, нежели при переливании крови.
Таким образом, трансплантология как полноправная клиническая дисциплина смогла полностью сформироваться только после того, как в отношении других тканей человека, помимо крови, была решена проблема их биологического подбора, а именно решена проблема создания методов установления тканевой совместимости донора и реципиента на основе их иммуногенетического типирования.
В 1956 г. французским иммуногематологом Жаном Доссе был открыт первый антиген тканевой совместимости, позже получивший обозначение - HLA-A2. Поскольку он был обнаружен на лейкоцитах, то и назвали его лейкоцитарным антигеном. Сама система была названа системой HLA.
Это открытие послужило толчком к планомерному и интенсивному изучению генов, ответственных за развитие реакции отторжения человека, причем эти работы проводились не отдельными исследовательскими группами, а на основании международного сотрудничества под эгидой международных программ по изучению HLA. Благодаря усилиям научных коллективов из различных стран, практически все HLA-антигены - белковые молекулы, экспрессированные на всех ядросодержащих клетках организма человека, известные на сегодняшний день, - были установлены уже в конце 1970-х годов, и к этому же времени были установлены многие основные биологические функции комплекса HLA-генов, кодирующих выявленные антигены.
За открытие антигенов тканевой совместимости человека (HLA), разработку подходов к их типированию и вклад в изучение их биологической роли в 1980 г. Жан Доссе был удостоен Нобелевской премии. Вместе с ним этой премии были удостоены Дж. Снелл и Б. Бенацераф, установившие и исследовавшие системы тканевой совместимости у животных. Дальнейшие исследования в этой области приобрели еще более интенсивный международный характер, и совместными усилиями многих научных коллективов идентифицировано более 10000 аллельных вариантов генов иммунного ответа, по которым сегодня осуществляют подбор совместимых пар донор-реципиент. Это сделало возможным подбор не только из числа родственных индивидуумов, но и среди тканесовместимых неродственников (подробнее см. ниже).
4.1. Клиническая трансплантация органов
Становлению клинической трансплантации органов как полноправной отрасли современного здравоохранения способствовал принципиально новый подход, разработанный в конце 1960-х годов [73] и используемый по настоящее время. Суть этого подхода состоит в том, что все больные, нуждающиеся в пересадке органов, т.е. потенциальные реципиенты, проживающие на территории того или иного крупного города, региона, отдельно взятой страны или объединения нескольких государств, проходят процедуру установления набора их HLA-генов (HLA-генотипов), определяющих их тканевую совместимость. Эти данные включаются в единый лист ожидания трансплантата потенциальных реципиентов, нуждающихся в трансплантации органов от тканесовместимых посмертных доноров органов. Таким образом, единый лист ожидания содержит данные, включающие индивидуальный набор тканесовместимых генов по всем потенциальным реципиентам, ожидающим трансплантацию органов в конкретном городе, регионе, стране или объединении государств. При этом следует отметить, что чем большее количество больных входит в лист ожидания, тем больше вероятность нахождения полностью тканесовместимой пары донор-реципиент. Минимальное количество пациентов в листе ожидания, при котором имеется вероятность для нахождения тканесовместимого донора органного трансплантата пациенту в листе ожидания, измеряется тысячами человек. Такая ситуация имеет место, в частности, в Московском регионе. Оптимальный вариант - это наличие в листе ожидания десятков и сотен тысяч человек, как это было, например, до конца 1980-х годов в объединении Соцтрансплант, включавшим в себя страны СЭВ (Совет экономической взаимопомощи). В настоящее время подобная ситуация наблюдается в таких объединениях, как Евротрансплант, объединяющий государства Западной и Центральной Европы.
Каждого потенциального посмертного донора, органы которого пригодны для трансплантации, а их изъятие может быть проведено лишь в соответствии с действующим национальным законодательством, также обследуют на предмет установления HLA-генотипа.
Вслед за этим данный HLA-генотип сопоставляют/скринируют через лист ожидания на предмет установления наиболее тканесовместимого с ним больного, входящего в лист ожидания [9]. Использование этого принципа обеспечивает как эффективность самой трансплантации, так и возможность контроля легитимности клинической трансплантации, поскольку в случае необходимости, например при подозрении на нарушение принципов безвозмездности и равнодоступности клинической трансплантации, в любое время может быть проведена повторная оценка тканевой совместимости (генотипирование) донора и реципиента. Такая возможность существует благодаря сохранению донорской ДНК, образцы которой сохраняются в течение длительного времени.
В целом следует сказать, что открытие генов тканевой совместимости и широкое использование тканесовместимых пар в клинической трансплантологии стали и являются в большинстве стран мира по настоящее время краеугольным камнем развития трансплантологии как клинической дисциплины. Так, поскольку к моменту открытия генов тканевой совместимости человека уже практически не существовало хирургических проблем в пересадке органов и тканей, очень быстро, в течение 5-10 лет в 1960-1970-е годы, из фундаментального направления медицины, когда каждая пересадка органов являлась не столько клиническим, сколько научным событием, трансплантология превратилось в полноценную и одну из наиболее передовых отраслей клинической медицины.
На этом пути одним из наиболее знаковых событий стала первая успешная клиническая пересадка сердца, выполненная южноафриканским хирургом Кристианом Барнардом в 1967 г. [39]. Это событие породило первую в истории клинической трансплантологии правовую и этическую дискуссию по тем вопросам, которые до настоящего времени остаются в центре внимания как специалистов-правоведов и врачей-трансплантологов, так и широких кругов общественности. И по сей день среди этих вопросов есть, в частности, вопросы о правах донора (в том числе посмертного), об ответственности врачей-трансплантологов, необходимости создания соответствующей правовой базы и, наконец, о проблеме торговли органами.
Принципиально важной вехой в истории трансплантологии, позволившей сделать прорыв в преодолении отторжения пересаженного органа у больного и продлении срока жизни пересаженного органа, стало открытие швейцарским ученым Д. Борелом в 1972 г. и введение в клиническую практику в 1979 г. Р. Kaлнэ [42, 44] лечебного препарата циклоспорина (сандиммуна), подавляющего развитие реакции отторжения за счет неспецифического угнетения иммунной системы реципиента. Применение данного лекарства в сочетании со стероидными гормонами в послеоперационном периоде дало возможность перейти от единичных, сенсационных по своей удаче трансплантаций почки, к серийным пересадкам органов, благодаря чему удается спасать жизни огромному числу людей, страдающих тяжелыми формами заболеваний различного генеза, обреченных до этого на неминуемую смерть. В последнее время главенствующее значение в мировой клинической трансплантологии, включая Россию, приобрела пересадка почек [34]. Сегодня в мире насчитывается более 700000 человек, которые живут уже более 10 лет с пересаженными почками.
В последние годы в мире возрастает количество и других видов трансплантаций - сердце, печень, легкие, эндокринные органы, но особое место приобретает пересадка костного мозга, точнее КСК. Данный вид трансплантаций занимает второе место в мировой практике после пересадки почки, но имеет все шансы выйти на первое место в будущем [47].
Клиническая трансплантация в своем развитии использует новейшие достижения молекулярной генетики, биотехнологии, фармакологии, биохимии и биоинформатики, а также других новых отраслей биологии и медицины. Таким образом, в результате развития клинической трансплантологии были созданы десятки и сотни новых препаратов, направленных на предотвращение и подавление реакции отторжения трансплантата. Многие из этих препаратов уже вторично нашли свое место в других областях медицины, в частности при лечении аутоиммунных заболеваний и аллергий.
Большое значение в развитии клинической трансплантации органов имели международные программы по обмену тканесовместимыми трансплантатами, в первую очередь почек, часть из которых существует и в настоящее время. Задачей данных программ было и есть безвозмездное сотрудничество по обмену органными трансплантатами для обеспечения пересадок органов тканесовместимым реципиентам вне зависимости от места нахождения реципиента. Для обеспечения эффективного сотрудничества были созданы международные листы ожиданий, включающие реципиентов, ожидающих появления тканесовместимых с ними донорских органов. Под понятием «тканесовместимые донор и реципиент» как в прошлый период, так и в настоящее время следует понимать в первую очередь совместимость по специфичностям HLA. Эти специфичности первоначально выявлялись так называемыми методами протеомного типирования, основанного на установлении специфичности молекул HLA-антигенов. В настоящее время основной метод - HLA-генотипирование [62].
Что касается пересадки КСК, то в период 1960-1970-х годов относительно эффективными оказались пересадки лишь от родственных доноров, и в первую очередь от братьев и сестер. Полное понимание причины указанной проблемы и далее ее решение начинаются в конце 1980-х годов и связаны с переходом с «классических» - протеомных методов HLA-типирования (серологических, клеточно-опосредованных), позволяющих идентифицировать не сами гены HLA, а их продукты - HLA-антигены, - на молекулярно-генетические методы, позволяющие «прямо» идентифицировать аллели HLA. Практическим результатом этого перехода стало то, что вместо 138 HLA-специфичностей, идентифицируемых до этого перехода, появилась возможность уже к 2012-му году выявлять более 8000 аллельных вариантов специфичностей (см. табл. 2.1, глава 2). На настояший момент их число превышает 10000 (рис. 2.1, см. цв. вклейку). Эти два уровня HLA-генотипирования в клинической трансплантологии принято обозначать как уровни низкого и высокого разрешения. В настоящее время генотипирование осуществляется и для выявления тех специфичностей, которые ранее выявлялись в протеомных тестах (т.е. типирование на низком уровне разрешения).
В табл. 2.1 (см. гл. 2) приведены данные о современной номенклатуре главного комплекса гистосовместимости человека в сравнении с данными, имевшимися на момент использования лишь «классических» - протеомных методов HLA-генотипирования. Приведенные в таблице данные свидетельствуют о том, что благодаря переходу на молекулярно-генетические методы типирования были открыты не только новые HLA-специфичности (аллельные варианты), входящие в уже известные локусы и гены, но и выявлены новые гены, многие из которых кодируют белки, принимающие непосредственное участие в развитии реакции отторжения или иных физиологических функциях организма. При этом надо помнить, что при трансплантации органов и тканей отторжение является физиологическим процессом, а преодоление реакции отторжения трансплантата - напротив, отнюдь не физиологический процесс. Следует отметить, что изучение роли вновь открытых генов HLA в развитии реакции отторжения трансплантата активно продолжается и в настоящее время. Практическим результатом этого является тот факт, что постоянно совершенствуется представление о том, какие из генов HLA необходимо учитывать при селекции совместимых пар донор-реципиент. Особенно актуально это направление исследований для повышения эффективности пересадки КСК [30].
Переход на уровень селекции пар донор-реципиент при подборе органных трансплантатов иммунокомпрометированным реципиентам органных трансплантатов и реципиентам КСК, полученных от неродственных доноров-добровольцев, сделал эффективным и этот вид клинической трансплантации (подробнее см. ниже). Естественно, что установленный на сегодняшний день уровень генетического полиморфизма (разнообразия) системы HLA потребовал огромного количества доноров-добровольцев КСК, объединенных в регистры безвозмездных неродственных доноров. Данная проблема решена на уровне международного сотрудничества. Общее количество таких доноров в мире превышает 19 млн, что обеспечивает возможность подбора полностью совместимых КСК для 80% больных, нуждающихся в их трансплантации.
Существенно более сложной является ситуация с подбором полностью совместимых пар донор-реципиент при органных трансплантациях.
Дело в том, что главная проблема трансплантации органов - нехватка аллогенных неродственных трансплантатов, основным источником которых служат посмертные доноры [9]. Решение этой проблемы состоит в создании многотысячных (в основном международных) листов ожидания трансплантатов.
Учитывая это обстоятельство, в странах, не участвующих в программах обмена органными тканесовместимыми трансплантатами, в ряде случаев трансплантологи вынуждены снижать требования к уровню тканевой совместимости органного донора и реципиента и пытаться «компенсировать» тканевую несовместимость контролируемой иммунодепрессивной терапией.
Открытие препаратов, подавляющих иммунный ответ реципиента на чужеродные HLA-антигены, стало вторым (после открытия системы HLA) важнейшим достижением биомедицинской науки.
Развитие данного направления иммунотерапии привело к усовершенствованию препаратов, относящихся к группе иммунодепрессантов, и снизило вероятность развития побочных эффектов и осложнений, возникающих даже при проведении поддерживающей терапии. Вместе с тем необходимо отметить, что использование высоких доз даже современных иммунодепрессантов - необходимое и основное средство купирования кризов отторжения пересаженных органов - зачастую ведет к глубокому угнетению противоинфекционного иммунитета и к развитию инфекционных осложнений, в том числе вызванных условно-патогенной флорой организма. Последнее в ряде случаев заканчивается гибелью реципиента даже при функционирующем трансплантате [17].
Другой причиной гибели реципиента при функционирующем трансплантате является смерть от сердечно-сосудистых осложнений, также вызванных использованием высоких доз иммунодепрессантов, назначаемых в целях подавления кризов отторжения трансплантата [35]. Основной причиной кризов отторжения является HLA-несовместимость донора и реципиента, и чем ниже уровень HLA-совместимости, тем выше вероятность возникновения криза.
Следует отметить, что реципиентов органных трансплантатов необходимо подразделить на 2 основные группы по степени HLA-совместимости с донором, которая может обеспечить снижение вероятности развития кризов отторжения (в том числе некупируемых - ведущих к потере функции трансплантата).
Первая группа (серонегативная) - соответственно около 90% реципиентов листа ожидания для России и около 30% для стран, входящих в международные объединения трансплантологов, - не несут такие антитела или имеют их в незначительных количествах. Подбор тканесовместимого донора в этой группе может быть ограничен подбором лишь по HLA-специфичностям класса II (HLA-DRB1) на уровне низкого разрешения - всего 18 специфичностей, благодаря чему для эффективного подбора достаточно листа ожидания, включающего 500-1000 реципиентов. Возможность такого рода эффективного подбора впервые была установлена отечественными исследователями [66], а затем подтверждена работами ряда зарубежных исследователей.
Вторая группа объединяет так называемых серопозитивных или иммунокомпрометированных реципиентов, в крови которых выявляются высокие титры предсуществующих антител, образовавшихся вследствие гемотрансфузий, гемодиализов или предшествующих трансплантаций. Число таких реципиентов составляет около 5-10% листа ожидания Московского региона. В этом случае из-за резко возрастающей угрозы потери трансплантата необходим тщательный подбор пар донор-реципиент, соответствующий таковому при трансплантации кроветворных стволовых клеток или костного мозга (КСК/КМ). Вероятность нахождения HLA-совместимой пары донор-реципиент составляет 1 на 1 000000, т.е. она приближается к требованиям, предъявляемым к подбору пар донор-реципиент при пересадке КСК.
Естественно, что при органных пересадках, в отличие от пересадок КСК/ КМ, где подбор может проводиться из контингента живых доноров-добровольцев (более 18 000000 добровольцев, входящих во Всемирный регистр), такая ситуация при трансплантации органов трупного происхождения нереальна. Это объясняется тем, что для нахождения HLA-совместимой пары донор-реципиент HLA-генотип каждого донора сопоставляется (скринируется) с HLA-генотипами потенциального реципиента из листа ожидания. Для Москвы лист ожидания не превышает 1000 человек, а международные регистры насчитывают не более 50000 человек.
Для стран, участвующих в таких объединениях, имеющих программы международного сотрудничества со значительными объемами международных листов ожидания, подбор тканесовместимых пар донор-реципиент, основанный на использовании HLA-генотипирования низкого уровня разрешения, вполне реален. Например, программа «Евротрансплант» объединяет все страны ЕС. Естественно, что на территории крупных стран, например США, обмен осуществляется на уровне взаимодействия отдельных штатов. Благодаря этому обмену реальный лист ожидания исчисляется тысячами и десятками тысяч реципиентов, что позволяет эффективно осуществлять подбор тканесовместимых трансплантатов не только по DRВ1, но и по специфичностям класса I (HLA-A и -B). Схожая ситуация была и в СССР, когда обмен трансплантатами осуществлялся не только на уровне региональных трансплантационных центров, но и на уровне стран СЭВ, в рамках существовавшей программы. Для стран, которые, как и Россия, не объединены в международные регистры, может быть предложен другой подход.
В настоящее время, в первую очередь вследствие экономической ситуации, на территории РФ практически отсутствует возможность обмена трансплантатами и максимальные объемы листов ожидания не превышают 400-500 потенциальных реципиентов, что исключает возможность эффективного подбора тканесовместимых трансплантатов органов по HLA-специфичностям I и II классов (HLA-DRB1 и HLA-A, -B).
Предлагающийся для трансплантологических центров с ограниченными листами ожидания переход селекции пар донор-реципиент на основе лишь совместимости по HLA-DRB1 имеет и теоретическое обоснование. Если реципиент не сенсибилизирован HLA-антигенами, представленными в HLA-генотипе донора, что устанавливается на основании отсутствия соответствующих антител, то иммунный ответ против чужеродных HLA-специфичностей донора (отсутствующих в HLA-генотипе реципиента) развивается по первичному типу против непроцессированной молекулы HLA-DRB1 [69].
В том случае, если донор и реципиент идентичны по генотипу HLA-DRB1, не развиваются ни клеточный, ни гуморальный ответы против HLA-специфичностей как II, так и I классов. Именно поэтому снижается актуальность селекции по классу I. Это служит объяснением того, что, как было показано в работе А.В. Сечкина [66], в подобных ситуациях несовместимость донора и реципиента по специфичностям HLA класса I при наличии полной совместимости по HLA-DRB1 не оказывает негативного влияния на результат трансплантации.
Еще раз следует повторить, что это относится к случаям, когда в организме реципиента отсутствуют предсуществующие антитела к HLA-антигенам класса I и II, имеющимся в генотипе донора [69].
На рис. 4.1 (см. цв. вклейку) представлены данные о взаимосвязи между HLA-DRB1-совместимостью донора и реципиента, частотой развития некупированных кризов отторжения и 5-летней выживаемости трансплантата. Материалом являются результаты трансплантаций почек в Московском регионе. HLA-селекция осуществлялась в Московском координационном центре органного донорства Московского департамента здравоохранения.
Как следует из представленных данных, в группе, где донор и реципиент полностью совместимы по специфичностям HLA-DRB1, 5-летняя выживаемость на 25% превышает таковую в группе, несовместимой по специфичностям HLA-DRB1. Так, в отношении ранних кризов их частота в группах сравнения различается на 23%. Что же касается некупированных кризов, то они вообще не были зарегистрированы в группе совместимых по HLA-DRB1 пар, но были зарегистрированы у 22,6% несовместимых с донором реципиентов. При этом следует отметить, что интенсивность иммунодепрессивной терапии в последней группе значительно превосходит таковую в первой группе. Последнее обусловлено тем, что количество кризов отторжения значительно выше в несовместимой группе реципиентов по сравнению с совместимой.
Таким образом, использование HLA-DRBl-генотипирования на уровне низкого разрешения позволяет добиться эффективности трансплантаций, соответствующей таковой в передовых трансплантологических центрах мира, где уровень пятилетней выживаемости аллогенных трансплантатов почки составляет 75-85%.
С другой стороны, использование такого подхода позволяет осуществлять подбор HLA-тканесовместимых доноров на уровне ограниченного листа ожидания, имеющегося в настоящее время в московском регионе (400-600 пациентов в листе ожидания). Следует еще раз подчеркнуть, что речь идет о первичных, несенсибилизированных реципиентах, в крови которых предсуществующие антитела либо отсутствуют, либо имеют низкие титры.
Необходимо отметить, что используемые в настоящее время методы молекулярно-генетического типирования, сменившие метод серологического типирования, применявшийся до 1990-х годов для селекции пар донор-реципиент, открыли принципиально новые возможности поиска тканесовместимого органного донора. Одной из них, в частности, стала возможность учитывать при селекции приоритетность использования HLA-DRB1-гомозиготных доноров.
Переход на использование молекулярно-генетического метода HLA- DRB1-селекции совместимых пар донор-реципиент позволил создать в посттрансплантационный период оптимальные условия для обеспечения эффективного функционирования тканесовместимого трансплантата, когда достаточной является доза иммунодепрессантов, не вызывающих существенного угнетения противоинфекционного иммунитета, но при которой развитие кризов отторжения маловероятно.
Разумеется, сегодняшняя ситуация с донорством в мире и особенно в России накладывает определенные ограничения на количество проводимых трансплантаций. Решение данной проблемы, как и в случае с трансплантациями КСК/КМ, связано с расширением листов ожидания реципиентами тканесовместимых трансплантатов, в первую очередь за счет объединения региональных и национальных регистров в международные организации, наиболее известной из которых является Евротрансплант, включающий в себя страны ЕС. В СССР в 1970-1980-е годы обмен трансплантатами проводился на территориях Советского Союза и стран СЭВ [34]. Таким образом, актуальным является создание системы с максимальными возможностями подбора тканесовместимых пар донор-реципиент в условиях ограниченных листов ожидания. При этом необходимо исходить из того, что реально такая возможность имеется лишь для реципиентов с отсутствием или низким уровнем предсуществующих антител, составляющих, по данным Московского координационного центра органного донорства, около 10% листа ожидания [9].
Как указывалось ранее, в этой ситуации (т.е. для 90% реципиентов) достаточным может быть подбор лишь по специфичностям HLA-DRB1, выявляемым на групп-специфическом уровне (т.е. на уровне низкого разрешения). При таком подходе для эффективной селекции тканесовместимых пар донор-реципиент в листе ожидания достаточно около 500 потенциальных реципиентов.
Тем не менее необходимо использовать хотя бы реально имеющиеся в настоящее время возможности, позволяющие осуществлять селекцию HLA-совместимых пар донор-реципиент в целях повышения эффективности органных трансплантаций.
Хотя механизм распознавания иммунодоминантных пептидов в контексте антигенов тканевой совместимости является в целом универсальным, из него, по-видимому, есть отдельные исключения, и в первую очередь это может относиться к распознаванию чужеродных (аллогенных) антигенов тканевой совместимости. Такая ситуация бывает, по крайней мере, в двух случаях: во-первых, при пересадке органов и тканей; а во-вторых, при беременности.
Что касается первой из указанных возможностей, то по первоначально сформировавшемуся представлению, наиболее полно изложенному в начале 1970-х годов [38], Т-клетки реципиента распознавали непосредственно целую молекулу чужеродного антигена (донорского происхождения) тканевой совместимости. Причем Т-хелперы распознавали чужеродные молекулы класса II, а Т-киллеры - чужеродные молекулы класса I. Такого рода распознавание целой непроцессированной молекулы чужеродных антигенов тканевой совместимости принято называть прямым [38].
В последующие годы, в связи с формированием представлений о роли иммунодоминантных пептидов, происходящих из целых антигенных молекул, естественно, возник вопрос о том, не имеет ли место и в случае трансплантационнного иммунитета описанный выше общий механизм антигенного процессинга и экспрессии. При этом были получены данные о реальной возможности распознавания процессированных пептидов чужеродных антигенов тканевой совместимости. Одной из наиболее значимых работ в данной области стала работа S. Khoury et al. [54], выполненная в лаборатории профессора Ch. Carpenter.
Суть данной работы состоит в том, что авторы показали в изящной экспериментальной системе, основанной на индукции иммунного ответа к пептидам класса II, возможность непрямой индукции иммунного ответа отдельными пептидами «донорских» антигенов тканевой совместимости класса II, индуцирующими ответ CD4+ клонов. Более того, авторам удалось показать, что эти клоны, способные продуцировать γ-интерферон, относятся к ThI клонам, и высказали обоснованное предположение о возможной роли непрямого распознавания антигенов тканевой совместимости (т.е. прошедших стадию процессинга), как в реакции отторжения, так и в индукции толерантности.
При этом следует принять во внимание, что эти данные целесообразно рассматривать, учитывая и то, что непрямой путь распознавания может касаться не только чужеродных, т.е. отличающихся от собственных (хотя бы на уровне отдельных пептидов) [36, 53, 58, 72], но и полностью идентичных HLA-антигенов. В пользу последнего свидетельствуют данные о возможности представления HLA-молекулами «собственных» пептидов [30].
Точка зрения о том, что молекулы HLA класса II «представляются» антигенпрезентирующими клетками «хозяина» без предварительного процессинга, не является достоянием истории 1970-1980-х годов. L.A. Sherman и S. Cattopadhyan [69] подтвердили наличие этого механизма уже в 1993 г. Причем эти авторы показали, что непроцессированные HLA-молекулы распознаются в период развития кризов отторжения в реакции смешанной культуры лимфоцитов - MLC (Mixed Lymphocyte Culture).
И наконец, уже в последующие годы появился целый ряд сообщений, авторы которых, используя современные методы исследования, также пришли к выводу о наличии прямого распознавания целой непроцессированной молекулы HLA в клинике трансплантации органов и тканей [40, 65].
Таким образом, дискуссия о том, какой путь распознавания - прямой или непрямой - обусловливает развитие реакции отторжения трансплантата, является незаконченной, и есть основания считать, что истина находится посередине.
Не подвергая сомнению принципиальную возможность участия в развитии реакции отторжения обоих путей распознавания продуктов генов HLA класса II, следует принять во внимание данные исследования Z. Lui et al. [57], которые показали, что бластогенный ответ в культуре лимфоцитов реципиентов с кризом отторжения могут индуцировать не только «целые» молекулы HLA, но и HLA-пептиды донорского генотипа. Вслед за этим A. Segers et al. [68] на международном конгрессе по трансплантации в Монреале в 1998 г. впервые предоставили данные о том, что только часть «чужеродных» HLA-эпитопов, представляемых собственными HLA-молекулами класса II, вызывает развитие иммунного ответа. Авторы отстаивают точку зрения о том, что только эта часть HLA-эпитопов, относящихся как к первому, так и ко второму классу аллелей HLA, вызывает развитие реакции отторжения трансплантата. Естественно, только в том случае, если данный эпитоп отсутствует у реципиента.
Казалось бы, противоположные точки зрения на роль в распознавании и индукции трансплантационного иммунного ответа целых молекул HLA и HLA-пептидов нашли общее решение. Так, исследователями, работающими в коллективе, возглавляемом профессором Дж. ван Руудом, были получены прямые доказательства того, что оба типа распознавания - прямое и непрямое - могут реализовываться одновременно [64]. Во всяком случае было установлено, что индукция цитотоксических Т-киллеров, активность которых направлена против антигенов класса I HLA-A и HLA-B, осуществляется в прямом распознавании, в то время как специфические Т-киллеры, реагирующие в цитотоксическом тесте, индуцируются только при распознавании иммуногенных сайтов пептидов HLA-C-антигенов. Так, в реакции отторжения органного трансплантата антигены HLA-C практически не принимают участия. Именно это объясняет известный трансплантологам факт, что селекция по антигенам HLA-C в клинической практике трансплантации органов не используется уже более 20 лет.
В целом можно констатировать, что на сегодняшний день точка зрения об одновременном участии в развитии реакции отторжения механизма прямого распознавания и ответа на процессированные HLA-пептиды донорского происхождения, представляемые молекулами HLA-реципиента, является наиболее распространенной [65].
Следует также напомнить, что все вышесказанное относится к органной трансплантации. При пересадке костного мозга селекция по всему набору HLA, включая аллели HLA-C, является абсолютно необходимой, и, более того, она имеет большее удельное значение по сравнению с аллелями HLA-А и -B. При этом полная селекция (на уровне аллельных вариантов) по HLA при трансплантации кроветворных стволовых клеток необходима уже при первичных трансплантациях.
Возвращаясь к вопросу об органной трансплантации реципиентам с отсутствием или низким уровнем предсуществующих антител, следует отметить следующее. Ведущую и определяющую роль в селекции пар донор-реципиент играют HLA-специфичности класса II, а не класса I [67]. В этих работах было убедительно показано, что совместимость донора и реципиента по HLA-специфичностям класса I в группе, где у реципиентов не имелось пресенсибилизации, практически не влияла на выживаемость трансплантатов в течение пятилетнего периода при условии идентичности донора и реципиента по специфичностям HLA класса II. При этом речь идет о специфичностях DRB1, выявляемых при генотипировании методом низкого разрешения (общее количество таких специфичностей - не более 18). Следует также отметить, что такой подход к селекции тканесовместимых пар донор-реципиент позволяет решить проблему «короткого листа ожидания», которая является характерной для ситуации, имеющейся на сегодняшний день в России. Так, наиболее обширный для России лист ожидания, имеющийся в Московском регионе, не превышает 2-3 тыс. больных. Однако даже эта цифра достаточна для эффективного подбора полностью DRB1-совместимых пар донор-реципиент [25].
Данные об эффективности селекции аллогенного почечного трансплантата в зависимости от степени совместимости донора и реципиента по специфичностям HLA-DRB1 представлены на рис. 4.1 (см. цв. вклейку). HLA-генотипирование проводили методом полимеразной цепной реакции с использованием сиквенс-специфических праймеров - метод SSP (Sequence Specific Primers). Применяли тест-системы производства ЗАО «НПФ ДНК-технология», г. Москва.
Как следует из представленных данных, в группе полностью совместимых по HLA-DRB1 специфичностям пар донор-реципиент 5-летняя выживаемость на 25% выше по сравнению с группой, несовместимой по специфичностям HLA-DRB1. При этом следует отметить, что интенсивность иммунодепрессивной терапии в последней группе значительно превосходит таковую в первой группе. Последнее обусловлено тем, что количество некупированных кризов отторжения значительно выше в несовместимой группе реципиентов по сравнению с совместимой. Естественно, что данное обстоятельство существенным образом влияет на дальнейший прогноз выживаемости.
Таким образом, использование HLA-DRB1 -генотипирования на уровне низкого/среднего разрешения, позволяет добиться эффективности трансплантаций, соответствующей передовым трансплантологическим центрам мира, где уровень 5-летней выживаемости аллогенных трансплантатов почки равен 75-85%. Также показано, что при наличии HLA-DRB1-совместимости пар донор-реципиент [25, 67] HLA-совместимость по локусам I класса (HLA-A, -B) влияет на эффективность трансплантации почки, т.е. не имеется выраженных различий в группах, где при наличии HLA-DRB1-совместимости имелась или не имелась совместимость по HLA-A, -B. Таким образом, эффективность определяется в первую очередь именно HLA-DRB1-совместимостью.
Причем существует реальная возможность повышения процента подбора совместимых по двум HLA-DRB1 -специфичностям пар донор-реципиент. Эта возможность основана на перспективном использовании высокого процента HLA-DRB1 -гомозигот среди реципиентов, ожидающих трансплантацию почки (табл. 4.1) в клиниках Московского региона.
Таблица 4.1. Процент HLA-DRB1 -гомозигот в 3 группах сравнения
Группы сравнения | Реципиенты почки | Доноры почки | Здоровые жители г. Москвы |
---|---|---|---|
Количество обследованных |
272 |
488 |
130 |
Процент HLA-гомозигот |
32,3 |
16,7 |
16,3 |
Как следует из табл. 4.1, процент HLA-DRB1 -гомозигот среди реципиентов в листе ожидания достигает 32,3%, что практически в 2 раза превышает этот уровень среди здоровых жителей г. Москвы и потенциальных доноров органных трансплантатов.
Наиболее вероятным объяснением этого феномена является тот факт, что среди реципиентов Московского региона более 80% больны хроническим гломерулонефритом - тяжелым аутоиммунным заболеванием, ведущим к потере функции почки [67]. Существенное место принадлежит также реципиентам, для которых причиной потери функции стал диабет, в том числе СД1, тоже являющийся аутоиммунным заболеванием. Как известно, HLA-DRB1-гомозиготность является фактором, обусловливающим высокий уровень предрасположенности к развитию аутоиммунных заболеваний [3].
В целях увеличения вероятности подбора пар донор-реципиент, совместимых по HLA-DRBl-специфичностям, отечественные исследователи еще в 1997 г. предложили модифицировать компьютерную программу подбора тканесовместимых пар донор-реципиент на основе выделения из общего листа ожидания реципиентов, гомозиготных по HLA-DRB1- специфичностям. Обоснованием этому послужил установленный отечественными исследователями факт двукратного превышения в группе потенциальных реципиентов количества HLA-DRB1-гомозиготных больных (32,5% по сравнению с 16,2% по московской популяции) [67]. Программа подбора основана на том, что любой донор, гомозиготный по HLA-DRB1-специфичности, первоначально сопоставляется со списком HLA-DRB1-гомозиготных реципиентов, и в случае наличия HLA-DRB1-совместимой пары ей отдается предпочтение по сравнению с HLA-DRB1-гетерозиготами, входящими в основной список листа ожидания.
Использование данной программы позволяет решить следующую проблему, а именно: для HLA-DRBl-гомозиготных реципиентов (составляющих 1/3 листа ожидания) любой из HLA-DRB1-гетерозиготных доноров является несовместимым как минимум по одному HLA-DRB1-гаплотипу и только HLA-DRB1-гомозиготный донор может оказаться полностью тканесовместимым данному реципиенту. Таким образом, полная HLA-DRB1-совместимость может возрасти на 1/3 из числа выполняемых трансплантаций. Возможность использования такого подхода была подтверждена на основе анализа клинического материала трансплантаций аллогенных почек от 130 HLA-DRB1-гомозиготных доноров в г. Москве, выполненного Московским координационным центром органного донорства [10].
Данные представлены в табл. 4.2, содержащей как сведения об эффективности почечных трансплантатов от HLA-DRB1-гомозиготных доноров, так и о реальной ситуации их использования.
По результатам 130 трансплантаций аллогенных почек, полученных от HLA-DRB1-гомозиготных доноров, можно сделать следующее заключение. К сожалению, группа, в которой HLA-DRB1-гомозиготным реципиентам были трансплантированы тканесовместимые почки от HLA-DRB1-гомозиготных доноров, оказалась чрезвычайно незначительной - только 11 случаев. При этом выживаемость в данной группе превышала 90%. Близкие показатели - 82% выживаемости - были зарегистрированы в группе HLA-DRB1-гетерозиготных реципиентов (n=36), которым были трансплантированы почки от тканесовместимых HLA-DRB1-гомозиготных доноров, имеющих 1 общую с реципиентами HLA-DRB1-специфичность (гаплоидентичность).
Таблица 4.2. Реальное использование HLA-DRB1 -гомозиготных доноров
Номер группы | Донор | Реципиент | Совместимость | Количество случаев | Процент выживаемости |
---|---|---|---|---|---|
1 |
HLA-DRB1-гомозигота |
HLA-DRB1-гомозигота |
Полная |
11 |
>90% |
2 |
HLA-DRB1-гомозигота |
HLA-DRB1-гетерозигота, только 1 общая с донором HLA-DRB1-специфичность |
Половинная для донора / полная для реципиента |
36 |
82% |
3 |
HLA-DRB1-гомозигота |
HLA-DRB1-гетерозигота, отсутствие общих с донором HLA-DRB1-специфичностей |
Полная несовместимость |
66 |
52% |
4 |
HLA-DRB1-гомозигота |
HLA-DRB1-гомозигота, отсутствие общих с донором HLA-DRB1-специфичностей |
Полная несовместимость |
17 |
>50% |
К сожалению, общий объем двух вышеописанных групп - 47 человек - составляет всего лишь 36,2%. И большая часть трансплантатов, полученных от HLA-DRB1-гомозиготных доноров, была трансплантирована HLA-DRB1-несовместимым реципиентам (т.е. без учета HLA-DRB1-совместимости). При этом 66 трансплантатов были пересажены HLA-DRB1-гетерозиготным реципиентам, в их генотипе отсутствовала HLA-DRB1-специфичность, идентичная донорской. Более того, в 17 случаях трансплантаты от HLA-DRB1-гомозиготных доноров были пересажены также HLA-DRB1-гомозиготным, но несовместимым реципиентам. Выживаемость в указанных группах была практически идентична (около 50%).
Таким образом, различие по 5-летней выживаемости между группами реципиентов, получивших трансплантаты от HLA-DRB1-гомозиготных доноров, с учетом и без учета HLA-DRB1-совместимости, превысило 30%. К сожалению, группа реципиентов с более низкой выживаемостью была значительно более многочисленной по сравнению с группой, где отмечалось эффективное использование трансплантатов от HLA-DRB1-гомозиготных доноров. Учитывая то, что данная группа оказалась весьма малочисленной (11 случаев), целесообразно было обследовать более многочисленную группу реципиентов.
К сожалению, в контингенте, обследованном в 2010 г., количество несовместимых пар донор-реципиент составило 148 случаев (около 50% от всех случаев), что значительно превысило группу, включающую HLA-DRB1-совместимые пары.
Таким образом, остается значительный «резерв» в увеличении количества HLA-совместимых пар донор-реципиент, в том числе за счет еще более рационального использования HLA-DRBl-гомозиготных доноров.
Анализируя в целом ситуацию с селекцией аллогенной почки, можно сделать вывод, что для достижения ее эффективности (тем более в формате короткого листа ожидания) достаточно использовать данный вид селекции доноров при пересадках реципиентам, в крови которых «предсуществующие» антитела отсутствуют или определяются в низком титре, что свидетельствует об отсутствии их сенсибилизации.
Именно такого рода подход позволяет надеяться на возможность быстрого и эффективного решения проблемы имеющегося в настоящее время отставания трансплантаций органов в России и выхода страны на лидирующие позиции в этой области клинической медицины.
Клиническая трансплантология, начавшая свое развитие в 1960-1970-х годах, на протяжении двух последних десятилетий играет роль наиболее высокотехнологичной, востребованной и радикальной в плане эффективности лечения в мировом здравоохранении [52]. Об этом, в частности, свидетельствует тот факт, что от момента, когда в мире были осуществлены первые десятки и сотни пересадок органов, до настоящего времени, когда только число пациентов с пересаженными почками превысило 700000, прошло всего лишь 30 лет. Таким образом, трансплантология, являясь одной из самых молодых отраслей клинической медицины, помогает спасти сотни тысяч жизней. В настоящее время в мире могут подлежать трансплантации следующие органы: почки, поджелудочная железа, комплекс «почка-поджелудочная железа», сердце, легкое, комплекс «сердце-легкое», печень, эндокринные железы. Количество трансплантационных центров, активно работающих в области пересадки указанных органов, измеряется уже не единицами и десятками и даже не сотнями, а тысячами, и это далеко не предел, поскольку ежегодно в мире в течение последних 5 лет количество таких центров и, соответственно, таких пересадок возрастает на 10-15%. Разумеется, такая динамика характерна не для всех стран в одинаковой степени. Лидируют в этом направлении США, Испания, Португалия и другие страны Западной Европы [32]. К сожалению, к странам, где количество клинических трансплантаций за последние 20 лет сократилось, относятся Россия и большинство независимых государств, входивших ранее в состав СССР. Однако страны Балтии (Латвия, Литва, Эстония) в настоящее время активно участвуют в международных программах обмена органными трансплантатами.
На сегодняшний день в клинической трансплантации как в Российской Федерации, так и в абсолютном большинстве стран с развитой клинической трансплантологией легитимно использование пересадок органов и тканей только от человека к человеку, т.е. аллотрансплантация. В то же время интенсивно ведутся фундаментальные исследования, целью которых является разработка методов использования трансплантатов альтернативного происхождения (т.е. не изъятых из тела сформировавшего человека). Последнее обусловлено острой нехваткой трансплантатов для обеспечения всех реципиентов, входящих в листы ожидания тканесовместимых трансплантатов.
Первое из направлений этих исследований - использование органов животного происхождения, так называемая ксенотрансплантация, имеет длительную историю своего развития, насчитывающую не одно десятилетие [33]. На первоначальном этапе работ, проводимых в этом направлении, основным препятствием для трансплантологов стал тот факт, что общий уровень несовместимости между человеком и животным несравненно выше такового между человеком и человеком и имеет большее количество своих проявлений по сравнению с реакцией несовместимости в аллогенных комбинациях [24]. Тем не менее в силу необходимости поиска новых путей решения проблемы, связанной с острой нехваткой донорских органов и существующей в той или иной степени во всех странах мира, ученые, работающие над фундаментальными проблемами трансплантологии, в определенной степени приблизились, в частности, к решению данной проблемы. Были созданы линии животных - свиней, имеющих относительно более высокий по сравнению с «обычными животными» уровень совместимости с человеком.
Однако в самые последние годы это направление утратило свою актуальность, во всяком случае для клинической трансплантации, в связи с тем, что на сегодняшний день одну из серьезнейших проблем биобезопасности человека представляют вирусы животного происхождения, т.е. обычно не передаваемые от животного к человеку и/или не опасные для человека. Есть все основания для опасения, что при ксенотрансплантации эти вирусы могут попасть прямо из трансплантата в кровоток человека, проникнуть с ним в органы и ткани и там мутировать. Это тем более вероятно, что на сегодняшний день уже зарегистрирован целый ряд возбудителей животного происхождения, которые в результате мутации стали смертельно опасными для человека. Установлено, что к таким заболеваниям относятся коровье бешенство, атипичная пневмония и птичий грипп. Имеет право на существование и точка зрения о том, что к таким заболеваниям относится СПИД. Следует также отметить, что в ряде случаев, например при атипичной пневмонии, мутация вируса происходит уже в организме человека и затем передается другим людям воздушно-капельным путем, что особенно опасно, поскольку может легко привести к развитию эпидемий и пандемий.
С учетом вышесказанного становится ясно, почему международные организации, занимающиеся обеспечением здравоохранения, высказались за введение моратория на клинические трансплантации органов и тканей животного происхождения, не ограничивая фундаментальных исследований в данной области. Отражением этого моратория является соответствующее запрещение трансплантаций органов и тканей животных в странах ЕС, что нашло отражение в международной «Конвенции о защите прав и достоинств человеческих существ в связи с использованием достижений биологии и медицины» [26]. Ведущие отечественные клинические трансплантологи, являющиеся признанными мировыми авторитетами в области ксенотрансплантации, также проявили озабоченность по этому поводу и поддержали эту международную инициативу.
Тем не менее следует отметить, что в ряде стран Южной Америки и Азии сохранилась практика клинических трансплантаций кроличьих клеток, вырабатывающих инсулин, людям, больным диабетом. К сожалению, в списке этих немногочисленных стран упоминается и Россия, где данный вид трансплантации нашел довольно широкое распространение, и в первую очередь в отдаленных регионах страны. Помимо того что данный факт представляет определенную опасность для отечественного и мирового здравоохранения, на международных биоэтических форумах, включая страны ЕС, трансплантация органов животного происхождения уже рассматривалась как одно из проявлений биотерроризма. В качестве борьбы с ним предлагались правовые меры и санкции против стран, допускающих на своей территории данный вид трансплантаций.
Поскольку Россия все больше интегрирует в мировое сообщество как в экономическом, так и в правовом отношении и является одним из активных участников противодействия любым видам терроризма, аналогичный мораторий на ксенотрансплантации был бы целесообразным (хотя бы на уровне подзаконных, а лучше законодательных актов), как это уже имело место в отношении моратория на клонирование человека, действующего на территории России и в настоящее время.
На сегодняшний день в Европе ксенотрансплантация законодательно разрешена только в Польше. Так, об этом говорится в ст. 15 национального закона Польши «Об изъятии и пересадке клеток тканей и органов» [13]. При этом указывается, что ксенотрансплантация может применяться только в лечебных целях. Скорее всего, в этот закон будут внесены соответствующие изменения для ликвидации его противоречий с положениями Конвенции «О защите прав и достоинства человеческих существ в связи с использованием достижений биологии и медицины», соблюдаемой в отдельных государствах ЕС.
Разумеется, этот запрет никоим образом не касается возможности проведения экспериментальных исследований по преодолению межвидового барьера.
Другая возможность появления реальной альтернативы для получения иного, чем органы, извлеченные из организма человека в качестве трансплантата, открылась в самые последние годы, благодаря развитию нового направления медицинской науки - клеточной биотехнологии. Речь идет о возможности искусственного выращивания из стволовых клеток, являющихся родоначальниками клеточных элементов и нормально функционирующих вне связи с организмом, органов и тканей человека, которые затем могут быть использованы для трансплантации. Несмотря на то что исследования, ведущиеся в этом направлении, через определенный период времени, исчисляемый годами или десятилетиями, могут привести к решению технической части этой проблемы, для внедрения этого достижения в практику клинической трансплантации потребуется также решение ряда этических и правовых вопросов. Последние в первую очередь связаны с источником необходимых стволовых клеток. Исходя из существующего в настоящее время в России законодательства, а именно Закона РФ «О трансплантации органов и (или) тканей человека», может быть законодательно обоснованным лишь использование для трансплантации аллогенного костного мозга, т.е. по существу аллогенных стволовых клеток. Вопрос об использовании аутологичных (т.е. собственных) костномозговых кроветворных стволовых клеток ни в Законе РФ «О трансплантации органов и (или) тканей человека», ни в аналогичных национальных законах других государств не рассматривается сейчас и, по-видимому, не будет рассматриваться и далее, поскольку речь о правовых вопросах не идет, а касается лишь медицинских и этических проблем.
Что же касается возможности использования эмбриональных стволовых клеток для выращивания из них тканей и органов, пригодных для трансплантации, то в этом случае вероятность преодоления этических и правовых проблем более чем сомнительна. Последнее объясняется не только резко отрицательной позицией большинства правоведов, представителей всех религиозных конфессий и мирового сообщества в целом, но также и законодательным запретом, существующим во многих отдельных странах и их объединениях, в частности в ЕС. Так, Парламентская ассамблея Совета Европы (рекомендация 1046) уже в 1986 г. ввела ограничения на использование эмбрионов в диагностических, терапевтических, научных, промышленных и коммерческих целях. Вслед за тем в «Конвенции о защите прав и достоинства человеческих существ в связи с использованием достижений биологии и медицины», разработанной в 1996 г. [26] и вступившей в силу 1 декабря 1999 г., и в резолюции Европейского парламента (от 7 сентября 2000 года) было указано, что «манипуляции с зародышевыми клетками человека, как и клонирование человека, является оскорблением публичного порядка и морали» (п.п.Ф преамбулы Резолюции о клонировании человека от 7 сентября 2000 года).
Ряд стран, и в первую очередь Германия, законодательно запретили использование тканей эмбрионов. Так, правовая защита эмбрионов в Германии осуществляется с 1990 г., когда был принят Закон о защите эмбрионов, разрешающий их использование исключительно в целях оплодотворения и на строго определенных условиях (п. 4-7 указанного закона). В параграфе 2 Закона о защите эмбрионов указано, что запрещены продажа эмбрионов и выделение из них стволовых клеток.
В настоящие время на территории стран ЕС действует мораторий на использование эмбриональных тканей человека, включая стволовые клетки, в медицинской практике. В 2004 г. в России при Государственной Думе была создана межведомственная комиссия по подготовке проекта аналогичного правового акта.
Наконец, следует отметить, что бесперспективным является и широко обсуждаемый в средствах массовой информации другой подход к получению полностью тканесовместимого трансплантата, а именно создание клонированного организма, органы и ткани которого были бы наилучшим трансплантатом для человека - источника клонирования. Однако сразу следует сказать, что само по себе клонирование человека запрещено Советом Европы и «в большинстве стран, подписавших Протокол о запрете клонирования человека, введены за такие эксперименты суровые наказания» [16]. В разных странах Европы виновные могут быть приговорены к тюремному заключению на срок от 5 до 20 лет.
В Российской Федерации законодательно введен мораторий на работы в области клонирования человека.
В целом можно сказать, что медико-биологические проблемы, стоящие на пути клонирования человека, а еще в большей степени этические, религиозные, а самое главное - правовые аспекты этой проблемы, вряд ли позволят создать полноценный в биологическом смысле клон человека, и еще менее вероятно, что этот путь окажется когда-либо основным или существенным в практике обеспечения потребностей легальной клинической трансплантологии. Что же касается вероятности того, что эта потребность может быть обеспечена органами и тканями, выращенными из стволовых клеток, то следует отметить следующее. С точки зрения биологии эта задача принципиально решаема только при использовании эмбриональных стволовых клеток, использование которых в России на сегодняшний день запрещено. Помимо этого следует принять во внимание, что трансплантат, выращенный из стволовых клеток эмбриона, должен быть тканесовместимым с реципиентом. Последнее требует создания банка и регистра эмбриональных стволовых клеток, насчитывающего, по крайней мере, десятки тысяч образцов.
Таким образом, можно констатировать, что вышеперечисленные альтернативные направления в области получения органных и тканевых трансплантатов ни в настоящие время, ни на период ближайших десятилетий не смогут, по-видимому, конкурировать с использованием трансплантатов, легально полученных от умерших или живых доноров. В свою очередь, учитывая значение клинической трансплантации для здравоохранения, необходимо преодоление препятствий, стоящих на пути развития этой наиболее передовой области медицинской науки, и в первую очередь это относится к оптимизации правовой базы российского законодательства.
Особенно это касается статей российского Закона РФ «О трансплантации органов и (или) тканей», относящихся к защите прав доноров. Помимо этого необходимо обратить внимание на то, что часть положений данного закона, принятого в 1992 г., а также его более поздних редакций, устарела или недостаточно отражает современное состояние клинической трансплантологии. В частности, это касается вопроса об установлении клинической смерти (Статья 9. Определение момента смерти). В ней отсутствует положение о том, что искусственно поддерживаемая (с помощью специальной аппаратуры) сердечная деятельность не может рассматриваться как признак жизни человека в том случае, если констатирована смерть мозга. Такого рода указание имеется во всех современных зарубежных, включая международные, законах о трансплантации. Именно отсутствие этого положения в Российском законе стало основой того, что в 2004 г. правоохранительными органами было возбуждено уголовное дело по «факту подготовки убийства человека» врачами бригады забора трупных органных трансплантатов. Хотя речь шла именно о ситуации, когда у потенциального донора была констатирована смерть мозга, а деятельность сердца поддерживалась аппаратом искусственного кровообращения. Последняя процедура является необходимым методом сохранения жизнеспособности трансплантата.
Данный случай мог бы рассматриваться как недоразумение, если бы процесс над врачами не длился более 3 лет. Это привело к снижению трансплантационной активности в России в период с 2004 по 2007 г. почти в 10 раз, и сотням больных, ожидающих трансплантаций органов, не было оказано необходимой медицинской помощи, что стало причиной смерти многих из них. Следует напомнить, что неоказание медицинской помощи является нарушением Основ законодательства РФ об охране здоровья от 22 июля 1993 года.
Положительная динамика, выражающаяся в стремительном росте трансплантаций в РФ, начиная с конца 2007 г. по настоящее время, произошла только после прекращения судебного преследования трансплантологов в связи с отсутствием состава преступления в их действиях. Между тем, к сожалению, это никак не отразилось на вышеуказанных положениях российского закона о трансплантации и в принципе подобные ситуации не исключены и в будущем.
В целом, представленные в данном разделе данные еще раз свидетельствуют о том, что от степени тканевой совместимости донора органа и реципиента напрямую зависит эффективность трансплантаций и имеется реальная возможность увеличения процента тканесовместимых пар донор-реципиент в условиях короткого листа ожидания. Таким образом, открывается возможность не только повысить выживаемость трансплантатов, но и реципиентов. Последнее обусловлено тем, что тканевая несовместимость донора и реципиента потенциально ведет к развитию кризов отторжения. Для их купирования требуется значительное усиление иммунодепрессивной терапии. Результатом этого в ряде случаев является развитие инфекционных осложнений, в том числе несовместимых с жизнью. Другим вариантом развития осложнений, несовместимых с жизнью, служат развитие сердечно-сосудистых осложнений, которые также зачастую являются причиной смерти реципиента. Такого рода неблагоприятные исходы относятся к категории так называемых «случаев смерти с функционирующим трансплантатом», т.е. они не рассматриваются как результат тканевой несовместимости донора и реципиента. В действительности это не так, поскольку причиной смерти стали осложнения, возникшие вследствие использования сверхвысоких доз иммунодепрессивных препаратов для купирования реакцией отторжения трансплантата, вызванного тканевой несовместимостью донора и реципиента.
Подводя итог всему вышесказанному, следует отметить следующее. Создается впечатление, что в России, в отличие от других стран, имеющих развитую клиническую трансплантологию, в последние десятилетия многие клинические трансплантологи уделяют все меньше внимания вопросам, связанным с тканевой совместимостью донора и реципиента. Можно также сказать, что прослеживается определенная взаимосвязь с развитием и совершенствованием иммунодепрессивной терапии и определенным пренебрежением к тканевой совместимости. Неизбежным следствием этого является высокая вероятность развития тяжелых осложнений, зачастую приводящих к гибели реципиента с «работающим» трансплантатом. Еще раз следует отметить, что эта ситуация характерна исключительно для России. Между тем приведенные выше данные свидетельствуют о несостоятельности такого подхода, который в конечном счете может еще раз привести к дискредитации клинической трансплантологии в России. При этом следует напомнить, что одним из основных аргументов, выдвигаемых в защиту клинической трансплантологии при обвинениях в ее адрес, в частности, выдвигаемых отечественными СМИ относительно торговли органами, является следующее. При торговле органами по определению невозможен тканесовместимый подбор трансплантата, поскольку эта задача может быть решена только на государственном уровне. Достаточно вспомнить, что так называемый трансплантационный туризм (покупка трансплантатов в странах Юго-Восточной Азии), распространенный в 1970-х годах в ряде стран Европы, полностью прекратился вследствие массовых отрицательных исходов трансплантаций несовместимых органов. Единственным примером торговли органами в Европе являются факты, установленные Парламентской комиссией ЕС на территории Косово в период Балканского конфликта. Однако в этом случае трансплантаты, изъятые у пленных, пересаживали на основании определения тканевой совместимости. Это стало возможным благодаря тому, что данный процесс был организован и осуществлялся под контролем руководства Косово.
Исходя из этого легко можно представить, что такая ситуация в России может трактоваться общественностью России и мировым сообществом трансплантологов, как полный отказ от подбора тканесовместимых органных трансплантатов и создание базы для торговли органами.
В качестве наиболее результативного способа решения данной проблемы представляется гармонизация Российского законодательства, регламентирующего органные трансплантации, с национальными и международными законодательными актами стран с развитой системой здравоохранения [2]. В первую очередь это касается Федерального закона Российской Федерации от 22 декабря 1992 г. № 4180-1 «О трансплантации органов и (или) тканей человека» (с изм. от 20 июня 2000 г.). В Статье 1 данного Закона «Условия и порядок трансплантации органов и (или) тканей человека» указано: «Операции по трансплантации органов и (или) тканей реципиентам производятся на основе медицинских показаний в соответствии с общими правилами проведения хирургических операций» [19]. Таким образом, речь идет о медицинских показаниях, которые являются основой для проведения любых хирургических операций. Естественно, что при проведении «стандартных» хирургических операций речь о какой-либо роли тканевой совместимости не идет. Таким образом, из данного закона следует, что тканевая совместимость при трансплантации органов и/или тканей не является обязательным условием проведения трансплантации. Совершенно иная картина имеет место в законодательных актах, включая международные, регламентирующие трансплантации в абсолютном большинстве зарубежных стран. Так, в законодательном акте, регламентирующем трансплантацию органов и тканей в странах ЕС, указано следующее: «Органы и ткани должны распределяться согласно медицинским показаниям. Понятие это следует трактовать в самом широком смысле, в свете всех соответствующих профессиональных стандартов и обязательств; оно включает любое обстоятельство, способное повлиять на состояние здоровья пациента, качество трансплантируемого материала или получение трансплантата. Примерами могут служить соображения совместимости органа или ткани с организмом пациента, медицинской безотлагательности, времени, необходимого для транспортировки органа, времени нахождения реципиента на листе ожидания, особые трудности подбора соответствующего подходящего органа для некоторых пациентов (например, в случае высокой иммунной чувствительности или редких характеристик ткани пациента) и ожидаемого результата трансплантации» (Глава II - Общие положения, Статья 3. Система трансплантации. Пункт 37) [11].
Таким образом, из приведенного выше текста следует, что тканевая совместимость донора-реципиента является первоочередным условием среди медицинских показаний при трансплантации органов и/или тканей. Отсутствие указанного условия в Законе РФ «О трансплантации органов и/или тканей» фактически позволяет официально трансплантировать тканенесовместимые органы и/или ткани, что, как в частности, следует из данной работы, резко снижает выживаемость как трансплантата, так и реципиента. Следует также отметить следующее: именно необходимость тканевой совместимости между донором и реципиентом является основным препятствием для различных видов криминальных трансплантаций, в том числе для трансплантационного туризма. В целом ясно, что отказ от подбора тканесовместимых пар донор-реципиент должен быть законодательно запрещен, в том числе в связи с тем, что существующая в России ситуация может иметь коррупционную составляющую. Наиболее целесообразным является гармонизация Закона РФ «О трансплантации органов и (или) тканей» с международным законодательством.
Сотрудниками Института иммунологии совместно с Московским координационным центром органного донорства и Институтом государства и права РАН опубликована серия работ и разработаны представления для МЗ РФ по обоснованию необходимости использования тканесовместимых (в первую очередь по HLA-DRB1-специфичностям) трансплантатов. 31 августа 2012 г. МЗ г. Москвы приняло соответствующее решение, обязательное для исполнения в организациях здравоохранения г. Москвы.
Следует также отметить, что представленные в настоящей работе данные позволяют решить проблему поиска тканесовместимых пар донор-реципиент в условиях «короткого» листа ожидания, что чрезвычайно актуально для современного социально-экономического уровня России. Вместе с тем этот опыт может оказаться востребованным и для стран, в которых, в отличие от России, используются национальные и международные листы ожидания трансплантата.
4.2. Роль трансплантации костного мозга/кроветворных стволовых клеток человека в биобезопасности и HLA-полиморфизм
Трансплантация КСК/КМ в настоящее время - одно из наиболее быстроразвивающихся направлений современной клинической медицины, которое вобрало в себя последние достижения гематологии, биотехнологии, иммунологии и фармакологии. Пересадка костного мозга помимо того, что она является радикальным методом лечения ряда онкогематологических заболеваний и иммунодефицитных состояний, в последние годы начинает применяться при лечении онкологических заболеваний различной локализации и тяжелых аутоиммунных заболеваний.
По количеству трансплантаций, выполненных в мире, пересадка кроветворных стволовых клеток (КСК) или, как было принято ранее называть данный вид трансплантации - пересадка костного мозга (КМ), вышла на второе место вслед за пересадкой почки, о чем, в частности, свидетельствуют данные анализа работы более 500 трансплантологических центров Европы [50]. Следует особо отметить, что пересадка КСК является на сегодняшний день в России единственным легитимным видом трансплантации чужеродных (аллогенных) стволовых клеток человека [14].
Трансплантация КСК, проведенная в целях восстановления функций иммунной и гемопоэтической систем - лечения неопластических заболеваний, является одним из основных достижений клинической медицины за последние 30 лет.
Уже в первых экспериментальных исследованиях было установлено, что пересадкой костного мозга может обеспечиваться противорадиационная защита, и далее было установлено, что протективный эффект опосредован пересадкой живых клеток и индукцией толерантности организма к ним. Следующий этап датируется с 1968 г., когда начались клинические трансплантации костного мозга. Первоначально трансплантация КМ была проведена в целях коррекции тяжелого комбинированного иммунодефицитного состояния (SCID - Severe Combined ImmunoDeficiency) и синдрома Wiscott-Aldrich [37]. Результаты исследований свидетельствовали о возможности восстановления иммунной системы посредством трансплантации клеток аллогенного гистосовместимого костного мозга у больных тяжелыми (смертельными) формами иммунодефицитов.
Первые обобщенные материалы в этом направлении были представлены Международным регистром трансплантатов костного мозга медицинского колледжа Висконсина, где с 1972 по 1995 г. были собраны данные из более 300 трансплантационных центров мира. Указанная база данных содержит информацию приблизительно о 40% трансплантаций аллогенного КМ (от неродственных доноров), проведенных в мире за период с 1970 по 1995 г. В соответствии с этими данными, в 1985 г. процент трансплантаций от неродственных доноров от общего числа трансплантаций КМ составил только 1-2%, тогда как в 1995 г. данный показатель возрос уже до 25%. Широкомасштабное использование этого подхода стало возможным в начале 1990-х годов после перехода метода селекции пар донор-реципиент при пересадках КСК на молекулярно-генетический уровень.
В последующие годы процент трансплантаций КСК от неродственных доноров неуклонно возрастал, и в настоящее время общее количество трансплантаций КСК/КМ от неродственных доноров в большинстве стран мира превышает таковой от родственных доноров, что обусловлено следующим.
В отличие от ситуации с органными трансплантатами, где в значительном проценте случаев достаточна селекция по HLA-DRB1-специфичностям на уровне низкого или среднего разрешения, при подборе доноров КСК/ КМ неродственного происхождения абсолютно необходим подбор донора на уровне отдельных аллельных вариантов генов HLA, общее количество которых в системе HLA превышает 10000 (рис. 2.1, см. цв. вклейку). Родственные трансплантации в большинстве случаев не могут обеспечить полной совместимости донора и реципиента. В то же время неродственные доноры, объединенные в многомиллионные регистры, позволяют по крайней мере в 80% случаев подобрать полностью HLA-совместимую пару донор-реципиент.
Это достижение обусловлено тремя взаимосвязанными обстоятельствами. Во-первых, благодаря переходу на молекулярно-генетические методы подбора пар донор-реципиент по генам главного комплекса гистосовместимости резко возросла эффективность возможности подбора тканесовместимых пар. Во-вторых, были организованы региональные, национальные и международные регистры неродственных доноров-добровольцев КСК/ КМ, что, в свою очередь, позволило реализовать саму возможность подбора тканесовместимых пар донор-реципиент. В-третьих, вышеуказанные обстоятельства позволили обеспечить более высокую эффективность трансплантаций (выживаемость больных) по сравнению с пересадками от родственных частично совместимых доноров КСК/КМ.
Вышеперечисленные достижения в области пересадки КСК/КМ от неродственных доноров, объединенных в многомиллионные национальные и международные регистры (общее количество неродственных доноров-добровольцев в них превышает 18 млн человек), позволяют сегодня государствам, являющимся членами международных регистров, не только решать такую животрепещущую проблему здравоохранения, как лечение онкогематологических заболеваний и тяжелых иммунодефицитных состояний, но и быть готовыми к проведению эффективных лечебных мероприятий в случае техногенных катастроф, террористических актов или военных действий, сопряженных с химическим и радиационным поражением кроветворной и иммунной систем организма среди значительных контингентов мирного населения или военнослужащих. При этом следует иметь в виду, что пересадка КСК/КМ может оказаться единственным способом спасения пострадавших как сразу после поражения, так и в отдаленные сроки, поскольку воздействие радиации или химических веществ в сублетальных дозах, тем не менее, может вести к развитию в отдаленные сроки сердечно-сосудистых, а также онкогематологических заболеваний, в первую очередь лейкозов, единственным эффективным способом лечения которых также является пересадка тканесовместимого КСК/КМ. В связи с этим существенным стимулом для развития клинической трансплантации КСК стали соображения государственной биобезопасности. Не случайно в США, где финансирование данных исследований осуществляется за счет военно-промышленных ведомств, имеется самый многочисленный в мире национальный регистр доноров-добровольцев КСК - более 8 млн человек, что позволяет осуществлять эффективный подбор тканесовместимых пар донор-реципиент не только на международном, но и на национальном уровне независимо от всемирного регистра КСК.
Естественно, что до конца 1980-х годов, т.е. до перехода на молекулярно-генетический уровень генотипирования, возможности HLA-селекции в принципе не позволяли осуществить подбор действительно HLA-совместимых неродственных доноров, и пересадка неродственных КСК для восстановления собственной системы кроветворения была малооправданным мероприятием.
В настоящее время в распоряжении клиницистов, работающих в гематологических центрах развитых стран, имеется возможность использования совместимого КСК/КМ из международных и национальных регистров КСК/ КМ. Естественно, что это в значительной степени повышает надежность и расширяет возможности использования КСК/КМ для 80% пациентов [49].
К сожалению, отечественные специалисты имеют ограниченный опыт трансплантации КСК/КМ от неродственных HLA-совместимых доноров. В большинстве случаев речь идет о пересадках КСК/КМ или от родственных доноров, или от частично совместимых неродственных доноров. Россия во Всемирном регистре доноров-добровольцев (ВАДКМ, англ. WMDA) представлена чисто формально, поскольку на территории России до настоящего времени не существует национального регистра неродственных доноров-добровольцев, соответствующего ВАДКМ, что исключает возможность прямого контакта с Всемирным регистром. В результате немногочисленные трансплантации неродственных КСК осуществляются на основании соглашений с национальными или частными регистрами, в первую очередь расположенными на территории Германии. Однако большая часть отечественных реципиентов неродственных КСК вынуждена осуществлять трансплантации за рубежом на коммерческой основе, в том числе за счет квот Минздрава России.
В целях решения проблемы организации службы трансплантации КСК/ КМ, полученных от неродственных доноров-добровольцев, основой является организация гематологических центров, участвующих в программах трансплантации неродственных КСК, для типирования доноров-добровольцев и лиц, нуждающихся в пересадке КСК/КМ по генам тканевой совместимости человека (HLA) на уровне, достаточном для обеспечения предотвращения развития реакций «трансплантат против хозяина» и «хозяин против трансплантата». Под достаточным уровнем понимается уровень, соответствующий стандартам Всемирной ассоциации доноров костного мозга (ВАДКМ). Регистр включает в себя только неродственных доноров-добровольцев, хотя на первый взгляд кажется естественным, что оптимальной должна быть трансплантация КСК/КМ от родственников.
Такого рода мнение имело право на существование до того момента, когда HLA-типирование перешло с серологического метода, позволявшего выявлять не более 138 HLA-специфичностей (что совершенно недостаточно для подбора донора) на молекулярно-генетический вариант, при котором выявляется уже более 8000 аллельных вариантов. Что касается принципиальной возможности использования для трансплантации КСК/КМ от родственных доноров, следует принять во внимание следующее. Тип наследования HLA-антигенов носит кодоминантный характер, при котором каждый человек получает по половине «своего» HLA-генотипа от каждого из родителей. Иначе говоря, из каждого локуса, кодирующего два HLA-антигена, один наследует от отца и один от матери, и поэтому в абсолютном большинстве случаев родители не могут быть полностью HLA-совместимыми со своими детьми. И речь может идти лишь о том, что донор и реципиент тканесовместимы на 50%, что недопустимо по стандартам ВАДКМ. Между сиблингами (братьями и сестрами) 100% вероятность совместимости может быть только в случае однояйцовых близнецов, а среди прочих она составляет 25%. Если же речь идет о многодетных семьях, то в этих случаях пересадка КСК/КМ может быть весьма перспективной. Однако в ряде стран, в том числе и в России, большие семьи имеются только в отдельных этнических группах. Основная же масса семей имеют только одного или двух детей.
Следует отметить, что по международным данным (анализ 605 трансплантологических групп Европы) в настоящее время в мире в 90% родственных трансплантаций КСК/КМ проводятся при полной HLA-совместимости между донором и реципиентом (табл. 4.3).
Таблица 4.3. Страны, имеющие наиболее объемные регистры неродственных доноров-добровольцев
№ | Страна | Количество доноров |
---|---|---|
1 |
США |
7,306 млн |
2 |
Германия |
4,68 млн |
3 |
Бразилия |
2,85 млн |
4 |
Великобритания |
844 тыс. |
5 |
Израиль |
763 тыс. |
6 |
Япония |
418 тыс. |
7 |
Тайвань |
387 тыс. |
8 |
Италия |
366 тыс. |
9 |
Польша |
352 тыс. |
10 |
Канада |
332 тыс. |
11 |
Португалия |
300 тыс. |
Под полной HLA-совместимостью в настоящее время понимается минимально необходимый в соответствии со стандартами ВАДКМ уровень совместимости по генам HLA класса I (локусы A, B, C); HLA класса II, генов DR1, DQB1. Желательна совместимость по генам HLA-DPB1 (класс II) и -MICA (класс I). Вероятнее всего, совместимость по двум последним генам в ближайшее время будет также признана необходимой.
На первый взгляд цифра 90% идентичности между сиблингами (братья, сестры) маловероятна, но дело в том, что в действительности речь идет о том, что в ряде развитых стран Европы значительный процент населения составляют иммигранты, имеющие большие семьи, что и позволяет повысить вероятность нахождения полностью идентичных пар донор-реципиент. Эта ситуация не типична для большинства регионов России. Для нее, как и для коренного населения большинства европейских стран, наиболее приемлемым путем решения проблемы трансплантации КСК/КМ является использование трансплантатов неродственного происхождения.
На рис. 4.2 (см. цв. вклейку) представлены сравнительные данные об эффективности, оцениваемой по годовой и 5-летней выживаемости при родственных и неродственных трансплантациях, при различном уровне HLA-совместимости донора и реципиента (международные данные).
Как следует из представленных данных, эффективность пересадки в комбинации HLA-идентичных гомозиготных близнецов практически соответствует таковой при пересадке от HLA-идентичного КСК/КМ. В то же время пересадка КСК/КМ в неродственной комбинации с наличием 1-2 несовпадений при 18-19 совпадениях значительно превосходит эффективность при совместимости по HLA-специфичностям, расположенным на одной хромосоме (пересадка от родителей). Следует принять во внимание, что именно последний вид родственных трансплантаций, никоим образом не соответствующий стандартам ВАДКМ, является наиболее распространенным в России.
Что касается представленных на рис. 4.2 (см. цв. вклейку) данных о родственных и неродственных трансплантациях при 1-2 несовпадениях из 20, то в данном случае результаты практически аналогичны.
Таким образом, с учетом полиморфизма системы HLA вероятность совместимости двух неродственных индивидуумов по такому количеству генов варьирует от 1 на 3 000000 до 1 на 7 000000 в зависимости от этнической принадлежности донора и реципиента. Оптимальным является поиск внутри одной этнической группы. Решение проблемы поиска совместимого донора состоит в организации больших национальных и международных регистров.
Процесс организации международных регистров начался в 1986 г. Национальной программой донорства костного мозга (NMDP - National Marrow Donor Program, USA), утвержденной Конгрессом США. В настоящее время в эту программу вовлечены более 7 млн доноров-добровольцев (см. табл. 4.3), что позволяет осуществлять ежегодно более 10 тыс. пересадок КСК/КМ в США.
Всемирная ассоциация доноров костного мозга (ВАДКМ) объединяет:
20 423 865 - текущее число неродственных доноров-добровольцев и образцов пуповинной крови в базе:
Другим крупнейшим регистром КСК/КМ является Европейский регистр доноров-добровольцев КСК/КМ со штаб-квартирой в г. Лейдене (Нидерланды). Этот регистр объединяет национальные и иные центры и регистры стран Евросоюза. Под иными центрами подразумеваются независимые регистры КСК/КМ, созданные, как правило, государственными или международными научными центрами. Все эти центры участвуют в международных программах обмена КСК/КМ в рамках работы международных регистров. Общее количество доноров-добровольцев во всех центрах мира превышает 19 млн человек.
В ряде государств Восточной Европы (Чехия, Венгрия, Болгария, Польша) созданы регистры КСК/КМ, которые по своему уровню могут быть включены в международные регистры. (Данные о наиболее активно работающих национальных регистрах приведены в табл. 4.3.)
Следует отметить, что указанный выше объем международных регистров доноров-добровольцев не является окончательным и в течение каждого года имеет место его значительное пополнение (на миллион и более доноров-добровольцев). Столь эффективная деятельность международных регистров обеспечивается тем, что начиная с 1980-х годов была создана и к настоящему времени усовершенствована четкая и строгая организация как самих международных регистров, так и национальных, а также так называемых независимых регистров.
Как указывалось, руководящую роль выполняет Всемирная ассоциация доноров костного мозга (ВАДКМ) - международная некоммерческая организация, которая осуществляет разработку и стандартизацию этических, технических, медицинских и финансовых аспектов трансплантации кроветворных стволовых клеток от доноров-добровольцев в каждой из стран, безвозмездно предоставляющих КСК неродственным больным в других странах.
Регистр - это национальная или независимая организация, чьей обязанностью является обработка запросов из учреждений, расположенных внутри страны или присланных из зарубежных центров, на КСК, включая пуповинную кровь, от неродственных доноров больным. Регистр должен координировать деятельность трансплантационного центра и донорских служб в данной стране. Деятельность независимых регистров координирует национальный центр. Для участия в международном обмене в рамках ВАДКМ необходима соответствующая аккредитация регистра. Также необходима аккредитация генотипирующей лаборатории вне зависимости от того, является ли она составной частью регистра или независима от него. Национальный регистр должен гарантировать перед ВАДКМ неукоснительное соблюдение стандартов ВАДКМ нижеуказанными структурами, участвующими в обеспечении процесса трансплантации КСК (среди основных стандартов ВАДКМ выделяют безвозмездность и добровольность донорства).
В ВАДКМ входят следующие структуры.
Донорский центр, являющийся организацией, ответственной за привлечение волонтеров, координацию и обследование перспективного донора. Центр проводит краткосрочное и долгосрочное диспансерное наблюдение за здоровьем взрослого донора-добровольца, предоставившего КСК.
Банк пуповинной крови - это донорский центр, чьей единственной миссией является сбор и хранение КСК, выделенной из пуповинной крови.
Центр сбора включает в себя медицинские помещения и медицинское оборудование, с их помощью происходит сбор гематопоэтических стволовых клеток. Сбор может включать выделение КСК из крови и забор костного мозга. Центр сбора проводит медицинское обследование донора и предоставляет окончательное заключение о пригодности донора. Если пуповинная кровь собрана, Центр ответствен за обработку и хранение единиц пуповинной крови. Центр сбора упаковывает образцы КСК для перевозки в Трансплантационный центр.
Подразделение обработки клеток является частью медицинской лаборатории, где проводится работа с гематопоэтическими стволовыми клетками, предшествующая трансплантации, в целях создания необходимого клеточного состава и соответствующей концентрации в трансплантате.
Трансплантационный центр объединяет медицинские помещения и оборудование, в Трансплантационном центре больной (реципиент) получает трансплантат КСК, выделенный от неродственного донора или из пуповинной крови. Центр следит за оказанием немедленной медицинской помощи и обеспечивает долгосрочное наблюдение за реципиентом. Внутри Трансплантационного центра может существовать так называемое поисковое звено, которое предпринимает поиск неродственного донора для конкретных больных по критериям, разработанным и запротоколированным Трансплантационным центром в соответствии со стандартами ВАДКМ. Данное звено может функционировать отдельно от Трансплантационного центра. Если поисковое звено независимо, то оно может координировать поиск для одного или нескольких Трансплантационных центров.
Трансплантационный центр/поисковое звено осуществляет поиск донора за рубежом через регистр, находящийся в данной стране.
Генотипирующая и генодиагностическая лаборатория сертифицирована и аккредитована при ВАДКМ (WMDA) или Европейской Федерацией иммуногенетики (ЕFI), Американским обществом по тканевой совместимости и имммуногенетике (ASHI), Ассоциацией стран Юго-Восточной Азии (ASEATTA) или же агентством со схожими стандартами и процессом аккредитации.
Данные лаборатории проводят тесты на совместимость, группу крови, инфекционные заболевания и пр. перспективных доноров и больных. Они могут находиться под руководством Регистра или же быть независимыми.
Следует отметить, что в настоящее время в России существует большая часть требуемых структур. Исключением является отсутствие самого национального регистра, для создания которого, в соответствии с требованиями ВАДКМ, необходимо проведение существенной организационной работы, а также выделение значительных бюджетных средств, как на период создания регистра, так и на весь срок его существования в виде ассигнования определенных бюджетных средств.
Несмотря на то что, как указывалось выше, история развития пересадки костного мозга в клинических целях насчитывает уже не одно десятилетие, в последние годы произошли существенные изменения, связанные не только с новыми возможностями селекции тканесовместимых пар донор-реципиент, но и с новыми возможностями получения кроветворных стволовых клеток человека. При этом изменилась и сама терминология, и, как правило, в научных статьях, клинических протоколах и законодательных актах, регламентирующих клиническую трансплантацию, в большинстве стран употребляется термин «кроветворные стволовые клетки» с указанием (если требуется) их источника. Последнее обусловлено тем, что такого рода источником, помимо костного мозга, могут служить периферическая кровь и пуповина новорожденного. При этом еще раз следует подчеркнуть, что во всех трех случаях речь идет об одном и том же «действующем начале», обусловливающем клинический эффект трансплантации КСК.
Вследствие этого, как указывалось ранее, термин «трансплантация КСК» в большинстве соответствующих законодательных актов заменен на термин «трансплантат костного мозга». Необходимо также отметить, что, несмотря на это, по сути, терминологическое изменение, в абсолютном большинстве стран, где в законодательных актах используется термин КСК, данный вид пересадок регламентируется Законом «О трансплантации органов и (или) тканей человека», и именно так он сформулирован и в законодательстве России. Одним из немногих исключений является законодательство Германии, где трансплантация КСК регламентируется Законом о переливании крови. Это различие является достаточно принципиальным, поскольку в первом случае необходимо соблюдать принципы, принятые ООН и ВОЗ, о безвозмездности и добровольности донорства органов и тканей. Эти принципы неукоснительно соблюдаются международными регистрами безвозмездных доноров-добровольцев. В то же время Закон о переливании крови, регламентирующий трансплантацию КСК в Германии, является значительно более либеральным относительно безвозмездности данного вида донорства. В результате в Германии в настоящее время имеется входящий в ВАДКМ национальный регистр, который является одним из крупнейших в Европе (см. табл. 4.3). В то же время в Германии есть несколько регистров, полностью независимых от данного регистра и формально не сотрудничающих с ВАДКМ, поскольку они не выполняют основного стандарта ВАДКМ - безвозмездность доноров КСК. Естественно, эти регистры значительно уступают национальному регистру Германии по своему объему, их деятельность фактически носит коммерческий характер, причем основная часть доноров и реципиентов КСК, входящих в эти регистры, не является гражданами Германии. Наличие в Германии этих регистров никоим образом не влияет на деятельность национального регистра страны, сотрудничающего с ВАДКМ в обеспечении граждан Германии, нуждающихся в трансплантации, тканесовместимыми КСК от безвозмездных неродственных доноров-добровольцев.
К сожалению, в настоящее время некоторые руководители крупных гематологических центров России настаивают на изменении существующего национального законодательства, регламентирующего трансплантацию КСК в России. Предлагается исключить регламентирование трансплантаций КСК из Закона РФ «О трансплантации органов и/или тканей человека» в существующей редакции и включить данное регламентирование в Закон о крови (Федеральный закон «О донорстве крови и ее компонентов»). Результат такого изменения в законодательстве РФ очевиден. Поскольку в настоящее время в России, в отличие от Германии, отсутствует соответствующий стандартам ВАДКМ национальный регистр безвозмездных неродственных доноров-добровольцев, а под эгидой Закона о крови развитие получит как безвозмездное, так и возмездное донорство, что не позволит России участвовать в международном обмене тканесовместимыми трансплантатами КСК, проблема трансплантации КСК в нашей стране не сможет найти своего решения. Тем самым будет нанесен значительный ущерб как здравоохранению России, так и ее биобезопасности.
Примечательно, что сторонники включения регламентирования клинических трансплантаций КСК в Закон о крови вместе с тем настаивают на отсутствии необходимости создания национального регистра КСК, отвечающего требованиям ВАДКМ. Вместо этого предлагается создать в качестве регистра организацию, единственная функция которой сводится к сбору, объединению и хранению информации о донорах КСК, имеющейся в различных центрах, занимающихся клинической трансплантацией КСК. Последнее сделает невозможным сотрудничество по обмену тканесовместимыми трансплантатами, включая участие в ВАДКМ.
Что касается современной структуры источников КСК, наиболее наглядным, на наш взгляд, могут являться обобщенные данные, представленные 605 трансплантационными центрами Европы, входящими в ВАДКМ. Суммарные данные приведены в табл. 4.4.
Таблица 4.4. Обзор статистических данных по пересадкам костного мозга/стволовых клеток в 2006 г. Количество центров: 605.
Количество больных, перенесших первую трансплантацию в 2006 г. |
||||||||||
Аллогенная трансплантация |
||||||||||
HLA-идентичные сиблинги |
Неидентичные сиблинги |
Близнецы |
Неродственные |
|||||||
Костный мозг |
Периферическая кровь |
Пуповинная кровь |
Костный мозг |
Периферическая кровь |
Пуповинная кровь |
Костный мозг |
Периферическая кровь |
Костный мозг |
Периферическая кровь |
Пуповинная кровь |
1310 |
3483 |
45 |
99 |
436 |
4 |
11 |
32 |
932 |
2851 |
458 |
Как следует из табл. 4.4, количество родственных пересадок превышало неродственные.
Количество идентичных родственных пересадок почти в 10 раз превышало количество HLA-неидентичных. На этот факт надо обратить особое внимание. Дело в том, что вероятность HLA-идентичности на уровне сиблингов (братьев, сестер) не превышает 25%.
Необходимо отметить, что представленные в табл. 4.4 данные свидетельствуют о весьма незначительном количестве пересадок в HLA-неидентичных комбинациях родственников. Это важно, поскольку именно данный вид трансплантаций КСК/КМ является распространенным в России.
Анализ структуры источников КСК свидетельствует о том, что во всех анализируемых комбинациях процент трансплантатов костного мозга не превышал 30% от количества трансплантатов КСК, выделенных из периферической крови.
Как следует из табл. 4.4, процент пересадок КСК, выделенных из пуповины, в обеих группах родственных трансплантаций не превышал единицы. Что касается неродственных трансплантаций, то в этом случае процент пересадок пуповинной крови не превышал 10. Несмотря на то что КСК, выделенные из пуповины, являются в настоящее время наименее востребованными в клинической практике, исследования в этом направлении имеют значительные перспективы. Что касается настоящего времени, то ограниченность использования данного подхода в клинической практике обусловлена следующим. На первый взгляд пуповинные КСК имеют определенные преимущества, и в первую очередь это простота получения кроветворных стволовых клеток как в техническом, так и в правовом отношении, поскольку процедура не требует рекрутирования добровольных безвозмездных доноров (во всяком случае на уровне существующих правовых норм). Однако следует иметь в виду, что количество КСК, выделяемых из пуповины, относительно ограничено. Для «полного замещения» собственных КСК реципиента и восстановления функций кроветворной и иммунной систем организма, количества КСК, выделенных из одной пуповины, достаточно лишь для детей в пределах 12-14 лет. Естественно, что при лечении детского контингента больных онкогематологическими заболеваниями и тяжелыми формами иммунодефицитных состояний, этот подход весьма перспективен. Однако он, по-видимому, не сможет в ближайшее время решить проблему трансплантации КСК для взрослых больных. Следует также отметить, что в настоящее время сам вопрос о сравнительной эффективности КСК, выделенных из периферической крови и костного мозга, с одной стороны, и пуповины, с другой, является предметом интенсивных исследований и научных дискуссий, проводимых в том числе на всех международных научных форумах, посвященных различным аспектам трансплантации КСК. Тем не менее целесообразность создания банков КСК, выделенных из пуповинной крови, представляется несомненной по двум причинам. О первой было сказано выше, второй является стремительный прогресс клеточных технологий в области изучения возможностей использования стволовых клеток, в том числе КСК, в различных областях клинической медицины.
Следует также отметить, что необходимым этапом в работе КСК банков является генотипирование хранящихся клеток, что позволит избежать случайных ошибок. Только контроль по генам главного комплекса тканевой совместимости реципиента и вводимых КСК может предотвратить данные ошибки, которые могут привести к летальному исходу и создать серьезные проблемы для администрации указанного банка.
Что же касается сегодняшних данных об интенсивности трансплантаций КСК, выделенных из пуповинной крови, можно констатировать следующее.
В группах трансплантаций от родственников их доля не превышала 1%. Среди неродственных трансплантаций их процент составил 10,8%. Таким образом, средний показатель количества проведенных трансплантаций КСК составил 5,27%. Это не позволяет говорить о существенном росте клинической активности в данном секторе трансплантаций КСК.
К сожалению, Россия до настоящего времени не только не имеет возможности активно участвовать в таком международном анализе, но и не может безвозмездно пользоваться, как это делают страны, входящие в Международный регистр, КСК/КМ. Это происходит потому, что в России до настоящего времени не создан национальный регистр, соответствующий стандартам ВАДКМ, включающий регистр генотипированных доноров-добровольцев, готовых безвозмездно предоставить в случае необходимости свой КСК/КМ в качестве трансплантата. Как результат в России практически не проводится пересадок от полностью совместимых неродственных доноров. И это имеет место при ситуации, когда онкогематологические заболевания, особенно детские, являются одной из самых серьезных проблем российского здравоохранения.
Заменой отсутствия полноценного национального регистра в России является так называемая квота на финансируемые государством трансплантации КСК за пределами России. Естественно, это не может решить проблему трансплантации КСК на уровне государства в целом.
Между тем в самые последние годы, благодаря развитию иммунобиотехнологии и внедрению ее последних достижений в практическую медицину, возможности использования трансплантации КСК/КМ в плане обеспечения биологической безопасности населения резко возросли. Дело в том, что в ведущих трансплантационных центрах мира удалось добиться блестящих результатов при трансплантациях тканесовместимого КСК/КМ совместно с органной трансплантацией. Таким образом, больным с различными формами и локализацией далеко зашедшего онкологического заболевания удается заменить пораженный орган или органы и одновременно с этим «заменить», благодаря пересадке КСК/КМ, неэффективную иммунную систему новой, способной активно бороться с раковыми клетками, но быть биобезопасной для организма реципиента. Такого рода операции, способные спасти жизнь безнадежным онкологическим больным, проводятся все чаще. Так, например, во Франции за 3 года выполнено около 100 операций пересадки легких с одновременной пересадкой КСК/КМ. Данное направление уже используется за рубежом при лечении рака желудка, почек, печени и других органов.
Таким образом, Россия является одним из немногих государств мира, где проблема трансплантации КСК/КМ никоим образом не может считаться разрешенной. Это связано с целым рядом проблем, в первую очередь социально-экономического и правового порядка, которые тормозят развитие этого важнейшего для биобезопасности России направления клинической медицины.
На сегодняшний день из всего многообразия стволовых клеток человека единственным легитимным и, соответственно, распространенным в лечебной практике большинства стран мира видом использования стволовых клеток является пересадка кроветворных стволовых клеток или, как ранее было принято называть данный вид трансплантации, пересадка костного мозга. Пересадка КСК/КМ - единственное лечебное мероприятие, позволяющее восстанавливать деятельность кроветворной и иммунной систем, утративших свою «нормальную» функцию в результате медикаментозного (при лечении онкогематологических заболеваний) или же техногенного (при химическом или радиационном поражении) воздействий [60]. Данный вид пересадок как за рубежом, так и в России законодательно регулируется соответствующими правовыми актами. Так, в Российской Федерации трансплантация КМ регулируется Законом РФ «О трансплантации органов и (или) тканей человека» (№ 4180-1, 1992 г.). При этом следует подчеркнуть, что, согласно отечественному и международному законодательствам, пересадка КСК/КМ является единственным видом трансплантации, для которой разрешены пересадки от генетически неродственных доноров-добровольцев (т.е. живых лиц) [14], в то время как органные трансплантации от генетически неродственных лиц, согласно российскому законодательству, допускаются лишь от посмертных доноров. Что касается пересадки других видов стволовых клеток (т.е. не относящихся к кроветворным клеткам), то на сегодняшний день, согласно российскому законодательству, она может осуществляться только в экспериментальных, но не клинических целях. При этом особо следует отметить, что даже если пересадка иных, чем КСК, стволовых клеток станет легитимной для клинического использования в Российской Федерации для диагностических и лечебных целей, наиболее значимой останется именно трансплантация КСК/КМ, как это имеет место в странах, активно занимающихся трансплантацией КСК. При этом следует отметить, что в данных странах проблема пересадки КСК/КМ рассматривается как одна из приоритетных проблем национальной биобезопасности [18].
Учитывая тот факт, что в настоящее время одним из приоритетных направлений развития медицинской науки является медицинская биотехнология, включая молекулярную медицину и клеточную терапию, есть все основания надеяться, что Россия наконец войдет в число стран, являющихся членами международных регистров безвозмездных доноров-добровольцев КСК, что позволит спасти жизни многих тысяч россиян.
Заключая данный раздел, следует отметить, что в настоящее время клиническая трансплантология во всем мире является одним из наиболее быстро развивающихся направлений клинической медицины. Данное направление вобрало в себя последние достижения молекулярной, клеточной медицины и иммуногенетики человека, благодаря которым более 700000 человек живут с пересаженными органами и около 100000 с полностью тканесовместимыми, но чужеродными кроветворными стволовыми клетками. Основой тканевой совместимости является подбор донора по генам главного комплекса тканевой совместимости человека (HLA). HLA является наиболее генетически полиморфной системой человека, поэтому вероятность случайной полной совместимости равна 1 на 3 000000.
Для России характерно отставание в указанной области медицины, это обусловлено не медицинскими, а правовыми, социальными и организационными проблемами безвозмездного донорства. Без преодоления этих проблем, решенных в большинстве стран более 20 лет назад, не может быть решен и вопрос подбора тканесовместимых доноров. Это, в свою очередь, делает Россию единственной из развитых стран мира, где этот вопрос, который является одним из ключевых не только для здравоохранения, но и для биобезопасности страны, не нашел своего решения.
4.3. Перспективы клинической трансплантологии в России в свете законодательных инициатив по правовому регулированию данной области здравоохранения
Период работы над этой монографией совпал с началом официального обсуждения разработанного и представленного Минздравом РФ в Государственную Думу проекта нового законодательного акта, регламентирующего клиническую трансплантологию в России. В случае утверждения и принятия этого закона, поименованного как Федеральный закон «О донорстве органов, частей органов человека и их трансплантации (пересадке)», отменяется действие существующих на сегодняшний день законодательных актов, включая Закон РФ «О трансплантации органов и (или) тканей человека». Федеральный закон «О трансплантации органов и (или) тканей человека» от 22.12.1992 года в последней редакции от 29.11.2007 года по настоящее время является правовым актом, регулирующим в РФ клиническую трансплантацию как органов, так и костного мозга (КМ), точнее, кроветворных стволовых клеток (КСК) [14, 27-29].
В предлагаемом для обсуждения в Госдуме законодательном акте содержатся предложения и статьи, посвященные регулированию исключительно трансплантации органов и никоим образом не касающиеся правовых аспектов трансплантации КМ/КСК.
Таким образом, трансплантация костного мозга после принятия нового правового акта полностью исключается из правового поля здравоохранения, т.е. регламентируется только трансплантация органов, а трансплантация КМ/КСК становится юридически нелегитимной и должна быть запрещена в России, поскольку приостановление действия предыдущего законодательного акта, регулирующего трансплантацию КМ/КСК, лишает этот вид трансплантации правового обоснования.
В целом принятие представленного на обсуждение проекта ФЗ «О донорстве органов, частей органов человека и их трансплантации (пересадке)» обрекает на гибель тысячи больных из числа детского и взрослого контингента, нуждающихся в ургентной трансплантации КМ/КСК по жизненным показаниям [8, 20, 21] и отбрасывает российское здравоохранение на уровень наиболее отсталых стран третьего мира, единицы из числа граждан которых могут позволить себе данный вид лечения за рубежом [43, 46, 51, 63].
Иначе говоря, принятие проекта Федерального закона «О донорстве органов, частей органов человека и их трансплантации (пересадке)» может привести к серьезным проблемам в данной области клинической медицины в целом [1, 4, 5].
Что касается обоснованности содержащихся в проекте ФЗ «О донорстве органов, частей органов человека и их трансплантации (пересадке)» предложений, касающихся рассматриваемого в нем правового регулирования органных трансплантаций, то следует отметить следующее. Прежде всего, неясна сама по себе позиция авторов проекта закона - на каком из принципов донорства построен закон, а именно: идет ли речь о модели испрошенного или подразумеваемого согласия доноров [1, 6, 7].
Предлагаемый проект Федерального закона «О донорстве органов, частей органов человека и их трансплантации (пересадке)» помимо негативных последствий, связанных с правовой коллизией [31, 70, 71], в результате которой в России будут прекращены трансплантации КМ/КСК, нанесет существенный вред и органной трансплантации. Это объясняется следующими имеющимися в нем неясностями и противоречиями, которые также негативно скажутся на органных трансплантациях в России [18, 19, 39].
Прежде всего, это касается отсутствия в законе прямого указания на то, какая из моделей органного донорства лежит в основе клинической трансплантации в России. Как известно, существуют две модели. Первая модель - испрошенного согласия, подразумевающая наличие прямого прижизненного согласия донора (в том или ином виде) на использование его органов после его смерти. Вторая модель - подразумеваемого согласия донора, когда отсутствие запрета в том или ином виде на посмертное использование его органов подразумевает его прижизненное согласие [39, 52].
Клиническая трансплантология КМ/КСК лишается законодательного регулирования на уровне Федерального правового акта. Последнее является не только беспрецедентной ситуацией для современного международного права, но может на определенное время создать правовую коллизию, поскольку исчезнет сама правовая основа данного вида трансплантаций [45, 48, 59].
Все это может привести как к временному, так и к постоянному прекращению трансплантаций КМ/КСК в России.
Действующий в настоящее время в России закон, приятый в 1992 г., основан на модели подразумеваемого согласия, что является единственным приемлемым принципом для существования трансплантации органов в нашей стране [14]. Этот же принцип используется в настоящее время в целом ряде стран [41, 44, 51].
Использование модели испрошенного согласия требует тщательной подготовительной работы, в том числе разъяснения и пропаганды донорства среди широких масс населения и осуществления мероприятий, направленных на форму волеизъявления донора, которая сделала бы возможным получение информации о характере волеизъявления потенциального донора в кратчайшие сроки [19].
Так, например, каждый гражданин Австрии, который не согласен с тем, чтобы его органы были трансплантированы, должен заранее эту информацию поместить на определенном интернет-сайте.
В Статье 5 «Основные принципы донорства органов и их трансплантации» проекта ФЗ содержится тринадцать положений, только одно из которых имеет косвенное отношение к указанному вопросу. Это пункт 3 «Каждый имеет право на личную неприкосновенность». Можно лишь предположить, что авторы проекта закона имели в виду, и что тем самым они декларируют принцип испрошенного согласия.
Также косвенно о модели, на которой основываются авторы проекта закона, можно судить на основании Статьи 19 «Учет мнения супруга или близких родственников в случае отсутствия прижизненного волеизъявления совершеннолетнего дееспособного гражданина о согласии или несогласии на изъятие его органов после смерти». Анализ этой статьи позволяет сделать предположение о том, что авторы проекта закона базируются на основе модели подразумеваемого согласия. Однако это лишь предположения о том, что имели в виду авторы проекта закона. В действительности все положения и статьи любого закона должны иметь лишь одну, прямо высказанную трактовку.
Статья 21 «Приоритет волеизъявления умершего», к сожалению, не проливает свет на то, какой из двух моделей авторы отдают приоритет.
Статья 22 «Регистр прижизненных волеизъявлений граждан о согласии или несогласии на изъятие их органов после смерти для трансплантации потенциальному реципиенту» фактически представляет собой анкету для граждан, решивших высказать свою прижизненную волю «о согласии или несогласии на изъятие их органов после смерти для трансплантации потенциальному реципиенту». Однако, хотя сама по себе организация регистра, безусловно, имеет положительное значение и аналоги такого рода подходов использованы в других странах, следует отметить следующее: во-первых, неясно, какая из рассматриваемых моделей должна быть использована в том случае, если потенциальный органный донор не зарегистрирован в регистре; во-вторых, само по себе наполнение регистра займет достаточно длительный период времени и потребует проведения дополнительных агитационных и разъяснительных мероприятий.
От того, какая из моделей подразумеваемого согласия (используемого в настоящее время в соответствии с ФЗ «О трансплантации органов и (или) тканей человека» 1992 года) или испрошенного согласия будет представлена в законодательном акте, регулирующем трансплантацию органов в РФ, зависит сама судьба клинической трансплантации. В том случае, если закон о трансплантации будет основан на принципе испрошенного согласия, то трансплантация органов от посмертных доноров (основной вид клинических трансплантаций) практически прекратит свое существование. Последнее обусловливается как особенностями современного социально-экономического состояния России, так и практически полным отсутствием пропаганды посмертного донорства в нашей стране.
Среди статей проекта ФЗ, регулирующих процесс трансплантации органов, имеется Статья 11 «Организация осуществления донорства органов человека и их трансплантации», пункт 2 которой посвящен роли в организации осуществления донорства органов человека и их трансплантации региональных координационных центров органного донорства. По существу на этих центрах лежит основная ответственность за организацию процесса поиска и подбора тканесовместимых пар донор-реципиент. В тексте данного пункта имеется ряд неточностей, которые могут осложнить или даже нарушить работу этих центров. В Статье 11 указано, что эти центры ведут листы ожидания и контролируют их. Неясно, кто создает листы ожидания. В действительности именно эти центры осуществляют создание единого листа ожидания донорских органов в определенном регионе на основе объединения листов ожиданий, представляемых отдельными медицинскими учреждениями, а также осуществляют их ведение. Указание о том, что они также осуществляют контроль ведения листа ожидания (т.е. сами себя контролируют), на наш взгляд, лишено смысла. Целесообразно было бы включить другую функцию контроля - контроль использования хирургами-трансплантологами рекомендованных пар донор-реципиент. Также эти центры осуществляют подбор тканесовместимых пар донор-реципиент на основании генотипирования реципиентов, входящих в единый лист ожидания, и потенциальных доноров, а также на основе определения индивидуальной иммунологической совместимости конкретных доноров и реципиентов на основе выявления в крови реципиента предсуществующих антител к антигенам донора [52].
Наиболее наглядным примером регионального координационного центра органного донорства является деятельность Московского координационного центра органного донорства, осуществляющего указанный вид деятельности в Московском регионе. Следует обратить особое внимание на Статью 9 «Запрещение изъятия и использования для трансплантации органов неопознанных трупов и неустановленных лиц». Согласно содержанию данной статьи, в целях трансплантации органов предлагается запретить изъятие и использование для трансплантации органов неопознанных трупов и неустановленных лиц. Следует отметить, что на сегодняшний день использование такого рода трансплантатов не противоречит действующему законодательству, и трансплантаты от данной категории доноров составляют около 20% от общего количества пересаженных трансплантатов. Следует принять во внимание, что сегодняшний уровень развития медицины позволяет оценивать инфекционный статус такого рода доноров в течение нескольких часов. Последнее позволяет исключить вероятность передачи реципиенту с трансплантатом опасных инфекционных заболеваний [18, 44].
Исключение данной группы доноров существенным образом скажется на снижении трансплантационной активности в России, которая и в настоящее время относится к странам с наиболее низкими показателями [47].
Необходимо еще раз обратить внимание на то, что практически все принятые и функционирующие в настоящее время в странах ЕС правовые акты, регулирующие клиническую трансплантацию, рассматривают как трансплантацию органов, так и КМ/КСК. Благодаря этому все главные принципы, и в первую очередь безвозмездность, т.е. запрещение купли-продажи, распространяются на оба вида трансплантаций [41, 70, 71]. Единственным исключением является ФРГ, где органная трансплантация регулируется Законом «О донорстве, изъятии и пересадке органов» от 5 ноября 1997 г., в то время как трансплантация КМ/КСК регулируется правовым актом, регламентирующим переливание крови. Последнее привело к постоянным дискуссиям, как на правовом уровне, так и на уровне здравоохранения. Результатом этого являются постоянно выдвигаемые обвинения в торговле КМ/КСК [12, 15, 55].
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
-
Авдеев М.И. Правовые аспекты пересадки тканей и органов // Экспериментальная хирургия и анестезиология. - 1969. - № 2. - С. 21-5.
-
Алексеева П.Л. Проблемы правового регулирования трансплантации органов и тканей в России и зарубежных странах. - М., 2007. - 149 с.
-
Болдырева М.Н. HLA (класс II) и естественный отбор. «Функциональный» генотип, гипотеза преимущества «функциональной» гетерозиготности // Автореф. дисс. … докт. мед. наук. - М., 2007. - 47 с.
-
Горелик И.И. Правовые аспекты трансплантации органов и тканей // Советское государство и право. - 1968. - № 9. - С. 88-93.
-
Горелик И.И. Правовые аспекты пересадки органов и тканей. - Минск, 1971.
-
Громов А.П. Медико-правовые вопросы в трансплантологии // Экспериментальная хирургия и анестезия. - 1970. - № 5. - С. 20-3.
-
Громов А.П. Правовое регулирование пересадки органов и тканей // Врач. - 1992. - № 5. - С. 36-7.
-
Демихов В.П. Пересадка жизненно важных органов в эксперименте // М.: Медгиз, 1960. - С. 259.
-
Долбин А.Г. Критерии селекции пар донор-реципиент и принципы первоочередного выбора реципиента // В кн.: Трансплантология / под ред. В.И. Шумакова. - М.: Медицина, 1995. - 391 с.
-
Долбин А.Г., Минина М.Г., Сергеев И.В. и др. Новые возможности поиска HLA-совместимых доноров для реципиентов листа ожидания почечного трансплантата // Физиология и патология иммунной системы. - 2009. - № 5. - С. 13-6.
-
Дополнительный протокол к Конвенции «О защите прав человека и человеческого достоинства в связи с применением биологии и медицины, касающийся трансплантации органов и тканей человеческого происхождения» // Пер. текста док. СМ (2001), рассмотренного на заседании Комитета министров 5 сентября 2001 г.
-
Дубовик О.Л., Жалинская А.А. Законодательство ФРГ о трансплантации органов и тканей // Журнал рос. права. - 1998. - С. 18-21.
-
Закон «Об изъятии и пересадке клеток, тканей и органов» // Dz.U., W-wa, 26. 10. 1995. - № 138. - Poz. 682.
-
Закон Российской Федерации от 22 декабря 1992 года № 4180-1 «О трансплантации органов и (или) тканей человека» // Ведомости Съезда народных депутатов Российской Федерации и Верховного Совета Российской Федерации, 1993, № 2, ст. 62 СЗ РФ.
-
Закон ФРГ «О донорстве, изъятии и пересадке органов» // 3ТП; BGBL; от 5.11.97 г. - P. 2638.
-
Йорыш А.И. Правовые и этические проблемы клонирования человека // Современное медицинское право в России и за рубежом. Сб. науч. тр. - М.: ИНИОН РАН, 2003.
-
Кофиади И.А., Гончарова Е.В., Каабак М.М. и др. Разработка нового подхода к мониторингу вирусной инфекции у взрослых реципиентов почечного трансплантата // Физиология и патология иммунной системы. - 2009. - № 9. - С. 3-8.
-
Пальцев М.А., Хаитов Р.М., Алексеев Л.П. Иммуногенетика и биобезопасность. (2-е изд., перераб. и доп.) // М.: Медицина, 2009. - 255 с.
-
Петровский Б.В. Защита донора // Клин. мед. - 1990. - № 8. - С. 31-4.
-
Петровский Б.В. Трансплантация органов и тканей // В кн.: Ежегодник БМЭ. - 1993. - Т. 3. - С. 933-40.
-
Петровский Б.В., Белорусов О.С. Деонтологические и социально правовые аспекты клинической трансплантологии и жизненно важных органов // Деонтология в медицине / Под ред. Б.В. Петровского. - М.: Медицина, 1988. - Т. 1. - С. 206-38.
-
Пирогов Н.И. О пластических операциях вообще, о ринопластике в особенности // В кн.: Собрание сочинений. - М., 1957. - Т. 1. - С. 100-1.
-
Свод этических правил проведения клинических испытаний и неклинических медико-биологических исследований НЦХ РАМН // В сб.: Этические и правовые проблемы клинических испытаний и научных экспериментов на человеке и животных / Под ред. Б.Г. Юдина. - М., 1994. - С. 28-35.
-
Сечкин А.В., Алексеев Л.П., Ланг Х.Р. и др. Двухлетний опыт селекции с использованием HLA-DRB1 генотипирования при трансплантации почки в Московском регионе. Материалы I Всероссийского съезда по трансплантологии и искусственным органам. - М., 1998. - C. 14.
-
Совет Европы. Конвенция «О защите прав человека и человеческого достоинства в связи с применением биологии и медицины» (О правах человека и биомедицине), Страсбург, ноябрь 1996 г. Dir/Jur (96).
-
Федеральный закон от 20 июня 2000 года № 91-ФЗ «О внесении дополнений в Закон Российской Федерации "О трансплантации органов и (или) тканей человека"» // Собрание законодательства Российской Федерации, 2000, № 26, ст. 2738.
-
Федеральный закон от 9 февраля 2007 года № 15-ФЗ «О внесении изменений в статью 4 Закона Российской Федерации "О трансплантации органов и (или) тканей человека"» // Собрание законодательства Российской Федерации, 2007, № 7, ст. 836.
-
Федеральный закон от 29 ноября 2007 года № 279-ФЗ «О внесении изменений в Закон Российской Федерации «О трансплантации органов и (или) тканей человека» // Собрание законодательства Российской Федерации, 2007, № 49, ст. 6040.
-
Хаитов Р.М. Физиология иммунной системы // М.: ВИНИТИ РАН, - 2005. -375 с.
-
Шаргородский М.Д. Прогресс медицины и уголовное право // Весник Ленинградского университета. - 1970. - № 17, вып. 3. - С. 97-105.
-
Шумаков В.И. Трансплантация // Руководство под ред. В.И. Шумакова - М.: Медицина, 1998. - 391 с.
-
Шумаков В.И., Тоневицкий А.Г. Иммунологические и физиологические проблемы ксенотрансплантации // М.: Наука, 2000. - 144 с.
-
Alexeev L.P., Dolbin A.G., Sechkin A.V. Renal transplants in Russia // Clinical Transplants 2000. UCLA 2001. Eds J.M. Cecka, P. Terasaki. - P. 392-3.
-
Andrews P.A. Renal transplantation // Br. Med. J. - 2002. - Vol. 324. - Р. 530-4.
-
Auchincloss H., Lee R., Shea S. et al. The role of «indirect» recognition in initiating rejection of skin grafts from major histocompatibility complex class II-deficient mice // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1993. - № 90. - P. 3373-7.
-
Bach F. et al. Bone marrow transplantation in a patient with the Wiskott-Aldrich syndrome // Lancet. - 1968. - Vol. 2. - P. 1364-6.
-
Bach F., Kuperman O., Sollinger O. et al. Cellular immunogenetics and LD-CD collaboration // Transplant. Proc. - 1977. - Vol. 9. - P. 859-63.
-
Barnard C.N. The operation. A human cardiac transplant: an interim report of a suc-cesful operation performed at Groote Schuur Hospital. Cape Town // South African Medical J. - 1967. - № 41. - P. 1271-4.
-
Benichou G. Direct and indirect antigen recognition: the pathways to allograft immune rejection // Front Biosci. - 1999. - № 4. - P.476-80.
-
Bioethics and human rights // Human Rights Teaching. - 1991. - Vol. 11. - P. 72.
-
Borel J.F., Feurer C., Gubler H.U., Stahelin H. Biological effects of cyclosporin A: a new antilymphocytic agent // Agents Actions. - 1976. - Vol. 6. - P. 468-75.
-
Brody В. Human rights aspects of transplantation in body parts - and human features // Paris: United Nations Education, 1990. - P. 111.
-
Calne R.Y., White D.J.G., Thiru S. et al. Cyclosporin A in patients receiving renal allografts from cadaver donors // Lancet. - 1978. - P. 1323-7.
-
Cameron J.S., Hoffenberg R. The ethics of organ transplantation reconsidered: paid organ donation and use of executed prisoners as donors // Kidney Int. - 1999. - Vol. 55. - P. 724.
-
Chugh K.S., Jha V. Commerce in transplantation in third world countries // Kidney Int. - 1996. - Vol. 49. - P. 1181.
-
Clinical transplants / Ed. J.M. Cecka, P.I. Terasaki // UCLA Immunogenetics Center Los Angeles, California. - 2000. - P. 1-707.
-
Commercial transactions in human organs and tissues for therapeutic purposes. А review of inernational and national legislation, codes and other measures // Report by the Director-General. WHA, 1990.
-
East-West. Transfer of Knowledge // International Conference. Proceedings. Prague, March, 2006.
-
General Transplantation Problems. Health Council of the Netherlands // The Hague, 1987.
-
Handbook of kidney transplantation // Еd. G.M. Danovitch // 2001 by Lippincott Williams & Wilkins, 530 Walnut street, Philadelphia, PА 19106, USA.
-
Heutinck Kirstin M., van den Heuvel Heleen, Yong Si L. et al. Functional analysis of virus specific cells with cross-reactivity to allo-antigens // 2013 John Wiley and sons.A/S Tissue Antigens, 2013. The 27th EFI European Immunogenetics and Histocompatibility Conference Maastricht, the Netherlands, May 11th-14th, 2013, P. 272.
-
Hornick P.I., Mason P.D., Yacoub M.H. et al. Assessment of the contribution that direct allorecognition makes to the progression of chronic cardiac transplant rejection in humans // Circulation. - 1998. - Vol. 97. - P. 1257-63.
-
Khoury S., Waaga A., Chen W. Class II MHC allopeptide-specific Th1 cell clone recognizes single epitopic difference and transfers delayed type hypersensitivity responses in vivo // Ed. Colon. XVI International Congress of the Transplantation Society, Barcelona, 1996. - Р. 33.
-
Konig P. Das strafbewehrte Verbot des Organhandels // Medizinstrafrecht. 2 Auf. Richard Boorberg Verl., 2001.
-
Lui Z. et al. Indirert recognition of donor MHC-class II antigens in human transplantation // Clin. Immunol. Immunopathol. - 1996. - Vol. 78. - Р. 228-35.
-
Mason P.D., Robinson C.M., Lechler R.I. Detection of donor-specific hyporesponsiveness following late failure of human renal allografts // Kidney Int. - 1996. - Vol. 50. - P. 1019-25.
-
Michaud J. French lows on bioethics // Europ. J. of Health Low; Dordrecht, etc., 1995. - Vol. 2, № 1. - P. 55-9.
-
Molina A., Popplewell L, Kashyap A. et al. Hematopoetic stem cell transplantation in the new millennium // Clinical transplants // Eds Cecka J. M., Terasaki P.I. UCLA Immunogenetics Center, Los Angeles, California, 2000. - P. 317-42.
-
Murray J.E., Merrill J.P., Harrison J.H. Renal homotransplantation in identical twins // Surg. Forum. - 1955. - Vol.6. - P. 432-6.
-
Opelz G. Factor influencing long-term graft loss // The Collaborative Transplant Study. Transplant. Proc. - 2000, May. - Vol. 32, № 3. - P. 647-9.
-
Qunibi W., Abulrub D., Shaheen F. et al. Attitudes of commercial renal transplant recipients towards rental transplantation in India // Clin. Transplant. - 1995. - Vol.9. - P. 317.
-
Roelen D, van Bree F, van Beelen E. et al. Regulatory functions of human СD4+ T-cells recognising HLA peptides presented by self-HLA-DR // Human Immunology, 14th European Histocompatibility Conference. - 2000. - Vol. 61, Suppl. 1. - Р. 1.
-
Rogers N, Lechler R.I. Allorecognition // Am. J. Transplant. - 2001. - Vol. 1. - P. 97-102.
-
Sechkin A., Boldyreva M., Dolbin A. et al. Three year experience in HLA DRB1 donor selection at Moscow center for organ donation. Human Immunology // 14th European histocompatibility Conference, Abstracts. - 2000. - Vol.61. - Suppl. 1 - P. 53-4.
-
Sechkin A.V., Dolbin A.G., Filiptsev P.Ya et al. HLA-DRB1-genotyping in perspective selection of kidney donor // Transplantation Proceedings, Elsevier. - 1997. - Vol. 29. - P. 3643-4.
-
Segers A., Tezcan C, DeSmet W. et al. Only a limited set of HLA epitopes is associated with organ graft loss // Book of abstracts Transplant 98. The transplantation society, XVII World Congress, Montreal. - 1998. - P. 73.
-
Sherman L.A., Cattopadhyan S. The molecular basis of allorecognition // Ann. Rev Immunol. - 1992. - Vol. 11. - P. 385-402.
-
Stazrl T.E. Ethical problems in organ transplantation // Annu. Intern. Med. - 1967. - Vol. 67, № 3. - P. 32-6.
-
Surman O.S. The morality of transplantation // JAMA, Chicago. - 1991. -Vol. 266, № 2. - P. 213.
-
Zavazava N., Fandrich F, Zhu X. et al. Oral feeding of an immunodominant MHC donor-recipient donor-derived synthetic class I peptide prolongs graft survival of heterotopic cardiac allografts in a high responder rat strain combination // J. Leukoc. Biol. - 2000. - Vol. 67. - Р. 793-800.
-
Zenker R. Etchische und rechtliche Probleme der Organstransplantation. Munchen, 1979.
Глава 5. HLA-полиморфизм и репродукция
Одна из важнейших функций системы HLA, которая тесно связана и с ее основной (или, возможно, более известной) функцией - контроль иммунного ответа, является ее участие в репродукции человека.
Исследования в области физиологической роли HLA начались уже в 1960-1970-х годах практически одновременно с работами по изучению возможностей использования доступных в то время методов HLA-типирования при селекции пар донор-реципиент в клинической трансплантологии. Одной из основных предпосылок начала этих исследований стали идеи относительно того, что поскольку плод можно рассматривать как «природный аллотрансплантат», то такого рода работы могут, с одной стороны, быть полезными в плане изучения возможности индукции толерантности - цели клинических трансплантологов, - а с другой стороны, могут дать ответ на вопросы, связанные с такими видами акушерской патологии, как привычное невынашивание беременности и бесплодие неясной этиологии. При этом была популярна точка зрения, согласно которой указанные осложнения беременности могли быть связаны с высоким уровнем тканевой несовместимости матери и плода, т.е. предполагалась возможность прямой аналогии с трансплантационным иммунитетом.
За прошедшие годы эта точка зрения изменилась на прямо противоположную, а по иному и не могло быть, поскольку беременность является физиологической функцией организма, в основе которой лежит временная иммунологическая толерантность матери к плоду. Напротив, сама по себе трансплантация отнюдь не является физиологической процедурой. В действительности же физиологическим проявлением функции иммунитета является отторжение трансплантата.
В настоящее время известно, что репродуктивный этап жизнедеятельности млекопитающих, в том числе человека, является одним из наиболее ярких примеров того, как гены иммунного ответа, и в первую очередь гены главного комплекса тканевой совместимости, обеспечивают генетическое разнообразие животного мира. Установлено, что мыши, крысы и ряд других животных распознают своих сексуальных партнеров из числа сородичей и осуществляют дифференциацию между ними именно с помощью молекул МНС. Причем мыши и крысы дифференцируют различие не только на уровне молекул МНС класса I других животных, но и «улавливают» даже точечные мутации в этих молекулах, т.е. различия на уровне SNP. Не совсем ясно, различаются ли сами полиморфные фрагменты молекул МНС I или одоранты, избирательно переносимые антигенами МНС класса I в мочу животных. Данная функция системы МНС у животных служит снижению инбридинга популяции животных, так как наличие аналогичных собственным антигенам МНС класса I служит табу для сексуального контакта между животными. Так, в работе P.W. Hedrick было установлено, что самки мышей предпочитают самцов, отличающихся от них по MHC, что фактически приводит к уменьшению пропорции гомозигот, усиливая генетический полиморфизм в популяции мышей [19]. Таким образом, у животных молекулы MHC служат переносчиками пахучих веществ - феромонов, которые влияют на индивидуальное распознавание, выбор партнера, гнездовое поведение и селективный блок беременности. При этом роль различных молекул МНС не ограничивается функцией пассивного переноса, а влияет на экспрессию запаха [21].
Подобные феномены трудно изучать у людей, так как HLA, являясь наиболее полиморфной системой в геноме человека, обладает потенциалом образовывать миллионы вариантов генотипов. Кроме того, высокая вариабельность фоновых запахов, кодируемых остальным геномом, а также культурная практика препятствуют исследованиям роли HLA в процессах воспроизведения. Тем не менее существует ряд доказательств того, что эта функция МНС не утрачена у человека.
В работе S. Jacob и колл. [21] было показано, что женщины могут определять различия запахов мужчин, отличающихся друг от друга по одному аллелю HLA. Механизм, лежащий в основе способности женщин различать и выбирать предпочтительные запахи, по мнению S. Jacob, связан с HLA-аллелями, полученными женщиной от отца, но не от матери. По данным C. Wedekind и S. Furi [48], от HLA зависел запах тела, эмоциональное восприятие которого определялось главным образом, если не исключительно, степенью «похожести» или «непохожести» по HLA-генотипу. Наблюдаемое предпочтение «непохожести», по мнению автора, должно приводить к увеличению гетерозиготности у потомства, но не накоплению определенных комбинаций MHC. J.D. Penn и колл. [36] также считают, что зависимый от MHC выбор партнера увеличивает MHC-гетерозиготность потомства.
Увеличение количества растворимых белков HLA в моче женщин перед овуляцией и снижение его до нормальных значений после овуляции [49], возможно, также участвует в данном процессе.
Направленный отбор МНС-гетерозиготности проявляется также в преимуществе, которым обладают МНС-гетерозиготные самцы по сравнению с гомозиготными. Так, например, в большой популяции свободно живущих макак-резус самцы, гетерозиготные по гену DQB1 MHC класса II, имели значительно более многочисленное потомство, чем гомозиготные. Подобные наблюдения были сделаны и у людей. Так, у мужчин из супружеских пар, имеющих детей, HLA-DRB1 -гомозиготность была в 3 раза ниже, чем у мужчин из пар с проблемами вынашивания беременности и из контрольной группы [5].
Подтверждением неслучайного выбора партнеров у людей служит серия работ, выполненных на племенах южноамериканских индейцев, живущих в дельтах рек Амазонки и Ориноко [20], а также в религиозной секте хатеритов (европеоиды). Оказалось, что количество гомозиготных по генам HLA индивидуумов было ниже математически прогнозированного, в соответствии с Менделевским распределением [24, 38]. В то же время количество гомозиготных по трем другим не-HLA локусам микросателитов, расположенных на 13-й хромосоме, в отличие от локусов HLA, расположенных на 6-й хромосоме, соответствовало расчетному.
Таким образом, выбор половых партнеров в природе направлен на поддержание гетерозиготности по генам MHC и на снижение возможности инбридинга, но, возможно, не на отбор конкретных вариантов генов MHC.
Возникает вопрос, какие из генов MHC (HLA) являются точкой приложения для осуществления направленного отбора? Разумеется, наиболее вероятно предположение, что это гены MHC с наибольшим уровнем полиморфизма и гетерозиготности. Известно, что среди генов HLA класса I это HLA-b, а среди генов HLA класса II это ген DRB1. Одним из подтверждений этому предположению служит работа A.M. Valdes и колл. [45], где приведены данные исследований, проведенных в 22 популяционных группах. Было установлено, что из четырех генов HLA класса II - DRB1, dqa1, DQB1 и dpb1 - наибольшей гетерозиготностью и наибольшим количеством вариантов обладал ген DRB1. В отношении гена DRB1 отмечен также высокий уровень гетерозиготности в позициях, критических для антигенного распознавания на уровне аминокислотных остатков, что подтверждает позитивную селекцию в сторону увеличения разнообразия репертуара иммунного ответа [40]. Интерес представляют результаты работы М.Т. Dorak и колл. [14], в которой установлено, что пропорция лиц, несущих две DRB1-специфичности, относящиеся к разным «древним» генам (DRB3, DRB4, DRB5), была значительно более выражена у мужчин (53,7% против 39,3 у женщин, р=0,003). Генотипы, состоящие из наиболее отстоящих филогенетически вариантов (DRB3 и DRB4) демонстрировали наиболее выраженные различия между полами (р=0,007). Гетерозиготность наиболее отстоящих гаплотипических семейств обеспечивает наивысший уровень гетерозиготности в главном локусе HLA класса II - DRB1, увеличивая гетерозиготность и в других локусах MHC.
Кроме того, было установлено также, что беременность у женщин из закрытой от общества секты хатеритов, совпадавших с партнером по гену DRB1, наступала через более длительные интервалы времени по сравнению с парами, не совпадавшими по гену DRB1, и в таких семьях было, соответственно, меньшее количество детей [32].
Таким образом, основной точкой приложения отбора в процессе репродукции среди генов HLA класса II являются, вероятно, гены DRB1.
Следующий возможный механизм направленного отбора, базирующийся на функции иммунной системы, имеющий непосредственную зависимость от генов MHC и косвенно связанный с репродукцией, - аутоиммунитет.
К настоящему моменту накопилось довольно много фактов о роли аутоиммунных процессов в нарушении репродуктивной функции, прежде всего у женщин.
Так, в работе S. Cowchock и колл. [12] у 29% женщин с необъяснимыми повторными выкидышами обнаружены антиядерные антитела, антитела к ДНК или экстракту ядерного антигена. По данным A.J. Shelton и колл. [42], аутоиммунные заболевания чаще встречались в семьях женщин, у которых наблюдали повторные выкидыши. T. Makino [28] проанализировал результаты обследования 1500 пар с повторными выкидышами, сделав заключение о возможной роли антифосфатидилэтаноламиновых и антианнексиновых антител. В то же время имеются данные о более общем влиянии аутоиммунитета на репродуктивную функцию, в частности аутоиммунитет рассматривается как причина недостаточности яичника [22, 26], а также таких заболеваний, как идиопатическое бесплодие, синдром поликистозного яичника, эндометриоз. Отмечается, что мишенями аутоантител могут быть стероидные гормоны, гонадотропины и их рецепторы, желтое тело, зона пеллюцида и ооцит [16].
Что касается непосредственно роли HLA, то у женщин с проблемами репродукции увеличена встречаемость HLA-специфичностей, которые относят к маркерам аутоиммунных заболеваний. Например, увеличение частоты DRB1*04 у женщин с привычным невынашиванием беременности было отмечено в нескольких работах [13, 5], где было также обнаружено увеличение частоты генов DRB1*01 и *03 у датчанок с этой патологией [13].
Работ относительно бесплодия у мужчин, связанного с аутоиммунитетом, очень мало. Однако в работе K. van der Ven [46] упоминаются HLA-маркеры, ассоциированные с нарушением сперматогенеза у мужчин. У таких мужчин повышена частота DRB1*01, одного из маркеров аутоиммунного процесса, и снижена частота DRB1*15, «протектора» аутоиммунитета.
Таким образом, если коротко подводить итоги всему вышесказанному, то в обеспечении полиморфизма системы генов главного комплекса тканевой совместимости принимает участие как непрерывный мутационный процесс, скорость которого, однако, не отличается от обычного, так и направленный отбор.
Приведенные выше факты свидетельствуют о том, что взаимодействие с инфекционным окружением направляет отбор на накопление конкретных вариантов генов, обеспечивающих максимально эффективное взаимодействие с конкретными патогенами. Помимо этого преимущество имеют гетерозиготные по аллелям генов MHC организмы, так как они обладают более разнообразным репертуаром иммунного ответа. Поддержание гетерозиготности и снижение вероятности инбридинга обеспечиваются самим участием МНС в репродуктивных процессах.
Следует отметить, что и ранее было известно следующее: повышение количества HLA-гомозигот в результате инбридинга, являющего следствием близкородственных браков, - это крайне неблагоприятный момент для здоровья потомства такого рода. Так, инбридинг резко возрастает в «замкнутых» популяциях, какими до последнего времени являлись малые этнические группы населения, проживающие в труднодоступных районах. Естественно, что аналогичная ситуация имеет место и в этнических кастовых или сословных группах (например, в королевских семьях, где браки по родству превалировали в течение нескольких поколений). Хорошо известно, что уже благодаря накоплению генов (и появлению их в гомозиготном состоянии), связанных с различными нарушениями развития среди представителей разных королевских домов, зачастую отмечалось увеличение числа наследственных заболеваний и уродств.
Несмотря на то что в последнее время точка зрения о низком значении обоняния для выбора HLA-несовместимого партнера по браку была пересмотрена, в определенных случаях браки заключаются между мужчиной и женщиной, частично, а иногда и полностью HLA-идентичными. Последнее может быть связано с тем, что при заключении брака человеком принимаются во внимание многие социальные, материальные и психологические условия, комплекс которых может иметь решающее значение.
Что же касается полной HLA-совместимости супругов, то на первый взгляд теоретическая вероятность ее более чем ничтожна, поскольку, ввиду крайне высокой степени полиморфизма системы HLA, средняя вероятность полной HLA-идентичности двух произвольно взятых людей приближается к 1 на миллион. Однако на практике вероятность негативного проявления HLA-совместимости значительно выше. Во-первых, имеет значение не только полная совместимость, но и частичная, и, по-видимому, наибольшую отрицательную роль может играть совместимость по специфичностям гена HLA-DRB1, в который, как указано выше, входят гены иммунного ответа человека, а совместимость по нему вносит наибольший вклад при подборе тканесовместимых пар при трансплантации органов. При этом следует отметить, что в большинстве популяций мира совместимость по специфичностям гена DRB1 встречается приблизительно на 2 порядка чаще, чем полная HLA-совместимость [6].
Во-вторых, даже в больших популяционных группах имеется значительное количество людей, в генотипе которых отдельные или группы генов HLA находятся в гомозиготном состоянии (так, например, в популяции русских, проживающих в Москве, количество гомозигот по HLA-DRB1- специфичностям - класс II - уже составляет более 15%). В данной ситуации достаточно, чтобы в HLA-генотипе гетерозиготного партнера присутствовал один из HLA-антигенов, находящихся в гомозиготном состоянии у другого. Исходя из законов наследования HLA-антигенов (кодоминантный принцип), у ребенка экспрессируются оба набора HLA, полученных от родителей. Результатом с высокой вероятностью может стать идентичность матери и плода по антигенам, которые присутствовали у одного из родителей в гомозиготном состоянии. Следующим фактором, повышающим вероятность первого, является то, что частота HLA-антигенов в популяциях весьма варьируется - от тысячных долей процента до десятков процентов. И, естественно, люди, имеющие в HLA-генотипе «высокочастотные» HLA-антигены, имеют более высокую вероятность встречи с супругом, имеющим этот же антиген в HLA-гетерозиготном состоянии. Наконец, еще одним фактором, относящимся далеко не ко всем популяционным и этническим группам, является то, что на Земле кроме больших этнических групп или групп, проживающих в условиях постоянного контакта этноса в течение исторически значимого периода, имеются малые этнические изолированно проживающие группы. Эти группы, в отличие от первых, которые «пользуются» практически всем HLA-разнообразием, т.е. в них с той или иной частотой встречаются практически все HLA-специфичности, «используют» весьма ограниченный набор HLA-специфичностей. Естественно, что в последних группах весьма высок уровень частотных HLA-антигенов и HLA-гомозигот. На территории России, особенно на севере, проживает значительное количество таких групп. Более того, существуют искусственно сформировавшиеся, например, некоторые религиозные секты, которые принадлежат к большим этносам, но в течение длительного времени проживают малыми группами в условиях изоляции.
Так или иначе ясно, что для человека, в отличие от животных, вероятность идентичности супругов, хотя бы по части HLA-антигенов, достаточно высока, что и предоставило возможность природе наглядно продемонстрировать все возможные последствия.
Следует отметить, что с проблемой «HLA и репродукция» в определенной степени связаны само становление и развитие изучения системы HLA. Дело в том, что первооткрыватель системы HLA французский иммуногематолог, лауреат Нобелевской премии Жан Доссе, поставивший перед собой задачу найти способ выявления антигенов тканевой совместимости, исходил в своей работе из следующей цепи предпосылок. Ребенок, находящийся в утробе матери, содержит часть антигенов, полученных от отца, и против них иммунная система матери должна развивать иммунный ответ, т.е. против этих антигенов должны появиться антитела. Эти антитела можно будет выделить из крови матери и затем использовать для идентификации антигенов, против которых они были выработаны. Идея оказалась полностью верной и плодотворной, поскольку Ж. Доссе действительно удалось получить антитела, идентифицирующие первый HLA-антиген, названный им «МАС», и индуцировать целый поток работ по выявлению при использовании предложенного им подхода других HLA-специфичностей. Затем была организована международная неправительственная организация по изучению системы HLA. К настоящему времени она объединяет несколько тысяч научных коллективов, имеет собственные журналы и проводит международные конгрессы и конференции. Жан Доссе на церемонии вручения ему Нобелевской премии за открытие системы HLA заявил, что данная область науки является наиболее ярким примером гуманитарного сотрудничества, в которой даже патентование результатов исследования является неприемлемым.
Что же касается проблемы «HLA и репродукция», то после первых успехов в области получения указанным выше путем HLA-типирующих сывороток от многорожавших женщин, вполне естественным было возникновение идеи о том, что с иммунологической точки зрения плод следует рассматривать как природный трансплантат. А отсюда также закономерно, как было указано выше, и проведение ряда более широких аналогий между плодом и трансплантатом. И поскольку к тому времени (начало 1960-х годов) уже было накоплено достаточно данных по механизмам трансплантационного иммунитета, который также является одной из физиологических функций иммунной системы, многие представления о нем были перенесены на проблему «Иммунология репродукции». А исходя из этого можно было предположить, что, как и в трансплантационном иммунитете, обнаружение цитотоксических анти-HLA-антител в крови, которые, будучи проявлением иммунного ответа на плод, одновременно играют неблагоприятную роль в развитии последнего, а возможно, и участвуют в реализации механизмов акушерских патологий. Следующим, вытекающим из предыдущего, стало заключение о том, что неблагоприятным является и HLA-несовместимость между матерью и плодом, как, собственно, это имеет место и при трансплантации органов. Таким образом, можно сказать, что сформировалось представление, согласно которому система МНС играла в репродукции человека прямо противоположную роль той, которую, как мы знаем теперь, она играет у животных.
Однако это представление претерпело более чем серьезные изменения и сегодня ясно, что и у человека система HLA создает условия, препятствующие появлению HLA-гомозиготного потомства, и хотя медицинские мероприятия в ряде случаев могут «преодолеть противодействие», в ряде случаев HLA-гомозиготные индивидуумы имеют повышенный риск развития целого ряда патологий.
Что же касается конкретной роли HLA в репродукции, то следует отметить, что неблагоприятные последствия даже неполной HLA-совместимости прослеживаются на различных этапах беременности. Так, одной из акушерских патологий, где проявляется неблагоприятная роль HLA-совместимости матери и плода, является такая патология беременности, как привычное или идиопатическое невынашивание беременности [2, 4]. Эта патология характеризуется многократными выкидышами у женщин, всестороннее обследование которых не позволяет выявить каких-либо видимых оснований для выкидыша. Примечательно также, что многие из этих женщин в новых браках имеют нормальную беременность.
Механизмы участия HLA-антигенов были изучены уже в 1980-х годах [2-4]. Была использована модель смешанной культуры лимфоцитов (СКЛ), позволяющая оценить уровень иммунного ответа HLA-DRB1-генотипированных лимфоцитов на аллогенные специфичности HLA-DRB1 [7]. При совместном культивировании клеток от двух лиц, различающихся по специфичностям HLA-DRB1, наблюдается развитие пролиферативной реакции лимфоцитов. Пик реакции наблюдается через 120 ч. Как правило, уровни ответа регистрируются на основе включения в пролиферирующие клетки радиоактивных или флюорохромных препаратов. Для выделения ответа тестируемого лица (отвечающая популяция) клетки стимулирующей популяции предварительно обрабатываются препаратами, подавляющими их пролиферацию (митомицин С). Таким образом, можно оценивать индивидуальный ответ тестируемого лица. Этот метод используется по настоящее время в клинической практике трансплантации кроветворных стволовых клеток для окончательного подтверждения тканевой совместимости донора и реципиента.
Примечательно, что в том случае, если донор стимулирующих клеток был предварительно сенсибилизирован к отвечающим клеткам, то пик ответа наблюдался по вторичному типу через 72 часа. Подобная ситуация наблюдается в случае сенсибилизации (примирования) отвечающих клеток в системе in vitro [1-4, 7].
Используя клеточную систему СКЛ (смешанная культура лимфоцитов), можно оценить не только пролиферативный ответ на чужеродные молекулы HLA-DRB1, но и клеточно-опосредованный цитотоксический эффект, регистрируемый в реакции клеточно-опосредованного лимфолизиса (CML - Cell-Mediated Lympholysis). C этой целью в качестве цитотоксических эффекторов используют примированные в течение 120 ч лимфоциты, а в качестве мишеней - популяцию клеток, стимулирующих СКЛ, меченных радиоактивной или флюорохромной меткой. Оценка реакции проводится на основе выхода метки из разрушенных клеток-мишеней.
В серии исследований, выполненных в 1980-х годах [2-4], с использованием вышеописанных методов для установления роли HLA-DRB1-совместимости в таких патологиях репродукции, как привычное невынашивание беременности и переношенная беременность, были получены следующие основные данные.
При постановке СКЛ в HLA-DRB1-совместимых парах наблюдалось отсутствие пролиферативного ответа как в период до развития беременности, так и в период беременности (вплоть до развития спонтанного выкидыша). Пролиферативный ответ в СКЛ на стимулирующие клетки, отличающиеся по HLA-DRB1 (клетки третьих партнеров), сохранялся.
При постановке СКЛ в группе HLA-DRB1-несовместимых пар (контроль) в период развития беременности наблюдали подавление СКЛ в комбинации, где стимуляция клеток матери осуществлялась отцовскими клетками на протяжении всей беременности. При этом ответ на HLA-DRB1-несовместимые клетки третьих партнеров оставался положительным. Что касается цитотоксического ответа, регистрируемого в CML, то в течение всей беременности в группе HLA-DRB1-тканенесовместимых супругов он был полностью подавлен. Его восстановление наблюдали лишь в период родоразрешения.
При обследовании пар с частичной HLA-DRB1-совместимостью установлено [2, 4], что помимо наличия осложнений в виде угрозы выкидыша и токсикоза беременности в ряде случаев, где также наблюдалась переношенная беременность, требующая оперативного разрешения, было установлено полное отсутствие CML при стимуляции клеток матери клетками отца.
Таким образом, можно сделать следующее заключение. HLA-DRB1-несовместимость супружеских пар является необходимым условием для инициации физиологически протекающей беременности. Частичная, а тем более полная HLA-DRB1-совместимость супругов является одной из причин таких осложнений беременности, как привычное невынашивание беременности, токсикозы беременности и нарушение физиологического процесса родоразрешения.
Среди причин привычного невынашивания беременности значимость HLA-DRB1-совместимости определяется тем, что среди пар с указанной патологией беременности идентичность по HLA-DRBl-специфичностям превышает 50%. Правомочно предположить, что такого рода специфическая активация аллореактивных клеток в процессе родоразрешения может служить одним из полноценных (а возможно, и основным) участником процесса родоразрешения. Это подтверждается тем, что, как известно, аллоиммунный ответ, т.е. ответ на антигены МНС, является наиболее сильным из известных ответов на чужеродные антигены [39, 43].
Естественно, что появление многочисленного МНС гомозиготного потомства ведет в конечном счете к снижению выживаемости любого вида животных. Разумеется, в человеческом социуме на выживаемость человечества влияют многие факторы, накладываемые самой цивилизацией. Тем не менее сама по себе тенденция к увеличению количества гомозигот HLA-DRB1 (тем более из числа наиболее часто встречаемых специфичностей HLA-DRB1), безусловно, является основой для снижения возможностей противостояния многим вызовам окружающей среды. Тем не менее в любом обществе следует учитывать имеющие место и подчас преобладающие конкретные интересы его членов. Например, проблемы бездетных пар, не имеющих потомства вследствие привычного невынашивания беременности. Поэтому еще в 1993 г. после проведения описанных выше исследований было найдено принципиальное решение проблемы преодоления бесплодия, вызванного привычным невынашиванием беременности, развившимся в результате HLA-DRB1-совместимости супругов. Было установлено, что успешное решение этой проблемы лежит в использовании аллоиммунизации будущей матери пулом клеток, различающихся по генотипу HLA-DRB1 (патент № 145084 от 04.03.93). Этот метод по настоящее время достаточно широко используется в клинической практике. Расширению использования данного подхода способствовал тот факт, что за прошедшие годы в иммуногенетике произошла технологическая революция, и основными методами анализа в настоящее время стали методы иммуногенотипирования, основанного на достижениях молекулярной генетики. Последнее дает возможность значительно более надежно и экспрессно оценивать HLA-тканевую совместимость супругов.
Необходимым условием использования данного метода является информирование будущих родителей о повышенной вероятности развития у ребенка иммунозависимых заболеваний в результате его HLA-DRB1- гомозиготности.
Таким образом, система HLA у человека, по-видимому, частично утеряв функцию выбора сексуального партнера, тем не менее, пытается защитить его от появления HLA-гомозигот, поскольку, как это обсуждалось ранее, именно высокий HLA-полиморфизм является необходимым условием для осуществления полноценной иммунорегуляторной функции системы HLA. Этот вывод, к которому пришел Р.М. Хаитов в своей монографии «Физиология иммунной системы» (2005 г.) [6], практически полностью подтвержден результатами, полученными А. Ziegler и колл. [51]. Ими было сделано заключение о том, что именно участие системы HLA в контроле репродуктивного процесса уже на самом начальном уровне (взаимодействие сперматозоид-яйцеклетка) позволяет избежать дорогостоящих вложений в эмбрион с потенциально неоптимальными генетическими и иммунологическими свойствами.
К указанному заключению А. Ziegler и колл. привели данные, полученные им и сотрудниками его лаборатории при исследовании влияния на репродуктивную функцию и участие в инициации репродуктивного процесса ассоциированных с HLA генов, кодирующих обонятельный рецептор. При проведении данной работы было обнаружено, что выявляемые в сперматоцитах в первой стадии и сперматозоидах антигены HLA класса I не имеют в своей структуре 2-микроглобулина и, являясь по существу неполной молекулой HLA, не могут участвовать в иммунных процессах. Функция этих иммунологически неполноценных молекул связана с функцией обонятельных рецепторов и ограничивается лишь участием в репродуктивном процессе, обеспечивая процесс селекции на сперматозоидах только тех обонятельных рецепторов, которые не способны распознавать собственные молекулы. Поэтому экспрессированные на сперме обонятельные рецепторы внутри женского пути репродукции способны распознавать только лиганды, отличающиеся от тех, с которыми обонятельные рецепторы взаимодействовали при тестикулярной селекции. Именно таким образом, по-видимому, может осуществляться участие HLA-системы, реализуемой через партнера.
Все вышеприведенные данные относятся к изучению роли HLA-совместимости партнеров в репродукции без попытки анализа того, могут ли отдельные конкретные HLA-специфичности в генотипе партнера или партнерши влиять на выбор партнера, возникновение и течение беременности. Разумеется, такого рода исследования проводились и ранее, и наибольшее их количество приходится на конец 1960-х - начало 1970-х годов. Можно сказать, что только в одном из них [13], выполненном на значительном материале (было проанализировано несколько десятков супружеских пар с привычным невынашиванием беременности), были получены достоверные результаты. Авторам удалось показать, что при данной патологии у женщин повышена частота специфичности HLA-DR1*04.
Недавно в Институте иммунологии было выполнено исследование, в котором предприняли попытку изучения особенностей HLA-DRB1 -генотипа у обоих партнеров в парах с привычным невынашиванием беременности (рис. 5.1, см. цв. вклейку). При этом не только было подтверждено повышение частоты специфичности DRB1*04 у женщин из исследуемой группы, но и установлены специфичности, наличие которых отрицательно ассоциировано с данной патологией. Ими оказались DRB1*07 у женщин и DRB1*01, *06 у мужчин [5, 10, 11]. Эти данные, помимо возможности их использования в клинической практике акушерства и гинекологии, могут быть рассмотрены и с фундаментальной точки зрения. Выявлены отрицательные и положительные ассоциации между конкретными HLA-специфичностями и патологиями беременности, препятствующими или, наоборот, способствующими репродуктивному процессу у лиц, несущих данные специфичности в генотипе. В свою очередь, это не может не повлиять на частоту встречаемости этих специфичностей в популяции. Таким образом, при рассмотрении формирования генетического профиля популяции в значительных временных этапах данный феномен может оказать эффект на HLA-полиморфизм, сопоставимый с эффектом средневековых эпидемий и пандемий, результатом которых, как считается, является HLA-профиль основных европейских популяций [8, 9, 17].
Все вышесказанное касалось так называемых «классических» HLA-антигенов, описанных и хорошо изученных в 1960-1980-х годах. В начале настоящего раздела были приведены также данные о так называемых новых антигенах, генах и локусах, открытых в последние годы. Среди них шла речь о молекулах HLA класса I локусов HLA-G и HLA-E, функция которых еще недавно была неясна. Первоначально антигены, кодируемые локусом HLA-G, были выявлены на клетках хориокарциномной клеточной линии, а также на мембране клеток больных хроническим цитотрофобластозом [15]. Уже на основании последней из работ было высказано предположение о том, что их физиологическая функция может быть связана с репродукцией.
Методом PCR-RFLP был установлен аллельный полиморфизм HLA-G в экзонах 2 и 3 [30, 33]. Всего к настоящему времени установлено 14 аллельных вариантов HLA-G. Следует отметить, что вопрос о степени полиморфизма у вышеописанных «неклассических» генов остается открытым. Значительно более исследованным к настоящему времени оказался вопрос о биологической функции аллелей HLA-G и их продуктов. Так, оказалось, что в отличие от молекул HLA класса II и I (за исключением антигенов локуса HLA-C), которые не экспрессированы на трофобласте [25], молекулы HLA-G экспрессируются на данном виде тканей [41] так же, как и молекулы HLA-E [23]. Эта экспрессия, в свою очередь, отражает, как это было установлено позже, и биологическую роль молекул HLA-G - их участие в процессе репродукции [47]. За период с 1990 по 2000 г. появились работы, связывающие функцию антигенов HLA-G с ролью в репродуктивном процессе естественных клеток-киллеров (ЕКК). Так, в работе Т. Yamamoto и колл. [50] была установлена взаимосвязь между уровнем активности ЕКК и экспрессией HLA-G, с одной стороны, и характером течения беременности. Низкая экспрессия HLA-G на уровне высокой экспрессии была ассоциирована с развитием повторных спонтанных выкидышей. Полученные при исследовании динамики экспрессии HLA-G данные позволили Р. Le Bouteiller и колл. [27] и L. Pazmany и колл. [35] сделать заключение о том, что физиологическая функция указанных молекул может лежать в основе развития толерантности организма матери по отношению к плоду, и что реализация этого механизма осуществляется через блокировку активности ЕКК. Результаты последующих исследований в области изучения механизмов функции антигенов HLA-G и HLA-E были подведены на состоявшемся в июне 2003 г. 4-м Международном конгрессе Европейского общества иммунологии репродукции и развития (о. Родос, Греция, 2003), где значительное число сообщений так или иначе было посвящено новейшим данным о роли антигенов HLA-G при физиологической беременности и при ее патологиях.
Следует также отметить, что развитие данного направления позволило также получить целый ряд принципиально новых данных об иммунологии репродукции, и в первую очередь это можно сказать о расширении представления о роли ЕКК при физиологической беременности и при ее патологиях. Последнее связано с тем, что именно продукты HLA-G, а также HLA-E участвуют в регуляции активности ЕКК, которые, в свою очередь, являются, как это стало известно, одним из важнейших участников перестройки иммунной системы, сопровождающей беременность и определяющей ее течение - физиологическое или патологическое [27, 31, 37]. Так, Е. Ntrivalas и колл. [31] показали, что в лютеальной фазе менструального цикла имеет место возрастание количества ЕКК, и в 1-й триместр беременности их количество еще более повышается. Этот процесс отражает физиологическую роль ЕКК-контроля чрезмерной инвазии трофобластов и предотвращении местной инфекции. Однако при избыточной функции ЕКК могут возникать такие осложнения, как преэклампсия и повторное невынашивание. В этом процессе участвуют ЕКК, несущие маркер CD69. И именно антигены HLA-G являются фактором, регулирующим активность CD69+ ЕКК. При нормально протекающей беременности на клетках трофобласта экспрессируются антигены HLA-G (отсутствующие в организме вне беременности), подавляющие активность ЕКК [27, 31, 37].
Именно недостаточность экспрессии HLA-G на трофобласте является пусковым механизмом для развития вышеуказанных патологических состояний. Достигнут благоприятный эффект от использования в качестве средства терапии повторного невынашивания беременности иммунизации лимфоцитарной взвесью, что приводит к повышению экспрессии на трофобласте антигенов HLA-G [37]. Помимо экспрессии на трофобласте, антигены HLA-G в мембраносвязанной и/или в растворимой формах принимают непосредственное участие в регуляции иммунной системы и другими способами. Так, они обнаружены на эндоваскулярном эпителии сосудов матки. Показано, что CD8+ Т-лимфоциты, специфичные иммунодоминантным пептидам CMV, проявляют HLA-G-рестриктированную активность. Одновременно с этим HLA-G, помимо регуляции активности ЕКК, по данным Р. Le Bouteiller и колл., оказывают прямое супрессивное воздействие на активность CD4+ Т-клеток и CD8+ цитотоксических Т-клеток. Помимо этого HLA-G в растворимой форме осуществляют контроль васкуляризации плаценты [27, 37].
Следует отметить, что одним из вопросов, на который еще предстоит дать ответ, является следующий: имеет ли значение для осуществления полноценной функции генов HLA-G их полиморфизм? Во всяком случае на сегодняшний день ответ на этот вопрос неоднозначен. Так, по данным K. van der Ven и колл. [47], взаимосвязи между конкретными аллельными вариантами HLA-G и их физиологической активностью не установлено. В то же время M. Grzywacz и колл. [18] представили данные о наличии ассоциации между аллельным вариантом HLA-G*01018 и осложнениями беременности, связанными с нарушением экспрессии антигенов HLA-G на тканях, обеспечивающих физиологическую беременность.
Помимо HLA-G из числа «неклассических» HLA-антигенов, в регуляции иммунитета при репродукции принимают участие и HLA-E-специфичности [44]. Однако в отличие от функции HLA-G активность этих антигенов направлена на регуляцию цитотоксичности не ЕКК, а Т-лимфоцитов, причем их субпопуляции Vdelta2. Эти авторы показали, что при физиологической беременности антигены HLA-E, экспрессированные на трофобласте, распознаются указанным субтипом Т-лимфоцитов через рецепторы CD94/ NKG2. Результатом этого взаимодействия является запуск апоптоза субпопуляции Vdelta2. Нарушение этого эффекта и возрастание процента последней субпопуляции цитотоксических Т-клеток на фоне снижения Vdelta1 играют важную роль в развитии патологии беременности.
Как часто это имеет место в биологии и медицине, та или иная физиологическая функция при изменении своих качественных и количественных параметров может перейти в свою противоположность, т.е. принять участие в развитии патологического процесса. Это относится и к описанным выше молекулам неклассических HLA-антигенов. Так, в работах B. Marin и колл. [29], исследовавших экспрессию HLA-E на 40 линиях опухолевого происхождения, были определены молекулы HLA-E, экспрессированные на их поверхности. Более того, G. Pangault и колл. [34] установили наличие экспрессии HLA-G антигенов на опухолевых клетках больных раком легких.
Несмотря на то что такого рода работы относятся к пилотным исследованиям, можно предположить, что дальнейшие исследования в данном направлении могут оказаться перспективными как в плане понимания патогенеза онкологических заболеваний, так и в разработке новых подходов в диагностике и прогнозе указанных заболеваний.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
-
Алексеев Л.П., Алексеева Л.В., Полунин А.И. и др. Изучение in vitro сенсорной и эффекторной функции лимфоцитов человека // Проблемы гематологии и переливания крови. - 1975. - № 12. - С. 14-9.
-
Алексеев Л.П., Федорова О., Зарецкая Ю.М. и др. Изучение роли HLA-D и CD антигенов при беременности в норме и патологии // Тер. архив. - 1980. - Т. 6. С. 8-15.
-
Алексеев Л.П., Федорова О. Иммунологические основы патологии беременности // Иммунология. - 1981. - Т. 4. - С. 13.
-
Алексеев Л.П., Федорова О., Сластен О.П. и др. Активация Т-клеток эффекторов в период родоразрешения // Иммунология. - 1984. - Т. 2. - С. 69-72.
-
Болдырева М.Н., Хаитов Р.М., Барцева О.Б. и др. Исследование роли HLA-DRB1-генов при невынашивании беременности неясного генеза // Иммунология. - 2004. - Т. 25, № 1. - С. 4-8.
-
Хаитов Р.М. Физиология иммунной системы. - М.: ВИНИТИ РАН. - 2005. - 375 с.
-
Bach F., Kuperman O., Sollinger O. et al. Cellular immunogenetics and LD-CD collaboration // Transplant. Proc. - 1977. - Vol. 9. - P. 859-863.
-
Bodmer W., Bodmer J.G. Evoluation and function of the HLA system // Brit. Med. Bull. - 1978. - Vol. 3. - P. 309-316.
-
Bodmer W. HLA Polymorphism: origin and maintenance // In: HLA 1997, P. Terasaki and D. Gjertson, eds. 1998. - P. 1-7.
-
Boldyreva M.N., Gouzov Bartseva O.B. et al. HLA-DRB1 genes possibly involved in spontaneous abortions of uncertain genesis // J. Reprod. Immunol. - 2003. - Vol. 58, № 2, April 2003, ELSEVIER. - P. 102.
-
Boldyreva M.N., Chromova N.A., Yankevich T.E. et al. HLA-DRB1 homozygosis in spontaneous abortions of uncertain genesis // 17th European Histocompatibility Conference. 11 Annual Meeting. German Society of Immunogenetics. Baden-Baden, Germany. - May 6-9, 2003. - P. S70.
-
Cowchock S., Dehoratius R.D., Wapner R.J. et al. Subclinical autoimmune disease and unexplained abortion // Am. J. Obste. Gynecol. - 1984. - Vol. 150, № 4. - P. 367-71.
-
Cristiansen O.B. The possible role of classical human leukocyte antigens in recurrent miscarriage // Am. J. Reprod. Immunol. - 1999. - Vol. Aug. 42, № 2. - P. 110-5.
-
Dorak M.T., Lawson T., Machulla H.K. et al. Increased heterozygosity for MHC class II lineages in newborn males // Genes Immun. - 2002. - Vol. 3, № 5. - P. 263-9.
-
Ellis S.A., Palmer M.S., McMichael A.J. Human trophoblast and the choriocarcinoma cell line BeWo express a truncated HLA class I molecule // J. Immunol. - 1990. - Vol. 144. - P. 731-5.
-
Forges T., Monnier-Barbarino P., Faure G.C. et al. Autoimmunity and antigenic targets in ovarian pathology // Hum. Reprod. Update. - 2004. - Vol. 10, № 2. - P. 163-75.
-
Gruen J.R., Weissman S.M. Evolving views of the major histocompatibility complex // Blood. - 1997. - Vol. 90. - P. 4252-65.
-
Grzywacz M., Gorski B., Jakubowska A. et al. Association between HLA-G*01018 allele pregnancy complications // J. Reprod. Immunol. - April 2003 ELSEVIER. - Vol. 58, № 2. - P. 162.
-
Hedrick P.W. Female choice and variation in the major histocompatibility complex // Genetics. - 1992. - Vol. 132, № 2. - P. 575-81.
-
Hedrick P.W., Black F.L. Random mating and selection in families against homozygotes for HLA in south Amerdinians // Hereditas. - 1997. - Vol. 127, № 1-2. - P. 51-8.
-
Jacob S., McClintock M.K., Zelano B. et al. Paternally inherited HLA alleles are associated with women’s choice of male odor // Nat. Genet. -2002. - Vol. 30, № 2. - P. 175-9.
-
Kauffman R.P., Castracane V.D. Premature ovarian failure associated with autoimmune polyglandular syndrome: pathophysiological mechanisms and future fertility // J. Women’s Health (Larchmt). - 2003. - Vol. 12, № 5. - P. 513-20.
-
King A., Allan D.S., Bowen M. et al. HLA-E expressed on trophoblast and interacts with CD94/NKG2 receptors on decidual NK cells // Eur. J. Immunol. - 2000. - Vol. 30. - P. 1623-31.
-
Kostyu D.D., Dawson D.V., Elias S. et al. Deficit of HLA homozygotes in Caucasian isolate // Hum. Immunol. - 1993. - Vol. 37, № 3. - P. 135-42.
-
Kovats S., Main E., Librach C. HLA-G expressed in human trophoblast // Science. - 1990. - Vol. 248. - P. 220-3.
-
Kuttech W.H. Autoimmune factors in assisted reproduction // Minerva Ginecol. - 2002. - Vol. 54, № 3. - P. 217-24.
-
Le Bouteiller P., Piazzato N., Solier C. et al. HLA-G: control of placental local immunity and angiogenesis // J. Reprod. Immunol. - April 2003, ELSEVIER. - Vol. 58, № 2. - P. 115.
-
Makino T. Recurrent reproductive wastage and immunologic factors // Am. J. Reprod Immunol. - 2002. - Vol. 48, № 4. - P. 266-8.
-
Marin R., Mendez R., Pedrinaci S. et al. HLA-E expression in tumor cell lines // Europ. J. Immunogenetics. - April 2002. - Vol. 29, № 2. - P. 145.
-
Nei M., Hughes A.L. Polymorphism and evolution of the major histocompatibility complex loci in mammals // In: R. Selander, A. Clark, T. Whittam, eds. Evolution at the molecular level. Sinauer Associates, Sunderland, Mass. - 1991. - Р. 222-47.
-
Ntrivalas E., Gilman-Sachs A., Kwak-Kim J. et al. NK cell activity // J. Reprod. Immunol. - April 2003, ELSEVIER. - Vol. 58, № 2. - P. 105.
-
Ober C., Elias S., O’Brien E. et al. HLA sharing and fertility in Hutterite couples: evidence for prenatal selection against compatible fetuses // Am. J. Reprod. Immunol. Microbiol. - 1988. - Vol. 18, № 4. - P. 111-5.
-
Orr H.T. HLA class I gene family: characterization of genes encoding non-HLA-A, B, C proteins //In: Immunobiology of HLA, Vol. II (ed. B. Dupont). Springer-Verlag, New York. - 1989. - Р. 33-9.
-
Pangault C., Leke Friec S., Caulet-Maugendre S. et al. Expression of HLA-G molecules in pulmonary diseases // Europ. J. Immunogenetics. - April 2002. - Vol. 29, № 2. - P. 144.
-
Pazmany L., Mandelboim O., Vales-Gomes M. et al. Human leukocyte antigen-G and its recognition by natural killer cells // J. Reprod. Immunol. - 1999. - Vol. 43. - P. 127-37.
-
Penn D.J., Damjanovich K., Potts W.K. MHC Heterozygosity confers a selective advantage against multiple-strain infections // Proc. Natl. Acad. Sci. - 2002. - Vol. 99, № 17. - Р. 11260-4.
-
Pohlmann T., Schaumann A., Fitzgerald J.S. et al. Influence of soluble HLA-G1 on natural killer cells isolated from the human decidua // J. Reprod. Immunol. - April 2003, ELSEVIER. - Vol. 58, № 2. - P. 146.
-
Robertson A., Charlesworth D., Ober C. Effect of inbreeding avoidance on Hardy-Weinberg expectations: examples of neutral and selected loci // Genet. Epidemiol. - 1999. - Vol. 17, № 3. - P. 165-73.
-
Rogers N., Lechler R.I. Allorecognition // Am. J. Transplantat. - 2001. - Vol. 1. - P. 97-102.
-
Salamon H., Klitz W., Easteal S. et al. Evolution of HLA class II molecules: allelic and amino acid site variability across populations // Genetics. - 1999. - Vol. 152, № 1. - P. 393-400.
-
Schmidt C., Orr H. Maternal fetal interactions: the role of the MHC class I molecule HLA-G // Crit. Rev. Immunol. - 1994. - Vol. 13. - P. 207-24.
-
Shelton A.J., Harger J.H., Dorman J.S. et al. Association between familial autoimmune diseases and recurrent spontaneous abortions // Am. J. Reprod. Immunol. - 1994. - Vol. 32, № 2. - P. 82-7.
-
Sherman L.A., Cattopadhyan S. The molecular basis of allorecognition // Ann. Rev Immunol. - 1992. - Vol. 11. - P. 385-402.
-
Szereday L., Barakonyi A., Miko E. et al. Gamma/delta T cell subsets, NKG2A expression and apoptosis of Vdelta2+ T cells in pregnant women with or without risk for premature pregnancy termination // J. Reprod. Immunol. - April 2003, ELSEVIER. - Vol. 58, № 2. - P. 171.
-
Valdes A.M., McWeeney S.K., Meyer D. et al. Locus and population specific evolution in HLA class II genes // Ann. Hum. Genet. - 1999. - Vol. 63, № 1. - P. 27-43.
-
Van der Ven K., Fimmers R., Engels G. et al. Evidence for major histocompatibility complex-mediated effects on spermatogenesis in humans // Human reproduction. - 2000. - Vol. 15, № 1. - P. 189-96.
-
Van der Ven K., Pfeiffer K., Skrablin S. HLA-G polymorphisms and molecule function-questions and more questions - a review // Placenta. - 2000. - Vol. 21 (Supple). - P. S86-92.
-
Wedekind C., Furi S. Body odor preferences in men and women: do they aim for specific MHC combinations or simply heterozygosity? // Proc. Biol. Sci. - 1997. - Vol. 264, № 1387. - P. 1471-9.
-
Wobst B., Zavazava N., Luszyk D. et al. Molecular form of soluble HLA in body fluids: potential determinants of body odor cues // Genetica. - 1998-1999. - Vol. 104, № 3. - P. 275-83.
-
Yamamoto T., Takahashi Y., Kase N. et al. Proportion of CD56+CD16+ T cells in deci-dual and peripheral lymphocytes of normal pregnancy and spontaneous abortion with and without history of recurrent abortion // Am. J. Reprod. Immunol. -1999. - Vol. 42. - P. 355-60.
-
Ziegler A., Dohr G., Kentenich H. et al. МНС, olfactory receptor genes and mate selection // Immunology letters. - 2003. - Vol. 87, № 1-3, June 2003, Special Issue: Abstracts of the 15th European Immunology Congress (EFIS 2003) June 8-12, 2003, ELSEVIER S5.2. - P. 12.
Глава 6. Иммуногенетика сахарного диабета 1 типа
Сахарный диабет 1 типа (СД1) - одно из наиболее широко распространенных и наиболее изученных аутоиммунных мультифакторных заболеваний человека. В то же время четко установлено, что СД1 имеет выраженную генетическую основу [6]. До недавнего времени было известно около 20 генов-кандидатов предрасположенности к СД1 [23]. В самые последние годы этот список резко расширился за счет включения в него генов и их аллельных вариантов, участвующих в развитии иммунного ответа, но не относящихся к системе HLA. В результате их общее количество превысило 60.
Наибольшее значение из известных генетических маркеров СД1 имеют гены, расположенные в области главного комплекса тканевой совместимости человека (HLA) на хромосоме 6р21.3 (локус IDDM1) [25, 23]. Подтверждением этому, в частности, является тот факт, что на протяжении уже более 30 лет именно СД1 занимает основное место в разделе «HLA и болезни» 4-летних программ в рамках международных рабочих совещаний и конференций, посвященных изучению HLA.
В ряде исследований, в том числе выполненных по международным программам, было установлено, что гены HLA до 70% определяют генетическую основу СД1 [23].
Столь высокий уровень ассоциации генов HLA с предрасположенностью к заболеванию СД1 объясняется тем, что продукты этих генов не только являются генетическими маркерами предрасположенности к СД1, но и выполняют функцию запуска аутоиммунного процесса, лежащего в основе заболевания [5].
Последнее неудивительно, если принять во внимание современные данные о структуре, функции и биологической роли генов HLA и особом месте, которое им принадлежит в геноме человека [13, 2].
Как уже упоминалось, расшифровка генома человека - одно из величайших достижений человечества конца XX - начала XXI в. В то же время ясно, что между полученными знаниями о строении генома и формированием четких представлений о его функции потребуются значительный отрезок времени и международная консолидация научных исследований. Разумеется, уже сейчас отдельные функции генома человека более изучены. Среди этих генов особая роль принадлежит генам главного комплекса тканевой совместимости человека (HLA), для которых в отличие от большинства генов, образующих геном человека, на сегодняшний день расшифрована не только геномная, но и протеомная основы. Это обстоятельство открывает большие возможности в изучении генетических основ заболеваний аутоиммунного генеза. Последнее связано с тем, что аутоиммунные процессы разворачиваются, как правило, не на уровне самих генов, а на уровне их белковых продуктов - HLA-антигенов. Этот вопрос был первоначально детально изучен при разработке проблемы трансплантации органов и тканей. В основе реакции отторжения трансплантата лежит несовместимость тканей реципиента по HLA-антигенам с тканями донорского трансплантата. Решением данной проблемы является подбор тканесовместимых пар донор-реципиент на уровне, необходимом для проведения трансплантации и проведения иммуносупрессивной терапии.
Совершенно иные механизмы лежат в основе участия HLA-специфичностей в развитии аутоиммунного процесса. В этом случае речь идет о феномене сходства или идентичности отдельных участков структуры возбудителей инфекционных заболеваний со структурами конкретных HLA-специфичностей, присутствующих в геноме лиц, имеющих предрасположенность к СД1. В основе этого феномена лежит так называемый феномен антигенной мимикрии.
В 1970-1980-е годы эти представления носили в определенной степени гипотетический характер, но эта гипотеза нашла полное подтверждение в конце XX в., когда стало ясно, что именно гены HLA являются наиболее информативными маркерами предрасположенности к развитию аутоиммунных заболеваний.
Дальнейший прогресс в данной области стал возможен в связи с разработкой и внедрением молекулярно-генетических методов генотипирования, которые позволили исследователям перейти на уровень непосредственного исследования и анализа генома HLA. О том, насколько большие возможности открылись перед исследователями, работающими в области прикладных и фундаментальных исследований HLA, в том числе в направлении «HLA и болезни», можно судить по данным, приведенным в табл. 2.1 (см. гл. 2).
Количество специфичностей, выявляемых молекулярно-генетическим методом, возросло почти в 60 раз по сравнению с серологическими и клеточно-опосредованными (т.е. протеомными методиками). При этом был выявлен ряд неизвестных генов HLA, в том числе осуществляющих такой важнейший этап развития иммунного ответа, как процессинг и презентация иммунодоминантных пептидов, входящих в те или иные антигены. Это относится как к пептидам, представляемым HLA-молекулами класса I, так и класса II. Нарушение функции указанных молекул лежит в основе целого ряда заболеваний, в том числе и СД1, где имеют место нарушения нормального процессинга иммунодоминантных пептидов, а также экспрессия вновь открытых HLA-специфичностей, участвующих в процессинге и презентации. Эти молекулы (в частности, HLA-DO и CLIP) экспрессируют ауто-HLA-пептиды на клеточных мембранах, что является одной из причин развития аутоиммунного процесса.
Эти данные позволяют по-новому пересмотреть результаты значительного количества работ, выполненных в 1980-1990-х годах и посвященных роли аберрантной экспрессии антигенов тканевой совместимости в развитии аутоиммунных заболеваний, в частности СД1. В целом результаты этих работ, выполненных на экспериментальном и клиническом материале, свидетельствовали о возможности участия молекул главного комплекса тканевой совместимости в патогенезе СД1, в первую очередь это относилось к молекулам HLA класса II, аберрантная экспрессия которых наблюдалась на клетках органов-мишеней аутоиммунного процесса, включая клетки поджелудочной железы животных и человека. Однако результаты, полученные исследователями, были неоднозначны. Наряду с данными о возможном участии аберрантно экспрессированных молекул тканевой совместимости в развитии аутоиммунного процесса [58, 21, 45] были получены данные, свидетельствующие о том, что аберрантная экспрессия молекул тканевой совместимости может быть индуктором иммунологической толерантности [35, 29, 19, 43, 41].
Естественно, что авторы работ, выполненных в тот период, не располагали современными представлениями о молекулярно-генетических основах процессинга и презентации молекул тканевой совместимости. Это ограничивало возможности как исследований по изучению тонких механизмов аберрантной экспрессии, так и трактовки роли тех или иных молекул тканевой совместимости в индукции аутоиммунного процесса.
Современные возможности молекулярной иммуногенетики позволяют оценивать непосредственную роль HLA-молекул и кодирующих их генов (в том числе HLA-DO, CLIP и др.) в экспериментальных исследованиях и в клинических наблюдениях. Более того, открываются принципиально новые возможности мониторинга активности указанных генов в целях установления доклинических этапов нарушения их функции, результатом чего может стать та или иная форма аберрантной экспрессии молекул HLA.
Если вопрос о роли аберрантной экспрессии молекул HLA в развитии СД1 и других аутоиммунных заболеваний до настоящего времени относится в основном к области гипотетических факторов развития аутоиммунного процесса и нуждается в проведении масштабных исследований на молекулярно-иммуногенетическом уровне, то вопрос о роли так называемой антигенной мимикрии в развитии аутоиммунного процесса не вызывает сомнений. Большинство исследователей, работающих в области изучения иммунопатогенеза аутоиммунных заболеваний, считают, что в основе большинства либо всех аутоиммунных заболеваний лежит феномен антигенной мимикрии. Сама основа данного феномена непосредственно связана со структурой молекул главного комплекса тканевой совместимости. Дело в том, что многие возбудители инфекционных заболеваний человека имеют общие антигенные детерминанты с определенными участками конкретных HLA-специфичностей. В результате развития нормального иммунного противоинфекционного ответа при повторном инфицировании происходит атака не только на болезнетворный агент, но и на собственные клетки организма. Процесс, запускаемый подобным образом, может заканчиваться развитием генерализованного заболевания. Таким образом, индукторами заболевания являются HLA-антигены, имеющие в своем составе иммунодоминантные пептиды, вызывающие перекрестную реакцию против мимикрирующих антигенов-возбудителей. При этом следует отметить, что большая часть из данных HLA-антигенов еще до установления этих фактов на основании статистического анализа была признана генетическими маркерами предрасположенности к СД1.
Давно известно, что перекрестные реакции между антигенами микроорганизмов и аутоантигенами человека могут возникать и приводить к аутоиммунному ответу. Двумя известными примерами молекулярной мимикрии являются болезнь Чагаса и ревматическая лихорадка, вызываемые соответственно взаимодействием антигенов Trypanosoma cruzi и стрептококка с белками миокарда [65].
Несколько лет назад была выдвинута более содержательная гипотеза, объясняющая патогенез ревматологического заболевания - анкилозирующего спондилита. Сообщалось, что в двух группах с повышенными титрами антител против кишечного патогена Klebsiella были отмечены реакции на лимфоциты от HLA-B27 положительных больных анкилозирующим спондилитом [26, 56]. Наблюдались также перекрестные реакции анти-В27-антитела с различными энтеробактериями, включая Klebsiella. После этого появились данные о том, что моноклональные антитела, появившиеся против В-27, также распознавали антигены, экспрессирoванные Klebsiella, Salmonella, Shigella и Yersenia. Результатом данных перекрестных реакций стало то, что эти бактерии являются именно теми, которые провоцируют развитие реактивного артрита у В-27 положительных индивидов.
Клиническим генетическим маркером предрасположенности к ревматоидному артриту являются антигены HLA-B27.
Однако относительно данной гипотезы существуют некие неясности. На концептуальном уровне неясно, почему данный вид перекрестной реактивности должен вызывать заболевание, ограниченное в большинстве случаев только суставами.
Таким образом, говоря об HLA-антигенах-маркерах предрасположенности к развитию аутоиммунных заболеваний, следует понимать, что фактически речь идет не столько об их роли как генетических маркеров, сколько как об индукторах аутоиммунного процесса.
На сегодняшний день хорошо известны инфекционные заболевания, возбудители которых несут в своем геноме участки, общие с антигенами тканевой совместимости человека. При этом следует отметить, что конкретные HLA-антигены, несущие эти общие участки, могут присутствовать или, напротив, отсутствовать в геноме конкретного человека в зависимости от его HLA-генотипа. И этим, собственно, определяется индивидуальная предрасположенность конкретного человека к развитию того или иного аутоиммунного заболевания. Дело в том, что в случае, если в конкретном геноме присутствуют общие с инфекционным агентом иммуногенные молекулы (молекулы, вызывающие иммунный ответ), то после развития иммунного ответа на инфекционный агент клеточные и гуморальные (антитела) компоненты иммунного ответа обращают свое действие и на клетки собственного организма, поскольку в них содержится тот же иммуноген, что и в возбудителе инфекции. Именно поэтому HLA-гены и их белковые продукты - HLA-антигены - являются, как правило, маркерами предрасположенности к аутоиммунным заболеваниям. Например, из числа маркеров предрасположенности к СД1, несмотря на обилие генов, ассоциированных с предрасположенностью к СД1, иммуногенетическая составляющая системы HLA приближается к 70%.
Все сказанное о роли HLA в предрасположенности и развитии СД1 можно в значительной степени отнести, помимо СД1, и к другим аутоиммунным заболеваниям человека.
Основные понятия о главенствующей роли HLA в развитии СД1 были сформированы еще в 1970-х - начале 1980-х годов. Однако переход на молекулярно-генетический метод исследования открыл принципиально новые возможности в установлении генетической предрасположенности и устойчивости к СД1. Так, например, если ранее речь могла идти лишь о возможности участия в данном феномене белковых молекул, в первую очередь HLA-DR4, теперь известно, что HLA-DR4 является группоспецифическим белком, выявляемым, в том числе серологическими методами типирования. В действительности в него входит несколько десятков вариантов молекул, кодируемых соответствующими аллельными вариантами. При этом, несмотря на минимальные межаллельные различия, определяющие третичную структуру молекул HLA, часть из них может выполнять функцию маркера предрасположенности к СД1, а часть, напротив, является маркером устойчивости к этому заболеванию.
Этот факт имеет не только научную значимость, но и может быть использован в практике, открывая принципиально новые возможности как в прогнозе и диагностике развития заболевания, так и в его лечении [60].
Так, один из перспективнейших методов терапии СД1 - восстановление толерантности, утраченной вследствие развития аутоиммунного заболевания [53]. Данный подход предполагает использование так называемых «измененных» пептидов, позволяющих блокировать пептидный мотив, против которого в результате антигенной мимикрии был индуцирован аутоиммунный ответ. Клиническая апробация данного метода, проведенная на пациентах, в генотипе которых присутствовал аллельный вариант DRB1*04:01 в гомозиготном состоянии, т.е. генотип DRB1*04:01/*04:01, позволила не только блокировать выработку антител, направленных против островковых клеток поджелудочной железы, но и подавить Т-клеточный ответ против них. Причем следует отметить пероральный способ применения данных пептидов [53].
Естественно, что данное направление находится в настоящее время на этапе своего развития, и естественно, что для эффективного использования в практике необходимо создание библиотеки пептидов, специфичности которых позволят блокировать основные HLA-аллели, участвующие в индукции СД1.
При реализации такого проекта надо иметь в виду наличие межэтнических различий в распределении HLA-ассоциированных с СД1 аллельных вариантов HLA-специфичностей, в том числе являющихся маркерными к СД1. В табл. 6.1 приведены данные о внутриэтническом полиморфизме гена HLA-DRB1*04 в русской популяции и предрасположенности к СД1.
Таблица 6.1. Внутриэтнический полиморфизм гена HLA-DRB1*04 и предрасположенность к сахарному диабету 1 типа
Аллели гена DRB1 |
Русские поморы |
Русские москвичи |
||||
СД1 (n=48) |
Контроль (n=81) |
ОР (относительный риск) |
СД1 (n=79) |
Контроль (о=300) |
ОР (относительный риск) |
|
*04:01 |
20,8 |
6,8 |
3,3 |
24,7% |
3,3 |
9,5 |
*04:04 |
37,5% |
7,4 |
8,2 |
11,8 |
3,2 |
4,2 |
*04:05 |
0 |
0 |
- |
5,9% |
0 |
90,1 |
В качестве обследуемых групп рассматривались русские, проживающие в Москве, и коренные поморы - жители Архангельской области. Из 35 аллельных вариантов, входящих в групповую специфичность гена DRB1*04, рассматривались аллельные варианты DRB1*04:01, *04:04 и *04:05, которые являются положительно ассоциированными с СД1.
Как следует из представленных в табл. 6.1 данных, в двух группах сравнения (москвичи и поморы) имеется более чем двукратное различие в частоте положительно ассоциированных аллелей в контроле. В то же время частота аллельного варианта DRB1*04:01 оказалась сопоставимой в данных двух группах, но DRB1*04:04 встречалась более чем в 2 раза чаще среди поморов, что соответственно нашло отражение в значениях ОР. Что касается алелля DRB1*04:05, то он был выявлен только среди москвичей, в результате чего именно в этой группе обнаружен высокий уровень ассоциации - 90%.
Такого рода исследования открывают один из принципиально новых подходов к пептидной блокировке диабетогенных сайтов HLA-молекул [53], и, несмотря на определенные сложности, стоящие на пути скрининга населения разных районов России, эта задача является принципиально решаемой, о чем, в частности, свидетельствует опыт международных программ HLA-генотипирования на аллельном уровне доноров-добровольцев костного мозга, которых к настоящему времени в мире насчитывается более 19 млн человек. Следует при этом напомнить, что пересадка полностью (на уровне аллельных вариантов) тканесовместимого костного мозга рассматривается в настоящее время не только как радикальный способ лечения онкогематологических заболеваний, но и как метод лечения иных нозологических форм онкологических заболеваний, а также тяжелых аутоиммунных заболеваний, в первую очередь СД1 [13].
Дело в том, что пересадка тканесовместимого костного мозга (или кроветворных стволовых клеток - по современной номенклатуре) дает возможность транспортировать новую иммунную систему, которая совместима с организмом больного, но не содержит иммунокомпетентных клеток, направленных против клеток больного, в отличие от собственной иммунной системы. Этот подход особенно перспективен при трансплантации КСК, выделенных из пуповинной крови, детям, больным СД1 [42].
В результате этого имеет место восстановление толерантности организма к трансплантату или, в случае, если пересадка костного мозга не сопровождается трансплантацией островковых клеток, восстанавливается толерантность к клеткам собственной поджелудочной железы или других тканей, против которых была направлена аутоиммунная атака.
Данный подход реализуется сегодня, естественно, лишь в тех странах, которые участвуют в организации и развитии международных регистров доноров-добровольцев костного мозга. Россия до настоящего времени практически не относится к таким странам, хотя эта проблема может быть решена в довольно короткие сроки в связи с развитием высоких медицинских технологий в России.
Что же касается возможностей практической медицины сегодняшнего дня в отношении повышения эффективности прогноза развития СД1 на популяционном, семейном и, наконец, индивидуальном уровне, то совместные исследования, выполняемые на протяжении почти 20 лет сотрудниками ФГБУ «Эндокринологический научный центр» МЗ РФ и Института иммунологии, открывают такого рода возможности [4, 9, 10, 8].
За время проведения этих исследований в значительной степени изменилось представление о роли тех или иных генов HLA в предрасположенности к СД1. Этому способствовало то, что вопрос об ассоциациях между HLA и СД1 был одним из наиболее интенсивно исследуемых в течение длительного времени в рамках международных программ по изучению HLA, а также то, что за долгий период исследований совершенствовались и принципиально изменялись методические возможности исследователей.
Следует отметить, что на этапе исследований, проводимых до середины 1980-х годов, когда ассоциации между СД1 и HLA уже были установлены, исследования проводились исключительно методами, позволяющими выявлять не сами гены и тем более их варианты, а лишь белковые продукты этих генов - HLA-антигены. Естественно, что само понятие HLA-генотипирования в этот период носило достаточно условный характер, поскольку о наличии того или иного гена судили лишь по его функции, т.е. установлению его белковых продуктов.
С середины 1980-х годов благодаря развитию молекулярной иммуногенетики появилась практическая возможность проводить реальное генотипирование, т.е. выявлять непосредственно сам ген.
Впервые результаты работ, выполненных на данном новом уровне, были представлены на XXII Международном конгрессе по изучению HLA (Япония, Йокогама, 1990 г.). Это событие стало отправной точкой для прорыва в развитии иммуногенетики человека в целом и всех ее направлений, включая «HLA и болезни».
Так, интенсивные исследования значения различных аллелей генов HLA класса II (DRB1, DQA1, DQB1) и их сочетаний в развитии СД1, проведенные в 1990-е годы на молекулярно-генетическом уровне, привели ряд исследователей к точке зрения, что основную роль в предрасположенности и устойчивости к СД1 играют аллели локуса HLA-DQ, при этом предполагали, что аллели локуса HLA-DR реализуют свою активность за счет неравновесного сцепления с локусом DQ [62]. Однако уже в 2000 г. были опубликованы результаты международных исследований, выполненных на обширном клиническом материале, свидетельствующие о том, что ассоциации с аллелями, входящими в локус DQ, и ассоциация с аллелями, входящими в локус DR, независимы друг от друга в реализации эффекта по отношению к СД1 [27], несмотря на то что между аллелями генов HLA-DRB1 и HLA-DQB1 существует выраженное неравновесное сцепление. Однако в последующий период и эта точка зрения была пересмотрена. Основой для этого стало установление значительно более выраженного полиморфизма гена HLA-DRB1 по сравнению с HLA-DQB1. Так, если HLA-DRB1 ген имеет на сегодняшний день 762 выявленных аллельных вариантов, то HLA-DQB1 - только 107. Более того, установлено, что внутри маркерных для СД1 DRB1- специфичностей имеется несравненно более выраженный полиморфизм аллельных вариантов, нежели внутри HLA-DQB1.
При этом аллельные варианты одной и той же специфичности гена HLA-DRB1 могут иметь разнонаправленные ассоциации с СД1, т.е. как положительные, так и отрицательные. Наиболее выраженными они являются для такого классического маркера СД1, как HLA-DRB1*04. Данная специфичность включает около 20 аллельных вариантов, среди которых имеются группы, ассоциированные с предрасположенностью, и группы, ассоциированные с устойчивостью к СД1. Естественно, что установление положительных ассоциаций с СД1 на уровне аллельных вариантов является значительно более перспективным нежели установление ассоциаций с «неразделенной» на аллельные варианты специфичностью HLA-DRB1*04 [4]. Следует также отметить, что вопрос о роли неравновесного сцепления генов HLA-DRB1 и HLA-DQB1 на уровне аллельных вариантов до настоящего времени остается неизученным. Исходя из этих данных, наиболее вероятной является точка зрения о том, что основная роль в генетической предрасположенности среди генов HLA класса II принадлежит генам DRB1 [39]. Наличие неравновесного сцепления (или неравновесие по сцеплению, существующее между генами HLA) является одной из причин разногласий, возникавших при анализе роли ассоциаций HLA-специфичностей, как по HLA в целом, так и в отношении генов II класса HLA в особенности. Неравновесное сцепление возникает в случаях, когда аллели двух разных локусов присутствуют вместе на одной хромосоме гораздо чаще ожидаемого. В таких случаях данные 2-го аллеля находятся в неравновесном сцеплении. Например, в европеоидной популяции HLA-A1 и -B8 присутствуют с индивидуальными частотами генов - 27,5 и 15,7% соответственно. Расчетная частота данных двух аллелей, присутствующих в данном гаплотипе, тогда составит 4,3% (0,275x0,157x100). Однако фактически гаплотипы А1 и В8 обнаружены у 9,8% европеоидов [59]. Более того, этот гаплотип принято называть генетическим маркером европеоидных популяций. Неравновесное сцепление наблюдается между аллелями класса I, класса II и класса III. Их частоты определены для различных этнических групп и документированы, т.е. отражены в литературе [20]. Внутри субрегиона HLA-D неравновесное сцепление между аллелями HLA-DR и HLA-DQ очень сильно. Однако имеется только слабое неравновесное сцепление между аллелями dr и dp, предполагающее, что «горячая точка» рекомбинаций может существовать внутри региона II класса. Существует несколько возможных объяснений неравновесному сцеплению, обнаруженному в популяции. Первое: возможно, что определенные аллели удерживаются вместе, поскольку их комбинация в генотипе предоставляет селективное преимущество своим носителям, например, в плане устойчивости к инфекциям, и поэтому в популяции сохраняются гаплотипы с данной комбинацией аллелей. Второе возможное объяснение неравновесному сцеплению таково. Не прошел еще достаточный период времени для того, чтобы установилось равновесие между генами, поскольку популяции, несущие различные наследственные гаплотипы, смешались в историческом смысле относительно недавно. Это объяснение является наиболее вероятным, поскольку расчеты показали, что время, требуемое для достижения неравновесного сцепления внутри HLA, очень коротко в контексте человеческой эволюции.
Независимо от того, какое из вышеприведенных объяснений является правомочным, наличие неравновесного сцепления является твердо установленным фактом, который необходимо учитывать как при проведении фундаментальных, так и прикладных работ в области изучения и практического использования знаний по генетике иммунного ответа человека, имеющихся на сегодняшний день. Так, в частности, это относится к данным о неравновесном сцеплении специфичностей, входящих в ген HLA-DRB1, с одной стороны, и HLA-DQА1 и HLA-DQB1, с другой.
Сам факт наличия неравновесного сцепления не вызывает сомнений, и сочетанный анализ HLA-DRB1, -DQA1 и -DQB1 гаплотипов и генотипов для установления роли HLA-молекул класса II в развитии СД1 и других аутоиммунных заболеваний является перспективным направлением как иммуногенетики человека, так и патогенеза аутоиммунных патологий, включая СД1. Что же касается практического использования HLA-генотипирования для установления риска развития СД1 и прогноза его течения, то, возможно, в настоящее время генотипирование полных HLA-DRB1, -DQA1 и -DQB1 гаплотипов и генотипов избыточно. Это может быть обосновано следующими соображениями. В случае использования в прикладных целях HLA-генотипирования на уровне низкого разрешения при установлении генотипа HLA-DRB1 с достаточно высокой вероятностью за счет наличия неравновесного сцепления можно предсказать (не типируя), какие именно специфичности HLA-DQA1 и HLA-DQB1 будут входить в генотип HLA-DRB1-DQA1-DQB1. Что касается генотипирования на уровне высокого разрешения (на уровне выявления аллельных вариантов), то преимущество этого метода реализуется в первую очередь за счет возможности анализировать полиморфизм аллельных вариантов тех или иных генов. Сам ген HLA-DRB1, в отличие от генов HLA-DQA1 и HLA-DQB1, по своей структуре является одним из наиболее полиморфных генов в системе HLA. А самое главное - именно в HLA-DRB1 входят полиморфные генетические маркеры (аллельные варианты генов) СД1, включающие как положительно, так и отрицательно ассоциированные с СД1 данные аллельные варианты, что позволяет осуществлять значительно более точный индивидуальный прогноз риска развития и течения заболевания. Аналогичный анализ HLA-DQA1 и -DQB1 не позволяет в настоящее время получать подобную информацию и не предоставляет дополнительной информации при полном генотипировании генотипа HLA-DRB1-DQA1-DQB1.
Одним из важнейших последствий сильного неравновесного сцепления, которое характеризует регион HLA, является постоянная осторожность при интерпретации корреляции между повышенной частотой HLA аллельных маркеров и заболеваний. Многие гены присутствуют внутри региона HLA в дополнение к тем, которые кодируют HLA-антигены. Некоторые из них уже охарактеризованы и включают гены, кодирующие белки, имеющие явное отношение к иммунной системе. Это относится к генам региона III класса, кодирующим компоненты комплемента С2, С4 и фактор В, гены фактора некроза опухолей (ФНО α и ФНОβ) и гены белков теплового шока (HSP70). Совсем недавно внутри региона II класса были идентифицированы пептиды-транспортеры и элементы протеасом. Хотя это может рассматриваться как верхушка айсберга, и внутри региона МНС имеется огромное множество других генов, которые будут охарактеризованы в течение последующих лет. Остается невыясненным, кодируют ли эти дополнительные гены продукты, которые влияют или прямо связаны с иммунной системой, и проявляют ли они значительный полиморфизм. Тем не менее существует возможность того, что ген истинной восприимчивости, лежащий в основе некоторых HLA-ассоциированных заболеваний, может быть как раз одним из этих не-HLA-генов. Очевидная HLA-ассоциация может отражать тот факт, что между аллельными вариантами не-HLA-генов и HLA-генов существует тесное неравновесное сцепление.
Возвращаясь к двум из недавно определенных не-HLA-генов региона HLA, а именно генам, кодирующим ФНО α и ФНОβ и HSP70, выяснилось, что все они имеют реальные возможные связи с иммунным ответом. ФНОβ является одним из растворимых факторов, которые могут индуцировать и/или усиливать экспрессию генов HLA класса II на некоторых клеточных типах [16]. Уже установлено, что в данном локусе имеется полиморфизм рестрикционной длины фрагмента [50, 33], но пока неизвестно, отражает ли это кодирующий регион или же вариант регуляторной последовательности, который мог бы, в свою очередь, привести к функциональным различиям в индукции гена ФНОβ или эффективности индуцирования экспрессии II класса. Принимая во внимание ключевую роль, которую играют молекулы II класса в Т-клеточных иммунных ответах, варианты эффектов ФНО могут оказывать сильное влияние на аутоиммунитет. Особое значение данному предположению придает наблюдение, что количественный вариант экспрессии молекул HLA класса II может иметь глубокое воздействие на Т-клеточные ответы, что было показано на примере трансфектантов, экспрессирующих II класс [40], и пересмотрено C.A. Janeway [34]. Предсказано, что индукция молекул II класса на клетках, производных не от костного мозга, в солидных органах влияет на течение аутоиммунного ответа. Имеет ли данная индукция II класса амплифицирующий или подавляющий эффект на местную аутоиммунную реакцию - остается поводом для споров. Тем не менее индивидуальная вариантность способности к индукции молекул II класса в тканях, связанная с аллельными вариантами генов ФНО, может очень хорошо работать как важный фактор восприимчивости к заболеваниям. В схожей манере аллельный вариант гена белков теплового шока воздействует на Т-клеточный иммунитет. Имеются предварительные свидетельства того, что данный стрессовый белок обладает определенным полиморфизмом, влияющим на его способность воздействовать на фагоцитированные антигены [46].
При этом следует принять во внимание, что это относится к обследованию представителей различных рас и этнических групп. Так, несмотря на то, что в противоположность европеоидной расе, монголоиды имеют более низкую заболеваемость СД1 (0,4-1,1 случая в год/100000 населения). M.H. Park и соавт. обнаружили, что идентичные гаплотипы DRB1-DQB1 у ориентов и европеоидов имеют сходные ассоциации с диабетом [7, 49]. В качестве специфичностей, имеющих наиболее выраженные положительные ассоциации с СД1, в большинстве работ было установлено наличие ассоциации развития СД1 с вариантами генов DRB1*03 и *04, а также сцепленные с ними варианты генов DQA1*03:01, *05:01 и DQB1*02:01, 03:02 в разных популяционных группах, принадлежащих как европеоидной расе, так и ориентам [7, 28, 32, 63].
Практически во всех работах, посвященных изучению ассоциаций между HLA и СД1, приводятся данные, из которых следует, что помимо ассоциаций с той или иной специфичностью HLA-DR (т.е. с гаплотипом HLA-DR) имеется выраженная ассоциация с HLA-генотипом HLA-DR3/ DR4. Этот факт неудивителен, так как указанные специфичности сами по себе являлись наиболее высоко ассоциированными с СД1. Примечательно, что уровень ассоциации с СД1 при генотипе HLA-DR3/DR4 превышал таковой как при генотипах HLA-DR3/DR3, так и при HLA-DR4/DR4. Эти данные были получены при изучении целого ряда европейских популяций: немцев, англичан, датчан, евреев, турок и русских, а также среди китайцев.
Были также установлены отрицательно ассоциированные или нейтральные по отношению к СД1 специфичности DRB1, а именно: DR7, DR11, DR13, DR14, DR15 [55].
К отрицательно ассоциированным относятся также генотипы DR2/DR2, DR5/DR5 и генотип, не включающий ни DR3-, ни DR4-специфичности.
Сотрудниками ФГБУ «Эндокринологический научный центр» МЗ РФ и Института иммунологии было проведено обследование 548 больных СД1 и контрольной группы, состоящей из 1547 здоровых лиц. Основными HLA-маркерами предрасположенности к СД1 в большинстве обследованных популяционных групп, проживающих на территории России и ближнего зарубежья, как и ожидалось, оказались специфичности DRB1*03 и 04. Так, в 8 из 11 обследованных групп (перечень групп на рис. 6.1, см. цв. вклейку) эти две специфичности служили маркерами предрасположенности к СД1. При этом из всех обследованных групп у русских и мари только эти DRB1- специфичности были маркерами СД1.
У русских из Удмуртии и Вологды, а также у татар значения относительного риска для DRB1*03 и *04 были приблизительно равны. Среди мари и узбеков большее значение относительного риска было отмечено для DRB1*03. У представителей монголоидных популяций - тувинцев, калмыков и бурят - было выявлено только по одной значимой маркерной DRB1-специфичности: у тувинцев это DRB1*03, у калмыков DRB1*09, у бурят DRB1*04. Что касается DRB1*01, то у татар и удмуртов эта специфичность была ассоциирована с СД1 с низким уровнем достоверности, а у узбеков имела противоположное, т.е. протективное, значение.
Таким образом, наиболее частыми маркерами СД1 среди самых разных популяций, населяющих Россию и ближнее зарубежье, оказались специфичности DRB1*03 и *04, но встречались также и другие варианты DRB1-маркеров, например DRB1*08 и *09.
Помимо DRB1-специфичностей, положительно ассоциированных с развитием СД1, среди обследованных популяционных групп были выявлены также DRB1-специфичности, ассоциированные с устойчивостью к развитию СД1. В качестве таких «протективных» были установлены пять вариантов гена DRB1: *07, *13, *15 и *16. DRB1*07 был «протективным» для русских из Москвы, из Архангельской и Вологодской областей, а также для татар и удмуртов. DRB1*11 - для русских из Москвы, Вологодской области и Удмуртии, а также для удмуртов и узбеков. DRB1*13 - для всех исследованных групп русских, а также для татар, мари и узбеков; DRB1*15 - для всех исследованных популяционных групп, кроме калмыков, тувинцев и бурят, для которых не было обнаружено ни одного «протектора», вероятно, в связи с малочисленностью группы больных, связанной с низкой заболеваемостью СД1 в указанных регионах. В качестве «протектора» специфичность DRB1*16 была обнаружена только у русских из Москвы.
Проведенные сотрудниками ФГБУ «Эндокринологический научный центр» МЗ РФ и Института иммунологии исследования свидетельствуют о том, что генотипы, включающие HLA-DRB1*04 и HLA-DRB1*03, также обеспечивают высокий уровень ассоциации с СД1. Таким образом, отмечалось влияние генотипа HLA-DRB1, т.е. сочетания двух вариантов гена DRB1 на развитие СД1. Оказалось, что генотип, состоящий из разных сочетаний двух наиболее часто встречаемых в разных популяциях HLA-маркеров DRB1*03 и DRB1*04, ассоциирован с высокой вероятностью развития СД1.
Следует отметить, что для разных популяционных групп генотипические сочетания указанных маркеров имеют разное значение. Так, если для русских из Архангельской области и Удмуртии большее значение имеет генотип DRB1*04/*04, для большинства других популяционных групп - DRB1*03/*04, и только для узбеков - DRB1*03/*03. В то же время наличие в генотипе только одного из указанных маркеров значительно уменьшает вероятность заболевания, а у узбеков при наличии в генотипе DRB1*04-специфичности относительный риск развития СД1 становится <1, что свидетельствует о его протективном значении.
Все вышесказанное определило целесообразность изучения роли всех положительно или отрицательно ассоциированных вариантов прогноза развития СД1, учитывая тот факт, что до проведения данных исследований практически была изучена роль только генотипа HLA-DRB1*04/ DRB1*03. Была поставлена задача исследовать возможную роль в HLA-DRB1-генотипе, которую играют прочие HLA-DRB1-специфичности, имеющие менее выраженный уровень положительных и отрицательных ассоциаций с СД1.
Полученные при обследовании данные типирования больных СД1 и соответствующего популяционного контроля в зависимости от HLA-генотипа, были разделены на три группы: маркер/маркер, если в генотипе присутствовали любые два варианта гена DRB1 из группы DRB1*01,*03,*04,*08,*09,*10; немаркер/немаркер, если в генотипе присутствовали любые 2 варианта гена DRB1 из группы *07,*11,*12,*13,*14,*15,*16; маркер/немаркер, если в генотипе один вариант был из группы DRB1*01,*03,*04,*08,*09,*10, а другой из группы *07,*11,*12,*13,*14,*15,*16. С такой новой позиции вновь были вычислены значения относительного риска отдельно для каждой из 11 популяционных групп в отдельности и для всех исследованных групп вместе.
Результаты анализа, представленные в логарифмическом формате на рис. 6.1 (см. цв. вклейку), свидетельствуют о том, что предрасположенность к развитию СД1 определяется наличием в генотипе не менее двух HLA-DRB1-маркеров. Отсутствие в генотипе хотя бы одного DRB1-маркера, и особенно полное их отсутствие, делает развитие СД1 чрезвычайно маловероятным событием. Эта закономерность прослеживается у большинства представленных популяционных групп, относящихся по расовой принадлежности к европеоидам (русские, татары, мари, удмурты), монголоидам (буряты) и смешанной группе (узбеки). Исключение составляют калмыки и тувинцы (монголоиды), для которых она оказалась недостоверной, что, скорее всего, определяется малочисленностью групп больных СД1 тувинцев и калмыков, связанной с чрезвычайно низкой заболеваемостью СД1 у представителей этих популяций.
Таким образом, открывается возможность исключения из числа лиц, которые ранее рассматривались как имеющие генетическую предрасположенность к СД1 (за счет наличия у них маркерных HLA-специфичностей), тех, кто имеет вторую «нейтральную» или отрицательно ассоциированную HLA-DRB1-специфичность. Тем самым, естественно, повышается уровень установления генетической предрасположенности и появляется возможность установления индивидуального риска развития СД1 при популяционном анализе.
Суммарные данные по относительному риску развития СД1 при 3 различных вариантах DRB1 -генотипа, полученные в результате обследования 1004 больных СД1 и 1547 здоровых добровольцев, представлены в табл. 6.2.
Таблица 6.2. Относительный риск развития СД1 в зависимости от комбинаций гаплотипов в генотипе HLA-DRB1 (популяционный анализ)
№ | Комбинация гаплотипов HLA-DRB1 | Количество обследованных | Относительный риск (ОР) | p (вероятность) |
---|---|---|---|---|
1 |
2 гаплотипа, положительно ассоциированных с СД1 |
614 |
7,8 |
2,8х10-18 |
2 |
1 гаплотип, положительно ассоциированный с СД1 |
327 |
0,59 |
8,8x10-11 |
3 |
Отсутствие гаплотипов, ассоциированных с СД1 |
63 |
0,11 |
2,7х10-83 |
Эффективность разработанного подхода была также исследована при анализе 89 ядерных семей, включающих детей, больных СД1. Результаты представлены в табл. 6.3. Как следует из представленных в таблице данных, результаты семейного обследования принципиально не отличаются от данных, полученных при популяционном анализе. При этом принципиален тот факт, что предрасположенность к СД1 реализовалась лишь у детей, несущих в генотипе два ассоциированных с СД1 гаплотипа (ОР=17). Присутствие одного гаплотипа не было ассоциировано с риском развития заболевания (ОР=0,49).
Таблица 6.3. Относительный риск развития СД1 в зависимости от комбинаций гаплотипов в генотипе HLA-DRB1 у детей, больных СД1 (семейный анализ)
№ | Комбинация гаплотипов HLA-DRB1 | Количество обследованных | Относительный риск (ОР) | p (вероятность) |
---|---|---|---|---|
1 |
2 гаплотипа, положительно ассоциированных с СД1 |
84 |
17,0 |
7,0х10-31 |
2 |
1 гаплотип, положительно ассоциированный с СД1 |
28 |
0,49 |
0,001 |
3 |
Отсутствие гаплотипов, ассоциированных с СД1 |
5 |
0,005 |
2,7х10-20 |
В целях изучения вопроса о том, какое влияние оказывало на результаты анализа в группе № 2 (один гаплотип положительно ассоциирован с СД1) (см. табл. 6.2 и 6.3) присутствие «классических» HLA-маркеров СД1 (HLA-DR1*03, HLA-DRB1*04), мы оценили, насколько данные HLA-специфичности представлены среди анализируемых гаплотипов. Установлено, что в анализируемой группе данные гаплотипы среди больных СД1 представлены в 24,6% случаев по сравнению с 21,2% в контрольной группе (см. табл. 6.2). Относительный риск развития СД1 при этом составлял 1,21 (p=0,01).
В анализируемой группе дети, больные СД1, составили 21,2%, при этом относительный риск развития СД1 составил 1,1 (p=0,01) (см. табл. 6.2).
Примечательно также следующее. При популяционных исследованиях в группе № 1 (см. табл. 6.2) суммарный процент генотипов, состоящих из высокоассоциированных с СД1 гаплотипов - HLA-DRB1*03/*03, HLA-DRB1*04/*04 и HLA-DRB1*03/*04, среди больных СД1 составил 37% по сравнению со здоровым контролем 4,5%. В этой же таблице в группе № 2 суммарный процент гаплотипов HLA-DRB1*03 и *04 (второй гаплотип был иным нежели *03 или *04) среди больных СД1 гаставил 25%.
Из представленного семейного анализа следует, что в группе № 1 (см. табл. 6.2) с наиболее высоким относительным риском развития СД1 (при популяционном анализе) только в 37% случаев предрасположенность к СД1 была связана с генотипами, включающими HLA-DRB1*03/*04 (в различных вариантах). В то же время большая часть анализированных больных СД1 (63%) несли генотип, включающий иные гаплотипы, нежели HLA-DRB1*03/*04. В то же время в группе № 2, где в генотипе присутствовал лишь один из гаплотипов HLA-DRB1*03/*04, среднее значение относительного риска определялось на уровне, недостаточном для осуществления клинического прогнозирования, а именно: ОР ~1.
Таким образом, представленные данные свидетельствуют о том, что наличие в генотипе лишь одного маркерного гаплотипа из числа HLA-DRB1*03/*04 существенным образом не оказывает влияния на уровень относительного риска развития СД1. В то же время стало ясным, что учет наличия в генотипе HLA-DRB1, положительно ассоциированных с СД1, но не относящихся к HLA-DRB1*03/*04 гаплотипов, играет существенную роль в предрасположенности к СД1.
При этом следует напомнить, что относительный риск в группах с положительно ассоциированными генотипами составил 7,8 при популяционном анализе и 17,0 - при семейном.
Общим заключением по данным исследования является следующее.
Использование метода оценки HLA-DRB1-генотипа более эффективно по сравнению с оценкой HLA-DRB1-гаплотипов как при популяционном, так и семейном анализе. Преимуществом генотипирования считается возможность установления индивидуального риска развития заболевания.
Выявление только в одном из анализируемых гаплотипов HLA-DRB1*03 или HLA-DRB1*04 может свидетельствовать лишь о наличии генетической предрасположенности со слабой вероятностью реализации.
Перспективным представляется дальнейшее развитие этого направления, включая проведение аналогичного иммуногенетического анализа уже не на уровне групповых специфичностей HLA, как это было проделано в рамках описанных исследований, а на уровне аллель-специфических вариантов HLA-генов - маркеров СД1. Об этом, в частности, свидетельствуют приведенные в настоящей работе данные о наличии внутри групповой специфичности гена HLA-DRB1*04 аллель-специфических вариантов, как положительно, так и отрицательно ассоциированных с СД1, а также данные о межпопуляционных различиях в частоте встречаемости указанных аллельных вариантов.
Вклад «классических» иммуногенетических маркеров в предрасположенность к СД1 оценивается приблизительно в 60-80% от общих факторов генетической предрасположенности к данному аутоиммунному заболеванию. Поэтому установленное в настоящем исследовании принципиальное преимущество использования оценки предрасположенности к СД1 на основе анализа генотипа HLA-DRB1, а не гаплотипов, как это имело место до последнего времени, имеет непосредственное значение для повышения эффективности профилактических мероприятий и установления популяционного, группового, семейного и индивидуального риска развития СД1. Вместе с тем достижения молекулярной иммуногенетики открывают принципиально новые возможности для более эффективного использования иммуногенетического мониторинга в клинической практике. В частности, это относится к использованию HLA-DRB1-генотипирования на уровне аллельных вариантов. Последнее открывает возможность оценивать индивидуальный вклад в предрасположенность и/или устойчивость к СД1 конкретных аллельных вариантов генов, положительно ассоциированных с предрасположенностью к СД1.
Помимо этого, несомненно, важным и перспективным направлением является оценка клинической значимости использования в указанных выше направлениях аллельных вариантов генов иммунного ответа, не относящихся к системе HLA.
Так, в самые последние годы появилось новое перспективное направление иммуногенетики, обозначенное в 2010 г. на конгрессе Европейской федерации иммуногенетики (ЕFI) во Флоренции как «не-HLA-иммуно-генетика». Это направление включает исследования роли полиморфизма генов, контролирующих те этапы развития иммунного ответа в норме и при патологических состояниях, которые не относятся к распознаванию чужеродного агента, инициации иммунного ответа и развитию его эффекторной фазы. Так, перспективными для изучения генами, ассоциированными с патогенезом СД1 или претендующими на роль кандидатных генетических маркеров СД1 и не входящими в систему HLA, являются: CTLA4, PTPN22, IFNG, TNF, SH2B3, ERBB3, CLEC16A, PTPN2, IL2RA, IL27, IL2, IL19, IL20, ORMDL3, GLIS3, CD69, IL10, UBASH3A, IFIH1, COBL, BACH2, CTSH, PRKCQ, C1QTNF6, RASGRP1, RAB5B, SUOX, IKZF4, ERBB3, CDK2, TRAFD1, PTPN1, PHTF1, CD226, AFF3, CAPSL, IL7R.
Безусловно, данное направление имеет значительные перспективы, как в фундаментальном, так и прикладном аспекте. В то же время столь широкий спектр кандидатных генов не может в настоящее время быть рекомендован для рутинного использования в клинической практике, как это имеет место в отношении HLA-генов - маркеров СД1.
Для получения ответа на данный вопрос нами было проведено специальное исследование [1], целью которого было следующее. На примере анализа данных по ассоциациям СД1 с четырьмя наиболее изученными генами, участвующими в контроле иммунного ответа, но не входящими в систему HLA, был получен ответ на вопрос, дают ли эти гены дополнительную информацию о генетической предрасположенности к СД1 по сравнению с генами HLA. С этой целью на материале семейного анализа сопоставили процент больных СД1, несущих кандидатные не-HLA варианты генов, с одновременным присутствием у них маркерных HLA-генотипов. Как следует из этих данных, варианты трех изученных генов, а именно: PTPN22, IFNG и TNF - выявлялись только в том случае, если у обследуемых больных СД1 присутствовали одновременно маркерные HLA-генотипы. Таким образом, можно предположить, что указанные кандидатные маркеры СД1, не относящиеся к HLA, не влияют на эффективность прогнозирования развития СД по сравнению с установлением только HLA-маркеров. Таким образом, в случае практического установления генетической предрасположенности к СД1 их оценка не может повысить уровень точности прогноза по сравнению с HLA. Естественно, это не исключает целесообразность изучения их роли в патогенезе СД1.
Напротив, прогностический эффект исследованного варианта гена CTLA4 не «перекрывается» полностью генами HLA, и в 14% случаев он является самостоятельным иммуногенетическим маркером предрасположенности к СД1. Вместе с тем можно отметить, что в 6% случаев у больных, входящих в обследованную группу, отсутствовали как HLA, так и CTLA4. Вполне возможно, что в списке не-HLA-иммуногенетических маркеров, представленном ниже, имеются гены, которые, так же как и CTLA4, могут вносить самостоятельный вклад в установление иммуногенетической предрасположенности к СД1. Следует отметить, что практически все указанные генетические маркеры являются генами или их аллельными вариантами, относящимися к генам иммунного ответа человека.
Применение предлагаемого генетического метода, основанного на установлении DRB1-генотипа для оценки предрасположенности к СД1, дает возможность выполнения дифференциальной диагностики и прогнозирования заболевания на индивидуальном и семейном уровне. Последнее позволяет более эффективно диагностировать заболевание на ранних его этапах, а также формировать группы высокого и низкого риска развития СД1 в семьях больных СД1 для последующего мониторинга лиц с высоким генетическим риском развития СД1 (в случаях установления ассоциированного с СД1 генотипа) и исключения необходимости мониторинга лиц с низким риском развития СД1 (в случаях наличия в HLA-DRB1-генотипе лишь одного положительно ассоциированного с СД1 HLA-DRB1-гаплотипа).
Следует также отметить, что основанное на результатах данного исследования заключение об отсутствии положительной ассоциации с СД1 генотипов HLA-DRB1, включающих отрицательно ассоциированный гаплотип, естественно, касается и тех случаев, когда вторым HLA-DRB1-гаплотипом был HLA-DRB1*03 или DRB1*04.
Таким образом, предложен новый инновационный эффективный способ оценки индивидуальной и семейной генетической предрасположенности к развитию СД1, который позволяет оценивать генетический риск развития СД1 вне зависимости от этнической принадлежности обследуемого на основе молекулярно-генетического метода HLA-DRB1-генотипирования с использованием отечественной высокоэффективной приборно-реагентной базы. В том числе наиболее перспективным для оснащения региональных учреждений, обеспечивающих мониторинг заболеваемости СД1, является отечественный прибор «DTprime» (производство ЗАО «НПФ ДНК-технология»), позволяющий в автоматическом режиме проводить широкомасштабный иммуногенетический мониторинг населения, а также создавать центры медико-генетического консультирования в различных регионах Российской Федерации.
Такой подход позволяет в короткие сроки объективно оценить индивидуальный и семейный риск развития СД1, связанный с генами HLA вне зависимости от этнической принадлежности обследуемого.
В целом, представленные в настоящей главе данные, на наш взгляд, свидетельствуют в пользу сочетанного участия различных HLA-специфичностей, входящих в генотип и положительно ассоциированных с СД1, в реализации генетической предрасположенности к заболеванию, а по сути дела и в реализации самого аутоиммунного процесса, лежащего в основе СД1. Иначе говоря, проявляется «эффект необходимости» участия в этом процессе второй специфичности, входящей в HLA-DRB1-генотип, для запуска и развития СД1.
Как указывалось выше, иммуногенетический анализ, проводимый на основе предлагаемого подхода, представляется полностью оправданным с точки зрения практического здравоохранения. Вместе с тем возникает вопрос о возможных механизмах взаимодействия HLA-DRB1-специфичностей, расположенных на различных, но гомологичных хромосомах, в реализации предрасположенности к СД1. В этом плане наиболее вероятной представляется предложенная ранее гипотеза по формированию трансдимеров между аллелями HLA, расположенными на гомологичных хромосомах, и названная «формированием трансдимеров». Это предположение было ранее сформулировано на основе анализа взаимодействия HLA-DQA1 и HLA-DQB1, расположенных на гомологичных хромосомах, в эффекте предрасположенности к СД1 [27]. Есть основания предполагать, что этот механизм может быть реализован при взаимодействии HLA-DRB1-аллелей, также расположенных на гомологичных хромосомах. При этом, как и в случаях с HLA-DQ-аллелями, это взаимодействие может быть реализовано в усилении предрасположенности к СД1. Следует отметить, что гипотеза, выдвинутая Н. Erlich и соавт. [27], базировалась на результатах исследований, выполненных в тот период, когда молекулы HLA-DQ рассматривались в качестве основного участника реализации иммуногенетической предрасположенности к СД1. В настоящее время более вероятными кандидатами являются гены HLA-DRB1, обладающие значительно более выраженным аллельным полиморфизмом по сравнению с DQ и, соответственно, более выраженной ассоциацией на уровне аллельных вариантов. При этом роль HLA-DQ рассматривается как вторичная за счет неравновесного сцепления с HLA-DRB1. Таким образом, можно предположить, что более вероятной основой совместного эффекта являются HLA-DRB1-специфичности (и скорее всего, определенные их аллельные варианты), участвующие в трансдимерном взаимодействии.
Разумеется, в дальнейшем целесообразно провести подобный анализ и на уровне отдельных аллелей DRB1, для части которых, и в первую очередь входящих в специфичность DRB1*04, уже хорошо установлено наличие как положительных, так и отрицательных ассоциаций с СД1.
Следует отметить, что представленные исследования были проведены на основании HLA-генотипирования на уровне низкого разрешения. Для того чтобы показать возможности HLA-генотипирования на уровне высокого разрешения, т.е. на уровне выявления аллельных вариантов генов HLA, представлялось целесообразным представить данные о межэтническом HLA-разнообразии на уровне аллельного полиморфизма одной лишь специфичности - HLA-DRB1*04. Выбор именно данной специфичности неслучаен, поскольку она является «классическим» маркером предрасположенности к СД1, а также потому, что при проведении данного исследования впервые были установлены выраженные различия в HLA-полиморфизме на уровне отдельных аллельных вариантов одного гена, не только на межэтническом, но и на внутриэтническом уровне [11, 12].
В табл. 3.1 (см. гл. 3) представлены данные по исследованию частоты встречаемости аллельных вариантов гена HLA-DRB1*04 в 7 популяционных группах России. Выбор для анализа аллельных вариантов именно данного гена связан с тем, что с отдельными его аллелями - HLA-DRB1*04:01, HLA-DRB1*04:04 и HLA-DRB1*04:05 - ассоциирована предрасположенность к СД1. В то же время с другим аллелем - HLA-DRB1*04:03 - ассоциирована устойчивость к развитию данного заболевания.
Из представленных в табл. 3.1 данных следует, что помимо выраженных различий в частоте встречаемости гена HLA-DRB1*04 (верхняя строка табл. 3.1), аналогичная картина наблюдается и в 8 проанализированных и представленных в табл. 3.1 аллельных вариантах данного гена. Наибольшие значения как в частоте встречаемости самого гена, так и его аллельных вариантов, ассоциированных с предрасположенностью к СД1, отмечены у русских-поморов (жителей Архангельской области). В то же время для них характерен один из наиболее низких показателей встречаемости аллельных вариантов, ассоциированных с устойчивостью к СД1. При этом следует отметить, что именно в этой этнической группе русского населения России установлен наиболее высокий уровень заболеваемости СД1. Более того, эта группа занимает по данному показателю второе место в мире, уступая лишь финнам. Относительно высокая встречаемость вариантов генов, ассоциированных с предрасположенностью к СД1 (аллели 04:01 и 04:04), отмечена также среди русских-москвичей, татар, саамов, мари и тувинцев. Для ненцев характерна следующая особенность распределения маркерных аллелей: ассоциация с 04:01 является минимальной для всех обследованных групп, в которых были выявлены данные аллели. В то же время частота встречаемости аллельного варианта 04:04 оказалась одной из самых выраженных. Что касается тувинцев, то только у них обнаружен ассоциированный с предрасположенностью к СД1 аллельный вариант 04:05. По литературным данным, этот аллельный вариант распространен только среди некоторых групп монголоидного происхождения.
Что касается аллельного варианта 04:03, ассоциированного с устойчивостью к СД1, можно отметить следующее: наиболее его высокое значение выявлено среди саамов, ненцев и тувинцев.
Анализ результатов, представленных в данной таблице, выявляет следующую закономерность. Более высокая заболеваемость СД1 отмечается в группах, для которых характерна высокая частота встречаемости положительно ассоциированных с СД1 аллельных вариантов гена HLA-DRB1*04 при низком уровне встречаемости аллельных вариантов, ассоциированных с устойчивостью. В то же время в случаях одновременного выявления в популяции аллельных вариантов, ассоциированных как с предрасположенностью, так и с устойчивостью с приблизительно равной частотой, что характерно для монголоидных популяций, заболеваемость СД1 была низкой. Следует отметить следующее. В данном исследовании были изучены только 8 из числа более 30 известных аллельных вариантов гена HLA-DRB1*04. Выбор именно этих аллельных вариантов обусловлен тем, что они, по данным литературы, являются наиболее распространенными на территории Евразии. Иначе говоря, полученные данные представляют собой наглядный пример межэтнического полиморфизма в распределении аллельных вариантов гена HLA-DRB1*04 - одного из наиболее клинически значимых генов при выявлении генетической предрасположенности к аутоиммунным заболеваниям. Вместе с тем эта таблица служит наглядным доказательством внутриэтнических различий по распределению аллелей HLA. Так, внутри русской популяции между москвичами и жителями Архангельской области имеются выраженные различия по аллелям HLA-DRB1*04:01 и *04:04. Причем оба аллеля имеют выраженную ассоциацию с предрасположенностью к СД1, его частота достаточно высока в обеих указанных группах.
По-видимому, в дальнейшем также целесообразным станет проведение аналогичного исследования по изучению роли HLA-полиморфизма на уровне аллельных вариантов в отношении аллелей генов HLA-DQA1 и -DQB1, которые, несмотря на выраженную генетическую связь с HLA-DRB1-генами, также могут вносить самостоятельный вклад в реализацию генетической предрасположенности к СД1. Об этом, в частности, может свидетельствовать тот факт, что HLA-молекулы, кодируемые генами DQA1 и DQB1, обладают индивидуальными пептид-связывающими сайтами, отличающимися от пептид-связывающих сайтов молекул HLA-DRB1.
С точки зрения клинической диабетологии и клиники аутоиммунных заболеваний в целом, на наш взгляд, несомненный интерес представляет возможность установления индивидуального риска развития заболевания, открывающаяся на основании анализа полного HLA-DRB1-генотипа. Сопоставляя присутствие в нем «диабетогенных», нейтральных и протективных HLA-DRB1-специфичностей, можно прийти к заключению о наличии или отсутствии у данного лица, в том числе из числа членов семьи со случаями диабета, повышенной предрасположенности к развитию заболевания. Таким образом, подобный подход открывает принципиальную возможность установления индивидуального риска развития СД1. Разумеется, дальнейшие исследования в области иммуногенетики СД1 могут резко повысить эффективность этого подхода. Тот уровень (HLA-DRB1-генотипирование), на котором удалось установить такую возможность, уже сейчас позволяет проводить подобного рода оценку не только в специализированных научных центрах, но и в любом практическом учреждении, имеющем обычную ПЦР-лабораторию и осуществляющем HLA-генотипирование на уровне низкого и среднего разрешения. Последнее в значительной мере облегчает методику HLA-генотипирования.
Как указывалось выше, в настоящее время развитие молекулярной генетики позволяет проводить HLA-генотипирование на уровне высокого разрешения, при котором выявляются отдельные аллельные варианты HLA-специфичности. При этом, в частности, было установлено, что отдельные аллельные варианты, входящие в ту или иную специфичность, могут иметь «разнонаправленные» ассоциации с заболеванием, для которых данная специфичность является маркерной. Естественно, что в этой ситуации наличие в HLA-генотипе аллельного варианта, имеющего высокую степень ассоциации с предрасположенностью к заболеванию, ОР может значительно возрастать. Более того, не исключено, что во всяком случае в отдельных этнических группах речь может идти о возможности использования HLA-генотипирования на уровне высокого разрешения для проведения скрининговых исследований в целях выявления лиц с генетической предрасположенностью к тем или иным заболеваниям.
Все больные, HLA-DRB1-генотип которых был гомозиготен и содержал две идентичные специфичности из числа положительно ассоциированных с СД1, учитывались в группе, где относительный риск имел положительное значение. Таким образом, наличие HLA-DRB1-гомозиготных по этим специфичностям индивидуумов существенно повышает вероятность развития у них СД1. Это относится и к другим заболеваниям аутоиммунного генеза, например к хроническому гломерулонефриту, который также в значительном проценте случаев поражает людей молодого возраста. При этом известно, что среди больных хроническим гломерулонефритом жителей Москвы процент HLA-DRB1-гомозигот вдвое превышает средний показатель по Москве [14].
Естественно, что представленные выше данные не только могут найти широкое применение в практике борьбы с СД1, а также, возможно, и с другими аутоиммунными заболеваниями, но и открывают перспективы для фундаментальных исследований, целью которых будет установление молекулярных механизмов взаимодействия продуктов двух HLA-гаплотипов, в состав которых входят синергически действующие HLA-специфичности. Результатом такого синергического взаимодействия и является генетически обусловленная предрасположенность к развитию СД1. В пользу роли такого синергизма свидетельствует факт отсутствия реализации генетической предрасположенности в случае наличия HLA-специфичности лишь в одном из гаплотипов.
Следует заметить, что варианты *01, *03 и *04, наиболее часто обнаруживаемые у больных с аутоиммунной патологией, являются чрезвычайно распространенными среди населения планеты вариантами гена (ранее локуса) DRB1. В самых разных популяциях различной расовой принадлежности эти три варианта встречаются с частотой до 18-25% [37]. Вероятно, такая распространенность аутоиммунных маркеров не случайна. Как указывалось в начале главы, установлено, что DRB1-специфичности, входящие в группу аутоиммунных маркеров, часто являются одновременно «маркерами», обеспечивающими эффективный иммунный ответ на вирусы гепатита С [24, 44], HIV-1 [47], тяжелой малярии [30].
И наоборот, DRB1 -специфичности, входящие в группу DRB1- специфичностей, которые являются «протекторами» аутоиммунитета - *07, *12, *13, *14, *15 и *16, - ассоциированы с чувствительностью к HIV-1 [47], к гепатиту В [48], лепре [64], легочному туберкулезу [15]. Тем не менее большинство перечисленных вариантов гена DRB1 не является чем-то уникальным, будучи широко распространенными среди представителей разных популяционных групп [37].
Таким образом, при сравнении вариантов генов DRB1, ассоциированных с предрасположенностью или же с устойчивостью к развитию инфекционных заболеваний и аутоиммунных патологий, нами было выявлено следующее. Маркеры предрасположенности к развитию аутоиммунитета ассоциированы в то же время с устойчивостью к развитию инфекций, и наоборот: маркеры устойчивости к аутоиммунитету ассоциированы с неблагоприятным исходом тяжелых инфекций. При этом и те, и другие варианты достаточно широко распространены в самых разных популяционных группах.
Иммунная система, основное назначение которой - обеспечение успешной борьбы организма с различными инфекциями, является инструментом направленного отбора. При нем взаимодействие микроорганизма с макроорганизмом завершается отбором макроорганизма, справившегося с инфекционным агентом, и «выбраковкой» организма, не справившегося с инфекцией. В случае с генами HLA - выбраковкой генов, ассоциированных с чувствительностью к инфекции, т.е. *07, *12, *13, *14, *15 и *16, и накоплением вариантов, ассоциированных с устойчивостью к инфекции, т.е. *01, *03, *04, *08, *09, *10. И, возможно, наиболее неблагоприятными вариантами для исхода взаимодействия макроорганизма и инфекционного агента будет наличие в геноме двух вариантов генов, ассоциированных с устойчивостью к инфекции. Эта гипотеза, разумеется, нуждается в экспериментальном и клиническом подтверждении. И в том случае, если она окажется верной, появится возможность значительно более точного установления предрасположенности либо устойчивости к развитию того или иного инфекционного заболевания у конкретного человека. Кроме того, будет использоваться новый подход к эпидемиологическому прогнозу уровня заболеваемости среди населения конкретного региона с заранее установленными особенностями его HLA-генетического профиля.
Накопление в популяции вариантов генов HLA, ассоциированных с устойчивостью к инфекции, ограничивается развитием аутоиммунных реакций, которые, как установлено, приводят к снижению фертильности.
Таким образом, инфекционные заболевания, с одной стороны, и аутоиммунитет, с другой, направляют естественный отбор в области генов иммунного ответа в сторону преимущества для лиц, гетерозиготных по так называемым «чувствительным» и «устойчивым» к развитию инфекции генам, сохраняя при этом все разнообразие генов MHC. Эта балансирующая система отбора, вероятно, должна хорошо реагировать на изменение факторов внешней среды в дикой природе. Воздействие человека на направление отбора также вероятно. Например, борьба с инфекциями с помощью антибиотиков может приводить к накоплению генов, «чувствительных» к развитию инфекции.
Если наше предположение до некоторой степени верно (что требует тщательной проверки), то HLA-типирование открывает новые возможности использования самых разнообразных лекарственных средств, начиная с лечения инфекционных заболеваний и вакцинации и кончая использованием различных иммуномодуляторов.
Какие механизмы могут лежать в основе осуществления функций таких «чувствительных» и «устойчивых» к инфекции вариантов генов HLA? Можно предположить, например, что они ассоциированы с разным уровнем экспрессии распознающих белков системы MHC, чему есть некоторые свидетельства [61, 54], с факторами естественного иммунитета, обеспечивающими первые реакции на инфицирующие агенты, тем самым направляя и регулируя адаптивный иммунитет [31, 51, 52, 20, 66]. Наконец, можно предположить, что в пределах системы MHC существуют два вида отбора. Первый поддерживает полиморфизм на уровне антигенраспознающих структур, т.е. имеет отношение к адаптивному иммунитету. Второй, более древний и более общий (осуществляющийся на более «грубом» уровне), контролирует баланс чувствительности/устойчивости иммунного ответа (в том числе на уровне популяций через процессы репродукции) в зависимости от изменяющихся условий внешней среды и направлен на сохранение любого полиморфизма. Если это так, то уровень связывания с пептидами антигенраспознающих структур in vitro и эффективность суммарного ответа in vivo не всегда должны совпадать. Оба эти процесса могут происходить параллельно.
Что касается преимуществ определения HLA-генотипа (вместо HLA-гаплотипа, как это имело место до настоящего времени) в установлении генетической предрасположенности к СД1, у нового подхода, на наш взгляд, имеются значительные дополнительные преимущества и перспективы.
Дело в том, что СД1 в ходе всего процесса развития человечества относился к заболеваниям, поражавшим, в основном, нерепродуктивные контингенты. С учетом генетического характера наследования заболеваемость СД1 поддерживалась на определенном относительно невысоком уровне. Разработка и применение поддерживающей инсулинотерапии в XX в. в корне изменили сложившуюся ситуацию, что в значительной степени позволяет говорить об ограничении влияния СД1 на репродуктивный процесс, что должно отразиться на уровне заболеваемости СД1. Вместе с тем необходимо учитывать, что потенциальные родители в семьях, включающих членов с установленным диагнозом СД1, как правило, информированы о вероятности развития заболевания у потомства.
Представленные в настоящей главе данные впервые позволяют устанавливать отсутствие превышенной по сравнению с популяционным уровнем HLA-ассоциированной предрасположенности к СД1 у детей в семьях, где HLA-маркеры имеет один из родителей.
Таким образом, даже превентивное генотипирование в значительном проценте случаев демонстрирует риск развития СД1. Следует отметить, что такой подход дает принципиальную возможность снижения частоты встречаемости ассоциированных с СД1 аллелей в популяции.
В том случае, если HLA-специфичности, ассоциированные с предрасположенностью к СД1, имеются у обоих супругов, существует возможность оценить вероятность развития СД1 у детей.
Разумеется, данный подход требует проведения новых исследований на значительном клиническом материале и его результаты целесообразно рассматривать исходя из клинических, эпидемиологических и этических аспектов.
Несомненно, что ответы на вопросы, обсуждаемые в данной главе, откроют новые возможности для прикладной медицины. Однако для получения ответов необходима длительная и кропотливая работа многих научных коллективов мира.
Естественно, что основой таких исследований является использование молекулярно-генетической базы обследования контингентов больных и лиц, входящих в группы повышенного риска развития СД1. При этом следует отметить, что на сегодняшний день приоритет в направлении имеют отечественные исследователи, и в первую очередь коллективы ФГБУ «Эндокринологический научный центр» МЗ РФ и Института иммунологии.
Как указывалось выше, типирование HLA-генов получило свое развитие в конце 1960-х - начале 1970-х годов, при этом оно было целиком и полностью основано на типировании продуктов генов HLA - HLA-антигенов. Первоначально единственным методом генотипирования был метод серотипирования, основанный на использовании HLA-типирующих сывороток, полученных из крови многорожавших женщин [3].
Первоначально этот метод использовался только для типирования HLA-антигенов класса I. После открытия HLA-антигенов класса II (в конце 1970-х годов) были получены и нашли ограниченное применение типирующие сыворотки к антигенам класса II.
В России основным производителем HLA-типирующих сывороток для типирования HLA как I, так и II классов, является фирма «Гисанс», г. Санкт-Петербург. По сравнению с серологическим типированием HLA-антигенов класса I HLA-серотипирование по HLA-антигенам класса II не получило широкого применения. Ограниченные возможности серотипирования HLA класса II были связаны с тем, что с их помощью выявлялись не все специфичности HLA класса II, открываемые клеточно-опосредованным методом типирования HLA класса II, разработанным в 1970-х годах. Суть метода состояла в использовании в однонаправленной смешанной культуре лимфоцитов (СКЛ) в качестве стимулирующей популяции HLA, гомозиготных по антигенам класса II лимфоцитов. Источником этих лимфоцитов, как правило, служили кровь потомков близкородственных браков, где в генотипе присутствовали 2 идентичных HLA-гаплотипа. При этом количество HLA-антигенов II класса, выявляемых клеточно-опосредованным методом, значительно превышало таковое, выявляемое серологическим методом.
Следует отметить, что при использовании как серологического, так и клеточно-опосредованного подходов генотипирования по антигенам HLA класса II выявлялись не гены HLA, а лишь белковые продукты - HLA-антигены. Другими словами, в тот период наличие в генотипе той или иной HLA-специфичности оценивали по наличию продуктов генов HLA.
Ситуация в корне изменилась после открытия прямых HLA-генотипирующих методов, основанных на установлении самих генов HLA, а не их продуктов. Первым и наиболее распространенным подходом стал метод полимеразной цепной реакции (ПЦР), предложенный Кэрри Б. Мюллисом в 1983 г., а широкое использование данный метод впоследствии получил именно при HLA-генотипировании II класса в рамках Международной программы по изучению HLA (1985-1989 гг.).
В настоящее время из серологических методов типирования применяется лишь типирование по продуктам генов HLA класса I. При таком методе типирования может быть обеспечен только низкий уровень разрешения, т.е. установление групп HLA-специфичностей. Сфера применения данного метода постоянно сокращается. В 2009-2010 гг. от него официально отказались при трансплантации костного мозга/кроветворных стволовых клеток (КСК/КМ). Однако метод все еще применяется при исследованиях в направлении «HLA и болезни» и «HLA и антропология».
Генотипирование HLA-генов класса I и II на уровне низкого и высокого разрешений (выявление аллельных вариантов HLA-генов) осуществляется методами, основанными на ПЦР. В настоящее время помимо методов «классической» ПЦР используются методы ПЦР в режиме реального времени и методы прямого секвенирования (SBT - Sequence-Based Typing). Последний метод предоставляет наибольшие возможности, поскольку позволяет устанавливать не только уже известные HLA-специфичности, но и открывать новые.
Для HLA-серотипирования антигенов класса I необходим микроскоп, термостат и наборы типирующих реагентов, в том числе могут быть использованы отечественные наборы фирмы «Гисанс» г. Санкт-Петербург.
Для HLA-генотипирования класса II необходима ПЦР-лаборатория, основу которой составляют оснащение для выделения анализируемых образцов ДНК, амплификатор для анализа результатов реакции, оборудование для электрофореза для вариантов HLA-типирования с использованием «классического» варианта ПЦР.
Наиболее распространенным отечественным оборудованием для данного вида генотипирования является оборудование, производимое НПО «ДНК-технология» (Россия), включающее амплификатор «Терцик» и комплекс соответствующего лабораторного оборудования.
Приборы для HLA-генотипирования методом SBT в настоящее время в РФ не производятся. Наиболее распространенными являются секвенаторы фирмы «Applied Biosystems» (США), для использования которых в настоящее время применяются наборы той же фирмы.
Благодаря тесной связи между структурой и функцией HLA, ее ролью в иммунном ответе, HLA-маркеры многих заболеваний, в первую очередь заболеваний с нарушением иммунитета, рассматриваются в качестве маркеров, имеющих патогенетическое значение [13].
Применяется два метода или подхода для изучения связи HLA и болезни: популяционные исследования (эпидемиологический подход) и семейные исследования (генетический подход). Эпидемиологический подход устанавливает наличие ассоциаций между заболеваниями и HLA-генами в результате сравнения частот HLA-генов у больных и здоровых людей. Показателем различия этих частот служит величина относительного риска (RR - Relative Risk), отражающая выраженность ассоциаций. Величина RR показывает, во сколько раз риск развития заболевания выше в случае присутствия в фенотипе определенной HLA-специфичности, чем при ее отсутствии. RR - статистическая величина, ее достоверность проверяется по критерию χ2 или точному тесту Фишера, с поправкой на количество сравниваемых антигенов.
Принята общая концепция, что предрасположенность к заболеванию обусловлена геном Ds (Disease susceptibility gene), который находится в неравновесном сцеплении с известным HLA-геном. Такой Ds-ген не обязательно является геном иммунного ответа. Для обозначения степени выраженности неравновесного сцепления между HLA-геном и Ds-геном введено понятие «сила ассоциации или атрибутивного риска». Величина атрибутивного риска (δ) может иметь значение от 0 до 1 и показывает, какая из ассоциированных с заболеванием HLA-специфичность имеет наиболее выраженную ассоциацию. Величина δ=1 означала бы, что данный HLA-ген и является Ds-геном.
При анализе связи HLA-антигенов с заболеванием используются два дополнительных понятия: «этиологическая фракция» и «превентивная фракция». Этиологическая фракция (EF - Etiologic Fraction) как показатель силы ассоциации по своему смыслу сходна с показателем атрибутивного риска и вычисляется при положительной ассоциации (RR>1). Величина EF отражает ту часть больных, у которых заболевание возникло именно благодаря наличию данного HLA-гена или сегрегирующего с ним гена предрасположенности к заболеванию.
Если имеется отрицательная ассоциация (RR<1), определяется величина превентивной фракции (PF - Preventive Fraction). Величина PF показывает ту часть случаев, когда заболевание не развилось, благодаря наличию ассоциированного HLA-гена (или сегрегирующего с ним гена резистентности к заболеванию) из всех гипотетических случаев заболевания, которые наблюдались бы среди лиц, имеющих ассоциированный с болезнью HLA-ген, если бы не действовали HLA-сцепленные защитные факторы.
На основании популяционных исследований можно определить способ наследования HLA-ассоциированного Ds-гена и частоту Ds-гена в популяции, что имеет большое значение для популяционного прогноза [4].
При семейных исследованиях определяется не ассоциация, а сцепление заболеваний с HLA-гаплотипом. В этом случае связь с HLA выражается в том, что определенный HLA-гаплотип сегрегирует в семье вместе с заболеванием. Семейные исследования важны, например, в том случае, если Ds-ген, хотя и находится рядом с определенным HLA-геном, но не имеет или имеет с ним незначительное неравновесное сцепление и поэтому не выявляется при популяционном анализе. Для определения генетического сцепления были разработаны следующие методы: метод максимальной вероятности «Lod scores», метод пар сибсов, а также методы установления наследования HLA-сцепленного Ds-гена.
Очень важен с практической точки зрения вопрос о диагностической ценности HLA-типирования. Возьмем пример с анкилозирующим спондилитом, имеющим очень сильную ассоциацию со специфичностью HLA-B27. Специфичность HLA-B27 встречается примерно у 90% больных анкилозирующим спондилитом в европеоидной расе. В группе сравнения (здоровые лица) - 8%. RR будет равен 103,5. Абсолютный или индивидуальный риск развития заболевания среди здоровых лиц, имеющих данную HLA-специфичность (при условии, что, например, частота болезни в данной популяции F равна 1/1000), будет равен 1%. Эта прогностическая величина может в значительной степени варьировать в зависимости от частоты болезни в популяции, пола, возраста и других факторов.
Ценность HLA-типирования в диагностике главным образом зависит от вероятности a priori, основанной на клинических, лабораторных и других находках, указывающих на то, что данный пациент болен. Если после обследования больного диагноз анкилозирующего спондилита (a priori вероятность 0,5%) может быть поставлен врачом с 50% вероятностью, то при выявлении в его фенотипе специфичности HLA-B27 вероятность такого диагноза увеличивается до 91,8%. В то же время при отрицательном результате теста (отсутствие в фенотипе антигена В27) вероятность наличия данного заболевания снижается до 9,8%.
Практически ни одна из выявленных ассоциаций не является абсолютной. Можно предположить несколько причин, объясняющих неполную ассоциацию. Исключением является ассоциация между HLA-DRB2 и нарколепсией в японской популяции, где зарегистрировано наивысшее значение RR - около 300. При этом частота данной специфичности среди японцев является одной из самых низких среди обследованных на сегодняшний день популяций. И все установленные на сегодняшний день больные нарколепсией японцы несут в генотипе данную специфичность. Только в этом случае есть основания утверждать, что в японской популяции HLA-DRB2 является Ds-геном.
Для определения частоты аллелей исследованных генов и их гаплотипов методом максимального правдоподобия (maximum-likelihood method) рекомендуется использовать компьютерную программу «Арлекин» версия 2.1 (URL: http://anthro.unige.ch/arleuin).
Помимо «классического» направления в развитии иммуногенетики СД и других аутоиммунных заболеваний в самые последние годы получило развитие новое направление - исследование роли генов иммунного ответа человека, не входящих в систему HLA, в развитии аутоиммунных заболеваний.
В самое последнее время классическая иммуногенетика человека, достижения которой базировались в первую очередь на использовании знаний в области главного комплекса генов тканевой совместимости (по сути, рассматриваемого как единственный аналог генам иммунного ответа человека), была дополнена новыми данными и представлениями. Так, помимо данных о неклассических генах HLA, были получены данные о роли генов, контролирующих звенья иммунного ответа, не находящиеся под прямым контролем генов HLA. Развитию этого направления способствовало появление новых возможностей молекулярной генетики, позволяющих идентифицировать присутствующие в генотипе того или иного человека варианты генов, регулирующих различные этапы иммунного ответа. Наличие таких вариантов (генный полиморфизм) обусловлено, как правило, присутствием в геноме одиночных нуклеотидных замен - SNP (Single Nucleotide Polymorphism).
Биологическим эффектом этих SNP может быть изменение экспрессии гена (если полиморфизм затрагивает регуляторные участки гена) или изменение аминокислотного состава продукта.
При обследований больных СД1 среди SNP были установлены следующие замены одиночных нуклеотидов: -238 G/A и -308 G/A в гене TNF (Tumor Necrosis Factor, member 2) и +874 T/A в гене IFNG (Interferon-γ), ассоциированные с развитием СД1 [18, 57]. Следует отметить, что, согласно данным автора [17], белковые продукты этих генов обладают широким спектром иммуномодулирующих, противовирусных и противоопухолевых эффектов, что позволило авторам [17] выдвинуть предположение о том, что изменение уровня их экспрессии, в том числе обусловленное заменами одиночных нуклеотидов, может повлиять на развитие иммунного ответа по отношению к вирусным инфекциям, а также привести к повреждению β-клеток поджелудочной железы.
Следует отметить, что при проведении аналогичных исследований в русской популяции жителей Москвы ассоциация между наличием вышеуказанных SNP и предрасположенностью к СД1 не выявлена. Можно предположить, что данные ассоциации могут быть характерны только для определенных этнических групп [1, 2].
В пользу этого, в частности, может свидетельствовать следующее. Ассоциации СД1 с аллельными вариантами генов HLA, характерные для одних этнических групп, отсутствуют в других. Между тем чрезвычайно выраженный на уровне аллельных вариантов полиморфизм системы HLA является по существу следствием возникших на разных этапах развития человека одиночных нуклеотидных замен, закрепившихся вследствие своей биологической целесообразности, например, благодаря повышению устойчивости носителей данной SNP к инфекционным заболеваниям. Именно тот факт, что прародители тех или иных этнических групп сталкивались с различными вызовами для их иммунной системы, нашел отражение в современном различии между вариантами генов, регулирующих иммунный ответ.
Иная картина имела место при изучении SNP, ассоциация которого с развитием СД1 показана при изучении различных популяционных групп. Речь идет об однонуклеотидной замене +49A/G (rs231775) в гене CTLA4 (Cytotoxic T-Lymphocyte associated Antigen-4, поверхностный антигенцитотоксических Т-лимфоцитов) [1, 2, 22, 36, 38]. Данная замена нуклеотида, в свою очередь, приводит к замене аминокислоты в 17-й позиции белкового продукта гена CTLA4, участвующего в регуляции активации Т-лимфоцитов, и, соответственно, к изменению его физиологического действия. Изменение свойств белкового продукта гена CTLA4 может привести к нарушению регуляции деятельности Т-лимфоцитов и к развитию аутоиммунного процесса. При проведении совместных исследований сотрудниками Института иммунологии и ФГБУ «Эндокринологический научный центр» МЗ РФ была установлена ассоциация с предрасположенностью к СД1 у 70% больных, несущих генотип 49GG, при отсутствии у них HLA-маркеров СД1, в то время как в контрольной группе частота этого генотипа не превышала 10%. Эти данные позволили сделать вывод, что генотип CTLA4 49GG может маркировать предрасположенность к СД1, независимую от HLA.
Таким образом, установление SNP генотипа CTLA4 49GG позволяет повысить эффективность прогноза развития СД1 при совместном генотипировании как по генам HLA, так и по данному SNP. Во всяком случае в этом исследовании такой подход позволил установить генетические маркеры предрасположенности к СД1 у 94% из обследованной группы больных [1].
Таким образом, предлагаемый подход позволяет выделить из числа генов, ассоциированных с СД1, клинически значимые гены, исследование которых повышает уровень достоверности прогноза развития заболевания. Можно согласиться с мнением авторов данной работы о необходимости проведения масштабного исследования, предполагающего изучение большего количества генетических полиморфизмов у представителей различных этнических групп. Также значительный интерес может представлять использование подхода, при котором установление индивидуального риска развития СД1 рассматривается в зависимости от наличия «функционального» HLA-DRB1 -генотипа [7].
Говоря о роли тех или иных генов, контролирующих иммунный ответ, в предрасположенности и устойчивости к СД1, следует отметить следующее. Общепризнанным является тот факт, что наибольшую и определяющую роль среди них, равно как и среди других генов предрасположенности к СД1, не участвующих в контроле иммунного ответа (например, ген INS или IDDM2, контролирующий продукцию инсулина), играют гены HLA (IDDM1). Высокий уровень ассоциации генов HLA с предрасположенностью к заболеванию СД1, как указывалось ранее, объясняется тем, что продукты этих генов не только являются генетическими маркерами предрасположенности к СД1, но и, представляя диабетогенные пептиды, выполняют функцию запуска аутоиммунного процесса, лежащего в основе заболевания [2].
Расчетный уровень вклада HLA в генетически обусловленную предрасположенность к СД1 составляет, по разным оценкам, от 40 до 70%. Вклад CTLA-4, так же как и INS, оценивается приблизительно в 10%. Естественно, что эти цифры достаточно приблизительны, т.е. при суммировании процентных содержаний всех известных на сегодняшний день генетических маркеров СД1 получается цифра, значительно превышающая 100% (вплоть до 200%). Последнее в значительной степени снижает общую достоверность и клиническую значимость прогнозирования развития СД1. Можно было предположить, что причиной неточности могло стать следующее. Несколько генетических маркеров предрасположенности к СД1 могут присутствовать в одном геноме одновременно. Поэтому целесообразно было бы использовать вышеописанный подход для установления других маркеров, определяющих предрасположенность к СД1 независимо друг от друга.
Следует напомнить, что гены HLA контролируют распознавание чужеродного, индукцию иммунного ответа и его эффекторную стадию. Однако для развития полноценного иммунного ответа чрезвычайно важной стадией является его генерализация, осуществляемая с помощью цитокинов. Мониторинг цитокинов на протеомном уровне является в настоящее время рутинной иммунологической процедурой, благодаря использованию наборов специфических моноклональных антител. Однако возможность генетического прогноза активности цитокинов появилась только в последнее время, в том числе благодаря использованию метода ПЦР в режиме реального времени.
Другим не менее важным подходом, расширившим возможности для более полного и эффективного в клиническом аспекте исследования иммуногенетического статуса человека, стало установление полиморфизма на уровне одиночных нуклеотидных замен - SNP.
Представленные данные позволят читателю не только составить представление о сегодняшнем уровне развития иммуногенетики человека, но и дадут возможность использовать их как в фундаментальных исследованиях, так и на практике при генодиагностике и генотипировании в целях установления риска развития заболеваний, в первую очередь иммунотропного генеза. Вместе с тем целесообразно отметить, что именно в настоящее время получили интенсивное развитие новые перспективные направления в иммуногенетике человека. Одним из них, также непосредственно связанным с генами HLA, является установление вероятности развития осложнений, связанных с использованием медикаментозной терапии у лиц, несущих конкретные аллельные варианты генов HLA. Наиболее ярким примером является ассоциация между наличием в генотипе больного аллеля HLA-B*57:01 и непереносимостью препарата абакавир, являющегося одним из наиболее эффективных при лечении ВИЧ-инфекции и терапии СПИДа. Прием абакавира вызывает тяжелые, в том числе летальные, осложнения у лиц, в генотипе которых имеется указанный аллельный вариант гена HLA. Следует отметить, что данный аллель не относится к редко встречаемым. Естественно, что эта ситуация требует обязательного HLA-генотипирования всех инфицированных и больных СПИДом. Этот пример является наиболее ярким, но не единственным, и можно ожидать, что в дальнейшем число терапевтических агентов, непереносимость которых ассоциирована с определенными HLA-специфичностями, будет увеличиваться. Следует отметить, что само понятие «иммуногенетика человека» в самое последнее время расширилось, и появилась новая формулировка «не-HLA-гены иммунного ответа». Эта формулировка стала официально признанной только в 2010 г., когда на XXIV Конгрессе Европейской федерации иммуногенетики (EFI) указанное направление было выделено в отдельную секцию. Речь идет в первую очередь о генах, контролирующих цитокиновые каскады, регулирующие все этапы иммунного ответа, начиная с распознавания чужеродного агента и, естественно, существенным образом влияя на результаты иммунного ответа. Развитие данного направления, которому в настоящее время уделяется значительное внимание исследователей, стало возможным благодаря появившейся возможности изучать генный полиморфизм на уровне одиночных нуклеотидных замен. Данный метод, названный SNP, благодаря тому, что он позволяет учитывать SNP в промоторных участках генов, дает информацию как о самих генах цитокинов, так и об их клеточных рецепторах. Использование ПЦР в режиме реального времени уже сейчас позволяет получить практические данные о генетической составляющей целого ряда социально значимых заболеваний иммунотропного генеза, в том числе аутоиммунных, онкологических, инфекционных и дерматологических. Более того, в настоящее время для многих заболеваний уже установлены SNP-варианты, ассоциированные с предрасположенностью или, напротив, с устойчивостью к широкому спектру заболеваний, начиная от онкогематологических и заканчивая СПИДом.
До недавнего времени большой проблемой практического использования этого подхода было отсутствие данных о тех показателях активности исследуемых генов, которые можно считать нормой. Первое такое исследование, в котором были изучены параметры клинически значимых полиморфизмов 14 генов, контролирующих важнейшие интерлейкины, обеспечивающие развитие иммунного ответа, было выполнено при обследовании русской популяции, что делает более доступным и эффективным использование этого метода в практической медицине [22].
Есть все основания считать, что новый подход к оценке полиморфизмов генов иммунного ответа человека, которые составляют генетическую основу функционирования иммунной системы, откроет новые возможности для клинической генетики человека.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
-
Абрамов Д.Д., Дедов И.И., Трофимов Д.Ю. и др. Полиморфизм гена РТР № 22 (1858С/Т) в русской популяции у больных сахарным диабетом 1-го типа и у здоровых доноров // Сахарный диабет. - 2007. - № 3. - С. 2-3.
-
Абрамов Д.Д., Дедов И.И., Хаитов Р.М. и др. Сравнение вклада системы HLA и других генов иммунного ответа в формирование генетической предрасположенности к развитию сахарного диабета 1 типа // Иммунология. - 2012. - Т. 1, № 33. - С. 4-6.
-
Алексеев Л.П., Яздовский В.В., Хаитов Р.М. Межэтнические различия в генетическом контроле иммунного статуса человека // Рос. физиол. журн. им. И.М. Сеченова. - 2000. - Т. 86. - С. 280-284.
-
Алексеев Л.П., Дедов И.И., Болдырева М.Н. и др. HLA-гены - маркеры инсулин-зависимого сахарного диабета, этнические аспекты // Иммунология. - 2003. - Т. 24, № 5. - C. 308-11.
-
Алексеев Л.П., Дедов И.И., Болдырева М.Н. и др. Иммуногенетика сахарного диабета 1 типа - от фундаментальных исследований к клинике // Вестник РАМН. -2012. - № 1 - С. 75-80.
-
Балаболкин М.И., Дедов И.И. Генетические аспекты сахарного диабета // Сахарный диабет. - 2000. - Т. 1, № 6. - С. 2-10.
-
Болдырева М.Н., Хаитов Р.М., Дедов И.И. и др. Новый взгляд на механизм HLA-ассоциированной предрасположенности к сахарному диабету 1 типа. Теоретические и прикладные аспекты // Иммунология. - 2005. - Т. 26, № 6. - С. 324-9.
-
Болдырева М.Н., Алексеев Л.П., Хаитов Р.М. и др. HLA-генетическое разнообразие населения России и СНГ. I. Русские // Иммунология. - 2005. - Т. 26, № 5. - С. 260-3.
-
Никонова Т.В., Дедов И.И., Алексеев Л.П. и др. Прогнозирование СД1 типа в группах высокого риска // Сахарный диабет. - 2000. - № 2. - С. 2-6.
-
Осокина И.В., Болдырева М.Н., Ширшина Р.К. и др. HLA-маркеры сахарного диабета 1 типа в тувинской популяции // Сахарный диабет. - 2001. - № 4. - С. 8-10.
-
Хаитов Р.М., Алексеев Л.П. Геномика HLA: новые возможности молекулярной генетики человека в диагностике и терапии // Молекулярная медицина. - 2003. - № 1. - С. 17-31.
-
Хаитов Р.М., Алексеев Л.П. Физиология генов иммунного ответа // Рос. физиол. журн. им. И.М. Сеченова. - 2003. - Т. 89. - № 3. - С. 313-28.
-
Хаитов Р.М. Физиология иммунной системы. - М.: ВИНИТИ РАН. - 2005. - 375 с.
-
Alexeev L.P., Dolbin A.G., Sechkin A.V. Renal transplants in Russia // Clin. Transpl. - 2000. - 392-3.
-
Amirzargar A.A., Yalda A., Hajabolbaghi M. et al. The association of HLA-DRB, DQA1, DQB1 alleles and haplotype frequency in Iranian patients with pulmonary tuberculosis // Int. J. Tuberc. Lung Dis. - 2004. - № 8. - P. 1017-21.
-
Arenzana-Scisdedos F., Mogenssen S.C., Vuiller F. et al. Autocrine secretion of tumor necrosis factor under the influence of interferon-gamma amplifies HLA-DR gene induction in human monocytes // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1988. - Vol. 85. - P. 6087-91.
-
Atkinson M.A., Maclaren N.K. The pathogenesis of insulin-dependent diabetes mellitus // N. Engl. J. Med. - 1994. - Vol. 331. - P. 1428-36.
-
Badenhoop K., Schwarz G., Bingley P. et al. TNF-Αlpha gene polymorphisms: association with type I (insulin-dependent) diabetes mellitus // J. Immunogenet. - 1989. - Vol. 16, № 6. - P. 455-60.
-
Bal V., Mclndoe A., Denton G. et al. Antigen presentation by keratinocytes induces tolerance in human T cells // Eur. J. Immunol. - 1984. - Vol. 20. - P. 1893-7.
-
Bauer M.P., Danilovs J.A. Population analysis of HLA-A, B, C, DR and other genetic markers // In: Histocompatibility testing 1980 (ed. P.I. Terasaki). UCLA Tissue Typing Lab, Los Angeles. - 1980. - P. 955-93.
-
Bohme G., Haskins K., Stecha P. et al. Transgenic mice with I-A on islet cells are normoclycemic but immunologically intolerant // Science. - 1989. - Vol. 244. - P. 1179-83.
-
Chistiakov D.A., Savost’anov K.V., Nosikov V.V. CTLA4 gene polymorphisms are associated with, and linked to, insulin-dependent diabetes mellitus in a Russian population // BMC Genet. - 2001. - Vol. 2. - P. 6.
-
Cox N.J., Wapelhorst B., Morrison V.A. et al. Seven regions of the genome show evidence of linkage to type 1 diabetes in a consensus analysis of 767 multiplex families // Am. J. Hum. Genet. - 2001. - Vol. 69, № 4. - P. 820-30.
-
Cramp M.E., Carucci P., Underhill J. et al. Association between HLA class II genotype and spontaneous clearance of hepatitis C viremia // J. Hepatol. - 1998. - Vol. 29, № 2. - P. 207-13.
-
Davies J.L., Kawaguchi Y., Bennett S.T. et al. A genome-wide search for human type 1 diabetes susceptibility genes // Nature. - 1994. - Vol. 371, № 6493. - P. 130-6.
-
Ebringer A. Ankylosing spondylitis, immune-response-genes and molecular mimicry // Lancet. - 1979. - Vol. 1. - P. 1186.
-
Erlich H., Valdes A.M., Noble J. et al. HLA DR-DQ haplotypes and genotypes and type 1 diabetes risk: analysis of the type 1 diabetes genetics consortium families // Diabetes. - 2008. - Vol. 57, № 4. - Р. 1084-92.
-
Hamaguchi K., Kimura A., Seki N. et al. Analysis of tumor necrosis factor-alpha promoter polymorphism in type 1 diabetes: HLA-B and -DRB1 alleles are primarily associated with the disease in Japanese // Tissue Antigens. - 2000. - Vol. 55, № 1. - P. 10-6.
-
Harding F., McArthur J, Gross G. et al. CD28-mediated signaling co-stimulates murine T-cells and prevents induction of anergy in T-cell clones // Nature. - 1992. - Vol. 356. - P. 607-9.
-
Hill A.V.S., Allsopp C.E., Kwiatkowski D. et al. Common West African HLA antigens are associated with protection from severe malaria // Nature. - 1991. - Vol. 352. - P. 595-600.
-
Huczko E.L., Bodnar W.M., Benjamin D. et al. Characteristics of endogenous peptides eluted from the class I MHC molecule HLA-B7 determined by mass spectrometry and computer modeling // J Immunol. - 1993. - Vol. 151. - P. 2572-87.
-
Hussain M.J., Maher J., Warnock T. et al. Cytokine overproduction in healthy first degree relatives of patients with IDDM // Diabetologia. - 1998. - Vol. 41. - P. 343-9.
-
Jacob C., Fronek Z., Lewis J. et al. Heritable major histocompatibility complex class II-associated differences in production of tumor necrosis factor a: relevance to systemic lupus erythematosis // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1990. - Vol. 87. - P. 1233-7.
-
Janeway C.A. Functions of the MHC: Presentation of Antigens to T cells. Plenary report at ASHI 23rd Annual Meeting, October 14-19, 1997, Atlanta, Georgia. - 1997. - P. 27-42.
-
Jenkins M.K., Schwartz R.H. Antigen presentation by chemically modified splenocytes induces antigen-specific T cell unresponsiveness in vitro and in vivo // J. Exp. Med. - 1987. - Vol. 165. - P. 3704-13.
-
Kavvoura F.K., Ioannidis J.P. CTLA-4 gene polymorphisms and susceptibility to type 1 diabetes mellitus: a HuGE Review and meta-analysis // Am. J. Epidemiol. - 2005. - Vol. 16, № 1. - P. 3-16.
-
Khaitov R., Boldyreva M., Trofimov D. et al. Russian, Tuvin, Buriat, and Armenian Normal // In HLA 1997. Eds. P.I.Terasaki, D.W.Gjertson. Publ. by UCLA Tissue Typing Lab. - 1998. - P. 241-3.
-
Kropshofer H., Hammerling G.J., Vogt A.B. The impact of non-classical MHC proteins HLA-DMA and HLA-DO on loading of MHC class II molecules // Immunol. Rev. - 1999 Dec. - Vol. 172. - P. 267-78.
-
Kwon O.J., Brautbar C., Weintrob N., Sprecher E., Saphirman C., Bloch K., Pinhas-Hamiel O., Assah S., Vardi P., Israel S. Immunogenetics of HLA class II in Israeli Ashkenazi Jewish, non-Ashkenazi Jewish, and Israeli Arab IDDM patients // Hum. Immunol. - 2001. - Vol. 62, № 1. - P. 85-91.
-
Lechler R.I. Qualitative and quantitative studies of antigen-presenting cell function by using I-A-expressing L cells // J. Immunol. - 1985. - Vol. 135. - P. 2914-22.
-
Lo D., Burkley L.C., Widera G. et al. Diabetes and tolerance in transgenic mice expressing class II molecules in pancreatic beta cells // Cell. - 1988. - Vol. 53. - P. 159-68.
-
Madrigal A. Immunological properties of cord blood // Клеточная трансплантология и тканевая инженерия. - 2011. - T. IV, № 1. - C. 19-21.
-
Markman J., Lo D., Naji A. et al. Antigen-presenting function of class II MHC-expressing pancreatic beta-cells // Nature. - 1988. - Vol. 336. - P. 476-9.
-
Mc Kiernan S.M., Hagan R., Curry M. et al. Distinct MHC class I and II alleles are associated with hepatitis C viral clearance? Originating from a single source // Hepatology. - 2004. - Vol. 40, № 1. - P. 108-14.
-
Miller J., Daitch L., Rath S. et al. Tissue specific expression of allogeneic class II MHC molecules induces neither tissue rejection nor clonal inactivation of alloreactive T cells // J. Immunol. - 1990. - Vol. 144. - P. 334-41.
-
Milner C.M., Campbell R.D. Structure and expression of the three MHC-linked HSP70 genes // Immunogenetics. - 1990. - Vol. 32. - P. 242-51.
-
Motta P., Marinic K., Sorrentino A., Lopez R. et al. Association of HLA-DQ and HLA-DR alleles with susceptibility or resistance to HIV-1 infection among the population of Chaco Province, Argentina // Medicina (B Aires). - 2002. - Vol. 62, № 3. - P. 245-8.
-
Park Y., Eisenbarth G.S. Genetic susceptibility factors of Type 1 diabetes in Asians // Diabetes Metab. Res. Rev. - 2001. - Vol. 17, № 1. - P. 2-11.
-
Park M.H., Song E.Y., Ahn C. et al. Two subtypes of hepatitits B virus-associated glomerulonephritis are associated with different HLA-DR2 alleles in Koreans // Tissue Antigens. - 2003. - Vol. 62, № 6. - P. 505-11.
-
Partanen J, Koskimies S. Low degree of DNA polymorphism in the HLA-linked lymphoto-xin (Tumor necrosis Factor-b) gene // Scand. J. Immunol. - 1988. - Vol. 28. - P. 313-6.
-
Peng R., Li Y., Brezner K. et al. Abnormal peripheral blood dendritic cell populations in type 1 diabetes //Ann. NY Acad. Sci. - 2003. - Vol. 1005. - P. 222-5.
-
Plesner A., Greenbaum C.J., Gaur L.K. et al. Macrophages from high-risk HLA-DQB1*0201/80302 type 1 diabetes mellitus patients are hypersensitive to lipopolysaccharide stimulation // Scand. J. Immunol. - 2002. - Vol. 56, № 5. - P. 522-9.
-
Rajni Rani, Sood A., Goswami R. Attenuation of autoreactive Th1 cells in vitro using altered peptide ligands in diabetes of the young // Tissue antigens. XIII International Congress on Histocompatibility and Immunogenetics, Seattle. 18-22 May, 2002. - P. 20.
-
Sauermann U., Nurnberg P., Bercovitch F.B. et al. Increased reproductive success of MHC class II heterozygous males among free-raning rhesus macaques // Hum. Genet. - 2001. - Vol. 108, № 3. - P. 249-54.
-
Schipper R.F., Koeleman B.P., Bruining G.J., Schreuder G.M., Verduijn W., Vries R.R. Roep B.O. HLA class II associations with Type 1 diabetes mellitus: a multivariate approach // Tissue Antigens. - 2001. - Vol. 57, № 2. - P. 144-50.
-
Seager K., Bashir H.V., Geczy A.F. et al. Evidence for a specific B-27-associated cell surface marker on lymphocytes of patients with ankylosing spondylitis // Nature. - 1979. - Vol. 277. - P. 68-70.
-
Siekiera U., Jarosz-Chobot P., Janusz J., Koehler B. Polymorphism of TNF-Αlpha (308 A/G), IL-10 (1082 A/G, 819 C/T 592 A/C), IL-6 (174 G/C), and IFN-gamma (874 A/T); genetically conditioned cytokine synthesis level in children with diabetes type 1 // Endokrynol. Diabetil. Chor. Przemiany Materii Wieku R. - 2002. - Vol. 8. - P. 29-34.
-
Starvetnick N., Liggitt D., Pitts S.L. Insulin-dependent diabetes mellitus induced in transgenic mice by ectopic expression of class II MHC and interferon-gamma // Cell. - 1988. - Vol. 52. - P. 773-81.
-
Svejgaard A., Hauge M., Jersild C. et al. the HLA system. An ontroductory survey // Monogr. Hum. Genet. - 1975. - Vol. 7. - P. 1-100.
-
Tait B.D., Drummond B.P., Varney M.D., Harrison L.C. HLA-DRB1*0401 is associated with susceptibility to insulin-dependent diabetes mellitus independently of the DQB1 locus // Eur. J. Immunogenet. - 1995. - Vol. 22. - P. 289-97.
-
Thursz M.R., Thomas H.C., Greenwood B.M. et al. Heterozygote advantage for HLA class-II type in hepatitis B virus infection // Nat. Genet. - 1997. - Vol. 17, № 1. - P. 11-2.
-
Todd J.A., Bell J.I., McDevitt H.O. HLA-DQ beta gene contributes to susceptibility and resistance to insulin-dependent diabetes mellitus // Nature. - 1987. - Vol. 329, № 6140. - P. 599-604.
-
Valdes A.M., McWeeney S., Thomson G. HLA class II DR-DQ amino acids and insulin-dependent diabetes mellitus: application of the haplotype method // Am. J. Hum. Genet. - 1997. - Vol. 60, № 3. - P. 717-28.
-
Van Eden W., de Vries R.R., Mehra N.K. et al. HLA segregation of tuberculoid leprosy: confirmation of the DR2 marker // J. Infect. Dis. - 1980. - Vol. 141, № 6. - P. 693-701.
-
Williams R. Rheumatic fever and the streptococcus // Am. J. Med. - 1983. - Vol. 75. - P. 727-30.
-
Wilson A.G., Clay F.E., Crane A.M. et al. Comparative genetic association of human leukocyte antigen class II and tumor necrosis factor-alpha with dermatitis herpetiformis // J. Invest. Dermatol. - 1995. - Vol. 104, № 5. - P. 856-8.
Глава 7. Роль генетической составляющей в развитии отдаленных эффектов радиационного воздействия
Одной из приоритетных задач Института иммунологии со времени своего основания является развитие исследований в области иммуногенетики человека. На разных этапах деятельности института его сотрудники активно принимали и принимают участие в разработке всех основных направлений иммуногенетики.
Объект исследований - гены иммунного ответа человека, продукты которых обеспечивают важнейшие биологические, в первую очередь иммунологические, функции организма. В основе развития большинства социально значимых заболеваний человека лежит нарушение этих функций, вызванное неблагоприятными эндогенными и экзогенными воздействиями. Одним из перспективных, но в то же время невероятно сложных и мало изученных вопросов в этой области остается изучение действия радиации на организм человека. С одной стороны, известно, что клетки иммунной системы являются одними из наиболее радиочувствительных клеток организма, что определяет выраженный иммуносупрессирующий эффект радиации, а с другой, очевидно, что именно иммунная система играет ключевую роль в восстановлении и адаптации организма после облучения и в условиях хронического радиационного воздействия.
Актуальность этой проблемы обусловлена непрерывным развитием атомных технологий, вызванным растущими потребностями человечества в доступных источниках энергии. Однако освоение энергии атома всегда будет связано с рисками для здоровья человека. История знает несколько примеров ядерных инцидентов, повлекших за собой аварийное облучение населения и участников ликвидации последствий аварий. По сей день система здравоохранения сталкивается с наследием крупнейших военных и техногенных катастроф, начиная с бомбардировки Хиросимы и Нагасаки и вплоть до аварии на Фукусимской АЭС, масштаб последствий которой до сих пор не оценен в полной мере.
В связи с этим уже в конце 1940-х - начале 1950-х годов перед мировым здравоохранением и человечеством в целом возникла новая задача - обеспечение ядерной и радиационной безопасности населения и в первую очередь контингентов, работающих в условиях повышенного риска воздействия радиации. В эти контингенты входит персонал предприятий атомной промышленности, добывающей отрасли, а также военных объектов. Кроме того, в связи с развитием космической отрасли в последние годы на повестке дня остро стоит вопрос обеспечения радиационной безопасности экипажей космических кораблей.
В 1950-1960-х годах во всех странах были начаты интенсивные исследования, целью которых стало создание препаратов, снижающих радиочувствительность. К сожалению, это развиваемое и в наши дни направление далеко не полностью оправдало первоначальные надежды.
В настоящее время в связи с реализацией и завершением Международной программы «Геном человека» и появлением новых данных о структуре и функциях генома человека более перспективным представляется принципиально иной подход. Этот подход основан на установлении генетических маркеров, обусловливающих индивидуальную чувствительность организма к радиации. Расшифровка генома человека позволила значительно расширить представления об уровне разнообразия (полиморфизма) генов.
Одновременно с этим изменились представления о роли мутационного процесса в биомедицине и формировании человека как вида. Сегодня ясно, что в рамках мутационных процессов происходят не только отрицательные явления, но также и процесс обеспечения человечества устойчивостью к воздействию неблагоприятных факторов окружающей среды, включая инфекционные и техногенные факторы.
При определении направления дальнейших исследований необходимо установить эффекты облучения, которые, с одной стороны, имели бы четкое клиническое проявление, а с другой - характеризовались значимостью иммунной системы и генетического аппарата в этиологии и манифестации заболевания. Среди таких эффектов наибольший интерес с практической и медицинской точки зрения представляет механизм развития злокачественных новообразований. Установлено, что хроническое низко- и среднедозовое облучение, особенно ставшее результатом инкорпорации радионуклидов, обладает канцерогенным эффектом [22]. Кроме того, на повышенный канцерогенный риск облучения указывают отчеты международной комиссии BEIR (Biologic Effects of Ionizing Radiation VII report) [12] и проводимые в России исследования отдаленных эффектов радиации у участников ликвидации последствий радиационных аварий и лиц, проживающих на радиоактивно загрязненных территориях [2].
Установление ключевых маркеров, отражающих генетическую предрасположенность к развитию негативных эффектов радиационного воздействия и в том числе онкопатологий, позволит исключить или снизить до минимума вероятность негативного влияния радиации на организм человека. Достижение этой цели позволит не только снизить радиационные риски для работников атомной, добывающей и аэрокосмической отрасли, но и откроет новые возможности повышения эффективности и безопасности методов ядерной медицины.
Проблема снижения медицинских рисков может быть решена путем комплексного изучения негативных эффектов радиации на здоровье человека и мониторинга основных показателей здоровья облученных лиц. Эта область исследований является одним из традиционных направлений радиационной медицины. Перечень практических и фундаментальных вопросов, которые рассматривает данная наука, чрезвычайно широк, и в ней, как и в любой дисциплине, ориентированной на быстрый перенос научных разработок в область практического здравоохранения, остро стоит вопрос выбора оптимальных инструментов исследования. Поэтому одной из приоритетных задач, решение которой обеспечивает проведение исследований на передовом мировом уровне, является обеспечение выполнения фундаментальных и прикладных исследований отечественными реагентами, а также высокотехнологичным оборудованием, соответствующим лучшим мировым стандартам.
7.1. Поиск кандидатных генов иммунного ответа, вовлеченных в ответ организма на радиационное воздействие
В условиях сдвига физиологического баланса, обусловленного действием радиации, особенную значимость приобретает иммунная система человека, в том числе процессы регуляции восстановления пула иммуно-компетентных клеток и поддержания разнообразия антигенраспознающих рецепторов, а следовательно, и защиты человека от внешних и измененных собственных антигенов. Длительные наблюдения за людьми, подвергшимися облучению, указывают на то, что иммунная система является одной из наиболее уязвимых к действию радиации. В целом, при радиоактивном облучении организма человека наблюдается сдвиг баланса в относительной представленности популяций Т-клеток на фоне общей лимфопении [8].
Так, проспективное исследование лиц, выживших после атомной бомбардировки городов Хиросима и Нагасаки (Япония), показало значительное уменьшение числа Т-клеток, в том числе CD4^^ CD45RA наивных клеток, на фоне увеличения активности NK-клеток [16].
Еще одной особенностью, характеризующей функциональное состояние иммунной системы наряду с лимфопенией и сдвигом иммунологического баланса, является повышение активности фагоцитов. На самом деле эти показатели взаимосвязаны. В результате разрушения лимфоцитов высвобождается значительное количество биологических молекул (РНК, ДНК, пептидов), за утилизацию которых отвечают фагоциты [4, 11, 25]. Врожденные нарушения в генах системы репарации ДНК на фоне разрушительной для нуклеиновых кислот ионизации приводит к накоплению мутаций, нарушениям процессов трансляции и посттрансляционного процессинга белков. Это, в свою очередь, приводит к образованию большого числа «новых» для распознающих молекул антигенов.
Изучению роли приобретенных и врожденных мутаций в развитии негативных эффектов облучения следует уделить особое внимание. Радиационно-индуцированное накопление мутаций в генах, продукты которых ответственны за презентацию антигенов и регуляцию развития иммунного ответа, может сыграть решающую роль в специфичности их связывания с антигеном [20, 28]. В неменьшей степени это относится к врожденным (наследуемым) мутациям. Замена всего одной аминокислоты может приводить к изменению конформации пептида, изменению стерических условий взаимодействия и аффинности связи. Это, в свою очередь, может запускать каскад дальнейших реакций и приводить к индивидуальным отклонениям в иммунологическом гомеостазе [15, 29].
Так, при рассмотрении базовых механизмов формирования иммунных реакций в ответ на радиационное воздействие отдельного внимания заслуживает процесс восстановления пула лимфоцитов после облучения. В ряде исследований показано, что у взрослых людей в условиях пониженной активности тимуса процесс репопуляции лимфоцитов осуществляется за счет периферических органов иммунной системы (гомеостатическая пролиферация). Увеличение пула олигоклональных клеток памяти, населяющих лимфатические узлы, приводит к снижению репертуара Т-клеточных рецепторов (TCR). Это, в свою очередь, может препятствовать взаимодействию Т-клеток с опухолевыми антигенами и повышать риск развития онкопатологий. Ключевыми цитокинами, регулирующими процесс репопуляции цитокинов, являются IL-15 и IL-7 [23, 30].
Таким образом, нарушение функций генов иммунного ответа и их продуктов ведет к развитию тяжелых форм иммунологической недостаточности и иммунозависимым заболеваниям. В связи с этим анализ генов иммунного ответа может иметь прогностическое значение в оценке риска развития осложнений радиационного воздействия. Именно поэтому, рассматривая особенности реакции организма человека на радиационное воздействие, особенное внимание мы уделяем именно регулирующей роли пептидов системы HLA и особенностям восстановления иммунной системы после стрессорного воздействия.
В рамках разработки аппаратно-диагностического комплекса созданы тест-системы и проведена работа по изучению частот 11 SNP-маркеров и 34 аллелей HLA класса II у лиц без известной истории облучения (как здоровых, так и с патологией), а также у лиц, проживающих на радиоактивно-загрязненных территориях (табл. 7.1).
Таблица 7.1. SNP-маркеры, включенные в исследование генетических основ индивидуальной реакции организма на радиационное воздействие
Маркер | Ген | Функция или установленная ассоциация |
---|---|---|
rs1801516 |
ATM |
Репарация ДНК, клеточный цикл |
rs664677 |
ATM |
Репарация ДНК, клеточный цикл |
rs1800469 |
TGFB1 |
Репарация ДНК, апоптоз |
rs1799782 |
XRCC1 |
Репарация ДНК |
rs1052133 |
OGG1 |
Репарация ДНК |
rs2717536 |
IL7 |
Иммунный ответ |
rs2296135 |
IL15RA |
Иммунный ответ |
rs9642880 |
8q24 |
Ассоциация с онкозаболеваниями |
rs6983267 |
8q24 |
Ассоциация с онкозаболеваниями |
rs1447295 |
8q24 |
Ассоциация с онкозаболеваниями |
rs13281615 |
8q24 |
Ассоциация с онкозаболеваниями |
В исследование по установлению генетических основ развития отсроченных эффектов хронического радиационного воздействия были включены кандидатные маркеры, расположенные в четырех генах систем контроля клеточного цикла и репарации ДНК: ATM (2 маркера), TGFB1, XRCC1 и OGG1 [3].
Серин-протеиновая киназа ATM (Ataxia Telangiectasia Mutated) принимает участие в фосфорилировании белков репарации ДНК, регуляции механизма апоптоза в ответ на формирование двухцепочечных разрывов ДНК, а также в стабилизации супрессорного опухолевого белка p53. Трансформирующий фактор роста TGFB1 вовлечен в ответ клетки на стрессорное воздействие (цитотоксические препараты, ионизирующее излучение, температурный шок, окислительный стресс), а также является медиатором системы передачи сигнала между компонентами врожденного и приобретенного иммунитета. Оба гена являются важными компонентами систем репарации ДНК и регуляции клеточного цикла, нарушения в которых связаны с процессом канцерогенеза. Гены XRCC1 и OGG1 кодируют тесно связанные продукты, регулирующие процесс гомологичной рекомбинации и репарации одноцепочечных разрывов ДНК.
Для установления ассоциации вариантов генов иммунного ответа с формированием фенотипа, характеризуемого повышенной устойчивостью к радиационному воздействию, сотрудниками Института иммунологии были определены частоты аллелей генов IL-7 (rs2717536), IL15-RA (rs2296135), а также 34 аллелей HLA-DRB1, DQA1 и DQB1. Кроме того, в панель было включено несколько маркеров, связанных с повышенным риском развития злокачественных новообразований по результатам GWAS (www.genome.gov/gwastudies) [5, 32]. Этот подход основан на статистической оценке ассоциации генотипа с фенотипическим признаком без учета экспериментальных данных. Для 4 исследованных маркеров из региона 8q24 на 8-й хромосоме ранее была установлена ассоциация с раком простаты, прямой кишки и молочной железы [9, 17, 26, 31].
7.2. Определение генетических маркеров, перспективных для оценки индивидуальной радиочувствительности
Совместно с ФГБУН «Уральский научно-практический центр радиационной медицины» ФМБА России (УНПЦ РМ ФМБА России) (г. Челябинск) было обследовано взрослое население из когорты реки Теча, здоровье которых на момент исследования можно охарактеризовать как соответствующее возрастной норме. Когорта сформирована специалистами УНПЦ РМ ФМБА России на основании проспективного медицинского и радиобиологического обследования лиц, проживающих на радиоактивно загрязненных территориях [2]. В отношении когорты реки Теча можно говорить о тенденции к повышению встречаемости онкологических заболеваний по сравнению с популяционными данными и повышенной долей онкологических заболеваний в структуре смертности [18, 19]. Таким образом, большая часть людей, предрасположенных к развитию патологии, к настоящему моменту ушли из жизни, и среди условно здоровых лиц в пределах обследуемой когорты частота маркеров предрасположенности к радиационно-индуцированным нарушениям (в том числе и к онкопатологии) уменьшилась. Собрав контрольные группы, сотрудники Института иммунологии провели классическое клинико-статистическое исследование, целью которого было установление отличий в распределении выбранных маркеров.
В качестве биологического материала использовали коллекцию периферической крови (220 образцов), предоставленную Институтом иммунологии и УНПЦ РМ ФМБА России. Первую группу (группа 1) составили 70 образцов геномной ДНК из коллекции УНПЦ РМ ФМБА России (г. Челябинск), полученных от неродственных пациентов - жителей прибрежных сёл р. Теча, подвергшихся длительному комбинированному облучению: внешнему γ- и внутреннему, обусловленному инкорпорацией 90Sr в костную ткань. Радиационное облучение стало результатом регламентных и аварийных сбросов жидких радиоактивных отходов радиохимического производства в реку Теча. В исследование были включены образцы, полученные от индивидуумов, рожденных до 1951 г., когда произошел один из наиболее крупных сбросов радиоактивных отходов, определивший чрезвычайно высокие мощности дозы облучения [2].
В исследованной группе показатель медианы накопленной дозы на красный костный мозг составил 1,23 Зв. Выборка включала представителей русской популяции, а также объединенной группы татарской и башкирской популяций тюркской ветви алтайской языковой семьи (19 и 51 человек соответственно) 1933-1949 годов рождения. Обследованные лица не имели серьезной соматической патологии.
Вторую группу (группа 2) составили пациенты с клиническими признаками соматической патологии (50 человек), возраста 58-64 года, в том числе подвергшиеся профессионально-ассоциированному облучению. Образцы были предоставлены Институтом иммунологии и Российским онкологическим научным центром им. Н.Н. Блохина РАМН (РОНЦ им. Н.Н. Блохина РАМН) [3, 6].
В третью группу (группа 3) вошли образцы ДНК, полученные от 100 здоровых представителей русской популяции - доноров крови из коллекции Института иммунологии, собранной на базе ФГБУ Российского научного центра хирургии им. акад. Б.В. Петровского РАМН. В состав группы вошли индивидуумы возраста 55-63 года, проживающие на территории Центрального, Волжского, Уральского и Северо-Западного федеральных округов РФ.
В основу исследования легли подтвержденные независимыми исследованиями данные о влиянии наследуемых факторов на риск развития онкопатологий в условиях хронического радиационного воздействия [10, 13, 24, 21]. Новизна предлагаемого подхода заключается в первую очередь в том, что до сих пор модели оценки риска радиационно-индуцированных осложнений учитывали лишь изменения в организме, произошедшие после облучения. Реализованный подход, помимо возможности прогнозирования негативных эффектов еще до облучения, создает принципиально новую возможность учета фактора индивидуальной изменчивости при оценке риска [3, 7]. Применение этих данных поможет оценить безопасность и целесообразность контактов с источниками радиации лиц, генетически предрасположенных к развитию радиационно-индуцированных осложнений, а также снизить заболеваемость в профессиональных областях, требующих длительного присутствия человека в условиях повышенной радиации.
Из 45 исследованных генетических маркеров для пяти (rs1801516, rs664677, rs1052133, rs1799782 и HLA-DRB1*11) в сравниваемых группах установлены различия в распределении (рис. 7.1, см. цв. вклейку) [5].
Минорный аллель T варианта Asp1853Asn гена ATM (rs1801516) встречается в группе 1 реже, чем в группе популяционного контроля (группа 3). В то же время частота минорного аллеля T варианта IVS22-77 (rs664677) того же гена в группе 1 выше, чем в группе популяционного контроля.
Еще одно отличие было обнаружено для минорного аллеля G варианта Ser326Cys, расположенного в 326 кодоне гена OGG1 (rs1052133). Наличие протективного эффекта для этого маркера описывалось ранее [1].
В группе 2 установлено единственное отличие в распределении аллеля А гена XRCC1 (rs1799782). Частота аллеля А в данной группе достоверно ниже, чем в двух других исследованных группах. Этот результат подтверждает установленную ранее ассоциацию маркера rs1799782 с онкозаболеваниями [14, 27]. Интересно то, что связь с онкозаболеваниями для большинства генетических маркеров, включенных в анализ, на данном этапе исследования не нашла подтверждения. В частности, в их число попали все SNP, ассоциация которых с различными типами злокачественных новообразований была установлена в нескольких независимых геномных ассоциативных исследованиях.
По всей видимости, это косвенно подтверждает гипотезу об эффекте «дозы гена» в развитии онкоассоциированных патологий. Иными словами, большая часть популяции является носителями мутаций, определяющих незначительное повышение риска развития онкопатологий, при этом сама патология развивается только в том случае, если число определенных мутаций превышает некое пороговое значение [5].
Из 34 аллелей HLA класса II единственная достоверная ассоциация с признаком устойчивости к радиационному воздействию установлена для группы аллелей HLA-DRB1*11 (рис. 7.1, см. цв. вклейку). Помимо этого установлены группы аллелей в генах HLA-DRB1 и HLA-DQB1, перспективные для дальнейшего исследования в более широких группах. Данные по распределению аллелей HLA класса II в группах индивидуумов с повышенной/пониженной устойчивостью к радиации получены впервые. Результаты настоящей работы открывают новые представления о роли молекул главного комплекса гистосовместимости в радиационной генетике. Результаты анализа позволяют говорить о влиянии генетического фактора на формирование индивидуальной радиочувствительности. Отличия в распределении маркеров, расположенных в генах репарации ДНК, подтверждают принципиальную роль компонентов этой системы в ответе тканей на радиационное воздействие. Наличие достоверных отличий даже на уровне десятков образцов определяет целесообразность дальнейших исследований.
Таким образом, полученные результаты имеют большое значение для развития фундаментальных и прикладных аспектов иммунологии, медицины и молекулярной биологии. Их значимость обусловлена созданием новых возможностей в объективизации процедуры медицинского обследования облученных лиц и подбора персонала объектов атомно-промышленного комплекса, а также важностью оценки радиационных рисков и создания научной базы для радиационного нормирования в диапазоне малых доз и малых мощностей доз. Данные могут быть использованы при создании новых средств и подходов к защите человека от вредных воздействий, разработке комплекса мер по снижению заболеваемости радиационно-ассоциированными заболеваниями и повышению биобезопасности.
Разработанный аппаратно-диагностический комплекс составил методологическую основу для изучения иммунного статуса и предрасположенности к развитию социально-значимых заболеваний у контингентов, задействованных в ликвидации последствий радиационных аварий, и населения радиоактивно загрязненных территорий. Универсальность комплекса определяется возможностью проведения широкого спектра биомедицинских исследований, в том числе:
-
генотипирования для подбора пар донор-реципиент при пересадке органов;
-
выявления генетически обусловленной устойчивочти или/и предрасположенности к различным заболеваниям;
-
определения возбудителей наиболее значимых инфекционных заболеваний;
-
исследования функциональной активности синтеза наиболее значимых регуляторных белков иммунной системы.
Комплекс этих методов позволяет получать всестороннюю информацию о генетических особенностях исследуемого объекта, активности генов иммунной системы и функциональном состоянии противоинфекционного иммунитета. Данный подход представляется перспективным как с точки зрения реализации фундаментальных научных исследований, так и для практического здравоохранения. Особое значение имеет его ориентация на отечественную технологическую и приборную базу, что позволяет эффективно решать вопрос импортозамещения в области высокотехнологичной продукции научного и медицинского назначения.
Новые технологии и методы, основанные на отечественном детектирующем оборудовании с повышенными пропускными характеристиками, позволяют эффективно решить проблему доукомплектования профильных медицинских учреждений и внедрения молекулярно-генетических методов в медицинскую практику, не прибегая к закупкам дорогостоящего импортного оборудования. Разработанные методы могут быть использованы в широкой медицинской практике при иммунологическом и генетическом консультировании пациентов, а также в профильных медицинских учреждениях для оценки риска развития осложнений терапевтического радиационного воздействия. Созданные сертифицированные реагенты и приборы позволили усовершенствовать технологии ПЦР-РВ, повысить эффективность данного метода и нашли широкое применение как в прикладных, так и в фундаментальных исследованиях, выполняемых в научно-исследовательских и клинических учреждениях как в России, так и за рубежом. Простота постановки и доступность для использования разработанных Институтом иммунологии совместно с компанией НПО «ДНК-Технология» приборов, специализированных лабораторий и тест-систем вывела Россию уже в конце 1990 - начале 2000-х годов на второе место в мире по количеству выполняемых ПЦР-анализов.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ И ИНТЕРНЕТ-ИСТОЧНИКОВ
-
Агеева А.М., Гонгарик О.О., Межерицкий С.А., Литвяков Н.В. Полиморфизм генов репарации в развитии злокачественных новообразований на фоне низкоинтенсивного облучения // Сибирский онкологический журнал. - 2010, Приложение № 1. - С. 11-13.
-
Аклеев А.В. Хронический лучевой синдром у жителей прибрежных сел реки Теча. - Челябинск: Книга, 2012. - 464 с.
-
Кофиади И.А. Иммуногенотипирование и генодиагностика в биомедицине: фундаментальные и прикладные аспекты // Автореф. дис. … д-ра биол. наук. - М., 2013. - 47 с.
-
Пелевина И.И., Николаев В.А., Готлиб В.И., Афанасьев Г.Г., Козлова Л.Е., Серебряный A.M. и др. Адаптивная реакция лимфоцитов крови людей, подвергшихся хроническому воздействию радиации в малых дозах // Радиационная биология. Радиоэкология. - 1994. - Т. 34, № 6. - Р. 805-17.
-
Уткин К.В. Поиск генетических полиморфизмов, ассоциированных с биологической устойчивостью организма к радиационному воздействию // Автореф. дис. .канд. мед. наук. - М., 2012. - 24 с.
-
Уткин К.В., Батенева Е.И., Абрамов Д.Д., Аклеев А.В., Кофиади И.А., Трофимов Д.Ю., Алексеев Л.П. Возможности применения молекулярно-генетических технологий для решения задач радиационной иммуногенетики //Физиология и патология иммунной системы. Иммунофармогеномика. - 2013. - Т. 17, № 3. - С. 3-13.
-
Хаитов Р.М., Алексеев Л.П., Аклеев А.В., Трофимов Д.Ю., Кофиади И.А. Поиск иммуногенетических полиморфизмов, ассоциированных с чувствительностью к радиационному воздействию - путь к повышению биобезопасности государства // Физиология и патология иммунной системы. Иммунофармакогеномика. - 2012. - Т. 16. - № 10. - С. 3-15.
-
Элленхорн М.Дж. Медицинская токсикология: диагностика и лечение отравлений у человека. В 2-х томах, Т. 1. - М.: Медицина, 2003. - 1048 с.
-
Ghoussaini M., Song H., Koessler T., Al Olama A.A., Kote-Jarai Z., Driver K.E. et al. Multiple loci with different cancer specificities within the 8q24 gene desert // Journal of the National Cancer Institute. - 2008. - Vol. 100, № 13. - Р. 962-6.
-
Gonzalez-Vasconcellos I., Domke T., Kuosaite V., Esposito I., Sanli-Bonazzi B., Nathrath M. et al. Differential effects of genes of the Rb1 signalling pathway on osteosarcoma incidence and latency in alpha-particle irradiated mice // Radiation and environmental biophysics. - 2011. - Vol. 50, № 1. - Р. 135-41.
-
Hanayama R., Tanaka M., Miwa K., Shinohara A., Iwamatsu A., Nagata S. Identification of a factor that links apoptotic cells to phagocytes // Nature. - 2002. - Vol. 417, № 6885. - Р. 182-7.
-
Health Risks from Exposure to Low Levels of Ionizing Radiation: BEIR VII Phase 2. Washington, DC: The National Academies Press, 2006.
-
Hosking F.J., Feldman D., Bruchim R., Olver B., Lloyd A., Vijayakrishnan J. et al. Search for inherited susceptibility to radiation-associated meningioma by genomewide SNP linkage disequilibrium mapping // British journal of cancer. - 2011. - Vol. 104, № 6. - Р. 1049-54.
-
Hu Z., Ma H., Lu D., Zhou J, Chen Y., Xu L. et al. A promoter polymorphism (-77T>C) of DNA repair gene XRCC1 is associated with risk of lung cancer in relation to tobacco smoking // Pharmacogenetics and genomics. - 2005. - Vol. 15, № 7. - Р. 457-63.
-
Hulsmeyer M., Hillig R.C., Volz A., Ruhl M., Schroder W., Saenger W. et al. HLA-B27 subtypes differentially associated with disease exhibit subtle structural alterations // The Journal of biological chemistry. - 2002. - Vol. 277, № 49. - Р. 7844-53.
-
Ichimaru M., Ishimaru T. Review of thirty years study of Hiroshima and Nagasaki atomic bomb survivors. II. Biological effects. D. Leukemia and related disorders // Journal of radiation research. - 1975. - Vol. 16, Suppl. - Р. 89-96.
-
Kiemeney L.A., Thorlacius S., Sulem P., Geller F., Aben K.K., Stacey S.N. et al. Sequence variant on 8q24 confers susceptibility to urinary bladder cancer // Nature genetics. - 2008. - Vol. 40, № 11. - Р. 1307-12.
-
Krestinina L.Y., Preston D.L., Ostroumova E.V., Degteva M.O., Ron E., Vyushkova O.V. et al. Protracted radiation exposure and cancer mortality in the Techa River Cohort // Radiation research. - 2005. - Vol. 164, № 5. - Р. 602-11.
-
Krestinina L.Y., Davis F., Ostroumova E., Epifanova S., Degteva M., Preston D. et al. Solid cancer incidence and low-dose-rate radiation exposures in the Techa River cohort: 1956-2002 // International journal of epidemiology. - 2007. - Vol. 36, № 5. - Р. 1038-46.
-
Kyoizumi S., Umeki S., Akiyama M., Hirai Y., Kusunoki Y., Nakamura N. et al. Frequency of mutant T lymphocytes defective in the expression of the T-cell antigen receptor gene among radiation-exposed people // Mutation research. - 1992. - Vol. 265, № 2. - Р. 173-80.
-
Lichtenstein P., Holm N.V., Verkasalo P.K., Iliadou A., Kaprio J., Koskenvuo M. et al. Environmental and heritable factors in the causation of cancer—analyses of cohorts of twins from Sweden, Denmark, and Finland // The New England journal of medicine. - 2000. - Vol. 343, № 2. - Р. 78-85.
-
Little M.P., Wakeford R., Tawn E.J., Bouffler S.D., Berrington de Gonzalez A. Risks associated with low doses and low dose rates of ionizing radiation: why linearity may be (almost) the best we can do // Radiology. - 2009. - Vol. 251, № 1. - Р. 6-12.
-
Lodolce J.P., Boone D.L., Chai S., Swain R.E., Dassopoulos T., Trettin S. et al. IL-15 receptor maintains lymphoid homeostasis by supporting lymphocyte homing and proliferation // Immunity. - 1998. - Vol. 9, № 5. - Р. 669-76.
-
Newhauser W.D., Durante M. Assessing the risk of second malignancies after modern radiotherapy // Nature reviews Cancer. - 2011. - Vol. 11, № 6. - Р. 438-48.
-
Odaka C., Mizuochi T. Macrophages are involved in DNA degradation of apoptotic cells in murine thymus after administration of hydrocortisone // Cell death and differentiation. - 2002. - Vol. 9, № 2. - Р. 104-12.
-
Pomerantz M.M., Ahmadiyeh N., Jia L., Herman P., Verzi M.P., Doddapaneni H. et al. The 8q24 cancer risk variant rs6983267 shows long-range interaction with MYC in colorectal cancer // Nature genetics. - 2009. - Vol. 41, № 8. - Р. 882-4.
-
Pratesi N., Mangoni M., Mancini I., Paiar F., Simi L., Livi L. et al. Association between single nucleotide polymorphisms in the XRCC1 and RAD51 genes and clinical radiosensitivity in head and neck cancer // Radiotherapy and oncology: journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology. - 2011. - Vol. 99, № 3. - Р. 356-61.
-
Sankaranarayanan K. Ionizing radiation and genetic risks. III. Nature of spontaneous and radiation-induced mutations in mammalian in vitro systems and mechanisms of induction of mutations by radiation // Mutation research. - 1991. - Vol. 258, № 1. - Р. 5-97.
-
Stewart-Jones G.B., Simpson P., van der Merwe P.A., Easterbrook P., McMichael A.J., Rowland-Jones S.L. et al. Structural features underlying T-cell receptor sensitivity to concealed MHC class I micropolymorphisms // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2012. - Vol. 109, № 50. - Р. E3483- 92.
-
Tan J.T., Ernst B., Kieper W.C., LeRoy E., Sprent J., Surh C.D. Interleukin (IL)-15 and IL-7 jointly regulate homeostatic proliferation of memory phenotype CD8+ cells but are not required for memory phenotype CD4+ cells // The Journal of experimental medicine. - 2002. - Vol. 195, № 12. - Р. 1523-32.
-
Yeager M., Orr N., Hayes R.B., Jacobs K.B., Kraft P., Wacholder S. et al. Genome-wide association study of prostate cancer identifies a second risk locus at 8q24 // Nature genetics. - 2007. - Vol. 39, № 5. - Р. 645-9.
Глава 8. Иммуногеномика и генодиагностика
Представленный в предыдущих главах материал свидетельствует о том, что толчком для развития иммуногенетики человека был переход на молекулярно-генетический уровень исследований. В свою очередь, это стало возможным благодаря открытию полимеразной цепной реакции (ПЦР).
Вместе с тем это открытие, в последующие годы давшее начало современной иммуногенетике, стало основой для развития такого важнейшего направления биомедицины, как генодиагностика, которое к настоящему времени в значительной степени вытеснило классическую иммунодиагностику. Последнее обусловлено целым рядом важных для практического здравоохранения преимуществ генодиагностики, а именно: более высокой чувствительностью, экспрессностью и биобезопасностью, связанной с отсутствием необходимости использования нативного (зачастую опасного) биоматериала. При этом следует напомнить, что, например, время получения результатов исследования измеряется часами, в то время как классическая иммунодиагностика зачастую требует нескольких суток (например, при культивировании возбудителей инфекций). Однако важным преимуществом иммунодиагностики является более низкая (особенно при использовании отечественной аппаратуры и реагентов) себестоимость. Но со временем именно генодиагностика может успешно заменить иммунодиагностику не только в крупных клиниках и больницах, но и в районных поликлиниках. Основой этого является то, что в данной области высоких технологий, используемых в практической медицине, лучшие образцы отечественного оборудования и реагентов полностью соответствуют международным стандартам.
Именно поэтому мы сочли целесообразным подробно ознакомить читателя с технологиями постановки и оценки результатов прикладной генодиагностики, объединенными в рамках создания единой инновационной технологической платформы.
В данной работе под инновационной технологической платформой понимается совокупность теоретических знаний, лабораторных методов и производственных технологий, позволяющая в короткие сроки решать фундаментальные и прикладные задачи современной иммуногенетики, связанные с использованием полимеразной цепной реакции с регистрацией продуктов реакции в режиме реального времени (ПЦР в реальном времени).
Условно можно выделить два уровня, составляющих платформу, - базовый и прикладной (рис. 8.1, см. цв. вклейку). Базовый уровень представлен согласованным комплексом специального оборудования, программного обеспечения и молекулярно-биологических компонентов и технологий. Прикладной - это технологии реализации трех основных аспектов, характеризующих здоровье человека и иммунную систему, в частности: генетические особенности (генотип), профиль экспрессии генов (текущее состояние, или фенотип) и взаимодействие организма с микробиологическим и вирусным окружением (нормофлора, патогенные и условно-патогенные инфекционные агенты).
Принципиальным моментом в данной работе является использование ключевых компонентов и оборудования отечественного производства, что делает разработанную технологическую платформу максимально независимой от зарубежных производителей.
8.1. Базовый уровень технологической платформы
8.1.1. ОБОРУДОВАНИЕ
Основным специальным прибором, необходимым для проведения ПЦР в реальном времени, является детектирующий термоциклер (амплификатор). Этот прибор представляет собой комбинацию программируемого термоциклера, обеспечивающего циклический температурный режим ПЦР, и флуоресцентного детектора, позволяющего измерять уровень флуоресценции в реакционных пробирках во время реакции. В ходе выполнения данной работы осуществлялось тесное взаимодействие с компанией ЗАО «НПФ ДНК-Технология» (далее «ДНК-Технология») при разработке серии приборов для постановки ПЦР в реальном времени «ДТ-322» (рис. 8.2, а, см. цв. вклейку) и «ДТ-96» (рис. 8.2, б, см. цв. вклейку). Детектирующий термоциклер «ДТ-96» стал первым серийно выпускаемым и зарегистрированным в МЗ РФ 96-луночным прибором для проведения ПЦР в реальном времени (регистрационное удостоверение № ФСР 2007/01250).
По всем основным характеристикам «ДТ-96» не уступает зарубежным аналогам. Сравнение «ДТ-96» с наиболее распространенными зарубежными моделями приборов для постановки ПЦР в реальном времени приведено в табл. 8.1.
Таблица 8.1. Сравнение технических характеристик «ДТ-96» с зарубежными аналогами
Технические характеристики | ДТ-96 «ДНК-Технология» | Rotor-Gene 6000 «Corbett Research» | IQ5 ICycler «Bio-Rad Laboratories» | ABI Prism 7500 «Арplied Biosystems» |
---|---|---|---|---|
Формат термоблока |
Планшетный: 96 пробирок по 0,2 мл, стрипы 8 по 0,2 мл, планшет 12x8 |
Роторный: 36x0,2 мл; 72x0,1 мл; 100x0,03 мл; стрипы 0,1 мл по 4 шт. |
Планшетный: 96 пробирок по 0,2 мл, стрипы 8 по 0,2 мл, планшет 12x8 |
Планшетный: 96 пробирок по 0,2 мл, стрипы 8 по 0,2 мл, планшет 12x8 |
Возможность независимой от компьютера работы после начала амплификации |
Есть |
Нет |
Нет |
Нет |
Наличие встроенной памяти |
Есть |
Нет |
Нет |
Нет |
Диапазон температур термоблока |
4-99°С |
25-99°С |
4-100°С |
4-99,9°С |
Наличие градиента в 2 направлениях (вертикальном и горизонтальном) по термоблоку |
Есть |
Нет |
Нет |
Нет |
Количество каналов детекции |
4 или 5 |
6 |
5 |
5 (1 канал - всегда референсный) |
Источник возбуждения флуоресценции |
Светодиоды |
Светодиоды |
Вольфрам-галогеновая лампа |
Вольфрам-галогеновая лампа |
Программное обеспечение (ПО) |
Русскоязычное |
Англоязычное, русифицированная версия |
Англоязычное, русифицированная версия |
Англоязычное |
Файлы загрузки параметров (в том числе и программ) амплификации различных тестов |
Есть |
Нет |
Нет |
Нет |
Предоставление полученных результатов в удобном для врача-клинициста виде |
Да |
Нет |
Нет |
Нет |
Подача образцов |
Автоматический привод термоблока |
Ручная загрузка |
Ручная загрузка |
Ручная загрузка |
Возможность подключения нескольких приборов к одному компьютеру |
Есть |
Нет |
Нет |
Нет |
К особенностям прибора можно отнести: а) полную адаптацию к российским условиям, включая русскоязычный интерфейс и соответствие параметрам российских электрических сетей; б) возможность интеграции в автоматизированные комплексы; в) реализацию температурного градиента по двум направлениям термоблока; г) вариант комплектации секционированным термоблоком, позволяющим одновременно проводить реакции с разными температурными параметрами. Другие отличительные черты и преимущества «ДТ-96» приведены в табл. 8.2.
Таблица 8.2. Особенности и преимущества «ДТ-96»
Особенность | Преимущества |
---|---|
Возможность независимой от компьютера работы после начала амплификации |
Сбои или отключения компьютера не влияют на работу «ДТ-96» |
Наличие встроенной памяти |
При сбоях в электросети прибор продолжает работу с момента отключения, при этом результаты сохраняются в памяти и могут быть считаны в любое время до начала следующей амплификации |
Диапазон температур термоблока: 4-99°С |
Возможность программирования температуры хранения ниже комнатной (например, +10°С) позволяет оставлять пробирки в приборе на длительное время после окончания амплификации (на ночь). Диапазон температур от 4 до 25°С значительно расширяет возможности работы в молекулярно-генетических лабораториях |
Наличие градиента в 2 направлениях (вертикальном и горизонтальном) по термоблоку |
Двунаправленный градиент позволяет значительно улучшить линейность температурных характеристик при оптимизации режима амплификации |
Светодиодный источник возбуждения флуоресценции |
Время жизни светодиодов около 100000 ч, что значительно больше, чем при использовании других технологий |
Русскоязычное программное обеспечение |
Русскоязычное ПО адаптировано для клинических лабораторий. Вся необходимая обработка результатов проводится прибором внутри самой программы. Результаты представлены в удобной для врача-клинициста форме. Интуитивно понятный программный интерфейс |
Файлы загрузки параметров амплификации различных тестов |
Значительно сокращает число ошибок при вводе сложных программ амплификации (таких, как «Фемофлор») |
Автоматический привод термоблока |
Наличие автоматического привода термоблока позволяет в перспективе вести работу по совместимости прибора со станциями по раскапыванию реагентов |
Большой цветной дисплей |
Цветной графический дисплей обеспечивает удобный оперативный доступ ко всей необходимой информации о ходе процесса |
Эргономичный дизайн |
Форм-фактор корпуса прибора позволяет оптимально использовать рабочее место на столе, особенно при одновременном использовании нескольких приборов, и обеспечивает удобную работу с прибором |
Возможность подключения нескольких приборов к одному ПК |
Не требует дополнительных затрат на покупку нескольких компьютеров и экономит место на рабочем столе |
Вся экспериментальная часть работы, связанная с постановкой ПЦР в реальном времени, осуществлялась на амплификаторах «ДТ-96» и «ДТ-322».
8.1.2. ПРОГРАММНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
При разработке программного обеспечения приборов серии «ДТ» учитывалась двухуровневая организация технологической платформы, в связи с чем программа реализована в виде двух различных взаимосвязанных приложений - «Работа с прибором» и «Анализ» (рис. 8.3, а и б соответственно, см. цв. вклейку).
Приложение «Работа с прибором» обеспечивает все базовые функции, необходимые для управления прибором и постановки ПЦР в реальном времени, включая определение циклического температурного профиля реакции, время и аппаратные параметры измерения флуоресценции, формирование протокола, содержащего информацию о проводимом исследовании, в том числе о расположении пробирок в термоблоке, об используемых флуорофорах, о виде тестов и т.д. Кроме того, в рамках этого приложения реализованы функции диагностики и сервисного обслуживания прибора.
Модуль «Анализ» соответствует прикладному уровню технологической платформы и обеспечивает математическую обработку и анализ полученных экспериментальных данных в соответствии с решаемой прикладной задачей. Реализация модуля «Анализ» в виде отдельного приложения позволяет одновременно проводить обработку нескольких экспериментальных протоколов, в том числе последнего и ранее поставленных из архива.
Другой особенностью разработанного программного обеспечения является организация различных типов анализа в виде пополняемой библиотеки. Это особенно удобно при разработке новых видов исследований и в комбинировании различных подходов к изучению биоматериала. Так, например, в рамках данной работы были разработаны и реализованы алгоритмы обработки данных для анализа генетических полиморфизмов (SNP) по кривым плавления, типирования генов локуса HLA-DRB1 по значению характеристических циклов (Cp) группоспецифичных реакций, специализированный анализ качественного и количественного состава биоценоза урогенитального тракта женщин.
Для облегчения понимания представленного далее материала приводим параметры, используемые для описания ПЦР в реальном времени.
Ср - значение характеристического цикла амплификации, автоматически определяемое детектирующим термоциклером.
Эффективность амплификации (Е) - величина, характеризующая увеличение количества специфичных продуктов реакции на каждом цикле. Теоретически на каждом цикле происходит удвоение ДНК, т.е. Е = 2. На практике эффективность амплификации определяется экспериментально по формуле:

где slope - разница в значениях Cp
при 10-кратном разведении образца (коэффициент уравнения линейной зависимости Ср от десятичного логарифма концентрации матрицы). Е может быть также выражена в процентах по формуле:

Уровень экспрессии мРНК исследуемого гена Х относительно мРНК нормировочного гена N определяли по формуле:

где ЕN EX - эффективности амплификации нормировочного и исследуемого генов; CpN, CpX - значения пороговых циклов реакции амплификации нормировочного и исследуемого генов.
Оценку корректности использования нормировочных генов определяли, анализируя значения ΔCp между парами различных нормировочных генов:

где Cp1 и Cp2 - значения индикаторных циклов для генов 1 и 2.
Фактор нормализации NF (Normalization Factor) определяли по формуле:

где E - эффективность амплификации; Cpmin - значение индикаторного цикла для образца из всей выборки с наиболее высоким уровнем экспрессии мРНК нормировочного гена; Cp - значение индикаторного цикла для исследуемого образца.
Для оценки динамики изменения уровня экспрессии генов использовали отношение R:

где [Xi]/[Ni] - относительный уровень экспрессии исследуемого гена в момент времени i; [Xf]/[Nf] - фоновое значение относительного уровня экспрессии исследуемого гена.
Альтернативный метод вычисления R без применения нормировочных генов:

где Cpf - фоновое значение индикаторного цикла для исследуемого гена; Cpi - значение индикаторного цикла в момент времени i.
Комплекс параметров «Тест»
При разработке учитывалось, что технологическая платформа должна отвечать требованиям как научных, так и медицинских диагностических лабораторий. В то же время в ряде случаев эти требования являются прямо противоположными. В частности, для решения научных задач широкому кругу сотрудников лаборатории необходимо иметь доступ к максимальному спектру различных параметров настройки прибора и анализа данных, в то время как в диагностических лабораториях все параметры исследований должны быть строго детерминированы, а работа с прибором максимально упрощена.
Данное противоречие было успешно преодолено в программном обеспечении приборов серии «ДТ». Это удалось сделать благодаря впервые реализованному подходу, основанному на понятии «Тест» (рис. 8.4, см. цв. вклейку).
Под «тестом» понимается полный комплекс пользовательских настроек, относящийся к конкретному виду исследования и состоящий из блока связанных с функционированием прибора аппаратных параметров, программы амплификации, конфигурации исследования (наличие контрольных образцов, стандартов и т.д.), типа и параметров анализа данных, а также ряда других настроек (табл. 8.3).
Таблица 8.3. Комплекс параметров, входящих в состав «Теста»
№ | Описание параметров |
---|---|
1 |
Наименование теста |
2 |
Описание (комментарии) |
3 |
Тип анализа (качественный, количественный со стандартами, относительный количественный, анализ полиморфизмов по кривым плавления, биоценоз и др.) |
4 |
Метод вычисления характеристического цикла (пороговый, геометрический) |
5 |
Формат протокола (тип пробирок, значения стандартов, количество контролей и т.д.) |
6 |
Объем реакционной смеси |
7 |
Используемые флуорофоры и назначение соответствующих сигналов |
8 |
Программа амплификации |
9 |
Дополнительные настройки, связанные с конкретным видом анализа |
10 |
Блок параметров обработки исходных оптических данных (параметры фитирования, нормировки и др.) |
Таким образом, при создании и редактировании «Теста» существует возможность максимально гибко изменять широкий спектр параметров исследования, в то время как при использовании стандартных, созданных ранее «тестов» требуется лишь выбрать наименование теста и количество анализируемых пробирок.
Совместное хранение аппаратных настроек и параметров конкретного прикладного исследования крайне важно в ситуации, когда в лаборатории проводятся несколько различных видов ПЦР-исследований и/или работает несколько сотрудников, каждый из которых решает свои задачи. Независимо от того, как был настроен прибор при предыдущем запуске, при выборе «теста» автоматически загружаются все корректные настройки. Кроме того, «тесты» могут быть сохранены в виде файла и переданы новым пользователям при инсталляции прибора или позднее в электронном виде, что очень удобно в условиях медицинских диагностических лабораторий.
Алгоритмы анализа исходных данных - метод delta-TF нормировки
Получаемые с помощью детектирующих ПЦР-амплификаторов исходные (необработанные) данные об изменении флуоресценции во время реакции содержат не только информацию о накоплении фрагментов ДНК, но и вклад ряда внешних (не обусловленных исследуемым процессом, «небиологических») факторов, искажающих результаты эксперимента. На форму кривых влияют ошибки приготовления реакций, разброс оптических свойств пробирок, неоднородности оптической схемы детектирующих амплификаторов, шумы электроники и т.д. Для снижения влияния таких факторов на результаты исследования современные алгоритмы анализа графиков накопления ДНК включают в себя этап нормировки данных.
В ходе данной работы в рамках разработки алгоритмов анализа для программного обеспечения приборов серии «ДТ» предложен и апробирован новый эффективный способ исключения вклада «небиологических» факторов в результирующие кривые накопления фрагментов ДНК при проведении ПЦР в реальном времени - метод delta-TF. Метод основан на считывании флуоресценции реакционной смеси, содержащей флуоресцирующее вещество с выраженной зависимостью интенсивности флуоресценции от температуры, при двух разных температурах в ходе нескольких первых циклов ПЦР с последующим расчетом нормировочных коэффициентов по полученной разнице в интенсивности флуоресценции.
На рис. 8.5, а (см. цв. вклейку) приведен пример исходных (необработанных) графиков изменения интенсивности флуоресценции для двух идентичных реакций в одном эксперименте. Поскольку все компоненты реакционных смесей одинаковы, наблюдаемые различия обусловлены факторами «небиологической» природы, такими как погрешности приготовления и разнесения по отдельным пробиркам реакционной смеси, неоднородность температуры термоблока амплификатора, искажения оптического тракта прибора, разброс оптических параметров реакционных пробирок и т.д.
Для сравнения показанных на рис. 8.5, а (см. цв. вклейку) кривых обычно используют один из двух основных подходов к анализу результатов ПЦР в реальном времени: пороговый метод (определение значения порогового цикла реакции Ct как точки пересечения графика накопления ДНК и пороговой линии) или метод прямого сравнения кривых (определение значения некоторой характеристической точки Cp на графике накопления ДНК по форме кривой, например метод максимума второй производной). Оба подхода предполагают нахождение значения на оси абсцисс (дробного значения цикла реакции), характеризующего данную кривую (найденное значение обычно обозначают как Ct в случае пороговых методов или Cp для методов, использующих анализ формы кривой) [1]. Полученные значения используют далее при сопоставлении результатов ПЦР для разных образцов.
Следует отметить, что методы анализа формы кривой более устойчивы к вкладу «небиологических» факторов (разброс значений фоновой флуоресценции и диспропорция масштаба графиков накопления ДНК), однако в случае неэкспоненциальной амплификации и при низком уровне флуоресцентного сигнала они проигрывают методам Ct. Наиболее эффективным должен быть алгоритм, сочетающий в себе преимущества обеих методик, т.е. использующий пороговый метод после вычитания вклада «небиологических» факторов.
Чаще всего предварительная обработка кривых в методе Ct ограничивается вычитанием фоновой составляющей и приведением графиков к одному базовому уровню. Такое преобразование дает результат, показанный на рис. 8.5, б (см. цв. вклейку). В ряде случаев кривые умножают на нормировочный коэффициент, получаемый по флуоресценции дополнительного красителя (алгоритм компании «Applied Biosystems», США) или флуоресценции собственно реакционной смеси перед началом амплификации (алгоритм компании «Bio-Rad», США). Однако рассчитанный по единственному начальному значению флуоресценции нормировочный коэффициент не дает достаточно информации для корректного вычитания, зачастую приводя к еще большему искажению данных. Предлагаемый в данной работе метод позволяет получить адекватный нормировочный коэффициент при использовании не одного, а двух значений фоновой флуоресценции для каждой реакции.
Метод основан на том, что одно из находящихся в пробирке флуоресцирующих веществ должно обладать заметной зависимостью интенсивности флуоресценции от температуры. Разница в интенсивности флуоресценции содержимого одной пробирки при разных температурах позволяет выявить и скорректировать вклад неоднородностей «небиологической» природы в результирующую кривую.
На рис. 8.6 (см. цв. вклейку) показан пример графиков, полученных с использованием предлагаемой методики. На всех циклах реакции измерение уровня флуоресценции проводят при температуре T1. Для нескольких первых циклов (в примере - с 4-го по 13-й) выполняют дополнительные измерения при температуре Т2. Затем по полученным значениям T1 и T2 для каждой реакционной смеси (Ki) определяют калибровочный коэффициент по формуле:

где Fi(T2) и Fi(T1) - интенсивности флуоресцентного излучения вещества с выраженной зависимостью уровня флуоресценции от температуры (калибровочная проба) при температурах Т2 и Т1 в i-той реакционной смеси.
Нормализованную интенсивность флуоресцентного сигнала каждой реакционной смеси (Fi(n) норм) рассчитывают по формуле:

где Fi(n) - регистрируемая интенсивность флуоресцентного сигнала в i-той реакционной смеси для n-го цикла ПЦР, а Bi - интенсивность фонового сигнала (Bi(n) при использовании алгоритма, учитывающего линейное изменение фона).
На рис. 8.5, г (см. цв. вклейку) показан результат нормировки кривых по приведенному выше методу. Видно, что использование двухтемпературного считывания сигнала позволяет убрать разброс фоновой флуоресценции и диспропорцию масштаба графиков накопления ДНК для разных пробирок. На рисунке также показаны величины, используемые при расчете коэффициентов Ki и Fi(n) норм.
Эффективность предлагаемого метода можно проиллюстрировать на примере, в котором смоделирован разброс значений фоновой флуоресценции и диспропорцию масштаба графиков накопления ДНК (главные последствия влияния «небиологических» факторов). По 4 идентичных ПЦР были выполнены для трех образцов ДНК с концентрацией X, 0,1X и 0,01X. В качестве флуоресцирующего вещества с зависящей от температуры интенсивностью флуоресценции использовали пробу типа «молекулярный маячок» [19]. В ходе выполнения циклов ПЦР с 4-го по 13-й интенсивность флуоресценции определяли дважды на каждом цикле реакции при температурах 94 и 60°С (рис. 8.7, в, см. цв. вклейку).
Для возможности сравнения классического варианта нормировки и метода delta-TF из полученных данных программным способом исключили дополнительные измерения при температуре 94°С, получив, таким образом, классические графики накопления ДНК (рис. 8.7, а, см. цв. вклейку). Уровень фоновой флуоресценции определяли путем апроксимации прямой на основе измерений при температуре 60°С для циклов с 4-го по 13-й.
Результаты классической нормировки (путем вычитания фоновой составляющей из каждой кривой) и delta-TF нормировки представлены на рис. 8.7, б и г (см. цв. вклейку). Полученные данные наглядно демонстрируют преимущество метода delta-TF над обычным приведением графиков к одному базовому уровню за счет вычитания фоновой составляющей.
В табл. 8.4 приведены стандартные отклонения и коэффициенты вариации для трех разных способов анализа, приведенных на рис. 8.7, а-г (см. цв. вклейку) кривых: (1) порогового метода (Ct) после вычитания фоновой составляющей, (2) метода прямого сравнения кривых (Cp) после вычитания фоновой составляющей (использовали метод максимума второй производной) и (3) порогового метода (Ct) после delta-TF нормировки.
Таблица 8.4. Стандартные отклонения (Std) и коэффициенты вариации (Cv) для результатов эксперимента, приведенного на рис. 8.7 (см. цв. вклейку)
Концентрация ДНК | Измеряемая величина | Ct | Cp | Delta TF |
---|---|---|---|---|
X |
Ct (Cp) |
24,9 |
26 |
23,6 |
24,2 |
26,1 |
23,5 |
||
24,2 |
26 |
23,5 |
||
24,3 |
26,1 |
23,6 |
||
Std |
0,34 |
0,06 |
0,06 |
|
среднее |
24,4 |
26,05 |
23,55 |
|
Cv |
1,4% |
0,2% |
0,2% |
|
0,1X |
Ct (Cp) |
27,6 |
29,5 |
27,1 |
27,4 |
29,6 |
27,1 |
||
28 |
29,6 |
27,4 |
||
28,3 |
29,8 |
27,4 |
||
Std |
0,40 |
0,13 |
0,17 |
|
среднее |
27,825 |
29,625 |
27,25 |
|
Cv |
1,4% |
0,4% |
0,6% |
|
0,01X |
Ct (Cp) |
31,8 |
33,3 |
30,7 |
31,2 |
33,2 |
30,7 |
||
31,3 |
33,3 |
30,7 |
||
31 |
33 |
30,5 |
||
Std |
0,34 |
0,14 |
0,10 |
|
среднее |
31,325 |
33,2 |
30,65 |
|
Cv |
1,1% |
0,4% |
0,3% |
|
среднее Cv |
1,3% |
0,4% |
0,4% |
Приведенные в табл. 8.4 данные показывают, что для описанного примера метод delta-TF дает существенное улучшение точности исследования в сравнении со стандартным пороговым методом и демонстрирует сопоставимые результаты в сравнении с методом максимума второй производной.
Следует отметить, что сходство полученных результатов для метода delta-TF и метода прямого сравнения кривых вызвано особенностями приведенного примера (влияние «небиологических» факторов на фоне экспоненциальной амплификации и при сильном сигнале) и не отражает равной эффективности применения этих методов на практике. Предлагаемая методика более устойчива к воздействию искажающих факторов, совмещая в себе сильные стороны порогового метода (Ct) и методов анализа результатов по форме кривых (Cp).
8.1.3. МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ КОМПОНЕНТЫ
К ключевым молекулярно-биологическим компонентам, необходимым для реализации ПЦР в реальном времени, относятся: Taq-ДНК-полимераза, дезоксинуклеотидтрифосфаты (дНТФ), олигонуклеотидные праймеры и зонды, флуоресцентные красители (FAM, HEX) и гасители флуоресценции (Dabcyl, BHQ1). В данной работе все перечисленные компоненты - российского производства (табл. 8.5). Исследования по сравнению с зарубежными аналогами показали полное соответствие компонентов российского производства всем выдвигаемым требованиям.
Таблица 8.5. Состав базового уровня технологической платформы
Наименование | Фирма-производитель |
---|---|
Оборудование |
|
Детектирующие термоциклеры «ДТ-322», «ДТ-96» |
«ДНК-Технология», Москва |
Программное обеспечение |
|
Пакет программ к приборам серии ДТ версия v7.3.1 |
«ДНК-Технология», Москва |
Молекулярно-биологические компоненты |
|
Taq-ДНК-полимераза |
«ДНК-Технология», Москва |
Обратная транскриптаза M-MuLV |
ООО «СибЭнзим», г. Новосибирск |
дНТФ |
ООО «СибЭнзим», г. Новосибирск |
Олигонуклеотиды: праймеры и флуоресцентно-меченые зонды |
«ДНК-Технология», Москва |
Флуоресцентные красители, гасители: FAM, HEX, Dabcyl, BHQ1 |
Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Москва |
8.1.4. МАТЕРИАЛ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЙ ДНК И РНК
В качестве биоматериала для исследований использовали периферическую кровь, синовиальную жидкость, биоптаты тканей, урогенитальные мазки, а также эпителиальные соскобы со щеки.
В случаях, когда целью исследования являлось типирование генов главного комплекса гистосовместимости, а также определение SNP, ДНК выделяли из ядер лимфоцитов по методу Higuchi [7] с некоторыми модификациями. Метод основан на разрушении лимфоцитов с помощью лизирующего буфера, не влияющего на целостность мембран ядер лимфоцитов. После двух отмывок ядра разрушали буфером с протеиназой К при 37°С в течение 20 мин с последующей инактивацией фермента при 98°С. Полученные образцы ДНК сразу использовали для типирования либо хранили при -20°С. Концентрация ДНК, определенная на ДНК-минифлуориметре («Ноеfer», США), составляла в среднем 50-100 мкг/мл.
Для определения уровня экспрессии генов цитокинов и других генов иммунной системы выделяли РНК лимфоцитов, в том числе мононуклеарных клеток. Выделение лимфоцитов из цельной крови проводили путем центрифугирования в градиенте плотности фиколла-урографина (плотность 1,077 г/мл). Для выделения нуклеиновых кислот использовали наборы «Проба НК» («ДНК-Технология», Россия). Метод основан на лизисе клеток в 4 М растворе гуанидинтиоционата и осаждении нуклеиновых кислот изопропанолом в присутствии соосадителя с последующими отмывками этанолом и ацетоном. В случае выделения из образца большого объема (более 0,5 мл крови), а также из синовиальной жидкости использовали метод фенол-хлороформной экстракции [17].
При исследовании урогенитальных мазков в случае изучения биоценозов, а также определения патогенных микроорганизмов использовали наборы для выделения ДНК «Проба ГС» («ДНК-Технология», Россия). Метод основан на сорбции ДНК на органическом носителе, отмывке примесей с последующей элюцией нуклеиновых кислот с сорбента.
Выделение вирусных нуклеиновых кислот (вирусы гепатитов, иммунодефицита человека) проводили из плазмы крови после удаления из нее форменных элементов с помощью набора для выделения «Проба НК» («ДНК-Технология», Россия).
8.2. Прикладной уровень технологической платформы
Как было отмечено выше, прикладной уровень технологической платформы составляют технологии установления параметров, характеризующих здоровье человека и иммунную систему, в частности: генетические особенности (генотип), профиль экспрессии генов (текущее состояние, или фенотип) и взаимодействие организма с микробиологическим и вирусным окружением (нормофлора, патогенные и условно-патогенные инфекционные агенты).
8.2.1. ГЕНОТИПИРОВАНИЕ
Одним из крупнейших научных достижений на рубеже XX-XXI вв. стала расшифровка генома человека. В качестве новой задачи на пути практического использования полученных знаний постулируется изучение молекулярных основ изменчивости, в том числе определение роли генетического полиморфизма в формировании уникальных признаков организма. Прогресс в этой области напрямую связан с внедрением методов молекулярной генетики. Применение молекулярно-генетических подходов к изучению механизмов реализации жизненно важных функций организма уже сегодня привело к прорыву во многих областях науки и медицины.
Наиболее яркий пример проявления полиморфизма генов - иммунная система человека и, в частности, главный комплекс гистосовместимости. Именно с исследованием системы генов HLA (Human Leukocyte Antigen), кодирующей молекулы главного комплекса гистосовместимости, была связана одна из первых международных программ в области молекулярной генетики, результаты которой были представлены на XI Международном рабочем совещании и конференции по изучению HLA (г. Йокогама, Япония, 1991 г.). На сегодняшний день эта система генов насчитывает более 10000 аллельных вариантов.
Важнейшим достижением биомедицинской науки последних лет стало формирование представлений о роли генетического полиморфизма на уровне одиночных нуклеотидных замен (SNP - Single Nucleotide Polymorphism).
В настоящий момент в геноме человека насчитывается более 50 млн уникальных вариантов последовательности генов человека, представленных SNP (по данным сайта www.ncbi.nlm.nih.gov). Многие из них расположены в так называемых не-HLA генах иммунного ответа, играющих ключевую роль в распознавании сигналов, дифференцировке и регуляции компонентов клеточного и гуморального иммунитета и, как следствие, в защите человека от огромного числа внешних и измененных собственных антигенов.
Нарушение функций генов иммунного ответа и их продуктов ведет к развитию тяжелых форм иммунологической недостаточности и иммуно-зависимым заболеваниям. В связи с этим одной из наиболее актуальных и перспективных задач современной биомедицинской науки является расширение теоретических знаний в области иммуногенетического контроля канцерогенеза и противоинфекционного иммунитета.
Типирование локуса HLA-DRB1 на уровне групп аллелей
Для типирования локуса DRB1 системы HLA был выбран и оптимизирован метод сиквенс-специфических праймеров (Sequence Specific Primers, SSP), реализованный в варианте ПЦР в реальном времени (real-time PCR-SSP). Метод основан на использовании праймеров, расположенных в полиморфных участках исследуемого гена, и детекции результатов с помощью флуоресцентно-меченых олигонуклеотидных зондов типа Taqman или Beacon. Возможны два варианта реализации систем генотипирования на подобной основе. В первом случае специфичность реакции полностью определяется праймерами (или одним праймером), при этом используется универсальный флуоресцентный зонд. Во втором случае специфичность обеспечивается комбинацией типирующих праймеров и зондов. Для типирования большинства специфичностей, за исключением DR14, был реализован первый вариант, для группы аллелей DR14 - второй.
Особенностью разработанного метода является использование внутреннего эндогенного контроля с модифицированной системой амплификации. Целью модификации было решение двух связанных задач - снижение конкурентного влияния внутреннего контроля и получение референсного сигнала, относительно которого оценивается основная реакция. В этом случае интерпретация результатов осуществляется не только по наличию или отсутствию продуктов ПЦР в соответствующей реакционной смеси, но и по смещению характеристического цикла основной реакции относительно модифицированного внутреннего контроля. Такой подход особенно эффективен в тех случаях, когда отличия между типируемыми специфичностями малы и возможна неспецифичная амплификация, но на более поздних циклах.
Исходя из изложенных выше принципов в модуле «Анализ» программного обеспечения к прибору «ДТ-96» была реализована функция автоматической интерпретации результатов ПЦР для определения генотипов HLA-DRB1 (рис. 8.8, см. цв. вклейку).
В целях оптимизации параметров автоматической интерпретации результатов было проведено типирование 300 образцов ДНК с помощью разработанной системы. Для каждой из 15 реакционных смесей было получено распределение значений dCp по выборке. Данные представлены в табл. 8.6 с рисунками (см. цв. вклейку). В первой колонке зеленым выделены наименования групп аллелей локуса HLA-DRB1, являющиеся специфичными для указанной типирующей смеси. Точки, соответствующие положительным результатам, показаны зеленым цветом, а отрицательным - синим.
Для положительных результатов каждой из типирующих реакций были вычислены средние значения и стандартные отклонения (s) значений dCp. На основе анализа полученных распределений предложен метод оценки нижней (Lпороговое) и верхней (Hпороговое) границы «серой» зоны, разделяющей положительные и отрицательные образцы, по формулам:

Итоговые значения параметров интерпретации результатов типирования, реализованные в программном обеспечении к приборам серии «ДТ», представлены в табл. 8.7.
Таблица 8.7. Параметры интерпретации результатов типирования
№ | Специфичность | Среднее значение dCp положительного результата | s | Нижняя граница «серой зоны» | Верхняя граница «серой зоны» |
---|---|---|---|---|---|
1 |
DR1 |
0,1 |
0,3 |
1,4 |
3,4 |
2 |
DR15(2) |
0,6 |
0,4 |
2,2 |
4,5 |
3 |
DR16(2) |
0,2 |
0,3 |
1,6 |
3,7 |
4 |
DR3 |
0,1 |
0,2 |
1,1 |
2,6 |
5 |
DR4 |
0,4 |
0,5 |
2,2 |
4,9 |
6 |
DR11(5) |
0,2 |
0,4 |
1,6 |
3,8 |
7 |
DR12(5) |
0,1 |
0,2 |
1,1 |
2,5 |
8 |
DR13(6), DR3 |
0,4 |
0,4 |
2,1 |
4,7 |
9 |
DR13(6), DR11(5) |
1,2 |
0,5 |
3,0 |
5,7 |
10 |
DR14(6) |
1,3 |
0,4 |
2,8 |
5,1 |
11 |
DR14(6) |
0,1 |
0,3 |
1,2 |
2,8 |
12 |
DR7 |
0,2 |
0,3 |
1,4 |
3,3 |
13 |
DR8 |
0,1 |
0,3 |
1,2 |
2,7 |
14 |
DR9 |
0,1 |
0,3 |
1,1 |
2,7 |
15 |
DR10 |
0,1 |
0,3 |
1,5 |
3,5 |
Для всех исследованных образцов найденные параметры типирования дали однозначный результат.
Анализ образцов, для которых значение dCp оказалось близким к «серой» зоне, показал, что в подавляющем большинстве случаев смещение dCp связано с низкой концентрацией ДНК. При этом значение характеристического цикла (Cp) специфичной реакции, соответствующее минимальной концентрации ДНК, обеспечивающей надежное типирование, составило 34 цикла.
Как видно из табл. 8.6, все типирующие смеси, кроме номеров 8, 9, 10 и 11, являются группоспецифичными, и определение генотипов для всех специфичностей, кроме DR13 и DR14, по результатам типирующих реакций является однозначным.
В случае DR13 результат типирования считается положительным только тогда, когда обе смеси 8 и 9 одновременно принимают положительное значение, так как смесь № 8, кроме DR13, дает положительный результат в случае образцов, несущих специфичность DR3, а смесь №9 - DR11. При интерпретации результатов необходимо учитывать возможные сочетания различных групп аллелей HLA-DRB1 в пределах одного генотипа (табл. 8.8).
Таблица 8.8. Интерпретация результатов для генотипов, содержащих специфичности DR3, DR11 и DR13
Генотип | Смесь № 4 | Смесь № 6 | Смесь № 8 | Смесь № 9 |
---|---|---|---|---|
DR3, DR3 |
+ |
+ |
||
DR3, DR11 |
+ |
+ |
+ |
+ |
DR3, DR13 |
+ |
+ |
+ |
|
DR11, DR11 |
+ |
+ |
||
DR11, DR13 |
+ |
+ |
+ |
|
DR13, DR13 |
+ |
+ |
Другим исключением при интерпретации является группа аллелей DR14. Для этой группы специфичным результат типирования считается в случае, если положительной оказывается любая из смесей 10 или 11. Это связано с тем, что DR14 включает большое число различных полиморфных аллельных вариантов, часть из которых амплифицируется смесью № 10, а другая - смесью № 11 (табл. 8.9).
На настоящий момент описано более 700 аллельных вариантов гена HLA-DRB1 [9]. В табл. 8.9 показаны результаты компьютерного анализа специфичности разработанной системы, полученные на основании сравнения последовательностей аллельных вариантов гена DRB1, представленных в базе IMGT/HLA Database, Release 2.25 (17-Mar-2009) с последовательностями праймеров и зондов типирующей системы. Следует отметить, что аллельные варианты, которые могут приводить к ложноположительным и ложноотрицательным результатам, не встречаются в европейских и азиатских популяциях либо их частота менее 0,1% [12].
Таблица 8.9. Анализ специфичности разработанной системы типирования
Номер смеси | Специфичность | Ложноотрицательный результат | Ложноположительный результат |
---|---|---|---|
1 |
DR01 |
0113 |
- |
2 |
DR15 |
1510, 1517N, 1525, 1521 |
- |
3 |
DR16 |
- |
1521 |
4 |
DR03 |
0342 |
1107, 1153 |
5 |
DR04 |
0466 |
- |
6 |
DR11 |
1105, 1122, 1130, 1167 |
0308 |
7 |
DR12 |
- |
0832, 1452 |
8 |
DR13, DR14, DR03 |
- |
- |
9 |
DR13, DR11 |
1309, 1344, 1386 |
1416, 1422, 1425, 1453, 1469, 1474 |
10 |
DR14 |
1403, 1412, 1427, 1463, 1467, 1478, 1485, 1415, 1440, 1477, 1484, 1416, 1422, 1424, 1425, 1437, 1453, 1469, 1473, 1474, 1476, 1479, 1410, 1446, 1457 |
|
11 |
DR14 (1403, 1412, 1427, 1463, 1467, 1478, 1485) |
- |
1318 |
12 |
DR07 |
- |
- |
13 |
DR08 |
0820, 0824, 0825, 0831 |
1167, 1415 |
14 |
DR09 |
- |
- |
15 |
DR10 |
- |
- |
Таким образом, на основе единой технологической платформы ПЦР в реальном времени разработан метод генотипирования, позволяющий эффективно определять HLA-DRB1-генотип исследуемых образцов.
Анализ однонуклеотидных полиморфизмов (SNP)
Для типирования однонуклеотидных полиморфизмов генов цитокинов и других белков иммунной системы сотрудниками Института иммунологии совместно с сотрудниками «ДНК-технологии» был разработан оригинальный вариант метода «примыкающих» олигонуклеотидных зондов (adjacent probes, kissing probes).
Метод основан на определении температуры плавления олигонуклеотидых зондов, которая напрямую зависит от наличия/ отсутствия нуклеотидных замен в матрице ДНК в области гибридизации зондов.
Для определения температуры плавления, помимо флуоресцентно-меченого типирующего зонда, в реакционную смесь добавляется тугоплавкий олигонуклеотидный зонд с гасителем флуоресценции, который гибридизуется на матрице ДНК в непосредственной близости к типирующему зонду («примыкает» к нему). При низкой температуре происходит гибридизация зондов с амплифицированной в ходе ПЦР ДНК, в результате чего флуоресцентный краситель оказывается рядом с гасителем флуоресценции. По увеличению флуоресцентного сигнала при повышении температуры можно определить температуру плавления типирующего зонда и, следовательно, определить наличие однонуклеотидной замены. Для повышения надежности типирования, что особенно важно во время клинических исследований, в данной работе предложен метод одновременной гибридизации с двумя альтернативными типирующими зондами, меченными различными флуорофорами.
Для автоматического анализа флуоресцентных кривых с последующим типированием в модуле «Анализ» программного обеспечения к прибору «ДТ-96» создан раздел «Анализ полиморфизмов, плавление» (рис. 8.9, см. цв. вклейку).
Температура плавления зондов определяется по максимуму функции dF/ dT, полученной путем дифференцирования экспериментальной зависимости флуоресценции от температуры после апроксимации кубическими сплайнами (метод наименьших квадратов).
С помощью разработанной технологии были созданы системы для типирования 22 замен одиночных нуклеотидов в генах CTLA4, IL1A, IL1B, IL1R1, IL1RN, IL2, IL4, IL4R, IL6, IL10, IL12B, IL18, INFG, TNF и TGFB1. Данные полиморфизмы связаны с характеристикой иммунного статуса человека и входят в список рекомендованных 15-м Международным рабочим совещанием по гистосовместимости и иммуногенетике (15th International Histocompatibility and Immunogenetics Workshop, Brazil, September 2008) для изучения в клинико-диагностических целях.
Перечень полиморфизмов и значения температур плавления олиго-нуклеотидных зондов для различных аллельных вариантов приведены в табл. 8.10.
Таблица 8.10. Температурные характеристики типирующих зондов (°С)
Ген |
rs-номер |
Аллель |
Зонд A1 (FAM) |
Зонд A2 (HEX) |
|||
А1 |
A2 |
A1 |
A2 |
A1 |
A2 |
||
CTLA4 |
rs231775 |
A |
G |
57,0 |
47,0 |
48,0 |
58,0 |
IL1A |
rs1800587 |
С |
T |
50,0 |
47,0 |
37,0 |
52,0 |
IL1B |
rs16944 |
A |
G |
58,5 |
47,0 |
48,0 |
57,5 |
IL1B |
rs1143634 |
C |
T |
51,0 |
41,0 |
43,0 |
51,5 |
IL1B |
rs1143627 |
C |
T |
51,5 |
44,0 |
42,0 |
52,5 |
IL2 |
rs2069762 |
G |
T |
53,5 |
50,0 |
45,0 |
55,0 |
IL2 |
rs2069763 |
G |
T |
54,8 |
42,0 |
50,0 |
55,8 |
IL4 |
rs2070874 |
C |
T |
55,0 |
51,0 |
46,0 |
54,5 |
IL4 |
rs2243250 |
C |
T |
53,0 |
42,0 |
44,0 |
51,5 |
IL4 |
rs2243248 |
G |
T |
56,5 |
45,5 |
46,0 |
56,0 |
IL4R |
rs1801275 |
A |
G |
54,5 |
45,0 |
49,0 |
56,5 |
IL6 |
rs1800795 |
C |
G |
51,0 |
41,0 |
35,0 |
51,5 |
IL10 |
rs1800872 |
A |
C |
55,0 |
49,0 |
48,0 |
56,5 |
IL10 |
rs1800871 |
C |
T |
58,5 |
48,0 |
52,0 |
55,5 |
IL10 |
rs1800896 |
A |
G |
50,5 |
37,0 |
38,0 |
49,5 |
IL12B |
rs3212227 |
A |
C |
51,0 |
45,0 |
43,5 |
53,2 |
IL18 |
rs187238 |
C |
G |
52,0 |
46,0 |
40,0 |
52,0 |
IL18 |
rs1946518 |
G |
T |
50,0 |
42,0 |
44,0 |
51,0 |
IL18 |
rs1946519 |
A |
C |
55,5 |
47,0 |
51,0 |
56,5 |
TNF |
rs361525 |
A |
G |
55,0 |
44,0 |
45,0 |
54,0 |
TNF |
rs1800629 |
A |
G |
53,8 |
44,5 |
46,5 |
54,0 |
INFG |
rs2430561 |
A |
T |
53,2 |
47,5 |
46,0 |
53,7 |
8.2.2. ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
Одной из ключевых характеристик клеток организма является профиль экспрессии генов, описывающий их состояние и функциональную активность. Для оценки профиля экспрессии генов была использована технология относительного анализа количества мРНК в образцах с помощью реакции обратной транскрипции и последующей ПЦР в реальном времени (ОТ-ПЦР в реальном времени).
В ходе исследования проведена оптимизация параметров реакции обратной транскрипции для оценки количества транскриптов генов иммунной системы. В частности, было установлено, что использование смеси коротких (12-17 п.н.) специфических ОТ-праймеров предпочтительнее по сравнению с использованием случайных гексамеров и поли(Т)-праймеров. Значения пороговых циклов ПЦР для специфических ОТ-праймеров в среднем были на 1,8±0,6 и 2,4±0,7 меньше, чем в случае гексамеров и поли(Т)-праймеров. При этом соответствующие коэффициенты корреляции количественных оценок мРНК были равны 0,97 и 0,95, в то время как коэффициент корреляции результатов, полученных с использованием случайных гексамеров и поли(Т)-праймеров, был менее 0,93.
Выбор нормировочных генов при оценке уровня экспрессии генов
Для корректной оценки уровня экспрессии исследуемых генов принципиальное значение имеет выбор нормировочных (референс) генов. В данной работе были проанализированы семь генов-кандидатов в качестве нормировочных для оценки экспрессии генов иммунной системы: 18S рибосомальная РНК (18SrRNA), глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа (GAPDH), β-актин (ACTB), гипоксантин-гуанин-фосфорибозилтрансфераза (HPRT1), β2-микроглобулин (В2М), TATA-связывающий протеин (ТВР), β-глюкуронидаза (GUSB).
Одно из главных требований к нормировочным генам - соответствие диапазонов уровней экспрессии нормировочных и исследуемых генов. Около 80% фракции суммарной РНК представлено рибосомальной РНК и только 2-5% пулом мРНК, причем соотношение рРНК/мРНК не всегда остается постоянным [8]. Гены GAPDH и ACTB также экспрессируются в клетках на высоком уровне. Помимо этого к недостаткам GAPDH и ACTB следует отнести большое число псевдогенов: 52 для GAPDH и 18 для ACTB [16]. Исходя из изложенного выше, для дальнейшей экспериментальной работы по оптимизации нормировки были выбраны гены HPRT1, ТВР и B2M.
Оценку стабильности экспрессии нормировочных генов проводили методом попарного сравнения значений ΔCp, вычисленных по формуле (4) [20]. Метод основан на том, что если ΔCp между двумя генами остается постоянной в различных образцах во всех условиях эксперимента, то оба гена стабильно экспрессируются в данных образцах или имеют общую регуляцию экспрессии. Если ΔCp имеет разбросы, выходящие за рамки погрешности метода, то уровень экспрессии одного или обоих генов не является стабильным.
В этом случае при сравнении разных образцов наилучшими нормировочными генами можно считать:
Уровень экспрессии нормировочных генов был определен с помощью ОТ-ПЦР в реальном времени. Были рассмотрены три комбинации пар нормировочных генов: TBP и HPRT1, В2М и HPRT1 В2М и TBP в клетках периферической крови (ПК) и синовиальной жидкости (СЖ). Результаты экспериментов обобщены в табл. 8.11 и 8.12 и представлены на рис. 8.10 (см. цв. вклейку).
Таблица 8.11. Сравнение контрольных генов по медиане ΔCp
Группа |
TBP-HPRT1 |
HPRT-B2M |
TBP-B2M |
|||
ПК |
СЖ |
ПК |
СЖ |
ПК |
СЖ |
|
Контроль |
1,3 (0,8-1,5) |
7,7 (7,1-8,1) |
8,9 (8,6-9,0) |
|||
РА |
1,4 (1,2-1,9) |
2,9 (2,6-3,5) |
7,8 (7,0-8,4) |
5,3 (4,3-6,5) |
9,0 (8,5-9,6) |
8,3 (6,8-9,3) |
РРА |
1,6 (1,4-1,7) |
3,1 (2,7-3,3) |
7,8 (7,2-8,3) |
5,0 (3,5-6,1) |
9,6 (9,0-9,9) |
7,7 (7,3-8,7) |
НДА |
1,2 (0,9-1,4) |
2,7 (2,5-2,9) |
8,1 (7,5-8,6) |
5,1 (4,7-6,6) |
9,2 (8,7-9,6) |
8,2 (7,2-9,3) |
ОА |
1,2 (0,9-1,4) |
2,7 (2,6-2,9) |
7,0 (6,6-7,3) |
4,1 (3,9-1,6) |
8,1 (7,8-8,5) |
6,9 (6,7-7,4) |
В мононуклеарных клетках крови и клетках синовиальной жидкости наиболее близкие значения медианы в разных группах получены для пары генов TBP и HPRT1. В то же время уровни экспрессии всех нормировочных генов были отличны в крови и синовиальной жидкости, поэтому в данном исследовании невозможно напрямую сравнивать уровень экспрессии мРНК генов цитокинов в ПК и СЖ, возможно лишь сравнение между группами отдельно по ПК и отдельно по СЖ.
При оценке среднего и среднеквадратичного отклонения получены похожие результаты (табл. 8.12). Наиболее близкие средние значения между группами получены для пары генов TBP и HPRT1. Среднеквадратичные отклонения для этой пары были также минимальными (от 0,5 до 0,6 в ПК и СЖ соответственно) в сравнении с парами генов HPRT1 и B2M (0,8 и 1,5 соответственно в ПК и СЖ) и TBP и B2M (0,8 и 1,3 в ПК и СЖ соответственно).
Таблица 8.12. Сравнение контрольных генов по среднему значению ΔСр и среднему квадратичному отклонению
Группа |
TBP-HPRT1 |
HPRT-B2M |
TBP-B2M |
|||
ПК |
СЖ |
ПК |
СЖ |
ПК |
СЖ |
|
Контроль |
1,2±0,5 |
7,5±0,7 |
8,7±0,5 |
|||
РА |
1,5±0,6 |
3,0±0,8 |
7,6±1,2 |
5,2±1,9 |
9,2±1,2 |
8,2±1,6 |
РРА |
1,6±0,4 |
3,2±0,7 |
7,7±0,7 |
5,0±1,9 |
9,3±0,9 |
8,1±1,6 |
НДА |
1,2±0,5 |
2,7±0,6 |
8,0±0,9 |
5,5±1,4 |
9,2±0,9 |
8,3±1,3 |
ОА |
1,2±0,4 |
2,8±0,3 |
6,9±0,4 |
4,3±0,8 |
8,1±0,5 |
7,1±0,7 |
Определение фактора нормализации
При определении фактора нормализации учитывалась эффективность амплификации. Стандартные прямые были получены при построении графиков зависимости Cp от относительной концентрации образцов, рассчитанной в соответствии с выполненными разведениями. Линейный коэффициент корреляции (R2) составил от 0,986 до 0,999. Эффективность амплификации, рассчитанная на основе значений угловых коэффициентов уравнений стандартных прямых (формула 2) для генов TBP, HPRT1 и B2M составила соответственно 90, 95 и 91%.
Фактор нормализации (NF) вычисляли по формуле (5). Данный показатель определен как показатель, оценивающий количество материала по уровню экспрессии мРНК контрольного гена [20]. Из всей выборки выделяется образец с максимальным уровнем экспрессии (следовательно, минимальным значением Cp). Уровень экспрессии контрольного гена в данном образце принимается равным 1. Для остальных образцов NF рассчитывается, как доля экспрессии мРНК контрольного гена по отношению к образцу с максимальным уровнем экспрессии. В случае идеальных референсных генов и идеальных тест-систем, вне зависимости от выбора контрольного гена, значения NF должны быть абсолютно одинаковыми.
На практике гены, выбранные в качестве референсных, могут по-разному экспрессироваться в разных тканях, а в некоторых случаях возможны и различия между образцами одной и той же ткани. Помимо этого сам метод имеет определенную ошибку измерения. Поэтому рекомендуется проводить нормировку по нескольким генам, а далее рассчитывать фактор нормализации как среднее геометрическое значений NF по этим генам.
В ходе данной работы была обнаружена значительная корреляция NF по HPRT1 c NF по TBP в ПК и в СЖ r=0,89, в то время как по остальным парам генов корреляция была незначительно ниже (рис. 8.11, см. цв. вклейку).
Таким образом, гены TBP и HPRT1 экспрессируются на хорошем постоянном уровне во всех образцах ПК или СЖ вне зависимости от группы пациентов, дают минимальное среднее квадратичное отклонение (в среднем 0,6 цикла). Их можно считать оптимальной референсной парой.
В то же время уровень экспрессии данных генов в ПК отличается от уровня экспрессии в СЖ, поэтому использование нормировки по паре этих генов некорректно для сравнения образцов ПК и СЖ между собой.
Системы для амплификации мРНК генов цитокинов
Сотрудниками Института иммунологии и «ДНК-технологии» были разработаны системы для количественного определения мРНК 15 цитокинов, наиболее значимых с точки зрения как научных, так и прикладных аспектов: IL1B, IL2, IL4, IL6, IL8, IL10, IL12a, IL15, IL17A, IL18, IL2RA, IFNG, TGFB1, TNF, FOXP3. В ходе этой части работы решались следующие задачи: подбор и синтез праймеров и флуоресцентно-меченых олигонуклеотидов (зондов), оптимизация условий реакций, оценка специфичности и чувствительности метода, определение эффективностей амплификации, линейного диапазона систем и ошибок метода.
Подбор праймеров и зондов осуществляли путем анализа последовательностей ДНК и мРНК генов цитокинов базы данных NCBI [13]. При подборе праймеров и зондов учитывали структурную организацию генов, кодирующих мРНК цитокинов, чтобы исключить отжиг на геномной ДНК цитокинов; наличие псевдогенов; варианты альтернативного сплайсинга (табл. 8.13).
Дополнительный контроль прохождения реакции осуществляли методом электрофореза. Для контроля отсутствия амплификации на геномной ДНК ставили ПЦР с образцами, не прошедшими реакцию обратной транскрипции (ОТ). Ни в одном случае не было отмечено наличия сигнала в образцах без ОТ. В некоторых случаях на электрофореграмме наблюдали наличие полос, не соответствующих по электрофоретической подвижности специфическому фрагменту, что может быть связано со случайной неспецифической амплификацией.
Таблица 8.13. Основные характеристики систем для определения уровня мРНК цитокинов
Ген |
Локализация гена |
мРНК |
Размер ПЦР-продукта, п.н. |
Эффективность ПЦР(Е) |
|||
Адресация основной формы |
Число |
Варианты альтернативного сплайсинга |
Какие варианты определяет система |
||||
IL1B |
2q14 |
NM_000576.2 |
7 |
нет |
NM_000576.2 |
131 |
1,96 |
IL2 |
4q26-q27 |
NM_000586.3 |
4 |
нет |
NM_000586.3 |
203 |
1,97 |
IL4 |
5q31.1 |
NM_000589.2 |
4 |
NMJ 72348.1 |
NM_000589.2 |
214 |
1,94 |
IL6 |
7р21 |
NM_000600.1 |
5 |
нет |
NM_000600.1 |
334 |
1,96 |
IL8 |
4q13-q21 |
NM_000584.2 |
4 |
нет |
NM_000584.2 |
174 |
1,98 |
IL10 |
1q31-q32 |
NM_000572.2 |
5 |
нет |
NM_000572.2 |
188 |
1,98 |
IL12A |
3q25.33-q26 |
NM_000882.2 |
7 |
нет |
NM_000882.2 |
177 |
1,96 |
IL15 |
4q31 |
NM_172174.1 |
8 |
NM 172175.1 |
NM 172174.1 |
327 |
1,96 |
IL17A |
6p12 |
NM_002190.2 |
3 |
нет |
NM_002190.2 |
310 |
1,97 |
IL18 |
11q22.2-q22.3 |
NM_001562.2 |
6 |
нет |
NM_001562.2 |
175 |
1,95 |
IL2RA |
10p15-p14 |
NM_000417.1 |
8 |
нет |
NM_000417.1 |
265 |
1,97 |
IFNG |
12q14 |
NM_000619.2 |
4 |
нет |
NM_000619.2 |
216 |
1,98 |
TGFB1 |
19q13.1 |
NM_000660.3 |
7 |
нет |
NM_000660.3 |
175 |
1,97 |
TNF |
6p21.3 |
NM_000594.2 |
4 |
нет |
NM_000594.2 |
83 |
1,98 |
FOXP3 |
Xp11.23 |
NM_014009.3 |
12 |
NM_001114377.1 |
NM 014009.3 |
210 |
1,96 |
CDC2 |
10q21.1 |
NM_001786.3 |
8 |
- |
NM_001786.3 |
200 |
1,98 |
Т0Р2А |
17q21-q22 |
NM_001067.2 |
35 |
нет |
NM_001067 |
356 |
1,97 |
Определение аналитической специфичности метода
Разработанные системы позволяют определять относительную концентрацию мРНК цитокинов и не дают положительного результата на геномной ДНК человека.
Специфичность метода определялась путем сравнения последовательностей исследованных генов относительно базы данных Genbank, содержащей наиболее полную коллекцию последовательностей ДНК и РНК.
Определение аналитической чувствительности амплификации
Аналитическая чувствительность тест-системы - это минимальное количество матрицы в образце, которое может быть определено при использовании данного метода. Она зависит от эффективности выделения РНК, реакций обратной транскрипции и амплификации. Было сделано допущение, что эффективность выделения РНК и обратной транскрипции близка к 1 (или 100%), т.е. к теоретически ожидаемой. В данной работе была проведена оценка аналитической чувствительности амплификационной части теста, как минимально определяемое количество кДНК в амплификационной пробирке (копий/амп).
Определение концентрации кДНК в стоковом растворе проводили методом количественного анализа. В качестве калибраторов использовали разведения плазмиды (pGemTeasy) с фрагментами кДНК цитокинов. Данные плазмиды были откалиброваны по pGemTeasy со вставкой вирусного гепатита В (HBV), в свою очередь откалиброванной относительно стандартов NIBSC для HBV (серия 97/746).
Оценку аналитической чувствительности проводили путем разведений образца с определенной концентрацией кДНК цитокина (стоковый раствор), который титровали с шагом в 10 раз при высоких концентрациях, далее ближе к обрыву положительных результатов с шагом в 2 раза. В соответствии с выполненными разведениями определяли концентрацию матрицы, при которой во всех амплификационных пробирках (не менее 10 воспроизведений) получен положительный результат. Определенная таким образом концентрация рассматривалась как аналитическая чувствительность метода.
Аналитическая чувствительность составила от 3 до 10 копий кДНК цитокинов на амплификационную пробирку, или от 180 до 600 копий на 1 мл цельной крови (табл. 8.14).
Определение эффективности амплификации
Для определения эффективности амплификации последовательно готовили 10-кратные разведения кДНК, проводили амплификацию, автоматически получали калибровочные «стандартные» кривые и значения эффективности амплификации. Исследование было проведено в серии экспериментов. Эффективность амплификации и для большинства тест-систем составила 95-99%, за исключением IL4 (92%) (табл. 8.14).
Таблица 8.14. Аналитические характеристики тест-систем
Ген |
Линейный диапазон коп/амп |
Аналитическая чувствительность копий/амп |
Коэффициент вариации Сv, % |
Эффективность амплификации, % |
|
Нижняя граница |
Верхняя граница |
||||
TNF |
не более 50 |
108 |
5,4±3,2 |
20 |
96-99 |
IL1β |
3,2±1,9 |
17 |
95-97 |
||
IL6 |
3,6±2,2 |
27 |
95-96 |
||
IL10 |
3,2±1,9 |
23 |
97-98 |
||
IL17 |
3,9±2,3 |
50 |
97-98 |
||
IFNG |
3,3±2,0 |
4 |
95-98 |
||
IL15 |
3,0±1,8 |
8 |
95-96 |
||
IL4 |
4,5±2,7 |
9 |
92 |
||
IL8 |
10,0± 6,0 |
19 |
97-98 |
||
IL2 |
4,9±2,9 |
18 |
95-98 |
||
HPRT1 |
4,4±2,6 |
95-96 |
Определение линейного диапазона тест-систем
Линейный диапазон оценивали по разведениям плазмид со вставками цитокинов, а также по разведениям концентрированных образцов РНК, полученных из 10 мл цельной крови. Далее строили калибровочные прямые зависимости логарифма концентрации цитокинов (log10 или lg) от экспериментально полученных значений индикаторного цикла (Cp). В качестве примера на рис. 8.12 (см. цв. вклейку) приведена оценка линейного диапазона для IL17.
Линейный диапазон тест-систем определяли как область линейной зависимости среднего значения Cp от логарифма концентрации мРНК. Помимо линейной зависимости учитывали и значение среднего квадратичного отклонения (σ) Cp. Приемлемым считали значение σ для Cp не более 0,5 цикла, так как далее ошибка количественного определения существенно возрастает.
По общим для всех тест-систем данным область линейного диапазона составила от 15 до 38 циклов значений Cp, что соответствует концентрациям от 10-50 до 108 копий на амплификационную пробирку (табл. 8.14). Как было показано, главным ограничивающим фактором является не столько отклонение от линейности, сколько значение среднего квадратичного отклонения, превышающее 0,5 цикла.
Определение ошибки метода
Ошибку относительной экспрессии цитокинов определяли в пределах одного эксперимента при физиологически нормальной концентрации цитокинов в плазме крови условно здорового пациента. Исследование одного образца было выполнено многократно (n=11), начиная со стадии выделения лимфоцитов.
В каждом случае по формуле (6) рассчитывали относительную экспрессию мРНК цитокина. Для полученных значений уровня экспрессии мРНК цитокинов определяли коэффициент вариации (Cv).
Значения коэффициентов вариации нормированного по HPRT1 значения уровня экспрессии цитокинов составили от 4 до 50%. Сv зависел от представленности транскрипта в образце. Для IL1B и IL8 характерен самый высокий уровень экспрессии (1-100 единиц относительно HPRT1), далее в порядке убывания IL15, TNF, IFNG (0,1 единицы), IL4, IL2, IL10, IL6 (10-2-10-3), IL17 (10-4). Значение коэффициента вариации для IL1B, IL8, IL15, TNF, IFNG, IL4 не превысило 20%, для IL6, IL10, IL2 - 30%, для IL17 значение порогового цикла вышло за границы линейного диапазона тест-системы и Су составило 50%. Поэтому в качестве способа снижения ошибки метода может быть предложен вариант с увеличением объема образцов.
Таким образом, на базе единой технологической платформы, основанной на ПЦР в реальном времени, разработаны и охарактеризованы системы для определения количества мРНК следующих 15 генов иммунной системы: IL1B, IL2, IL4, IL6, IL8, IL10, IL12A, IL15, IL17A, IL18, IL2RA, IFNG, TGFB1, TNF, FOXP3.
Оценка результатов РБТЛ с помощью ПЦР в реальном времени
Одним из классических методов исследования функциональной активности лимфоцитов является реакция бластной трансформации лимфоцитов (РБТЛ). Принцип метода основан на митогенном влиянии на лимфоциты некоторых веществ растительного и бактериального происхождения. Классическим примером митогена является фитогемагглютинин (ФГА). Инкубация мононуклеарных клеток периферической крови (ПК) в присутствии ФГА осуществляется в течение 72 ч, результаты реакции оценивают по включению 3Н-тимидина. Использование радиоактивной метки существенно ограничивает применение РБТЛ в клинических лабораториях, в связи с чем разработка альтернативных способов оценки РБТЛ является актуальной задачей. Одним из возможных подходов является использование ПЦР в реальном времени для описания изменений уровней экспрессии генов во время РБТЛ. В качестве маркеров реакции были выбраны гены, активность которых возрастает при митозе: TOP2A (Topoisomerase 2 Alpha, топоизомераза-2-альфа) [2] и CDC2 (ген белка CDC2, Cell Division Cycle 2), контролирующего клеточный цикл. Ранее было показано [6], что содержание мРНК этих генов увеличивается в клетках, претерпевающих митотическое деление.
В работе была использована кровь здоровых добровольцев. Кровь брали натощак в вакутейнеры с гепарином, выделение лимфоцитов из ПК проводили не позднее чем через 2 ч после забора крови.
Мониторинг осуществляли путем оценки уровня мРНК генов CDC2 и TOP2A в определенные временные промежутки времени РБТЛ (табл. 8.15). Каждая временная точка ставилась в двух повторах, в расчетах использовали среднее значение. Помимо стимулированных лимфоцитов в качестве отрицательного контроля использовали точки спонтанной пролиферации без добавления ФГА.
Таблица 8.15. Мониторинг РБТЛ. Дизайн исследования
Номер эксперимента | Время взятия материала,ч | Всего точек на каждый образец |
---|---|---|
1 |
1, 2, 3, 5, 7, 14, 18, 23, 31, 38, 48, 54, 96, 168 |
96 |
2 |
0, 8, 19, 32, 43, 54, 72, 81, 97, 128 |
40 |
3 |
0, 47, 55, 79, 91, 103, 114, 127, 138, 151, 165 |
44 |
Реакция бластной трансформации лимфоцитов (РБТЛ)
Выделение лимфоцитов проводили не позднее чем через 2 ч после забора крови. Выделение фракции мононуклеарных клеток проводили, как описано ранее [3], с небольшими изменениями. Полученные клетки раскапывали в стерильный планшет по 105 выделенных клеток на лунку и добавляли фитогемагглютинин (ФГА) до конечной концентрации 2,5 мкг/мл. Для контроля спонтанной пролиферации в контрольные лунки ФГА не добавляли. Мониторинг осуществляли путем отбора проб через определенные промежутки времени в ходе культивирования в СО2-инкубаторе.
Оценку РБТЛ по включению меченного тритием тимидина (3Н-тимидин) проводили, определяя β-излучение на β-счетчике «Wallac 1409 DSA». По полученным значениям определяли индекс стимуляции лимфоцитов (ИС):

где СРМопыт - среднее число импульсов в минуту; СРМконтроль - среднее значение СРМ-образцов, культивированных без добавления ФГА.
Реакция обратной транскрипции (ОТ)
Реакцию обратной транскрипции (синтез кДНК из полученной РНК) проводили в объеме 40 мкл. В качестве праймеров для обратной транскрипции использовали разработанные специфические олигонуклеотиды и обратную транскриптазу M-MuLV (ООО «СибЭнзим», Россия). Реакцию проводили при температуре 40°С в течение 1 ч, с последующей инактивацией обратной транскриптазы при 95°С в течение 15 мин.
Дизайн и синтез олигонуклеотидов
При разработке олигонуклеотидов использовали базы данных нуклеотидных последовательностей GenBank, dbSNP и программное обеспечение Oligo 6.0. Синтез праймеров и олигонуклеотидных флуоресцентно-меченых зондов для ПЦР в реальном времени проводили на синтезаторах ДНК ASM-800 и ASM-102 (Россия, г. Новосибирск), позволяющих синтезировать как экспериментальные (20 нмоль), так и препаративные количества (0,5 мкмоль). Использовали флуорофоры (FAM, HEX) и гасители флуоресценции (Dabcyl, BHQ1), синтезированные в лаборатории изотопных методов анализа Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН. Олигонуклеотиды очищали методом высокоэффективной жидкостной хроматографии с использованием обращеннофазных колонок Диасфер-110-С18 (Россия). Чистоту полученных олигонуклеотидов контролировали методом аналитического вертикального гель-электрофореза в полиакриламидном геле.
При планировании исследования предполагалось, что уровень экспрессии мРНК генов CDC2 и TOP2A будет измеряться относительно РНК нормировочного гена HPRT1. Выбор данного гена был обоснован его невысоким уровнем экспрессии, сопоставимым с уровнем экспрессии исследуемой мРНК. Нормированное значение определяли согласно формуле (3) материалов и методов, а нарастание мРНК генов CDC2 и TOP2A методом ΔΔ Cp (формула 6) как соотношение нормированных значений уровня экспрессии. Данная практика расчетов общепризнана [8, 11]. Считается, что она позволяет контролировать и корректировать все стадии прохождения реакции. Вместе с тем необходимым условием является постоянство экспрессии нормировочных генов в исследуемом материале.
Поскольку в каждую лунку планшета вносилось одинаковое количество материала и, кроме того, благодаря использованному в данной работе протоколу взятия проб и выделения нуклеиновых кислот, исключалась деградация мРНК, нормировка по мРНК генов жизнеобеспечения клетки (housekeeping genes) не являлась необходимой. Для корректировки полученных значений по количеству клеток использовали нормализацию по количеству ДНК, определяемому с помощью ПЦР в реальном времени. Более того, поскольку в данной работе количество клеток и условия культивирования были стандартизованы, оказалось возможным определять соотношение уровней экспрессии мРНК генов CDC2 и TOP2A напрямую, без применения нормировочных генов (формула 7). Соотношения нормированных значений по уровням экспрессии мРНК HPRT1 в период активной пролиферации лимфоцитов существенно отличались от соотношения нормированных значений по ДНК и были в 2-10 раз ниже. Это связано с увеличением экспрессии мРНК HPRT1 в образцах. Кажется логичным, что в РБТЛ в период активной пролиферации лимфоцитов происходит активация гена HPRT1, участвующего в обмене пуринов. В связи с этим ген HPRT1 оказался непригоден для нормировки, но может быть использован для контроля стадий выделения нуклеиновых кислот и обратной транскрипции. Соотношения нормированных значений по ДНК в большинстве случаев соответствовали соотношению уровня экспрессии без применения нормировочных генов.
Для контроля постановки РБТЛ использовали метод ее оценки по включению меченого 3 Н-тимидина. Полученные значения сведены в табл. 8.16.
Таблица 8.16. Включение 3Н-тимидина в ходе РБТЛ при стимуляции лимфоцитов ФГА
Номер эксперимента | Донор | CPMCP, спонтанная пролиферация | стимуляция ФГА | Индекс стимуляции |
---|---|---|---|---|
1 |
1 |
393 |
2237 |
5,7 |
2 |
366 |
3504 |
9,6 |
|
2 |
1 |
317 |
2105 |
6,6 |
2 |
348 |
3418 |
9,8 |
|
3 |
1 |
352 |
2151 |
6,1 |
2 |
381 |
3265 |
8,6 |
В первые часы после взятия крови и выделения мононуклеарных клеток в них происходит резкое снижение уровня экспрессии генов CDC2 и TOP2A (рис. 8.13, см. цв. вклейку), на рисунке транскрипты TOP2A отмечены как ТРА-1 и ТРА-2), вероятно, из-за того, что клетки испытывают стрессовое воздействие в связи с процедурой выделения. Значения уровней экспрессии этих генов в «нулевой» точке имеют большой разброс и не могут быть использованы в качестве нормировки. Спустя 10-12 ч после выделения мононуклеарных клеток из периферической крови значения уровней мРНК генов TOP2A и CDC2 выходят на плато, и именно эти значения были выбраны для нормировки в данной работе.
В табл. 8.17 показано сравнение результатов оценки степени пролиферативного ответа клеток, полученных с помощью классического метода включения меченого 3Н-тимидина после культивации лимфоцитов в течение 72 ч и с помощью ПЦР в реальном времени через 72, 106 и 128 ч культивации. Количества мРНК приведены относительно содержания мРНК данных генов через 12 ч после начала культивирования клеток. Индекс стимуляции и относительные количества мРНК генов даны в среднем по трем независимым экспериментам. Видно, что если отбирать образцы клеток только через 72 ч, то результаты, полученные этими двумя методами, хорошо соответствуют друг другу, однако не являются максимальными в случае оценки относительного количества мРНК. Максимальные значения количества мРНК генов CDC2 и TOP2A достигаются позднее, и кинетика их накопления различается у разных доноров.
Таблица 8.17. Сравнение результатов оценки степени пролиферации лимфоцитов, полученных с помощью включения 3 Н-тимидина и ПЦР в реальном времени
Донор |
Индекс стимуляции, 72 ч |
Количество мРНК, 72 ч |
Количество мРНК, 106 ч |
Количество мРНК, 128 ч |
|||
CDC2 |
TOP2A |
CDC2 |
TOP2A |
CDC2 |
TOP2A |
||
1 |
6,1 |
72,1 |
45,4 |
288,9 |
181,9 |
419,3 |
358,0 |
2 |
9,3 |
138,7 |
119,8 |
282,8 |
330,8 |
158,8 |
263,0 |
Можно сделать вывод, что при анализе результатов воздействия на мононуклеарные клетки периферической крови разнообразными стимулами для получения более адекватной картины следует анализировать несколько образцов (оптимально 2-3) в различные промежутки времени, учитывая возможные временные отличия в динамике пролиферативного ответа у разных людей (рис. 8.14, см. цв. вклейку). Например, для анализа с помощью ПЦР в реальном времени мРНК генов CDC2 и TOP2A можно отбирать образцы клеток через 96 и 128 ч после начала культивирования.
На рисунке видно, что образец крови с более поздним ответом клеток на стимуляцию ФГА (сдвиг на 12-20 ч, в зависимости от периода культивации) имеет максимум относительной экспрессии мРНК 3Н-тимидина (см. табл. 8.16 и 8.17) также объясняется различиями в динамике ответа клеточной популяции на митогенный стимул. В случае мРНК гена CDC2 временной сдвиг в профиле экспрессии между двумя донорами также наблюдается, хотя в несколько меньшей степени.
Содержание мРНК гена CDC2 достигает максимума на несколько часов раньше по сравнению с мРНК гена TOP2A (рис. 8.14, см. цв. вклейку). Это согласуется с ранее полученными данными о том, что максимум содержания мРНК гена TOP2A приходится на 16 ч после прохождения клетками метафазы [6], а в случае с геном CDC2 клетки содержат максимальное количество его мРНК именно в метафазе. В данной работе разница между временем максимального накопления мРНК этих двух генов составляет не менее 20 ч только для первого донора; для второго донора разница не столь заметна. Это может быть связано с погрешностями экспериментов, а также с гетерогенностью культур клеток в нашей работе и, следовательно, с тем фактом, что мононуклеарные клетки периферической крови претерпевали митоз не одновременно, в отличие от ранее опубликованных работ, где авторы использовали гомогенные и синхронизированные по клеточному циклу клетки.
Тем не менее на основании полученных данных можно сделать вывод, что если имеется необходимость исследовать пролиферативный ответ лимфоцитов за более короткое время, то следует предпочесть мРНК гена CDC2 для ПЦР в реальном времени; если же такой необходимости нет, то можно использовать мРНК любого из этих двух генов, поскольку они оба дают четкую картину и различия в кинетике их экспрессии для каждого конкретного донора довольно незначительны. Различия в кинетике экспрессии мРНК этих генов имеются между разными донорами и связаны, по-видимому, с индивидуальной реактивностью лимфоцитов у конкретного человека.
В ходе экспериментов была построена кривая, отражающая изменение уровня экспрессии мРНК генов CDC2 и TOP2A в течение 5 сут в популяции мононуклеарных клеток из периферической крови двух доноров без стимуляции ФГА (рис. 8.15, см. цв. вклейку); показаны средние значения по двум донорам. Как видно на рисунке, в первые часы культивирования клеток уровень мРНК исследуемых генов падает в 5-8 раз (вероятно, ввиду стресса, которому подвергаются клетки при выделении), примерно к 12 ч выходит на плато и в дальнейшем практически не меняется. Следовательно, нормировку значений уровня экспрессии мРНК генов CDC2 и TOP2A можно проводить как по значениям, полученным на стимулированных ФГА клетках после 12 ч их культивирования (рис. 8.13, см. цв. вклейку), а также по значениям, полученным на клетках без стимуляции ФГА после первых 12 ч инкубации.
В экспериментах, описанных в данной работе, использовали мРНК генов TOP2A и CDC2 для оценки степени пролиферации, поскольку продукты этих генов непосредственно задействованы в процессе деления лимфоцитов в ответ на митогенные стимулы. Целью исследования было найти такие маркеры, которые позволили бы напрямую заменить методику радиоактивного мечения ДНК при оценке пролиферативного ответа. Кроме этого подхода также можно исследовать возможность использования мРНК генов, продукты которых являются воспринимающими сигнал молекулами или участвуют в проведении стимула и передаче его эффекторным молекулам, участвующим в ответе на стимул. ПЦР-протоколы на основе таких генов могут дать результат в более сжатые сроки, поскольку воспринимающие и передающие сигнал молекулы вовлекаются в процесс стимуляции на более ранних этапах по сравнению с началом пролиферации лимфоцитов в ответ на стимул.
Метод ПЦР может оказаться слабоэффективным, когда речь идет об изменениях в количестве нуклеиновых кислот в пределах 2-3 раз; такие изменения сопоставимы с ошибкой метода, требуют серьезных доказательств и значительного увеличения объемов исследования. В то же время уровень экспрессии мРНК генов CDC2 и TOP2A при стимуляции лимфоцитов ФГА повышается в сотни раз. Изменения в сотни раз легко показать с помощью ПЦР, поэтому данный метод кажется очень перспективным для оценки уровня экспрессии выбранных генов в реакции бласттрансформации лимфоцитов в связи со своей простотой, доступностью, хорошей воспроизводимостью, чувствительностью и специфичностью и возможностью использовать этот метод в клинических исследованиях.
Таким образом, в ходе исследования были разработаны тест-системы для определения экспрессии генов CDC2 и TOP2A в лимфоцитах, стимулированных ФГА. Данные гены были использованы как маркеры РБТЛ с использованием метода ПЦР в режиме реального времени. Проведен мониторинг нарастания мРНК генов CDC2 и TOP2A, определены основные закономерности экспрессии мРНК данных генов в ходе стимуляции выделенных лимфоцитов ФГА, выявлены значимые различия в экспрессии данных генов у двух доноров крови. Применен новый подход оценки результатов реакции без использования нормировочных генов.
Результаты проведенных экспериментов могут быть использованы в дальнейшей работе, как в научных разработках, так и в клинической практике, поскольку РБТЛ является удобной и наглядной моделью исследования функциональной активности лимфоцитов in vitro.
Следует отметить, что помимо использования радиоактивной метки РБТЛ имеет еще один недостаток - длительное время исследования, обусловленное использованием финальной пролиферативной стадии активации лимфоцитов для оценки результатов реакции. В то же время при использовании в качестве маркеров мРНК некоторых генов, например цитокинов, существует принципиальная возможность оценки степени стимулирующего воздействия на более ранних стадиях.
В качестве предварительного исследования, иллюстрирующего такую возможность, и апробации разработанной технологической платформы было проведено исследование динамики изменения количества мРНК интерлейкина 6 (IL-6) в лимфоцитах, выделенных из периферической крови, в ответ на воздействие иммуностимулирующего олигонуклеотида CpG-ODN-2006. Максимум экспрессии IL-6 соответствовал 5-7 ч (рис. 8.14, см. цв. вклейку). В случае подтверждения в дальнейшем полученные результаты могут позволить существенно сократить время анализа.
8.2.3. ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ЧЕЛОВЕКА С ИНФЕКЦИОННЫМ ОКРУЖЕНИЕМ
Важным аспектом, характеризующим состояние иммунной системы, является ее взаимодействие с микробиологическим и вирусным окружением, включая патогенные, условно-патогенные и латентные инфекции, а также нормофлору организма. Диагностика патогенных инфекционных агентов с помощью «классической» ПЦР и ПЦР в реальном времени является сегодня стандартным подходом и широко используется в клинико-диагностических лабораториях в большинстве стран с развитой системой здравоохранения.
Генодиагностика латентных инфекций
С точки зрения взаимодействия с иммунной системой среди латентных инфекций наиболее интересными и клинически значимыми являются вирусы семейства Herpesviridae. По данным многочисленных исследований [18], более 90% людей в течение жизни инфицируются хотя бы одним из герпес-вирусов (вирус простого герпеса 1 и 2 типов, цитомегаловирус, варицелла-зостер, Эпштейна-Барр, вирус герпеса человека 6 типа). Для диагностики герпесвирусов, особенно в случаях иммунодефицитных состояний, важен количественный анализ вирусной нагрузки.
Сотрудниками Института иммунологии и «ДНК-технологии» разработаны и апробированы на клиническом материале системы для количественного определения методом ПЦР в реальном времени вирусов HSV, CMV, VZV, EBV, HHV6, а также вируса BK, диагностика которого имеет важное клиническое значение в трансплантологии. Линейный диапазон тест-систем составил 103-108 копий вирусной ДНК на 1 мл образца, чувствительность - 300-500 копий/мл.
Основные характеристики разработанных тест-систем приведены в табл. 8.18.
Таблица 8.18. Системы для диагностики латентных вирусных инфекций
Вирус | Ген | Адресация | Размер ПЦР продукта, п.н. | Эффективность ПЦР (Е) |
---|---|---|---|---|
CMV |
IE1(UL123) |
X17403 |
279 |
1,97 |
HSV |
gB (UL27) |
X14112 (HSV1) |
260 |
1,98 |
EBV |
LMP1 |
V01555 |
184 |
1,97 |
HHV-6 |
13R(U67) |
X83413 |
276 |
1,96 |
VZV |
TK |
X04370 |
268 |
1,97 |
BK |
VP2 |
V01108 |
316 |
1,98 |
Оценка состояния биоценоза
На базе созданной технологической платформы разработан метод оценки состояния биоценозов различных биотопов человека, основанный на количественном анализе 16S РНК бактерий и 18S РНК грибов.
Одной из наиболее актуальных задач, связанных с изучением биоценозов и их взаимодействием с иммунной системой человека, является исследование микрофлоры урогенитального тракта женщин. По данным многочисленных исследований, более 100 видов бактерий относят к нормальной и условно-патогенной флоре влагалища [4, 5, 10, 14, 15]. При этом состав и относительное количество различных микроорганизмов во многом определяют клиническую картину и ассоциированы с такими распространенными патологиями, как бактериальный вагиноз и вагиниты.
В ходе работы был проведен филогенетический анализ 16S РНК достаточно полного списка бактерий, относящихся к нормальной и условно-патогенной флоре влагалища, а также близкородственных микроорганизмов.
По результатам анализа для разработки генодиагностической мультиплексной ПЦР тест-системы исследованные микроорганизмы были разделены на 12 групп (рис. 8.16, см. цв. вклейку).
В качестве мишени для амплификации ДНК и идентификации был выбран участок гена 16S РНК бактерий, содержащий вариабельные районы V2-V3-V4.
Помимо указанных 12 групп в состав системы были включены микоплазмы и грибы рода Candida. Полный перечень групп микроорганизмов и список проанализированных видов с указанием номера последовательности 16S РНК в базе NCBI [13] представлены в табл. 8.19.
Таблица 8.19. Перечень изученных (анализируемых) микроорганизмов
№ | Группа | Список видов |
---|---|---|
1 |
Lactobacillus spp. |
Lactobacillus crispatus (3808154), Lactobacillus iners (42521630), Lactobacillus jensenii (7621510), Lactobacillus johnsonii (AE017198), Lactobacillus gasseri (21637410), Lactobacillus vaginalis (50080126), Lactobacillus acidophilus (AB008203) |
2 |
Enterobacteriaceae |
Escherichia coli (AM184233), Klebsiella pneumoniae (EF197996), Morganella morganii (AJ301681), Proteus mirabilis (EF626945), Salmonella enterica (EF643616), Shigella sonnei (X96964), Shigella flexneri (X96963), Shigella dysenteriae (X96966), Shigella boydii (X96965), Shigella sonnei (X80726), Shigella flexneri (X80679), Shigella dysenteriae (X80680), Cronobacter saka-zakii (EF059881), Yersinia enterocolitica (Z75316) |
3 |
Streptococcus spp. |
Streptococcus agalactiae (AF015927), Streptococcus cristatus (AY281090), Streptococcus genomosp. (AY278632), Streptococcus infantis (AY485603), Streptococcus mitis (AY281077), Streptococcus oralis (AY281080), Streptococcus pneumoniae (AJ617796), Streptococcus pyogenes (FJ662846), Streptococcus suis (AF009501), Streptococcus salivarius (AM157451), Streptococcus sanguis (AF003928) |
4 |
Staphylococcus spp. |
Staphylococcus aureus (Y15856), Staphylococcus caprae (AY346310), Staphylococcus epidermidis (D83363), Staphylococcus haemolyticus (D83367), Staphylococcus hominis (X66101), Staphylococcus pasteuri (AB009944), Staphylococcus saccharolyticus (L37602) |
5 |
G.vaginalis, Prevotella spp., Porphyromonas spp. |
Gardnerella vaginalis (M58744), Porphyromonas endodontalis (L16491), Porphyromonas asaccharolytica (L16490), Porphyromonas cansulci (X76260), Porphyromonas gingivalis (L16492), Prevotella copri (AB244773), Prevotella salivae (AB108826), Prevotella bivia (L16475), Prevotella veroralis (L16473) |
6 |
Eubacterium spp., Bacteroides spp. |
Eubacterium nodatum (Z36274), Eubacterium brachy (U13038), Eubacterium moniliforme (L34622), Bacteroides intestinalis (AB214328), Bacteroides acidofaciens (AB021157), Bacteroides uniformis (AB117564), Bacteroides plebeius (AB200217), Bacteroides vulgatus (M58762), Bacteroides pyogenes (AB200229), Bacteroides thetaiotaomicron (AY319392), Bacteroides ovatus (DQ100446), Bacteroides fragilis (X83948), |
7 |
Leptotrichia spp., Sneathia spp., Fusobacterium spp. |
Leptotrichia amnionii (AY078425), Leptotrichia sp. (AF385542), Sneathia san-guinegens (AJ344093), Uncultured Sneathia (EF120363), Fusobacterium cani-felinum (AY162220), Fusobacterium genomosp. (AY278616), Fusobacterium nucleatum (AJ133496), Fusobacterium necrophorum (AF044948) |
8 |
Megasphaera spp., Veillonella spp., Dialister spp. |
Megasphaera hominis (L79909), Megasphaera elsdenii (AY038994), Megasphaera cerevisiae (L37040), Veillonella dentocariosa (EF185167), Veillonella sp. (AY355141), Veillonella sp. (AF473836), Veillonella sp. (AY244769), Veillonella parvula (X84005), Veillonella dispar (X84006), Veillonella atypica (X84007), Dialister micraerophilus (AF473837), Dialister sp. (AY850122) |
9 |
Clostridium spp., Lachnobac-terium spp. |
Clostridium perfringens (Y12669), Clostridium corinoforum (X76742), Lachnobacterium sp. (AJ518873) |
10 |
Mobiluncus spp., Corynebacterium spp. |
Mobiluncus mulieris (AJ576087), Mobiluncus curtisii (AJ576075), Corynebacterium mycetoides (X84241), Corynebacterium imitans (AF537597), Corynebacterium sp. (X89778), Corynebacterium lipophilofla-vum (Y09045), Corynebacterium mucifaciens (AF537600) |
11 |
Peptostrepto-coccus spp., Anaerococcus spp. |
Peptostreptococcus sp. (X90471), Peptostreptococcus ivoricus (Y07840), Peptostreptococcus micros (D14143), Peptostreptococcus prevotii (D14139), Peptostreptococcus hydrogenalis (D14140), Anaerococcus vaginalis (29825719), Anaerococcus lactolyticus (AF542233), Anaerococcus tetradius (AF542234) |
12 |
Atopobium vaginae |
Atopobium vaginae (AJ585206), Atopobium sp. (Y17195), Atopobium rimae (X67149), Atopobium parvulum (X67150), Atopobium minutum (X67148), Uncultured Atopobium (EF120360) |
13 |
Mycoplasma spp. |
Mycoplasma hominis (AJ002268), Mycoplasma genitalium (X77334), Mycoplasma pneumoniae (M29061), Mycoplasma orale (AY796060), Mycoplasma iners (AF064063), Mycoplasma mycoides (U26050), Mycoplasma capricolum (AF009843), Mycoplasma volis (U22415), Mycoplasma pirum (M23940), Mycoplasma imitans (L24103), Mycoplasma gallisepticum (M22441), Mycoplasma agalactiae (AJ419903) |
14 |
Ureaplasma spp. |
Ureaplasma urealyticum (AF073447), Ureaplasma parvum (AF073459) |
15 |
Candida spp. |
Candida albicans (X71088), Candida dubliniensis (AF405231), Candida glabrata (L11351), Candida tropicalis (AF287910), Candida lusitaniae (AF172262), Candida krusei (L11350), Candida parapsilosis (U10989) |
16 |
Прочие микроорганизмы |
Enterococcus faecium (AB232955), Enterococcus faecalis (EF653454), Aerococcus sanguinicola (AY837833), Aerococcus sp. (Y17318), Aerococcus urinae (U64458), Bifidobacterium longum (AY675246), Bifidobacterium saeculare (D89330), Bifidobacterium subtile (D89329), Bifidobacterium bifidum (M38018), Bifidobacterium breve (M58731) |
Кроме того, в состав системы входят оценка суммарного количества бактерий (бактериальной массы) в образце путем амплификации общего для всех бактерий консервативного участка 16S РНК и контроль взятия материала по наличию ДНК эпителиальных клеток человека.
Для контроля полноты спектра выявляемых бактерий с помощью разработанной системы было проведено тестирование 235 проб вагинального отделяемого, полученных во время диспансеризации сотрудниц трех медицинских учреждений. Для каждого образца вычисляли разницу логарифмов общего количества бактерий (БМ) и суммы выявленных групп бактерий (ni). Обобщенные и разбитые на диапазоны результаты анализа представлены в табл. 8.20. С учетом точности определения количества бактерий разработанным методом равной 0,3 Log, основные компоненты биоценоза были выявлены более чем в 98% случаев. В случаях когда вычисленная разница логарифмов составила более 0,3 Lg, была проведена идентификация преобладающего вида бактерий в образце методом секвенирования 16S РНК. В двух образцах таким видом оказался E. faecalis, по одному - Bifidobacterium bifidum и Burkholderia cepacia.
Таблица 8.20. Контроль выявляемости бактерий вагинальной микрофлоры, разработанной системой
Lg(БM) - Lg(Σnl) | <-0,3 | -0,1-0,3 | 0,1-0,1 | 01-03 | >0,3 |
---|---|---|---|---|---|
Количество образцов |
2 (0,9%) |
48 (20,4%) |
151 (64,3%) |
32 (13,6%) |
4 (1,7%) |
Количественное определение латентных вирусов
Материалом для апробации разработанных систем служили образцы мочи и периферической крови, поступившие из отделения трансплантации почки РНЦХ РАМН (Российский научный центр хирургии им. акад. Б.В. Петровского). За период с сентября по ноябрь 2007 г. было собрано 183 образца крови и 165 образцов мочи от 137 человек. В течение указанного времени осуществлялся мониторинг количества ДНК вируса BK в моче 24 пациентов и вирусов HSV, CMV, EBV, BK в крови 32 пациентов.
Выделение ДНК из образцов цельной крови проводили протеиназным лизисом с последующей очисткой фенольно-хлороформным методом, из образцов мочи - с использованием набора «Проба-НК», производства «ДНК-Технология» (Россия), согласно инструкции фирмы-изготовителя.
Контроль эффективности выделения ДНК осуществляли, используя систему для выявления геномной ДНК человека. Контроль эффективности выделения ДНК необходим для исключения ложноотрицательных результатов при исследовании биологического материала, содержащего клетки человека.
Наличие вирусов и вирусную нагрузку CMV, EBV, BKV, HSV в препаратах ДНК, полученных из цельной крови, а также вируса BK в препаратах ДНК из мочи проводили методом ПЦР в реальном времени с использованием разработанных систем.
При исследовании образцов мочи 24 пациентов ДНК вируса BK была обнаружена в 11 случаях. При этом у 4 человек вирусная нагрузка составляла менее 103 копий/мл, у остальных 7 колебалась в пределах 4x103-4x109. Интересно, что при рассмотрении этих пациентов в динамике обнаружилось, что у 4 человек, у которых вирусная нагрузка была менее 103 копий/мл, при первом исследовании с течением времени она не изменилась, тогда как у 2 пациентов с повышенной вирусной нагрузкой количество вирусной ДНК уменьшилось в 50-100 раз, а у 5 - увеличилось в 10-100 раз (табл. 8.21).
Таблица 8.21. Результаты определения нагрузки вируса BK в образцах мочи
Всего случаев |
Положительные |
Вирусная нагрузка |
||
Менее 103, количество не изменилось |
Количество уменьшилось на 0,5-1 порядок |
Количество увеличилось на 1-3 порядка |
||
24 |
11 |
4 |
2 |
5 |
В качестве группы контроля исследовали образцы мочи, полученные от 17 здоровых доноров. Ни в одном случае ДНК вируса BK не выявлена.
Результаты выявления и определения вирусной нагрузки CMV, EBV, HSV и вируса BK в ДНК в образцах крови 32 пациентов представлены в табл. 8.22.
Таблица 8.22. Результаты анализа динамики изменения вирусной нагрузки в крови пациентов (копий/мл)
Вирус | Положительные | <103, группа 1 | <103, группа 2 | <103, группа 3, | >103 |
---|---|---|---|---|---|
CMV |
10 |
1 |
5 |
2 |
2 |
EBV |
7 |
1 |
3 |
3 |
0 |
HSV |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
BK |
4 |
0 |
4 |
0 |
0 |
Группа 1 - вирусная нагрузка не изменилось; группа 2 - вирусная нагрузка уменьшилась (в первой точке <103, последующие - отрицательные); группа 3 - вирусная нагрузка увеличилась (в первой точке - отрицательная, во второй <103).
Итоговый состав прикладного уровня технологической платформы для решения молекулярно-генетических задач иммуногенетики и клинической иммунологии представлен в табл. 8.23.
Таблица 8.23. Состав прикладного уровня технологической платформы
Прикладной аспект технологической платформы | Назначение разработанных систем |
---|---|
Иммуногенетика |
Типирование локуса DRB1: |
Экспрессия генов |
IL1B, IL2, IL4, IL6, IL8, IL10, IL12A, IL15, IL17A, IL18, IL2RA, IFNG, TGFB1 , TNF, FOXP3 |
Взаимодействие организма с вирусами и микроорганизмами (генодиагностика) |
Латентные вирусные инфекции: |
Разработанная в ходе исследований технологическая платформа не только не уступает, но и по ряду параметров превосходит зарубежные аналоги и позволяет эффективно решать прикладные задачи современной иммуно-геномики. Созданные методы и технологии часто являются универсальной и удобной заменой классических методов иммунологии и служат источником информации о ряде ключевых параметров, отражающих действенность функционирования иммунной системы и говорящих о состоянии человеческого организма в норме и при патологии.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ И ИНТЕРНЕТ-ИСТОЧНИКОВ
-
Ребриков Д.В., Трофимов Д.Ю. ПЦР «в реальном времени»: подходы к анализу данных // Прикладная биохимия и микробиология. - 2006. - Т. 42. - С. 520528.
-
Christensen M.O., Larsen M.K., Barthelmes H.U., Hock R., Andersen C.L., Kjeldsen E., Knudsen B.R., Westergaard O., Boege F., Mielke C. Dynamics of human DNA topoisomerases II alpha and II beta in living cells // J. Cell Biol. - 2002. - Vol. 157. - P. 31-44.
-
Current Protocols in Immunology. Ред. Coligan J.E., Kruisbeek A.M., Margulies D.H., Shevach E.M., Strober W. John Wiley & Sons; 2003; ISBN: 0471522767.
-
Fredricks D.N., Fiedler T.L., Marrazzo J.M. Molecular identification of bacteria associated with bacterial vaginosis // N. Engl. J. Med. - 2005. - Vol. 353. - P. 1899-1911.
-
Fredricks D.N., Fiedler T.L., Thomas K.K., Oakley B.B., Marrazzo J.M. Targeted PCR for detection of vaginal bacteria associated with bacterial vaginosis // J. Clin. Microbiol. - 2007. - Vol. 45. - P. 3270-3276.
-
Goswami P.C., Roti J.L., Hunt C.R. The cell cycle-coupled expression of topoisomerase II alpha during S phase is regulated by mRNA stability and is disrupted by heat shock or ionizing radiation // Mol. Cell. Biol. - 1996. - Vol. 16. - P. 1500-1508.
-
Higuchi R. Simple and rapid preparation of samples for PCR. In: PCR technology: Principles and applications for DNA amplification (Erlich H, ed.) // Stockton Press, New York, NY, USA. - 1989. - P. 31-38.
-
Huggett J., Dheda K., Bustin S., Zumla A. Real-time RT-PCR normalization; strategies and considerations // Genes and Immunity. - 2005. - Vol. 6. - P. 279-284.
-
IMGT/HLA Database. - http://www.ebi.ac.uk/imgt/HLA/stats.html. Дата обращения: 14.04.2009.
-
Livengood C.H. Bacterial Vaginosis: An Overview for 2009 // Reviews in Obstetrics & Gynecology. - 2009. - Vol. 2. - P. 2837.
-
Ma H., Shieh K.-J, Chen G. and Qiao X.T. Real-time Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) // J. Am. Sci. - 2006. - Vol. 2. - P. 1-15.
-
Middleton D., Menchaca L., Rood H., Komerofsky R. Tissue Antigens. - 2003. - Vol. 61. - P. 403-407. New Allele Frequency Database. - http://www.allelefrequencies.net. Дата обращения: 14.04.2009.
-
Oakley B.B., Fiedler T.L., Marrazzo J.M., Fredricks D.N. Diversity of human vaginal bacterial communities and associations with clinically defined bacterial vaginosis // Appl. Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 74. - P. 4898-4909.
-
Onderdonk A.B., Lee M.L., Lieberman E. Delaney M.L., Tuomala R.E. Quantitative microbiologic models for preterm delivery // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41. - P. 1073-1079.
-
Pseudogene Database. - http://www.pseudogene.org. Дата обращения: 14.04.2009.
-
Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. Molecular cloning: a laboratory manual. 2nd ed. N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory Press. Cold Spring Harbor, 1989.
-
Sanger F., Niclein S., Coulson A.R. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1977. - Vol. 74. - P. 5463-5467.
-
Vandesompele J., De Preter K., Pattyn F., Poppe B., Van Roy N., De Paepe A., Speleman F. Accurate normalization of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of multiple internal control genes // Genome Biol. - 2002. - Vol. 3. - R. 0034.1-R.0034.11.
-
Welch P.J., Wang J.Y.J. Coordinated synthesis and degradation of CDC2 in the mammalian cell cycle // PNAS. - 1992. - P. 3093-3097.
-
Zhou X., Bent S.J., Schneider M.G., Davis C.C., Islam M.R. Forney L.J. Characterization of vaginal microbial communities in adult healthy women using cultivation-independent methods // Microbiology. - 2004. - Vol. 150. - P. 2565-2573.
Глава 9. Иммуногеномика в биомедицине: этапы развития и перспективы
В настоящее время иммуногенетика, и в первую очередь иммуногенетика человека, является не только одним из ведущих направлений иммунологии, но и биомедицинской науки в целом. Дело в том, что иммуногенетические функции выполняют в организме человека не только такую важнейшую роль, как генетический контроль иммунного ответа, но и много других жизненно важных функций, а также обеспечивают выживаемость (жизнеспособность) вида. Этот факт неоспоримо подтверждает даже краткий перечень биологических функций, которые выполняют белковые продукты генов иммунного ответа.
Среди этих функций в первую очередь следует отметить иммунное распознавание и уничтожение чужеродных агентов, несущих генетическую информацию, отличную от генома хозяина. Причем это касается не только вирусов, бактерий, паразитов, чужеродных клеток и их элементов, но и злокачественно перерожденных (раковых) клеток собственного организма. Таким образом, гены иммунного ответа (ГИО) осуществляют точный контроль за генетической стабильностью своего организма.
Результатом поломок этого «контрольного» механизма может стать развитие заболеваний самого разнообразного генеза, начиная с инфекций и заканчивая аутоиммунными заболеваниями и онкопатологиями.
Упомянутый контроль осуществляется не только при участии иммунной системы организма, но и дублируется на уровне сохранения его функциональной целостности. Это происходит за счет следующих механизмов. Все ядросодержащие клетки организма человека несут на своей поверхности белковые продукты ГИО. Физиологическое взаимодействие (межклеточный контакт) двух целых клеток (помимо эритроцитов) возможен лишь в том случае, если они идентичны по белковым продуктам ГИО. Напротив, если клетка несет чужеродные белки ГИО - развивается иммунный ответ против них с последующим их уничтожением. Ярким примером этого является отторжение чужеродного пересаженного органа, несовместимого по генам иммунного ответа.
Следует отметить, что указанная функция ГИО и их белковых продуктов является по сути важнейшей физиологической функцией, поскольку она обеспечивает функциональную целостность организма, т.е. его жизнеспособность. Однако, с другой стороны, сам способ реализации этой функции происходит на основе использования иммунных реакций и функций - иммуногенетическое распознавание и уничтожение чужеродных клеток.
Разумеется, все вышерассмотренные функции целиком и полностью относятся к генетическому контролю иммунного ответа и являются в целом одним из важнейших механизмов обеспечения биомедицинской устойчивости организма к воздействию неблагоприятных факторов внешней и внутренней среды биологического происхождения.
Комплексу ГИО и их продуктам принадлежит и целый ряд функций, которые на первый взгляд не связаны с генетическим контролем иммунного ответа.
Одной из таких функций является участие в репродуктивном процессе. Причем это относится как к физиологически протекающему репродуктивному процессу, так и к таким патологическим состояниям, как идиопатическое бесплодие, привычное невынашивание беременности, токсикозы беременности и, наконец, переношенная беременность.
В целом, в основе всех этих патологических состояний лежит выраженная в той или иной степени совместимость супругов по ГИО. Механизм развития патологии состоит в отсутствии «первоначального сигнала» к запуску цепи физиологических изменений в организме матери. Эти изменения в целом обеспечивают не только процесс физиологического вынашивания плода, но и своевременное родоразрешение. Первичным сигналом, в свою очередь, является наличие в геноме плода ГИО (HLA II класса), отличающихся от собственного иммуногенотипа матери.
Результат распознавания этих чужеродных HLA-специфичностей, присутствующих в иммуногенотипе отца ребенка (плода), - развитие многих иммунологических событий, ведущих к временной (на период беременности) толерантности организма матери по отношению к плоду. При этом распознавание других чужеродных агентов, в том числе продуктов, иных, чем входящие в генотип плода, HLA-специфичностей, остается неизменным. Временная толерантность к плоду заканчивается у человека (при физиологически протекающей беременности) через 9 мес. Именно в этот срок наблюдается восстановление иммунного распознавания иммунной системой матери HLA-специфичностей отцовского генотипа.
В том случае, если имеется выраженная степень идентичности HLA-генотипов матери и плода (что может иметь место при HLA-гаплоидентичности супругов), процесс родоразрешения в физиологические сроки не наступает, т.е. развивается переношенная беременность, и требуется искусственное родоразрешение.
Все приведенные выше механизмы участия в процессе репродукции ГИО и их продуктов в целом могут рассматриваться как механизм поддержания иммуногенетического разнообразия человеческой популяции (или вида).
Дело в том, что наличие общих для отца и матери HLA-специфичностей, а тем более HLA-гаплотипов, повышает вероятность появления HLA-гомозиготного потомства. Возможность последнего особенно велика при инцестах.
В свою очередь, гомозиготность (удвоение одних и тех же HlА-гаплотипов) ведет к резкому «обеднению» возможности иммунной системы организма человека к противостоянию различным вызовам внешней и внутренней среды. В связи с развитием иммунологии и в особенности с переходом как фундаментальных, так и прикладных исследований на молекулярно-генетический уровень, представления об этих описанных для человечества вызовах неуклонно расширяются, и сегодня к ним относят не только заболевания инфекционного, аутоиммунного и онкогенеза, но и воздействие таких агрессивных факторов техногенного происхождения, как ионизирующая радиация, опасные вещества химического происхождения и др.
Следует отметить, что, благодаря разработке новых методов направленного воздействия на определенные звенья иммунного ответа организма, практическая медицина, в том числе акушерство и гинекология, располагают в ряде случаев возможностью преодолевать сам процесс развития в женском организме негативных по отношению к HLA-совместимому плоду реакций. Однако следует принять во внимание, что в этом случае будут рождены дети, несущие в своих геномах гомозиготные ГИО, т.е. имеющие заведомо дефицитную иммунную систему. Более того, резко возрастает вероятность того, что потомство этих детей также будет иметь аналогичную особенность своих иммуногенотипов.
Учитывая тот факт, что именно гены иммунного ответа человека обеспечивают биологическую устойчивость человека как вида, благодаря разнообразию (полиморфизму) генотипов иммунного ответа (в первую очередь HLA), снижение этого разнообразия, в свою очередь, снижает способность к выживанию человека как вида в условиях все возрастающей агрессивности факторов окружающей среды (в том числе техногенных).
При рассмотрении вопроса о роли ГИО в репродуктивном процессе, в целом имеются основания сделать вывод о том, что они выполняют не только функцию генетического контроля иммунного ответа, но и обеспечивают осуществление важнейшей для человечества задачи - эффективного противостояния неблагоприятным изменениям факторов окружающей среды.
Знания, полученные при исследованиях, проводимых в области установления видовых, популяционных и индивидуальных особенностей биологической устойчивости организма человека, представляются одними из важнейших условий для выживания и прогресса человечества.
Наконец, именно HLA и их белковым продуктам принадлежит такая универсальная биологическая функция, как обеспечение разнообразия человечества как вида. Тем самым система HLA, являющаяся наиболее полиморфной (разнообразной - общее количество аллельных вариантов около 10 тыс.), обеспечивает вероятность полной идентичности HLA-гаплотипов двух случайно взятых неродственных лиц, равную 1:3x106 .
Столь высокий уровень разнообразия генов иммунной системы позволил в свое время человечеству выжить в условиях пандемий, вызванных смертельно опасными инфекциями (чума, оспа, холера и т.д.). Это произошло благодаря тому, что среди генов HLA встречались варианты, ассоциированные с врожденной устойчивостью к данным патологиям.
В настоящее время установлены варианты генов HLA и ряда других генов, участвующих в реализации иммунного ответа, ассоциированных с «новыми видами», в частности со СПИДом.
Более того, в самое последнее время установлена ассоциация между конкретными генами HLA и чувствительностью к радиации.
Представленный выше анализ роли ГИО в контроле иммунного ответа, как такового, так и в общей физиологии и биологии человека, позволяет сделать следующее заключение. Это делает возможным разделение ГИО на комплекс генов, выполняющих генетический контроль сугубо иммунологических функций и реакций (к которым относятся и гены иммунного ответа, не входящие в систему HLA) и на другие группы генов, для которых контроль иммунного ответа является одной из важнейших физиологических и биомедицинских функций.
Наиболее удобным с экспериментальной точки зрения лабораторным объектом данных исследований стали мыши. С помощью близкородственных скрещиваний были созданы мышиные линии, внутри которых все животные являлись идентичными по «целевым» генам, причем линейные мыши генетически отличаются не только от «диких» популяций мышей, но и от мышей других линий. Одним из критериев внутрилинейной генетической идентичности является толерантность к трансплантату или опухоли, пересаженным от донора, принадлежащего к этой же линии. На этом факте построены основополагающие представления о функциональной роли генов иммунного ответа. Так, например, еще на рубеже XIX-XX вв. профессор Е. Тиззер (E.E. Tyzzer), проводивший эксперименты с линиями японских «танцующих мышей» (Musbactrianus), высказал мысль о решающей роли наследуемых факторов в формировании предрасположенности к определенным типам опухолей [1, 8].
Используя те же методы и представления, американский исследователь Дж. Снелл сформулировал основополагающие законы трансплантационного иммунитета и ввел само понятие «главный комплекс гистосовместимости». В серии работ, выполненных П.А. Горером и колл., было установлено, что на клетках мыши экспрессируются антигены, ответственные за тканевую совместимость. Были выделены антигены, каждый из которых специфичен определенной линии мышей. В дальнейшем при пересадке опухолей было установлено, что один из исследованных антигенов достоверно ассоциирован с устойчивостью животных к развитию опухоли. В ходе дальнейших исследований антисыворотка к этому антигену была использована для определения белковых продуктов трех аллелей кодирующего эти антигены локуса, названного вторым локусом генов гистосовместимости (H-2) [7].
Параллельно с решением проблемы селекции тканесовместимых пар донор-реципиент расширялись представления об общебиологической роли продуктов генов иммунного ответа. Было установлено, что они выполняют в организме целый ряд биологических функций, связанных не только с контролем иммунного ответа, но и с поддержанием целостности и наследуемости генома, а также с сохранением видов в условиях естественного отбора.
Например, с функцией генов MHC связано множество ключевых этапов развития противоинфекционного иммунитета, в том числе чувствительность и устойчивость к некоторым вирусным и бактериальным инфекциям [19, 13, 18]. Так, участие генов H-2 в формировании предрасположенности к заболеваниям показано для инфекций, вызываемых вирусом простого герпеса, цитомегаловирусом, Listeria monocytogenes и Leishmania donovani [3, 4, 7].
Изучение ассоциации генов локуса H-2 с инфекционными заболеваниями стало возможным благодаря созданию различных линий мышей, характеризуемых повышенной резистентностью или чувствительностью к патогену. После установления роли определенных гаплотипов обычно тестируют рекомбинантные линии для локализации субобластей H-2, контролирующих противоинфекционную защиту. Однако зачастую восприимчивость к заболеванию контролируется более чем одним геном.
Подтверждение участия многих генетических факторов (генов) в развитии инфекционной резистентности было впервые установлено на модели инфекции паратифоидного энтерита у мышей [15-17]. Такие связи обычно устанавливаются при анализе потомков возвратных скрещиваний. Если между оппозитными линиями обнаруживается расщепление, это указывает на наличие более чем одного гена, контролирующего восприимчивость. Так, например, у мышей осуществляется контроль над инфекцией, вызываемой паразитическими простейшими рода Plasmodium, Trypanosoma cruzi, Toxoplasma gondii [9, 12, 14, 18].
В последних исследованиях, основанных на рентгеноструктурном анализе молекул HLA, были установлены основные принципы реализации генетического контроля иммунного ответа [2]. Они состоят в следующем: для развития ответа на тот или иной иммунодоминантный пептид в антигенсвязывающей области молекулы должны иметься специфичные для данного пептида участки связывания. В случае их отсутствия иммунный ответ не развивается. Это относится как к реагированию на болезнетворный инфекционный агент, так и на вакцину, созданную для профилактики данного заболевания. Именно этот феномен лежит в основе генетического контроля иммунного ответа и определяет его специфичность.
При этом стала понятна и причина генетически обусловленной «неотвечаемости» на инфекционные и иные чужеродные агенты. Этот вопрос принципиален для развития вакцинопрофилактики, поскольку вакцины, создаваемые против социально значимых заболеваний, заведомо неэффективны для определенных групп населения с генетически обусловленной неотвечаемостью. Оставалось, однако, неясным: возможно ли преодоление такого рода реакции организма, и если да, то каким образом.
Решение этой проблемы нашли отечественные исследователи академики Рэм Викторович Петров и Рахим Мусаевич Хаитов, открывшие принципиально новый подход к преодолению иммуногенетической «неотвечаемости». Разработанный ими метод «Фенотипическая коррекция иммунного ответа» стал основой для появления наиболее перспективного и широко используемого в настоящее время направления в вакцинологии. Модифицируя молекулу антигена иммуномодуляторами, авторы добились превращения особей, фенотипически низкореагирующих на болезнетворный антиген, входящий в состав вакцины, в высокореагирующих. Основу такого превращения составляет дополнительное вовлечение в иммунный ответ новых сайтов генов, участвующих в развитии иммунного ответа на данный антиген.
Формирование современных знаний о ГИО прошло несколько основных этапов. На первом из них были осуществлены исследования, посвященные созданию нового направления фундаментальной иммунологии - разработка экспериментальных моделей для изучения основ иммуногенетики.
Эти исследования были основаны на данных о механизмах генетического контроля иммунного ответа. Коррекция иммуногенеза была достигнута с помощью конъюгации антигена с молекулами полиэлектролитов, которые позволяли провести фенотипическую коррекцию, суть которой заключается в переводе генетически низкоотвечающих животных в высокоотвечающие за счет обхода генетического контроля на молекулярном уровне [11]. Данный подход, предложенный в 1980-е годы академиками Р.В. Петровым и Р.М. Хаитовым, первоначально успешно использовался в работах отечественных ученых, в настоящее время применяется и за рубежом. Так, в частности, именно этот подход рассматривается как наиболее перспективный для создания эффективных вакцин против ВИЧ/СПИД. При этом следует принять во внимание, что речь идет о фенотипической коррекции иммунного ответа на ВИЧ/СПИД не отдельной группы индивидуумов, а о создании универсальных вакцин, подходящих для широкого применения. Таким образом, разработка метода фенотипической коррекции, предложенная академиками Р.В. Петровым и Р.М. Хаитовым, является наиболее перспективным путем для создания вакцин не только против ВИЧ/СПИД, но и против новых и возвратных инфекций.
Все вышесказанное еще раз подчеркивает принципиальную роль экспериментальных животных в развитии иммунологии, и в первую очередь это касается лабораторных мышей.
Несмотря на удобство данной экспериментальной модели в изучении функций иммунной системы, серьезные отличия в строении генетического аппарата, профиле экспрессии генов иммунного ответа, а также некоторых компонентов и путей развития иммунного ответа у человека и мыши, ограничивают возможности прямого переноса экспериментальных данных «от мыши к человеку».
Еще более принципиальным аспектом, ограничивающим использование экспериментальных животных, является наличие внутривидовой генетической гетерогенности. Суммарный уровень иммунологических потенций каждого организма зависит от сложнейших взаимодействий иммунокомпетентных клеток, их продуктов и разнообразных субстратов. В генетически гетерогенной популяции количественное выражение основных иммунологических признаков сильно варьирует у разных индивидов. Эти отличия обусловлены в первую очередь полиморфизмом генов иммунной системы. Таким образом, полиморфизм генов, испытывающий на себе регулирующее воздействие внешних факторов, является основным механизмом адаптации к изменяющимся условиям окружающей среды и во многом определяет различия в индивидуальной реакции на то или иное воздействие [6, 10].
Мышиная модель, при создании которой сознательно поддерживается отбор, направленный на закрепление признака (повышение уровня гомозиготности), противоположна по смыслу естественным механизмам поддержания разнообразия генов, реализующих защитный потенциал организма.
Для решения задач, связанных с установлением иммуногенетических факторов, ассоциированных с особенностями развития иммунного ответа у человека в норме и при патологии, необходима модернизация экспериментальной парадигмы. Особенно актуальной эта задача выглядит в связи с развитием концепций доказательной и персонализированной медицины.
Таким образом, если в изучении фундаментальных аспектов развития и дифференцировки иммунной системы мышиная модель сохраняет актуальность, благодаря возможности использования гуманизированных животных, а также постоянно пополняющимся данным о межвидовых отличиях в экспрессии ключевых компонентов иммунного ответа, то в решении задач практической иммуногенетики данная модель представляется не вполне корректной. В первую очередь это обусловлено тем, что вслед за установлением базовых механизмов наследования иммунологической патологии остро встает вопрос о внутривидовых отличиях в строении генов иммунной системы, а также о влиянии генетического полиморфизма на индивидуальный риск развития заболеваний.
Генотипирование на уровне установления аллельных вариантов генов иммунного ответа, а также ряда других генетических систем, которые рассматриваются в качестве мишеней неблагоприятного воздействия, может стать перспективным подходом для оценки риска развития иммуноассоциированных патологий. При этом следует учесть, что эксперименты с лабораторными животными, равно как и с культурами клеток, не позволяют учесть параметры индивидуальной генетической изменчивости. Поэтому для дальнейшего развития знаний и создания теоретической базы в данном направлении могут быть адаптированы современные клинико-статистические и популяционные методы, позволяющие устанавливать связь индивидуальных генетических особенностей с устойчивостью или чувствительностью человека к иммуноассоциированным заболеваниям.
Вторым этапом изучения основ иммуногенетики стали установление и изучение генов иммунного ответа. Данный этап берет свое начало с конца 1950-х годов, он ознаменовался открытием и началом изучения ГИО человека. Основа этого этапа - открытие белковых продуктов ГИО человека. Вслед за этим в рамках международных исследований было проведено детальное изучение белковых продуктов ГИО человека - HLA-антигенов. Указанный этап ознаменовался пятью нобелевскими медалями за установление основных функций генетической системы HLA.
Третий этап, берущий свое начало с конца 1970-х годов, ознаменовался переходом с белкового на молекулярно-генетический уровень. Это позволило сделать объектом исследования ГИО не только HLA-антигены, но и осуществлять прямое изучение самих HLA-генов, а затем и их аллельных вариантов. Данное направление имеет огромное значение не только для развития фундаментальных представлений о структуре и функции ГИО человека, но и для прогресса медико-биологической науки и развития прикладных аспектов биомедицины. Так, эти данные уже позволили усовершенствовать систему национальной биобезопасности.
Дальнейшее развитие исследований в области ГИО является одним из наиболее перспективных направлений по укреплению и совершенствованию системы биологической защиты населения, в том числе в период природных вызовов - эпидемий, пандемий, а также в случаях экстремальных ситуаций, вызванных воздействием неблагоприятных факторов техногенного происхождения.
Наиболее перспективным в дальнейшем развитии фундаментальных и прикладных направлений в изучении ГИО является установление аллельных вариантов генов иммунного ответа, служащих генетическими маркерами индивидуальной, групповой и популяционной устойчивости и чувствительности к социально значимым заболеваниям, а также к воздействию факторов техногенного происхождения. Результатом этих исследований, возможно, будет решение одной из актуальнейших проблем современной медицины - создание персонифицированных методов прогноза, диагностики и терапии социально значимых заболеваний. Вместе с тем будет решена задача по разработке эпидемиологического прогноза развития социально значимых заболеваний и воздействия ряда неблагоприятных факторов на конкретные этнические группы и популяции населения.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
-
Asepoax М.М., Mopoe А.М., Апт A.C., Никоненко Б.В. Иммуногенетика инфекционных заболеваний. - М.: Медицина, 1985. - 256 с.
-
Bjorkman P.J., Saper M.A., Samraoui B. et al. Structure of the human class I histocompatibility antigen, HLA-A2 // Nature. - 1987. - Vol. 329, № 6139. - P. 506-12.
-
Blackwell J.M. Leishmania donovani infection in heterozygous and recombinant H-2 haplotype mice // Immunogenetics. - 1983. - Vol. 18, № 2. - Р. 101-9.
-
Cheers C., Sandrin M.S. Restriction in adoptive transfer of resistance to Listeria mono-cytogenes. II. Use of congenic and mutant mice show transfer to be H-2K restricted // Cell. Immunol. - 1983. - Vol. 78, № 2. - Р. 199-205.
-
Gorer P.A. The significance of studies with transplanted tumours // Brit. J. Cancer. - 1948. - Vol. 2, № 2. - Р.103-7.
-
Hedrick P.W. Genetic variation in a heterogeneous environment. II. Temporal heterogeneity and directional selection // Genetics. - 1976. - Vol. 84, № 1. - Р. 145-157.
-
Klein J., Figueroa F. Evolution of the major histocompatibility complex // Crit. Rev. Immunol. - 1986. - Vol. 6, № 4. - Р. 295-386.
-
Little C.C., Tyzzer E.E. Further experimental studies on the inheritance of susceptibility to a transplantable tumor, carcinoma (J.W.A.) of the Japanese waltzing mouse // J. Med. Res. - 1916. - Vol. 33, № 3. - Р. 393-453.
-
Nadel E.M., Greenberg J., Jay G.E. et al. Backcross studies on the genetics of resistance to malaria in mice // Genetics. - 1955. - Vol. 40, № 5. - Р. 620-6.
-
Nei M., Chesser R.K. Estimation of fixation indices and gene diversities // Ann. Hum. Genet. - 1983. - Vol. 47, Pt 3. - P. 253-9.
-
Petrov R.V., Khaitov R.M., Man’ko V.M., Mikhailova A.A. Immune response control and regulation. - Leningrad, Meditsina, 1981. - 311 p.
-
Sayles P.C., Wassom D.L. Immunoregulation in murine malaria. Susceptibility of inbred mice to infection with Plasmodium yoelii depends on the dynamic interplay of host and parasite genes // J. Immunol. - 1988. - Vol. 141, № 1. - P. 241-8.
-
Trischmann T., Tanowitz H., Wittner M. et al. Trypanosoma cruzi: role of the immune response in the natural resistance of inbred strains of mice // Exp. Parasitol. - 1978. - Vol. 45, № 2. - Р. 160-8.
-
Trischmann T.M., Bloom B.R. Genetics of murine resistance to Trypanosoma cruzi // Infect. Immun. - 1982. - Vol. 35, № 2. - Р. 546-51.
-
Webster L.T., Pritchett I.W. Microbic virulence and host susceptibility in paratyphoid-enteritidis infection of white mice: V. The effect of diet on host resistance // J. Exp. Med. - 1924. - Vol. 40, № 3. - P. 397-404.
-
Webster L.T. Inherited and acquired factors in resistance to infection: II. A comparison of mice inherently resistant or susceptible to Bacillus enteritidis infection with respect to fertility, weight, and susceptibility to various routes and types of infection // J. Exp. Med. - 1933. - Vol. 57, № 5. - Р. 819-43.
-
Webster L.T. Microbic virulence and host susceptibility in paratyphoid-enteritidis infection of white mice: VII. The effect of selective breeding on host resistance. Further studies // J. Exp. Med. - 1925. - Vol. 42, № 1. - Р. 1-7.
-
Williams D.M., Grumet F.C., Remington J.S. Genetic control of murine resistance to Toxoplasma gondii // Infect. Immun. - 1978. - Vol. 19, № 2. - Р. 416-20.
-
Zinkernagel R.M. Role of the H-2 gene complex in cell-mediated immunity to infectious disease // Transplant. Proc. - 1977. - Vol. 9, № 4. - Р. 1835-8.
Дополнительные иллюстрации

Рис. 1.1. HLA-молекулы и иммунный ответ

Рис. 1.2. Кристаллическая структура молекулы HLA-DR1, содержащей сайт специфического связывания с антигеном pMART-1 (phosphopeptide Melanoma Antigen Recognized by T cells-1) (Li Y. et al., 2010):
а - пептид-связывающая бороздка: изображены домены α1 (показано голубым цветом) и β1 (показано синим цветом) в комплексе с антигеном (показано зеленым цветом); б - общий вид молекулы (номер доступа в базе данных PDB - 3L6F, разрешение 2.1Е, изображение получено с помощью программы RasMol)

Рис. 1.3. Распределение генов иммунного ответа в различных этнических группах населения - дендрограмма генетических расстояний

Рис. 1.4. Строение системы HLA

Рис. 1.5. Процессинг и экспрессия комплекса HLA-пептид

Рис. 1.6. Географическое распределение аллеля CCR5Δ32

Рис. 2.1. Изменение представлений о полиморфизме системы HLA класса I и класса II с 1987 по 2013 г. (по Marsh S.G.E.) [65, 77]

Рис. 2.2. Взаимосвязь белковой и генной организации молекул HLA классов I и II. Показаны экзон/интронная организация αи β-цепей класса II и полипептидные домены молекул HLA, которые они кодируют: L - лидерный пептид; Тm - трансмембранный регион; Cyt - внутриклеточный регион; 3’UTR - З'-нетранслируемый регион

Рис. 2.3. Пространственное строение антигена HLA-A2 класса I по данным рентгеноструктурного анализа: а - вид сбоку; б - вид сверху. Стрелками изображены участки антипараллельной β-структуры, спиралями - α-спиральные фрагменты

Рис. 3.1. Межэтнический полиморфизм в распределении 3 специфичностей HLA-DRB1 в 10 популяционных группах

Рис. 3.2. Дендрограмма генетических расстояний на основании частот гена DRB1 у русских из разных регионов России: Арх - Архангельская обл.; Кос - Костромская обл., СПб - Санкт-Петербург (данные С.И. Капустина); Вол - Вологодская обл.; Удм - районы Удмуртии; Астр - г. Астрахань; Мос - Москва; Смо - Смоленская обл.

Рис. 3.3. Дендрограмма генетических расстояний на основании частот гаплотипов DRB1-DQA1-DQB1 у русских из разных регионов России: Арх - Архангельская обл.; Кос - Костромская обл.; СПб - Санкт-Петербург (данные С.И. Капустина); Вол - Вологодская обл.; Удм - районы Удмуртии; Астр - г. Астрахань; Мос - Москва; Смо - Смоленская обл.

Рис. 3.4. График многомерного шкалирования генетических расстояний на основе частот гена DRB1 у русских из разных регионов: Арх - Архангельская обл.; Кос - Костромская обл.; СПб - Санкт-Петербург (данные С.И. Капустина); Вол - Вологодская обл.; Удм - районы Удмуртии; Астр - г. Астрахань; Мос - Москва; Смо - Смоленская обл.

Рис. 3.5. График многомерного шкалирования генетических расстояний на основе частот гаплотипов DRB1-DQA1-DQB1 у русских из разных регионов: Арх - Архангельская обл.; Кос - Костромская обл.; СПб - Санкт-Петербург (данные С.И. Капустина); Вол - Вологодская обл.; Удм - районы Удмуртии; Астр - г. Астрахань; Мос - Москва; Смо - Смоленская обл.

Рис. 3.6. Распределение частот аллеля CCR5D32 в исследованных популяциях

Рис. 3.7. Распределение частот аллеля CCR2-64I в исследованных популяциях

Рис. 3.8. Распределение частот аллеля SDF1-3’A в исследованных популяциях

Рис. 3.9. Относительная опасность развития СПИД (ООР) у ВИЧ-инфицированных индивидуумов в исследованных популяциях

Рис. 3.10. Относительная опасность смерти в результате СПИД (ООС) у ВИЧ-инфицированных индивидуумов в исследованных популяциях

Рис. 4.1. Эффективность селекции аллогенного почечного трансплантата в зависимости от степени совместимости донора и реципиента по специфичностям HLA-DRB1

Рис. 4.2. Эффективность молекулярно-генетической HLA-селекции кроветворных стволовых клеток

Рис. 5.1. Привычное идиопатическое невынашивание беременности

Рис. 6.1. Относительный риск заболевания больных СД1 в трех группах сравнения

Рис. 7.1, а. Результаты исследования частот генетических маркеров в группах облученных лиц и здоровых испытуемых. На рисунке представлены результаты исследования частот генетических маркеров, ассоциированных с наследственной предрасположенностью к развитию онкологических заболеваний в группах лиц, подвергшихся хроническому низкодозовому радиационному воздействию, а также в группах клинического и популяционного контроля: а - отличия в распределении маркеров

Рис. 7.1, б. Результаты исследования частот генетических маркеров в группах облученных лиц и здоровых испытуемых. На рисунке представлены результаты исследования частот генетических маркеров, ассоциированных с наследственной предрасположенностью к развитию онкологических заболеваний в группах лиц, подвергшихся хроническому низкодозовому радиационному воздействию, а также в группах клинического и популяционного контроля: б - отличия в распределении групповых специфичностей генов HLA-DRB1, -DQB1 и -DQA1 в исследованных группах. Звездочкой обозначены обнаруженные отличия для группы аллелей DRB1♠11

Рис. 8.1. Схема инновационной технологической платформы

Рис. 8.2. Детектирующие термоциклеры «ДТ-322» (а) и «ДТ-96» (б)

Рис. 8.3, a. Модуль «Работа с прибором» (а) программного обеспечения приборов серии «ДТ»

Рис. 8.3, б. Модуль «Анализ» (б) программного обеспечения приборов серии «ДТ»

Рис. 8.4. Окно параметров «Тест» программного обеспечения приборов серии «ДТ»

Рис. 8.5. Схема применения метода delta-TF в сравнении с обычным подходом: а - необработанные данные; б - результат вычитания фонового уровня для кривых, изображенных на (а); в - необработанные данные, полученные по методу delta-TF; г - результат применения метода delta-TF для кривых, изображенных на (в)

Рис. 8.6. Параметры, используемые при расчете по методу delta-TF

Таблица 8.6 с 15 рисунками. Характеристика реакционных смесей для типирования локуса DRB1 на уровне групп аллелей

Продолжение табл 8.6

Продолжение табл. 8.6

Продолжение табл. 8.6

Продолжение табл. 8.6

Продолжение табл. 8.6

Продолжение табл. 8.6

Продолжение табл. 8.6

Продолжение табл. 8.6

Продолжение табл. 8.6

Продолжение табл. 8.6

Продолжение табл. 8.6

Продолжение табл. 8.6

Продолжение табл. 8.6

Окончание табл. 8.6

Рис. 8.7. Применение метода delta-TF на практике: а - необработанные данные; б - результат вычитания фонового уровня для кривых, изображенных на (а); в - необработанные данные, полученные по методу delta-TF; г - результат применения метода delta-TF для кривых, изображенных на (в)

Рис. 8.8. Реализация функции интерпретации результатов типирования локуса HLA-DRB1 в программном обеспечении к прибору «ДТ-96»

Рис. 8.9. Анализ кривых плавления и определение однонуклеотидных замен в программном обеспечении к прибору «ДТ-96»

Рис. 8.10. ΔСр между парами референсных генов в образцах ПК (а) и СЖ (б)

Рис. 8.11. Корреляция факторов нормализации (NF), определенных по разным контрольным генам (TBP, HPRT1 и B2M)

Рис. 8.12. Оценка линейного диапазона на примере системы амплификации мРНК IL-17

Рис. 8.13. Уровень экспрессии генов TOP2A и CDC2 в первые часы культивации мононуклеарных клеток периферической крови, стимулированных ФГА: CDC-1, CDC-2 - уровни экспрессии мРНК гена CDC2 в популяциях клеток доноров 1 и 2 соответственно; TPA-1, TPA-2 - уровни экспрессии мРНК гена TOP2A в популяциях клеток доноров 1 и 2 соответственно

Рис. 8.14. Кинетика изменения уровней экспрессии мРНК генов TOP2A и CDC2 в мононуклеарных клетках периферической крови, взятых у двух здоровых доноров и стимулированных ФГА: CDC-1, CDC-2 - уровни экспрессии мРНК гена CDC2 в популяциях клеток доноров 1 и 2 соответственно; TPA-1, TPA-2 - уровни экспрессии мРНК гена TOP2A в популяциях клеток донора 1 и 2 соответственно; IL-6 - уровень экспрессии мРНК IL-6 в популяции клеток донора 2 в ответ на стимуляцию CpG-ODN-2006

Рис. 8.15. Кинетика изменения уровней экспрессии мРНК генов TOP2A и CDC2 в мононуклеарных клетках периферической крови, взятых у двух здоровых доноров и культивированных без добавления ФГА: CDC - уровень экспрессии мРНК гена CDC2 в популяции клеток, среднее по двум донорам; TPA - уровень экспрессии мРНК гена TOP2A в популяции клеток, среднее по двум донорам

Рис. 8.16. Филогенетический анализ 16S РНК бактерий, составляющих урогенитальный биоценоз, и близкородственных им видов. Выделение пунктиром и цифры справа соответствуют разбиению на группы в тесте